MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012580	GCTC	2	8	342828	342835	0 %	25 %	25 %	50 %	227811964
5502	NC_012580	TCC	2	6	342908	342913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811964
5503	NC_012580	AGAAA	2	10	343010	343019	80 %	0 %	20 %	0 %	227811964
5504	NC_012580	GTAC	2	8	343050	343057	25 %	25 %	25 %	25 %	227811964
5505	NC_012580	CTT	2	6	343079	343084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811964
5506	NC_012580	A	6	6	343104	343109	100 %	0 %	0 %	0 %	227811964
5507	NC_012580	ACG	2	6	343117	343122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811964
5508	NC_012580	AAT	2	6	343193	343198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811964
5509	NC_012580	GCA	2	6	343224	343229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811964
5510	NC_012580	AGA	2	6	343238	343243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811964
5511	NC_012580	GAA	2	6	343412	343417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811964
5512	NC_012580	TTGGT	2	10	343459	343468	0 %	60 %	40 %	0 %	227811964
5513	NC_012580	GTT	2	6	343474	343479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811964
5514	NC_012580	A	7	7	343517	343523	100 %	0 %	0 %	0 %	227811964
5515	NC_012580	TGT	2	6	343525	343530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811964
5516	NC_012580	A	6	6	343548	343553	100 %	0 %	0 %	0 %	227811964
5517	NC_012580	GAG	2	6	343576	343581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811964
5518	NC_012580	ATT	2	6	343587	343592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811964
5519	NC_012580	ATA	2	6	343636	343641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811964
5520	NC_012580	TGT	2	6	343642	343647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811964
5521	NC_012580	ACC	2	6	343649	343654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811964
5522	NC_012580	ATG	2	6	343713	343718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811964
5523	NC_012580	A	7	7	343960	343966	100 %	0 %	0 %	0 %	227811965
5524	NC_012580	GCA	2	6	343992	343997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811965
5525	NC_012580	TCGT	2	8	344015	344022	0 %	50 %	25 %	25 %	227811965
5526	NC_012580	GAA	2	6	344030	344035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811965
5527	NC_012580	TGA	2	6	344086	344091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811965
5528	NC_012580	GAA	2	6	344109	344114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811965
5529	NC_012580	AT	3	6	344130	344135	50 %	50 %	0 %	0 %	227811965
5530	NC_012580	AAT	2	6	344147	344152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811965
5531	NC_012580	GAG	2	6	344237	344242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811965
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5534	NC_012580	CAT	2	6	344498	344503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811965
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5540	NC_012580	T	7	7	344964	344970	0 %	100 %	0 %	0 %	227811966
5541	NC_012580	T	6	6	345133	345138	0 %	100 %	0 %	0 %	227811966
5542	NC_012580	CAA	2	6	345368	345373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811967
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5544	NC_012580	TAA	2	6	345400	345405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811967
5545	NC_012580	TCAA	2	8	345638	345645	50 %	25 %	0 %	25 %	227811967
5546	NC_012580	TTC	2	6	345750	345755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811968
5547	NC_012580	TGA	3	9	345803	345811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811968
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5549	NC_012580	CAT	2	6	345860	345865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811968
5550	NC_012580	GT	3	6	345875	345880	0 %	50 %	50 %	0 %	227811968
5551	NC_012580	ATC	2	6	346132	346137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811969
5552	NC_012580	TAA	2	6	346153	346158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811969
5553	NC_012580	A	6	6	346193	346198	100 %	0 %	0 %	0 %	227811969
5554	NC_012580	GAT	2	6	346205	346210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811969
5555	NC_012580	GGT	2	6	346224	346229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811969
5556	NC_012580	AGCA	2	8	346255	346262	50 %	0 %	25 %	25 %	227811969
5557	NC_012580	GGA	2	6	346280	346285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811969
5558	NC_012580	GGC	2	6	346341	346346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811969
5559	NC_012580	TGT	2	6	346358	346363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811969
5560	NC_012580	ACA	2	6	346412	346417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811969
5561	NC_012580	TCA	2	6	346483	346488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811969
5562	NC_012580	TTG	2	6	346767	346772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811970
5563	NC_012580	TGA	2	6	346815	346820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811970
5564	NC_012580	AGT	2	6	346834	346839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811970
5565	NC_012580	CAA	2	6	346841	346846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811970
5566	NC_012580	TAGCT	2	10	346875	346884	20 %	40 %	20 %	20 %	227811970
5567	NC_012580	AT	3	6	346901	346906	50 %	50 %	0 %	0 %	227811970
5568	NC_012580	GGA	2	6	347216	347221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811972
5569	NC_012580	AAAG	2	8	347373	347380	75 %	0 %	25 %	0 %	227811972
5570	NC_012580	GTG	2	6	347434	347439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811972
5571	NC_012580	GGCC	2	8	347695	347702	0 %	0 %	50 %	50 %	227811972
5572	NC_012580	CAT	2	6	347841	347846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811973
5573	NC_012580	GCT	2	6	347888	347893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811973
5574	NC_012580	TGAAC	2	10	347931	347940	40 %	20 %	20 %	20 %	227811973
5575	NC_012580	CTCGA	2	10	347969	347978	20 %	20 %	20 %	40 %	227811973
5576	NC_012580	ATG	2	6	348032	348037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811973
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5578	NC_012580	T	6	6	348151	348156	0 %	100 %	0 %	0 %	227811973
5579	NC_012580	CAG	2	6	348349	348354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811973
5580	NC_012580	AATA	2	8	348356	348363	75 %	25 %	0 %	0 %	227811973
5581	NC_012580	TGA	2	6	348542	348547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811974
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5584	NC_012580	ACA	2	6	348631	348636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811974
5585	NC_012580	TATC	2	8	348718	348725	25 %	50 %	0 %	25 %	227811974
5586	NC_012580	CTT	2	6	348774	348779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811974
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5588	NC_012580	T	6	6	348894	348899	0 %	100 %	0 %	0 %	227811974
5589	NC_012580	TTG	2	6	348931	348936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811974
5590	NC_012580	TCA	2	6	349001	349006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811974
5591	NC_012580	TAC	2	6	349055	349060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811975
5592	NC_012580	TGC	2	6	349157	349162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811975
5593	NC_012580	AGC	3	9	349202	349210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811975
5594	NC_012580	ATC	2	6	349508	349513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811976
5595	NC_012580	AGT	2	6	349622	349627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811976
5596	NC_012580	CGC	2	6	349636	349641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811976
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5601	NC_012580	CTG	2	6	350241	350246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811978
5602	NC_012580	GAT	2	6	350311	350316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811978
5603	NC_012580	A	6	6	350381	350386	100 %	0 %	0 %	0 %	227811978
5604	NC_012580	A	7	7	350440	350446	100 %	0 %	0 %	0 %	227811978
5605	NC_012580	CAA	2	6	350454	350459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811978
5606	NC_012580	CAAA	2	8	350468	350475	75 %	0 %	0 %	25 %	227811978
5607	NC_012580	GC	3	6	350665	350670	0 %	0 %	50 %	50 %	227811979
5608	NC_012580	TAGTTG	2	12	350671	350682	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227811979
5609	NC_012580	CGC	2	6	350793	350798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811979
5610	NC_012580	ATG	2	6	350831	350836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811979
5611	NC_012580	TCTT	2	8	350870	350877	0 %	75 %	0 %	25 %	227811979
5612	NC_012580	TG	3	6	350882	350887	0 %	50 %	50 %	0 %	227811979
5613	NC_012580	CCA	2	6	351045	351050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811980
5614	NC_012580	TAA	2	6	351055	351060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811980
5615	NC_012580	TCGTG	2	10	351136	351145	0 %	40 %	40 %	20 %	227811980
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5617	NC_012580	GAGC	2	8	351611	351618	25 %	0 %	50 %	25 %	227811981
5618	NC_012580	AAT	2	6	351681	351686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811981
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5621	NC_012580	CGTGT	2	10	351875	351884	0 %	40 %	40 %	20 %	227811982
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5623	NC_012580	TGCG	2	8	351929	351936	0 %	25 %	50 %	25 %	227811982
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5859	NC_012580	TACT	2	8	373234	373241	25 %	50 %	0 %	25 %	227812014
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5991	NC_012580	CAT	2	6	383711	383716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812031
5992	NC_012580	AGC	2	6	383723	383728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812031
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5994	NC_012580	CATG	2	8	383804	383811	25 %	25 %	25 %	25 %	227812031
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