MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 3522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	TAA	2	6	2019	2024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
2	NC_011185	TGA	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
3	NC_011185	AAAT	2	8	2103	2110	75 %	25 %	0 %	0 %	197336538
4	NC_011185	AACT	2	8	2193	2200	50 %	25 %	0 %	25 %	197336538
5	NC_011185	TCG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336538
6	NC_011185	AGC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336538
7	NC_011185	GAT	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
8	NC_011185	TGA	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
9	NC_011185	ATT	2	6	2472	2477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
10	NC_011185	CA	3	6	2497	2502	50 %	0 %	0 %	50 %	197336538
11	NC_011185	ACA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336538
12	NC_011185	GAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
13	NC_011185	ACA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336538
14	NC_011185	AAT	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
15	NC_011185	ATT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
16	NC_011185	TAA	2	6	2864	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
17	NC_011185	TCC	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197336538
18	NC_011185	AATTA	2	10	2949	2958	60 %	40 %	0 %	0 %	197336538
19	NC_011185	TTTAAT	2	12	3121	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
20	NC_011185	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
21	NC_011185	GAA	2	6	3196	3201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336538
22	NC_011185	TGT	2	6	3211	3216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336538
23	NC_011185	A	6	6	3236	3241	100 %	0 %	0 %	0 %	197336538
24	NC_011185	GAT	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
25	NC_011185	A	6	6	3410	3415	100 %	0 %	0 %	0 %	197336538
26	NC_011185	CTCA	2	8	3440	3447	25 %	25 %	0 %	50 %	197336538
27	NC_011185	TTA	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
28	NC_011185	TAATA	2	10	3549	3558	60 %	40 %	0 %	0 %	197336538
29	NC_011185	CTA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336538
30	NC_011185	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336538
31	NC_011185	ATA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
32	NC_011185	ATT	2	6	3654	3659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
33	NC_011185	ATT	2	6	3767	3772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336634
34	NC_011185	TG	3	6	3814	3819	0 %	50 %	50 %	0 %	197336634
35	NC_011185	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336634
36	NC_011185	AG	3	6	3879	3884	50 %	0 %	50 %	0 %	197336634
37	NC_011185	TAA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336634
38	NC_011185	ATTTGC	2	12	4069	4080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197336634
39	NC_011185	AAC	3	9	4263	4271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336634
40	NC_011185	T	6	6	4325	4330	0 %	100 %	0 %	0 %	197336634
41	NC_011185	TTC	2	6	4336	4341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336634
42	NC_011185	AAT	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336634
43	NC_011185	ACG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336634
44	NC_011185	TATTGA	2	12	4418	4429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197336634
45	NC_011185	TGA	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336634
46	NC_011185	TTA	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336634
47	NC_011185	AATCTC	2	12	4603	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336634
48	NC_011185	CCA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336634
49	NC_011185	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336485
50	NC_011185	TAA	2	6	4765	4770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
51	NC_011185	AGGT	2	8	4791	4798	25 %	25 %	50 %	0 %	197336485
52	NC_011185	T	6	6	4800	4805	0 %	100 %	0 %	0 %	197336485
53	NC_011185	TGC	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336485
54	NC_011185	ATG	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336485
55	NC_011185	GAATA	2	10	4856	4865	60 %	20 %	20 %	0 %	197336485
56	NC_011185	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	197336485
57	NC_011185	AAT	2	6	4911	4916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
58	NC_011185	TCT	2	6	5005	5010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336485
59	NC_011185	ATTA	2	8	5028	5035	50 %	50 %	0 %	0 %	197336485
60	NC_011185	T	6	6	5074	5079	0 %	100 %	0 %	0 %	197336485
61	NC_011185	TCA	2	6	5089	5094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336485
62	NC_011185	TTC	2	6	5106	5111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336485
63	NC_011185	TAT	2	6	5159	5164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336485
64	NC_011185	TTTTG	2	10	5320	5329	0 %	80 %	20 %	0 %	197336485
65	NC_011185	CTC	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197336485
66	NC_011185	GAT	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336485
67	NC_011185	CTG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336485
68	NC_011185	TGT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336485
69	NC_011185	CTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336485
70	NC_011185	GTTT	2	8	5547	5554	0 %	75 %	25 %	0 %	197336485
71	NC_011185	ATA	2	6	5566	5571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
72	NC_011185	TGT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336485
73	NC_011185	ATA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
74	NC_011185	ATC	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336485
75	NC_011185	GTT	2	6	5737	5742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336485
76	NC_011185	T	7	7	5777	5783	0 %	100 %	0 %	0 %	197336485
77	NC_011185	T	8	8	5792	5799	0 %	100 %	0 %	0 %	197336485
78	NC_011185	ATTAAC	2	12	5802	5813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197336485
79	NC_011185	TAC	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336485
80	NC_011185	TAA	2	6	5918	5923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
81	NC_011185	T	6	6	5955	5960	0 %	100 %	0 %	0 %	197336485
82	NC_011185	ACTT	2	8	6069	6076	25 %	50 %	0 %	25 %	197336564
83	NC_011185	ATA	2	6	6093	6098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
84	NC_011185	ATGA	2	8	6101	6108	50 %	25 %	25 %	0 %	197336564
85	NC_011185	CAT	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
86	NC_011185	GTTG	2	8	6147	6154	0 %	50 %	50 %	0 %	197336564
87	NC_011185	ATTT	2	8	6155	6162	25 %	75 %	0 %	0 %	197336564
88	NC_011185	T	6	6	6160	6165	0 %	100 %	0 %	0 %	197336564
89	NC_011185	A	7	7	6207	6213	100 %	0 %	0 %	0 %	197336564
90	NC_011185	ATC	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
91	NC_011185	CTT	2	6	6247	6252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336564
92	NC_011185	AAT	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
93	NC_011185	ATA	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
94	NC_011185	CAT	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
95	NC_011185	A	6	6	6452	6457	100 %	0 %	0 %	0 %	197336564
96	NC_011185	T	6	6	6459	6464	0 %	100 %	0 %	0 %	197336564
97	NC_011185	TGT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336564
98	NC_011185	AGTG	2	8	6506	6513	25 %	25 %	50 %	0 %	197336564
99	NC_011185	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336564
100	NC_011185	CATT	2	8	6561	6568	25 %	50 %	0 %	25 %	197336564
101	NC_011185	ATT	2	6	6600	6605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336564
102	NC_011185	TAAA	2	8	6622	6629	75 %	25 %	0 %	0 %	197336564
103	NC_011185	GTA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336564
104	NC_011185	T	6	6	6672	6677	0 %	100 %	0 %	0 %	197336564
105	NC_011185	CAA	2	6	6712	6717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336564
106	NC_011185	A	6	6	6766	6771	100 %	0 %	0 %	0 %	197336564
107	NC_011185	TTTC	2	8	6844	6851	0 %	75 %	0 %	25 %	197336564
108	NC_011185	TCA	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
109	NC_011185	TAA	2	6	6888	6893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
110	NC_011185	A	6	6	6901	6906	100 %	0 %	0 %	0 %	197336564
111	NC_011185	TTAA	2	8	6939	6946	50 %	50 %	0 %	0 %	197336564
112	NC_011185	ATGC	2	8	6988	6995	25 %	25 %	25 %	25 %	197336576
113	NC_011185	CTAA	2	8	7072	7079	50 %	25 %	0 %	25 %	197336576
114	NC_011185	AGC	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336576
115	NC_011185	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336576
116	NC_011185	TTCA	2	8	7188	7195	25 %	50 %	0 %	25 %	197336576
117	NC_011185	CAAG	2	8	7265	7272	50 %	0 %	25 %	25 %	197336576
118	NC_011185	TAC	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336576
119	NC_011185	ATT	2	6	7353	7358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336576
120	NC_011185	GCT	2	6	7447	7452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336576
121	NC_011185	TG	3	6	7453	7458	0 %	50 %	50 %	0 %	197336576
122	NC_011185	CTA	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336576
123	NC_011185	T	7	7	7553	7559	0 %	100 %	0 %	0 %	197336517
124	NC_011185	TTC	3	9	7574	7582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336517
125	NC_011185	CTT	2	6	7588	7593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336517
126	NC_011185	TA	3	6	7604	7609	50 %	50 %	0 %	0 %	197336517
127	NC_011185	ATA	2	6	7628	7633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336517
128	NC_011185	GAA	2	6	7680	7685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336517
129	NC_011185	T	8	8	7780	7787	0 %	100 %	0 %	0 %	197336517
130	NC_011185	AG	3	6	7794	7799	50 %	0 %	50 %	0 %	197336517
131	NC_011185	GTT	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336517
132	NC_011185	AAT	2	6	7857	7862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336517
133	NC_011185	T	6	6	7866	7871	0 %	100 %	0 %	0 %	197336517
134	NC_011185	CTAT	2	8	7878	7885	25 %	50 %	0 %	25 %	197336517
135	NC_011185	TGT	2	6	7895	7900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336517
136	NC_011185	AT	3	6	7984	7989	50 %	50 %	0 %	0 %	197336517
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268	NC_011185	TAC	2	6	13978	13983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336490
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394	NC_011185	A	6	6	20264	20269	100 %	0 %	0 %	0 %	197336509
395	NC_011185	TAC	2	6	20307	20312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336509
396	NC_011185	TCA	2	6	20351	20356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336509
397	NC_011185	TTG	2	6	20389	20394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336509
398	NC_011185	CT	3	6	20576	20581	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
399	NC_011185	TCT	2	6	20586	20591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336637
400	NC_011185	AGA	2	6	20630	20635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336637
401	NC_011185	ATT	2	6	20645	20650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336637
402	NC_011185	TCA	2	6	20676	20681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336637
403	NC_011185	GTG	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197336637
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405	NC_011185	ATCAA	2	10	20850	20859	60 %	20 %	0 %	20 %	197336637
406	NC_011185	TTAAT	2	10	20878	20887	40 %	60 %	0 %	0 %	197336637
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499	NC_011185	ATAGA	2	10	25011	25020	60 %	20 %	20 %	0 %	197336513
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