MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 54218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011184	TTCAA	2	10	210660	210669	40 %	40 %	0 %	20 %	197333886
4002	NC_011184	AAG	2	6	210731	210736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333886
4003	NC_011184	ATG	2	6	210814	210819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333886
4004	NC_011184	ATTT	2	8	210860	210867	25 %	75 %	0 %	0 %	197333886
4005	NC_011184	ATT	2	6	211337	211342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334020
4006	NC_011184	CTT	2	6	211346	211351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334020
4007	NC_011184	AGA	2	6	211422	211427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334020
4008	NC_011184	AGC	2	6	211486	211491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334020
4009	NC_011184	ATC	2	6	211536	211541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334020
4010	NC_011184	ATT	2	6	211630	211635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334020
4011	NC_011184	CGG	2	6	211665	211670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334020
4012	NC_011184	TAATT	2	10	211681	211690	40 %	60 %	0 %	0 %	197334020
4013	NC_011184	CGA	2	6	211699	211704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334020
4014	NC_011184	TCT	2	6	211727	211732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334020
4015	NC_011184	TAA	2	6	211767	211772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334020
4016	NC_011184	GAT	2	6	211799	211804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334020
4017	NC_011184	CTG	2	6	211818	211823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334020
4018	NC_011184	TTA	2	6	211866	211871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334020
4019	NC_011184	ATCA	2	8	211911	211918	50 %	25 %	0 %	25 %	197334020
4020	NC_011184	TTTG	2	8	211972	211979	0 %	75 %	25 %	0 %	197334020
4021	NC_011184	TCG	2	6	212002	212007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334020
4022	NC_011184	GTG	2	6	212013	212018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334020
4023	NC_011184	GAT	3	9	212081	212089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334020
4024	NC_011184	ATA	2	6	212121	212126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334020
4025	NC_011184	GA	3	6	212139	212144	50 %	0 %	50 %	0 %	197334020
4026	NC_011184	GGT	3	9	212165	212173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334020
4027	NC_011184	AGA	2	6	212211	212216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334020
4028	NC_011184	CA	3	6	212442	212447	50 %	0 %	0 %	50 %	197334181
4029	NC_011184	ATC	2	6	212481	212486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334181
4030	NC_011184	TA	3	6	212497	212502	50 %	50 %	0 %	0 %	197334181
4031	NC_011184	AAG	2	6	212509	212514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334181
4032	NC_011184	TGGT	2	8	212539	212546	0 %	50 %	50 %	0 %	197334181
4033	NC_011184	GTATT	2	10	212752	212761	20 %	60 %	20 %	0 %	197334181
4034	NC_011184	AGA	2	6	212864	212869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334181
4035	NC_011184	ATTT	2	8	213002	213009	25 %	75 %	0 %	0 %	197334181
4036	NC_011184	GTC	2	6	213025	213030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334181
4037	NC_011184	AGC	2	6	213128	213133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334181
4038	NC_011184	AAG	2	6	213151	213156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334181
4039	NC_011184	TTC	2	6	213202	213207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334181
4040	NC_011184	TCG	2	6	213266	213271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334181
4041	NC_011184	TGA	2	6	213350	213355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334181
4042	NC_011184	CAG	2	6	213654	213659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4043	NC_011184	CTT	2	6	213717	213722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334074
4044	NC_011184	TAC	2	6	213738	213743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334074
4045	NC_011184	TG	3	6	213781	213786	0 %	50 %	50 %	0 %	197334074
4046	NC_011184	CGC	2	6	213789	213794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334074
4047	NC_011184	ATC	2	6	213809	213814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334074
4048	NC_011184	CAG	2	6	213834	213839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4049	NC_011184	AGT	2	6	213845	213850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334074
4050	NC_011184	CTT	2	6	213861	213866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334074
4051	NC_011184	CAA	2	6	213876	213881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334074
4052	NC_011184	CGT	2	6	213984	213989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4053	NC_011184	TTC	2	6	214096	214101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334074
4054	NC_011184	GCC	2	6	214123	214128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334074
4055	NC_011184	GAA	3	9	214132	214140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334074
4056	NC_011184	CTT	2	6	214191	214196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334074
4057	NC_011184	TAG	2	6	214249	214254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334074
4058	NC_011184	CAG	2	6	214263	214268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4059	NC_011184	GCT	2	6	214412	214417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4060	NC_011184	TTC	2	6	214420	214425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334074
4061	NC_011184	CTG	2	6	214503	214508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4062	NC_011184	GTT	2	6	214573	214578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334074
4063	NC_011184	GTA	2	6	214594	214599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334074
4064	NC_011184	AG	3	6	214610	214615	50 %	0 %	50 %	0 %	197334074
4065	NC_011184	GTG	3	9	214683	214691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334074
4066	NC_011184	GTAG	2	8	214716	214723	25 %	25 %	50 %	0 %	197334074
4067	NC_011184	TGC	3	9	214741	214749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4068	NC_011184	CTG	2	6	214758	214763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334074
4069	NC_011184	ATG	2	6	214814	214819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334074
4070	NC_011184	TTG	2	6	214876	214881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334074
4071	NC_011184	ACA	2	6	214931	214936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334074
4072	NC_011184	GT	3	6	215025	215030	0 %	50 %	50 %	0 %	197334074
4073	NC_011184	CTT	2	6	215143	215148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334074
4074	NC_011184	CTC	2	6	215678	215683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197333986
4075	NC_011184	TTCTTG	2	12	215707	215718	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197333986
4076	NC_011184	ACC	2	6	215738	215743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333986
4077	NC_011184	ATAA	2	8	215769	215776	75 %	25 %	0 %	0 %	197333986
4078	NC_011184	TTCCA	2	10	215780	215789	20 %	40 %	0 %	40 %	197333986
4079	NC_011184	ACAA	2	8	215829	215836	75 %	0 %	0 %	25 %	197333986
4080	NC_011184	T	6	6	215870	215875	0 %	100 %	0 %	0 %	197333986
4081	NC_011184	TACT	2	8	215890	215897	25 %	50 %	0 %	25 %	197333986
4082	NC_011184	TAAA	2	8	215986	215993	75 %	25 %	0 %	0 %	197333986
4083	NC_011184	GA	3	6	215995	216000	50 %	0 %	50 %	0 %	197333986
4084	NC_011184	AAAG	2	8	216031	216038	75 %	0 %	25 %	0 %	197333986
4085	NC_011184	CTT	2	6	216079	216084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333986
4086	NC_011184	GTT	2	6	216097	216102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333986
4087	NC_011184	TGA	2	6	216137	216142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333986
4088	NC_011184	CAG	2	6	216161	216166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333986
4089	NC_011184	CAT	3	9	216233	216241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333986
4090	NC_011184	AGCA	2	8	216347	216354	50 %	0 %	25 %	25 %	197333986
4091	NC_011184	TGAG	2	8	216366	216373	25 %	25 %	50 %	0 %	197333986
4092	NC_011184	GCA	2	6	216426	216431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333986
4093	NC_011184	CAT	2	6	216512	216517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333986
4094	NC_011184	GAA	2	6	216683	216688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333986
4095	NC_011184	GCA	2	6	216753	216758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333986
4096	NC_011184	A	6	6	216902	216907	100 %	0 %	0 %	0 %	197333986
4097	NC_011184	CCA	2	6	216913	216918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333986
4098	NC_011184	CGT	2	6	216959	216964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333986
4099	NC_011184	AAG	2	6	217351	217356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333904
4100	NC_011184	CTG	3	9	217396	217404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333904
4101	NC_011184	ACGGT	2	10	217459	217468	20 %	20 %	40 %	20 %	197333904
4102	NC_011184	AAG	2	6	217549	217554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333904
4103	NC_011184	CAT	2	6	217577	217582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333904
4104	NC_011184	TTG	2	6	217588	217593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333904
4105	NC_011184	AAT	2	6	217594	217599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333904
4106	NC_011184	GCT	2	6	217679	217684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334170
4107	NC_011184	ACG	2	6	217704	217709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334170
4108	NC_011184	GTT	2	6	217787	217792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334170
4109	NC_011184	ATG	2	6	217920	217925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334170
4110	NC_011184	ACA	3	9	217940	217948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334170
4111	NC_011184	TGC	2	6	217996	218001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334170
4112	NC_011184	GCT	2	6	218051	218056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334170
4113	NC_011184	GAA	2	6	218207	218212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334170
4114	NC_011184	GTT	2	6	218240	218245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334170
4115	NC_011184	AAG	2	6	218298	218303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334170
4116	NC_011184	CTTG	2	8	218335	218342	0 %	50 %	25 %	25 %	197334170
4117	NC_011184	ACT	2	6	218371	218376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334170
4118	NC_011184	CTT	2	6	218414	218419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334170
4119	NC_011184	ATC	2	6	218420	218425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334170
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4121	NC_011184	CGT	2	6	218525	218530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334170
4122	NC_011184	ACTG	2	8	218557	218564	25 %	25 %	25 %	25 %	197334170
4123	NC_011184	GTT	2	6	218609	218614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334170
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4241	NC_011184	ATTT	2	8	225351	225358	25 %	75 %	0 %	0 %	197334185
4242	NC_011184	GCT	2	6	225374	225379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334185
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4247	NC_011184	TAA	2	6	225480	225485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334185
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4250	NC_011184	GTC	2	6	225651	225656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334185
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4351	NC_011184	TATT	2	8	230860	230867	25 %	75 %	0 %	0 %	197334091
4352	NC_011184	TTC	2	6	230924	230929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334091
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4363	NC_011184	T	6	6	231571	231576	0 %	100 %	0 %	0 %	197334091
4364	NC_011184	TAC	2	6	231611	231616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334091
4365	NC_011184	GCT	2	6	231637	231642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334091
4366	NC_011184	TAT	2	6	231644	231649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334091
4367	NC_011184	GTG	2	6	231658	231663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334091
4368	NC_011184	GAT	2	6	231732	231737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334091
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4471	NC_011184	TTG	2	6	236728	236733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334090
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4473	NC_011184	TCT	2	6	236856	236861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334090
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4479	NC_011184	GGT	2	6	237051	237056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334090
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4485	NC_011184	TTTG	2	8	237364	237371	0 %	75 %	25 %	0 %	197333889
4486	NC_011184	AGA	2	6	237402	237407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333889
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4488	NC_011184	TGC	2	6	237497	237502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334023
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4490	NC_011184	ATG	2	6	237569	237574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334023
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4493	NC_011184	TCAT	2	8	237627	237634	25 %	50 %	0 %	25 %	197334023
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