MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 54218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_011184	CTTA	2	8	2281013	2281020	25 %	50 %	0 %	25 %	197335609
43002	NC_011184	CTT	2	6	2281038	2281043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197335609
43003	NC_011184	ATT	2	6	2281051	2281056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197335609
43004	NC_011184	TA	3	6	2281244	2281249	50 %	50 %	0 %	0 %	197335609
43005	NC_011184	TGA	2	6	2281307	2281312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197335609
43006	NC_011184	CTA	2	6	2281317	2281322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335609
43007	NC_011184	ATTCC	2	10	2281325	2281334	20 %	40 %	0 %	40 %	197335609
43008	NC_011184	GCAAC	2	10	2281369	2281378	40 %	0 %	20 %	40 %	197335609
43009	NC_011184	GAT	2	6	2281419	2281424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197335609
43010	NC_011184	TCT	2	6	2281439	2281444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197335609
43011	NC_011184	CAT	3	9	2281467	2281475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335609
43012	NC_011184	CAA	2	6	2281545	2281550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197335609
43013	NC_011184	TGC	2	6	2281578	2281583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197335609
43014	NC_011184	TCC	2	6	2281605	2281610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197335609
43015	NC_011184	TGG	2	6	2281662	2281667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197335609
43016	NC_011184	A	6	6	2281710	2281715	100 %	0 %	0 %	0 %	197335009
43017	NC_011184	AGTA	2	8	2281739	2281746	50 %	25 %	25 %	0 %	197335009
43018	NC_011184	GAA	2	6	2281764	2281769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335009
43019	NC_011184	TTG	2	6	2281786	2281791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197335009
43020	NC_011184	CCA	2	6	2281813	2281818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197335009
43021	NC_011184	AGA	2	6	2281841	2281846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335009
43022	NC_011184	TCA	2	6	2281864	2281869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335009
43023	NC_011184	CA	3	6	2281948	2281953	50 %	0 %	0 %	50 %	197335009
43024	NC_011184	ACA	2	6	2281966	2281971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197335009
43025	NC_011184	ATA	2	6	2282029	2282034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197335009
43026	NC_011184	GGT	2	6	2282091	2282096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197335009
43027	NC_011184	CAACGT	2	12	2282097	2282108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197335009
43028	NC_011184	TAC	2	6	2282192	2282197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335009
43029	NC_011184	GTT	2	6	2282345	2282350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197335009
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43031	NC_011184	GGT	2	6	2282427	2282432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197335009
43032	NC_011184	GAA	2	6	2282469	2282474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335009
43033	NC_011184	TCTG	2	8	2282514	2282521	0 %	50 %	25 %	25 %	197335009
43034	NC_011184	GAA	2	6	2282565	2282570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335009
43035	NC_011184	TGC	2	6	2282583	2282588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197335009
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43038	NC_011184	TGA	2	6	2282708	2282713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197335009
43039	NC_011184	A	6	6	2282713	2282718	100 %	0 %	0 %	0 %	197335009
43040	NC_011184	GTTA	2	8	2282723	2282730	25 %	50 %	25 %	0 %	197335009
43041	NC_011184	T	6	6	2282751	2282756	0 %	100 %	0 %	0 %	197335009
43042	NC_011184	AAT	2	6	2282812	2282817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197335009
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43046	NC_011184	TTTC	2	8	2283092	2283099	0 %	75 %	0 %	25 %	197334432
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43051	NC_011184	TATT	2	8	2283356	2283363	25 %	75 %	0 %	0 %	197334432
43052	NC_011184	T	6	6	2283362	2283367	0 %	100 %	0 %	0 %	197334432
43053	NC_011184	ACCA	2	8	2283412	2283419	50 %	0 %	0 %	50 %	197334432
43054	NC_011184	AG	3	6	2283421	2283426	50 %	0 %	50 %	0 %	197334432
43055	NC_011184	TCACA	2	10	2283430	2283439	40 %	20 %	0 %	40 %	197334432
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43057	NC_011184	TC	3	6	2283629	2283634	0 %	50 %	0 %	50 %	197335933
43058	NC_011184	GAA	2	6	2283670	2283675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335933
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43060	NC_011184	TCA	2	6	2283712	2283717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335933
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43064	NC_011184	ATACG	2	10	2283879	2283888	40 %	20 %	20 %	20 %	197335933
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43066	NC_011184	TATCG	2	10	2283946	2283955	20 %	40 %	20 %	20 %	197335933
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43071	NC_011184	T	6	6	2284318	2284323	0 %	100 %	0 %	0 %	197335933
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43075	NC_011184	CAT	2	6	2284515	2284520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335933
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43100	NC_011184	TGA	2	6	2286344	2286349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334397
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43102	NC_011184	TGAT	2	8	2286514	2286521	25 %	50 %	25 %	0 %	197334397
43103	NC_011184	A	7	7	2286527	2286533	100 %	0 %	0 %	0 %	197334397
43104	NC_011184	AATTA	2	10	2286553	2286562	60 %	40 %	0 %	0 %	197334397
43105	NC_011184	TGA	2	6	2286731	2286736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334397
43106	NC_011184	TA	3	6	2286760	2286765	50 %	50 %	0 %	0 %	197334397
43107	NC_011184	T	6	6	2286861	2286866	0 %	100 %	0 %	0 %	197334397
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43111	NC_011184	TATT	2	8	2287067	2287074	25 %	75 %	0 %	0 %	197334397
43112	NC_011184	GGT	2	6	2287077	2287082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334397
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43352	NC_011184	ACCA	2	8	2300529	2300536	50 %	0 %	0 %	50 %	197335307
43353	NC_011184	AACC	2	8	2300567	2300574	50 %	0 %	0 %	50 %	197335307
43354	NC_011184	GCT	2	6	2300575	2300580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197335307
43355	NC_011184	GAA	2	6	2300584	2300589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335307
43356	NC_011184	CAT	2	6	2300613	2300618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335307
43357	NC_011184	CAA	2	6	2300627	2300632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197335307
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43359	NC_011184	GCTTT	2	10	2301379	2301388	0 %	60 %	20 %	20 %	197336148
43360	NC_011184	GTA	2	6	2301398	2301403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336148
43361	NC_011184	CTT	2	6	2301412	2301417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336148
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43363	NC_011184	TCAA	2	8	2301508	2301515	50 %	25 %	0 %	25 %	197336148
43364	NC_011184	GTTGCA	2	12	2301616	2301627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197336148
43365	NC_011184	GTG	2	6	2301755	2301760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197336148
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43367	NC_011184	TCT	2	6	2301821	2301826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336148
43368	NC_011184	ATC	2	6	2301829	2301834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336148
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43371	NC_011184	CGT	2	6	2301970	2301975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336148
43372	NC_011184	CAT	2	6	2301986	2301991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336148
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43379	NC_011184	CTG	2	6	2302208	2302213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336148
43380	NC_011184	GCA	2	6	2302222	2302227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336148
43381	NC_011184	ACC	2	6	2302247	2302252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336148
43382	NC_011184	GT	3	6	2302283	2302288	0 %	50 %	50 %	0 %	197336148
43383	NC_011184	GTTA	2	8	2302299	2302306	25 %	50 %	25 %	0 %	197336148
43384	NC_011184	GAT	2	6	2302326	2302331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336148
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43387	NC_011184	GGT	2	6	2302411	2302416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197336148
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43390	NC_011184	TG	4	8	2302550	2302557	0 %	50 %	50 %	0 %	197336148
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43412	NC_011184	TTTTC	2	10	2304002	2304011	0 %	80 %	0 %	20 %	197335642
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43461	NC_011184	CTTT	2	8	2306765	2306772	0 %	75 %	0 %	25 %	197334283
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43468	NC_011184	CTA	2	6	2307190	2307195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334283
43469	NC_011184	CCA	2	6	2307371	2307376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334283
43470	NC_011184	TAA	2	6	2307396	2307401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334283
43471	NC_011184	TTA	2	6	2307429	2307434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334283
43472	NC_011184	TGA	2	6	2307460	2307465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334283
43473	NC_011184	AAATC	2	10	2307484	2307493	60 %	20 %	0 %	20 %	197334283
43474	NC_011184	CTG	2	6	2307513	2307518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334283
43475	NC_011184	ATC	2	6	2307611	2307616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334283
43476	NC_011184	TGG	2	6	2307697	2307702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334283
43477	NC_011184	TAAT	2	8	2307731	2307738	50 %	50 %	0 %	0 %	197334283
43478	NC_011184	CCA	2	6	2307938	2307943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197335850
43479	NC_011184	CA	3	6	2307942	2307947	50 %	0 %	0 %	50 %	197335850
43480	NC_011184	A	8	8	2307990	2307997	100 %	0 %	0 %	0 %	197335850
43481	NC_011184	TGAAAC	2	12	2307999	2308010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197335850
43482	NC_011184	CT	3	6	2308027	2308032	0 %	50 %	0 %	50 %	197335850
43483	NC_011184	CAC	2	6	2308178	2308183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197335850
43484	NC_011184	TTAT	2	8	2308208	2308215	25 %	75 %	0 %	0 %	197335850
43485	NC_011184	ATC	2	6	2308220	2308225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335850
43486	NC_011184	TGTA	2	8	2308271	2308278	25 %	50 %	25 %	0 %	197335850
43487	NC_011184	GCA	2	6	2308285	2308290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197335850
43488	NC_011184	ACC	2	6	2308382	2308387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197335850
43489	NC_011184	TGA	2	6	2308404	2308409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197335850
43490	NC_011184	CTG	2	6	2308448	2308453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197335850
43491	NC_011184	AAG	2	6	2308499	2308504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197335850
43492	NC_011184	AGC	2	6	2308518	2308523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197335850
43493	NC_011184	AAACG	2	10	2308534	2308543	60 %	0 %	20 %	20 %	197335850
43494	NC_011184	ATTC	2	8	2308571	2308578	25 %	50 %	0 %	25 %	197335850
43495	NC_011184	CGTG	2	8	2308596	2308603	0 %	25 %	50 %	25 %	197335850
43496	NC_011184	GAC	2	6	2308651	2308656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197335850
43497	NC_011184	ACT	2	6	2308724	2308729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197335850
43498	NC_011184	CAA	2	6	2308738	2308743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197335850
43499	NC_011184	TGT	2	6	2309063	2309068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197335647
43500	NC_011184	TTA	2	6	2309086	2309091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197335647

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