MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 54218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011184	CCCAT	2	10	162993	163002	20 %	20 %	0 %	60 %	197333993
3002	NC_011184	TCT	2	6	163044	163049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333993
3003	NC_011184	CTC	2	6	163077	163082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197333993
3004	NC_011184	GAAGC	2	10	163083	163092	40 %	0 %	40 %	20 %	197333993
3005	NC_011184	CAA	2	6	163175	163180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333993
3006	NC_011184	ATC	2	6	163185	163190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333993
3007	NC_011184	ACA	2	6	163331	163336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333993
3008	NC_011184	AGA	2	6	163355	163360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333993
3009	NC_011184	TGG	2	6	163361	163366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333993
3010	NC_011184	ATT	3	9	163371	163379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333993
3011	NC_011184	TCA	2	6	163436	163441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333993
3012	NC_011184	A	7	7	163443	163449	100 %	0 %	0 %	0 %	197333993
3013	NC_011184	CAT	2	6	163466	163471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333993
3014	NC_011184	A	6	6	163521	163526	100 %	0 %	0 %	0 %	197333993
3015	NC_011184	AAG	2	6	163537	163542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333993
3016	NC_011184	AAC	2	6	163557	163562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333993
3017	NC_011184	CAT	2	6	163592	163597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333993
3018	NC_011184	ATT	2	6	163662	163667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333993
3019	NC_011184	CGC	2	6	163670	163675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197333993
3020	NC_011184	TG	3	6	163684	163689	0 %	50 %	50 %	0 %	197333993
3021	NC_011184	ATT	2	6	163721	163726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333993
3022	NC_011184	ATT	2	6	163746	163751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333993
3023	NC_011184	CAAC	2	8	163823	163830	50 %	0 %	0 %	50 %	197333993
3024	NC_011184	TGATT	2	10	163892	163901	20 %	60 %	20 %	0 %	197333993
3025	NC_011184	TTG	2	6	163906	163911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333993
3026	NC_011184	GAG	2	6	163920	163925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197333993
3027	NC_011184	AGGA	2	8	163929	163936	50 %	0 %	50 %	0 %	197333993
3028	NC_011184	GGT	2	6	163937	163942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333993
3029	NC_011184	TGT	2	6	163943	163948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333993
3030	NC_011184	GAT	2	6	163959	163964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333993
3031	NC_011184	GCTA	2	8	164014	164021	25 %	25 %	25 %	25 %	197333993
3032	NC_011184	GT	3	6	164192	164197	0 %	50 %	50 %	0 %	197334060
3033	NC_011184	ATT	2	6	164256	164261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334060
3034	NC_011184	TTC	2	6	164304	164309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334060
3035	NC_011184	AT	3	6	164327	164332	50 %	50 %	0 %	0 %	197334060
3036	NC_011184	AG	5	10	164343	164352	50 %	0 %	50 %	0 %	197334060
3037	NC_011184	A	6	6	164365	164370	100 %	0 %	0 %	0 %	197334060
3038	NC_011184	TAT	3	9	164379	164387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334060
3039	NC_011184	TTAC	2	8	164409	164416	25 %	50 %	0 %	25 %	197334060
3040	NC_011184	AAC	2	6	164730	164735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334142
3041	NC_011184	TAA	2	6	164793	164798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334142
3042	NC_011184	AGA	2	6	164799	164804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334142
3043	NC_011184	ATC	2	6	164806	164811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334142
3044	NC_011184	CCAA	2	8	164856	164863	50 %	0 %	0 %	50 %	197334142
3045	NC_011184	AGA	2	6	164868	164873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334142
3046	NC_011184	CAA	2	6	164875	164880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334142
3047	NC_011184	T	6	6	164952	164957	0 %	100 %	0 %	0 %	197334142
3048	NC_011184	ACCT	2	8	164966	164973	25 %	25 %	0 %	50 %	197334142
3049	NC_011184	TGA	2	6	164988	164993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334142
3050	NC_011184	GAT	2	6	165094	165099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334142
3051	NC_011184	CAT	2	6	165137	165142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334142
3052	NC_011184	TGT	2	6	165228	165233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334142
3053	NC_011184	AGA	2	6	165279	165284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334142
3054	NC_011184	CCG	2	6	165606	165611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334229
3055	NC_011184	ATG	2	6	165669	165674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334229
3056	NC_011184	CAG	2	6	165730	165735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334229
3057	NC_011184	TAAG	2	8	165847	165854	50 %	25 %	25 %	0 %	197334229
3058	NC_011184	TTC	2	6	165858	165863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334229
3059	NC_011184	AAGA	2	8	165864	165871	75 %	0 %	25 %	0 %	197334229
3060	NC_011184	ATA	2	6	165884	165889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334229
3061	NC_011184	CTT	2	6	165952	165957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334229
3062	NC_011184	GAT	2	6	165958	165963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334229
3063	NC_011184	ACC	2	6	166076	166081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334229
3064	NC_011184	TTC	2	6	166136	166141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334229
3065	NC_011184	AGG	2	6	166235	166240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197334229
3066	NC_011184	GT	3	6	166443	166448	0 %	50 %	50 %	0 %	197334229
3067	NC_011184	TCA	2	6	166470	166475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334229
3068	NC_011184	ATT	2	6	166514	166519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334229
3069	NC_011184	ATCA	2	8	166544	166551	50 %	25 %	0 %	25 %	197334229
3070	NC_011184	GATT	2	8	166572	166579	25 %	50 %	25 %	0 %	197334229
3071	NC_011184	AAT	2	6	166586	166591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334229
3072	NC_011184	CAA	2	6	166687	166692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334229
3073	NC_011184	ATC	2	6	166703	166708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334229
3074	NC_011184	GTT	2	6	166753	166758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334229
3075	NC_011184	TCA	2	6	166782	166787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334229
3076	NC_011184	ATTG	3	12	166788	166799	25 %	50 %	25 %	0 %	197334229
3077	NC_011184	TCA	2	6	166827	166832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334229
3078	NC_011184	CAC	2	6	166894	166899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334229
3079	NC_011184	AC	3	6	166945	166950	50 %	0 %	0 %	50 %	197334229
3080	NC_011184	GT	3	6	166965	166970	0 %	50 %	50 %	0 %	197334229
3081	NC_011184	ACC	2	6	167078	167083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334229
3082	NC_011184	GCT	2	6	167091	167096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334229
3083	NC_011184	GCC	2	6	167129	167134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334229
3084	NC_011184	ACC	2	6	167303	167308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334229
3085	NC_011184	CT	3	6	167349	167354	0 %	50 %	0 %	50 %	197334229
3086	NC_011184	GCT	2	6	167423	167428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334229
3087	NC_011184	GTG	2	6	167504	167509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334229
3088	NC_011184	ATT	2	6	167516	167521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334229
3089	NC_011184	ACC	2	6	167591	167596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334229
3090	NC_011184	ACT	2	6	167622	167627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334229
3091	NC_011184	TCA	2	6	167773	167778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334229
3092	NC_011184	TTA	2	6	167793	167798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333940
3093	NC_011184	GTTT	2	8	167896	167903	0 %	75 %	25 %	0 %	197333940
3094	NC_011184	CAG	2	6	167971	167976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333940
3095	NC_011184	AGA	2	6	167978	167983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333940
3096	NC_011184	TCA	2	6	168006	168011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333940
3097	NC_011184	TGC	2	6	168043	168048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333940
3098	NC_011184	AATC	2	8	168055	168062	50 %	25 %	0 %	25 %	197333940
3099	NC_011184	A	7	7	168068	168074	100 %	0 %	0 %	0 %	197333940
3100	NC_011184	A	6	6	168175	168180	100 %	0 %	0 %	0 %	197333940
3101	NC_011184	GTG	2	6	168197	168202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333940
3102	NC_011184	A	6	6	168256	168261	100 %	0 %	0 %	0 %	197333940
3103	NC_011184	TC	3	6	168268	168273	0 %	50 %	0 %	50 %	197333940
3104	NC_011184	GCT	2	6	168289	168294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333940
3105	NC_011184	A	6	6	168517	168522	100 %	0 %	0 %	0 %	197333940
3106	NC_011184	GAA	2	6	168528	168533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333940
3107	NC_011184	TAC	2	6	168659	168664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333903
3108	NC_011184	AAT	2	6	168703	168708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333903
3109	NC_011184	GGAT	2	8	168718	168725	25 %	25 %	50 %	0 %	197333903
3110	NC_011184	CAA	2	6	168733	168738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333903
3111	NC_011184	TGT	2	6	168764	168769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333903
3112	NC_011184	TAAA	2	8	168820	168827	75 %	25 %	0 %	0 %	197333903
3113	NC_011184	T	6	6	168876	168881	0 %	100 %	0 %	0 %	197333903
3114	NC_011184	AAG	2	6	168895	168900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333903
3115	NC_011184	GAA	3	9	168909	168917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333903
3116	NC_011184	C	6	6	168975	168980	0 %	0 %	0 %	100 %	197333903
3117	NC_011184	ATC	2	6	168990	168995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333903
3118	NC_011184	AGA	2	6	169004	169009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333903
3119	NC_011184	TTC	2	6	169044	169049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333903
3120	NC_011184	CCA	2	6	169083	169088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333903
3121	NC_011184	GCT	2	6	169103	169108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333903
3122	NC_011184	TGC	2	6	169131	169136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333903
3123	NC_011184	CAT	2	6	169150	169155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333903
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3155	NC_011184	TCA	2	6	171533	171538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333953
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3491	NC_011184	TGC	2	6	187843	187848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334040
3492	NC_011184	GCTA	2	8	187849	187856	25 %	25 %	25 %	25 %	197334040
3493	NC_011184	TG	3	6	187894	187899	0 %	50 %	50 %	0 %	197334040
3494	NC_011184	AGCC	2	8	188046	188053	25 %	0 %	25 %	50 %	197334040
3495	NC_011184	CGT	2	6	188129	188134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334040
3496	NC_011184	CAT	2	6	188180	188185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334040
3497	NC_011184	TCT	2	6	188207	188212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334040
3498	NC_011184	TTC	2	6	188258	188263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334040
3499	NC_011184	GTGA	2	8	188288	188295	25 %	25 %	50 %	0 %	197334040
3500	NC_011184	AAT	2	6	188433	188438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334040

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