MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 54218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011184	CTAA	2	8	238115	238122	50 %	25 %	0 %	25 %	197334000
4502	NC_011184	CGG	2	6	238147	238152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334000
4503	NC_011184	GTT	2	6	238181	238186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334000
4504	NC_011184	GTG	2	6	238194	238199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334000
4505	NC_011184	CGT	2	6	238422	238427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334072
4506	NC_011184	GCT	2	6	238478	238483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334072
4507	NC_011184	CTG	2	6	238528	238533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334072
4508	NC_011184	A	6	6	238534	238539	100 %	0 %	0 %	0 %	197334072
4509	NC_011184	GAA	2	6	238602	238607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334072
4510	NC_011184	GTGG	2	8	238653	238660	0 %	25 %	75 %	0 %	197334072
4511	NC_011184	GTG	2	6	238747	238752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334072
4512	NC_011184	ACT	4	12	239087	239098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334243
4513	NC_011184	GCA	2	6	239156	239161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334243
4514	NC_011184	TGGA	2	8	239171	239178	25 %	25 %	50 %	0 %	197334243
4515	NC_011184	GCAAGA	2	12	239179	239190	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	197334243
4516	NC_011184	ATC	2	6	239273	239278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334243
4517	NC_011184	GTT	2	6	239345	239350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334243
4518	NC_011184	TCCAA	2	10	239518	239527	40 %	20 %	0 %	40 %	197334243
4519	NC_011184	GTG	2	6	239556	239561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334243
4520	NC_011184	TTG	2	6	239562	239567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334243
4521	NC_011184	GAA	2	6	239630	239635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4522	NC_011184	GAA	2	6	239663	239668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4523	NC_011184	AGC	2	6	239689	239694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334243
4524	NC_011184	GAA	2	6	239738	239743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4525	NC_011184	AAG	2	6	239763	239768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4526	NC_011184	TGC	2	6	239962	239967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334243
4527	NC_011184	TTG	2	6	239997	240002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334243
4528	NC_011184	TA	3	6	240057	240062	50 %	50 %	0 %	0 %	197334243
4529	NC_011184	GAA	2	6	240125	240130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4530	NC_011184	AAG	2	6	240135	240140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4531	NC_011184	TGC	3	9	240157	240165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334243
4532	NC_011184	AAC	2	6	240184	240189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334243
4533	NC_011184	TG	3	6	240201	240206	0 %	50 %	50 %	0 %	197334243
4534	NC_011184	A	6	6	240297	240302	100 %	0 %	0 %	0 %	197334243
4535	NC_011184	AGA	2	6	240331	240336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4536	NC_011184	TGA	2	6	240358	240363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334243
4537	NC_011184	TAC	2	6	240499	240504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334243
4538	NC_011184	TGG	2	6	240535	240540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334243
4539	NC_011184	TTG	2	6	240606	240611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334243
4540	NC_011184	GGT	2	6	240623	240628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334243
4541	NC_011184	ATG	2	6	240845	240850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334243
4542	NC_011184	AGA	2	6	240871	240876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334243
4543	NC_011184	TGT	2	6	240889	240894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334243
4544	NC_011184	CGC	2	6	240911	240916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334243
4545	NC_011184	ATC	2	6	241094	241099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334243
4546	NC_011184	ATA	2	6	241111	241116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334243
4547	NC_011184	AAC	2	6	241297	241302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333959
4548	NC_011184	GCT	2	6	241310	241315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333959
4549	NC_011184	TAC	2	6	241321	241326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333959
4550	NC_011184	CGG	2	6	241342	241347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197333959
4551	NC_011184	TGC	2	6	241507	241512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333959
4552	NC_011184	ATGG	2	8	241517	241524	25 %	25 %	50 %	0 %	197333959
4553	NC_011184	GTT	2	6	241535	241540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333959
4554	NC_011184	GTC	2	6	241590	241595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333959
4555	NC_011184	CAT	2	6	241612	241617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333959
4556	NC_011184	TGA	3	9	241645	241653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333959
4557	NC_011184	CTT	2	6	241691	241696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333959
4558	NC_011184	TGA	2	6	241717	241722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333959
4559	NC_011184	CTA	2	6	241856	241861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333959
4560	NC_011184	ACA	2	6	241973	241978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333959
4561	NC_011184	ACT	2	6	241982	241987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333959
4562	NC_011184	ACT	2	6	242053	242058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333959
4563	NC_011184	TGA	2	6	242074	242079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333959
4564	NC_011184	TGC	2	6	242101	242106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333959
4565	NC_011184	TCAA	2	8	242114	242121	50 %	25 %	0 %	25 %	197333959
4566	NC_011184	CA	3	6	242124	242129	50 %	0 %	0 %	50 %	197333959
4567	NC_011184	TTCT	2	8	242154	242161	0 %	75 %	0 %	25 %	197333959
4568	NC_011184	GGC	2	6	242171	242176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197333959
4569	NC_011184	TTC	2	6	242189	242194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333959
4570	NC_011184	GTT	2	6	242384	242389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333959
4571	NC_011184	CTAC	2	8	242943	242950	25 %	25 %	0 %	50 %	197334021
4572	NC_011184	TTG	2	6	243046	243051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334021
4573	NC_011184	TGC	2	6	243095	243100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334021
4574	NC_011184	GTCG	2	8	243156	243163	0 %	25 %	50 %	25 %	197333952
4575	NC_011184	GAA	2	6	243192	243197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333952
4576	NC_011184	TGT	2	6	243218	243223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333952
4577	NC_011184	GAA	2	6	243405	243410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333952
4578	NC_011184	A	6	6	243456	243461	100 %	0 %	0 %	0 %	197333952
4579	NC_011184	A	7	7	243618	243624	100 %	0 %	0 %	0 %	197333952
4580	NC_011184	CTT	2	6	243702	243707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333952
4581	NC_011184	ACT	2	6	243836	243841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334113
4582	NC_011184	AGT	2	6	243877	243882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334113
4583	NC_011184	GCA	2	6	243893	243898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334113
4584	NC_011184	A	6	6	243924	243929	100 %	0 %	0 %	0 %	197334113
4585	NC_011184	GGT	2	6	244028	244033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334113
4586	NC_011184	TGC	2	6	244042	244047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334113
4587	NC_011184	A	7	7	244079	244085	100 %	0 %	0 %	0 %	197334113
4588	NC_011184	GTG	2	6	244092	244097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334113
4589	NC_011184	TTCT	2	8	244110	244117	0 %	75 %	0 %	25 %	197334113
4590	NC_011184	AGTT	2	8	244119	244126	25 %	50 %	25 %	0 %	197334113
4591	NC_011184	GCT	2	6	244265	244270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334113
4592	NC_011184	CTGCAG	2	12	244353	244364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197334113
4593	NC_011184	GAG	2	6	244376	244381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197334113
4594	NC_011184	CTA	2	6	244408	244413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334063
4595	NC_011184	CAA	2	6	244448	244453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334063
4596	NC_011184	GCT	2	6	244456	244461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334063
4597	NC_011184	A	6	6	244507	244512	100 %	0 %	0 %	0 %	197334063
4598	NC_011184	AGC	2	6	244521	244526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334063
4599	NC_011184	GTT	2	6	244536	244541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334063
4600	NC_011184	TGAAGT	2	12	244542	244553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334063
4601	NC_011184	CGT	2	6	244615	244620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334063
4602	NC_011184	A	6	6	244630	244635	100 %	0 %	0 %	0 %	197334063
4603	NC_011184	CGTA	2	8	244637	244644	25 %	25 %	25 %	25 %	197334063
4604	NC_011184	AAG	2	6	244652	244657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334063
4605	NC_011184	AGACTT	2	12	244662	244673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334063
4606	NC_011184	GGC	2	6	244678	244683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334063
4607	NC_011184	GTC	3	9	244742	244750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333916
4608	NC_011184	GTT	2	6	244753	244758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333916
4609	NC_011184	CAC	2	6	244799	244804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333916
4610	NC_011184	GGT	2	6	244828	244833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333916
4611	NC_011184	TGG	3	9	244869	244877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333916
4612	NC_011184	TGT	2	6	244935	244940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333916
4613	NC_011184	CGT	2	6	245008	245013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333916
4614	NC_011184	GC	3	6	245159	245164	0 %	0 %	50 %	50 %	197333916
4615	NC_011184	CTG	2	6	245177	245182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333916
4616	NC_011184	TTCT	2	8	245258	245265	0 %	75 %	0 %	25 %	197333916
4617	NC_011184	GGT	3	9	245404	245412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333916
4618	NC_011184	GTC	2	6	245432	245437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333916
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4620	NC_011184	AAT	2	6	245528	245533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333916
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4851	NC_011184	ACA	3	9	258089	258097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334019
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4980	NC_011184	TAC	2	6	264446	264451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333950
4981	NC_011184	TATGAT	2	12	264529	264540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197333950
4982	NC_011184	AGA	3	9	264549	264557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333950
4983	NC_011184	ATG	2	6	264620	264625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333950
4984	NC_011184	ATT	2	6	264682	264687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333950
4985	NC_011184	ATC	2	6	264690	264695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333950
4986	NC_011184	AGC	2	6	264696	264701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333950
4987	NC_011184	CAAGCT	2	12	264712	264723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197333950
4988	NC_011184	GT	3	6	264770	264775	0 %	50 %	50 %	0 %	197333950
4989	NC_011184	TTAAT	2	10	264824	264833	40 %	60 %	0 %	0 %	197333950
4990	NC_011184	ATG	2	6	264883	264888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333950
4991	NC_011184	AGA	2	6	264936	264941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333950
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4993	NC_011184	GAAA	2	8	265020	265027	75 %	0 %	25 %	0 %	197333950
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4995	NC_011184	AGCA	2	8	265085	265092	50 %	0 %	25 %	25 %	197333950
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4999	NC_011184	ACTT	2	8	265289	265296	25 %	50 %	0 %	25 %	197333950
5000	NC_011184	TTGC	2	8	265384	265391	0 %	50 %	25 %	25 %	197333950

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