MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009456	GCG	2	6	233264	233269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671586
4002	NC_009456	AAT	2	6	233271	233276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671586
4003	NC_009456	GC	3	6	233279	233284	0 %	0 %	50 %	50 %	147671586
4004	NC_009456	CGG	2	6	233319	233324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671586
4005	NC_009456	TAC	2	6	233340	233345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671586
4006	NC_009456	GCG	2	6	233350	233355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671586
4007	NC_009456	CGC	2	6	233397	233402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671586
4008	NC_009456	GGC	2	6	233483	233488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671586
4009	NC_009456	CGC	2	6	233507	233512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671586
4010	NC_009456	CGC	2	6	233559	233564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671586
4011	NC_009456	GT	3	6	233745	233750	0 %	50 %	50 %	0 %	147671586
4012	NC_009456	GAT	2	6	234052	234057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672361
4013	NC_009456	TGA	2	6	234069	234074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672361
4014	NC_009456	CAGC	2	8	234090	234097	25 %	0 %	25 %	50 %	147672361
4015	NC_009456	CAAGC	2	10	234160	234169	40 %	0 %	20 %	40 %	147672361
4016	NC_009456	AGA	2	6	234241	234246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672361
4017	NC_009456	ACA	2	6	234261	234266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672361
4018	NC_009456	ACA	2	6	234273	234278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672361
4019	NC_009456	TG	3	6	234337	234342	0 %	50 %	50 %	0 %	147672361
4020	NC_009456	A	6	6	234395	234400	100 %	0 %	0 %	0 %	147672361
4021	NC_009456	AGA	2	6	234402	234407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672361
4022	NC_009456	AAACAC	2	12	234409	234420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672361
4023	NC_009456	GTG	2	6	234423	234428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672361
4024	NC_009456	GC	3	6	234493	234498	0 %	0 %	50 %	50 %	147672361
4025	NC_009456	AACGT	2	10	234552	234561	40 %	20 %	20 %	20 %	147672361
4026	NC_009456	AAG	2	6	234578	234583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672361
4027	NC_009456	AGCC	2	8	234680	234687	25 %	0 %	25 %	50 %	147672361
4028	NC_009456	GAG	2	6	234746	234751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147672361
4029	NC_009456	CAGC	2	8	234841	234848	25 %	0 %	25 %	50 %	147671730
4030	NC_009456	CAG	2	6	234852	234857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671730
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4032	NC_009456	TCT	2	6	234896	234901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671730
4033	NC_009456	AGGA	2	8	234955	234962	50 %	0 %	50 %	0 %	147671730
4034	NC_009456	CTT	2	6	235044	235049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671730
4035	NC_009456	TCA	2	6	235067	235072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671730
4036	NC_009456	GCA	2	6	235077	235082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671730
4037	NC_009456	TTA	2	6	235160	235165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671730
4038	NC_009456	T	6	6	235306	235311	0 %	100 %	0 %	0 %	147671730
4039	NC_009456	CAG	2	6	235315	235320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671730
4040	NC_009456	AAT	2	6	235327	235332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671730
4041	NC_009456	CGG	2	6	235377	235382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671730
4042	NC_009456	GT	3	6	235509	235514	0 %	50 %	50 %	0 %	147671730
4043	NC_009456	CTG	2	6	235524	235529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671730
4044	NC_009456	CAA	2	6	235549	235554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671730
4045	NC_009456	GTAA	2	8	235559	235566	50 %	25 %	25 %	0 %	147671730
4046	NC_009456	AAT	2	6	235601	235606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671730
4047	NC_009456	GC	3	6	235664	235669	0 %	0 %	50 %	50 %	147672412
4048	NC_009456	AAC	2	6	235717	235722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672412
4049	NC_009456	AGAT	2	8	235723	235730	50 %	25 %	25 %	0 %	147672412
4050	NC_009456	CGC	2	6	235731	235736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672412
4051	NC_009456	GTG	2	6	235795	235800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672412
4052	NC_009456	A	6	6	235920	235925	100 %	0 %	0 %	0 %	147672412
4053	NC_009456	AGCG	2	8	235939	235946	25 %	0 %	50 %	25 %	147672412
4054	NC_009456	CGC	2	6	235985	235990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672412
4055	NC_009456	AGG	2	6	236089	236094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147672412
4056	NC_009456	GCG	2	6	236111	236116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672412
4057	NC_009456	TGAC	2	8	236172	236179	25 %	25 %	25 %	25 %	147672412
4058	NC_009456	GCA	2	6	236180	236185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672412
4059	NC_009456	GGT	2	6	236190	236195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672412
4060	NC_009456	CCAAAG	2	12	236201	236212	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	147672412
4061	NC_009456	CCA	2	6	236277	236282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672412
4062	NC_009456	CAT	2	6	236394	236399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672412
4063	NC_009456	GGC	2	6	236406	236411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672412
4064	NC_009456	CAG	2	6	236415	236420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672412
4065	NC_009456	ATC	2	6	236440	236445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672412
4066	NC_009456	TTG	2	6	236471	236476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671833
4067	NC_009456	AAC	2	6	236502	236507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671833
4068	NC_009456	CAT	2	6	236603	236608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671833
4069	NC_009456	TCA	2	6	236688	236693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671833
4070	NC_009456	TGCA	2	8	236712	236719	25 %	25 %	25 %	25 %	147671833
4071	NC_009456	GAGC	2	8	236724	236731	25 %	0 %	50 %	25 %	147671833
4072	NC_009456	GTT	2	6	236743	236748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671833
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4075	NC_009456	CTT	2	6	236836	236841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671833
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4087	NC_009456	TGC	2	6	237598	237603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671471
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4093	NC_009456	TGC	2	6	237847	237852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671471
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4103	NC_009456	TGA	2	6	238246	238251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671471
4104	NC_009456	GCG	2	6	238317	238322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671471
4105	NC_009456	TGA	2	6	238357	238362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671471
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4110	NC_009456	GTT	2	6	238851	238856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671984
4111	NC_009456	GCGT	2	8	238903	238910	0 %	25 %	50 %	25 %	147671984
4112	NC_009456	TATC	2	8	239070	239077	25 %	50 %	0 %	25 %	147671631
4113	NC_009456	TGT	2	6	239115	239120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671631
4114	NC_009456	AG	3	6	239242	239247	50 %	0 %	50 %	0 %	147671631
4115	NC_009456	AGCA	2	8	239325	239332	50 %	0 %	25 %	25 %	147671631
4116	NC_009456	CCA	2	6	239415	239420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671631
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4118	NC_009456	TTA	2	6	239552	239557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671631
4119	NC_009456	AGCTG	2	10	239593	239602	20 %	20 %	40 %	20 %	147671631
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4121	NC_009456	GC	3	6	239750	239755	0 %	0 %	50 %	50 %	147671631
4122	NC_009456	GCA	2	6	239830	239835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671631
4123	NC_009456	TGCTC	2	10	239845	239854	0 %	40 %	20 %	40 %	147671631
4124	NC_009456	TGC	2	6	239962	239967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671631
4125	NC_009456	CTG	3	9	240012	240020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671631
4126	NC_009456	GC	3	6	240047	240052	0 %	0 %	50 %	50 %	147671631
4127	NC_009456	A	6	6	240072	240077	100 %	0 %	0 %	0 %	147671631
4128	NC_009456	GCT	2	6	240199	240204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671631
4129	NC_009456	TGAA	2	8	240237	240244	50 %	25 %	25 %	0 %	147671631
4130	NC_009456	CG	3	6	240398	240403	0 %	0 %	50 %	50 %	147671631
4131	NC_009456	CGT	2	6	240446	240451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671631
4132	NC_009456	TAA	2	6	240520	240525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671631
4133	NC_009456	TTG	2	6	240575	240580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671631
4134	NC_009456	GCG	2	6	240590	240595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671631
4135	NC_009456	CG	3	6	240604	240609	0 %	0 %	50 %	50 %	147671631
4136	NC_009456	GGT	2	6	240637	240642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671631
4137	NC_009456	ATCG	2	8	240817	240824	25 %	25 %	25 %	25 %	147671631
4138	NC_009456	GCG	2	6	240872	240877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671631
4139	NC_009456	AGTC	2	8	240892	240899	25 %	25 %	25 %	25 %	147671631
4140	NC_009456	CAG	2	6	240976	240981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671631
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4143	NC_009456	AGG	2	6	241041	241046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671631
4144	NC_009456	CTA	2	6	241084	241089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672363
4145	NC_009456	GC	3	6	241131	241136	0 %	0 %	50 %	50 %	147672363
4146	NC_009456	GAT	2	6	241138	241143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672363
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4148	NC_009456	GCC	2	6	241292	241297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672363
4149	NC_009456	TGA	2	6	241302	241307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672363
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4152	NC_009456	T	6	6	241519	241524	0 %	100 %	0 %	0 %	147672363
4153	NC_009456	ATT	2	6	241631	241636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672363
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4158	NC_009456	ATG	2	6	242092	242097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672363
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4160	NC_009456	TGA	2	6	242172	242177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672363
4161	NC_009456	TTGG	2	8	242203	242210	0 %	50 %	50 %	0 %	147672363
4162	NC_009456	CGA	2	6	242330	242335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672363
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4168	NC_009456	CAACT	2	10	242966	242975	40 %	20 %	0 %	40 %	147671744
4169	NC_009456	GCTG	2	8	243261	243268	0 %	25 %	50 %	25 %	147671512
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4195	NC_009456	AG	3	6	244391	244396	50 %	0 %	50 %	0 %	147671512
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4212	NC_009456	TTTC	2	8	245530	245537	0 %	75 %	0 %	25 %	147672239
4213	NC_009456	TTCA	2	8	245556	245563	25 %	50 %	0 %	25 %	147672239
4214	NC_009456	T	6	6	245704	245709	0 %	100 %	0 %	0 %	147671441
4215	NC_009456	CTG	2	6	245821	245826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671441
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4218	NC_009456	GAG	2	6	245927	245932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671441
4219	NC_009456	TGC	2	6	246052	246057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671441
4220	NC_009456	GTT	2	6	246100	246105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671441
4221	NC_009456	TTG	2	6	246152	246157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671441
4222	NC_009456	GT	3	6	246167	246172	0 %	50 %	50 %	0 %	147671441
4223	NC_009456	CGG	2	6	246183	246188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671441
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4225	NC_009456	CAG	2	6	246217	246222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671441
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4227	NC_009456	TTGTGT	2	12	246356	246367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671441
4228	NC_009456	CGCCA	2	10	246510	246519	20 %	0 %	20 %	60 %	147671441
4229	NC_009456	CCAA	2	8	246562	246569	50 %	0 %	0 %	50 %	147671441
4230	NC_009456	GCA	2	6	246639	246644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671441
4231	NC_009456	CTT	2	6	246678	246683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671441
4232	NC_009456	TCA	2	6	246692	246697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671441
4233	NC_009456	GGC	2	6	246715	246720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671441
4234	NC_009456	CGAAA	2	10	246726	246735	60 %	0 %	20 %	20 %	147671441
4235	NC_009456	TTGG	2	8	246799	246806	0 %	50 %	50 %	0 %	147671441
4236	NC_009456	TAG	2	6	246866	246871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671441
4237	NC_009456	CAC	2	6	246937	246942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671441
4238	NC_009456	TGG	2	6	246984	246989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671441
4239	NC_009456	AAT	2	6	247065	247070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671441
4240	NC_009456	CATCT	2	10	247267	247276	20 %	40 %	0 %	40 %	147671441
4241	NC_009456	TCA	2	6	247433	247438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671441
4242	NC_009456	AG	3	6	247557	247562	50 %	0 %	50 %	0 %	147671441
4243	NC_009456	TTCATT	2	12	247655	247666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	147671441
4244	NC_009456	A	6	6	248100	248105	100 %	0 %	0 %	0 %	147672344
4245	NC_009456	TGC	2	6	248117	248122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672344
4246	NC_009456	GTC	2	6	248248	248253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672344
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4249	NC_009456	GCG	2	6	248356	248361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672344
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4489	NC_009456	CCA	2	6	262252	262257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672283
4490	NC_009456	GGTGC	2	10	262278	262287	0 %	20 %	60 %	20 %	147672283
4491	NC_009456	CTT	2	6	262327	262332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672283
4492	NC_009456	TCTA	2	8	262396	262403	25 %	50 %	0 %	25 %	147672283
4493	NC_009456	AGA	2	6	262421	262426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672283
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