MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_009456	GAA	2	6	204748	204753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672108
3503	NC_009456	AGTTAG	2	12	204770	204781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672108
3504	NC_009456	AGAC	2	8	204793	204800	50 %	0 %	25 %	25 %	147672108
3505	NC_009456	TAC	2	6	204829	204834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672108
3506	NC_009456	TGGT	2	8	204906	204913	0 %	50 %	50 %	0 %	147672108
3507	NC_009456	AAG	2	6	204917	204922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672108
3508	NC_009456	AGC	2	6	204927	204932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672108
3509	NC_009456	ATTG	2	8	205023	205030	25 %	50 %	25 %	0 %	147672108
3510	NC_009456	GCC	2	6	205036	205041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672108
3511	NC_009456	AGC	2	6	205340	205345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672108
3512	NC_009456	CTTG	2	8	205392	205399	0 %	50 %	25 %	25 %	147672108
3513	NC_009456	TCG	2	6	205503	205508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672108
3514	NC_009456	CAA	2	6	205557	205562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672108
3515	NC_009456	TCG	2	6	205565	205570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672108
3516	NC_009456	A	6	6	205590	205595	100 %	0 %	0 %	0 %	147672108
3517	NC_009456	GCC	2	6	205642	205647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672108
3518	NC_009456	GAA	2	6	205770	205775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672108
3519	NC_009456	CAA	2	6	205822	205827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672108
3520	NC_009456	ATC	2	6	205879	205884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672108
3521	NC_009456	CCA	2	6	205916	205921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672108
3522	NC_009456	CGC	2	6	205974	205979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672108
3523	NC_009456	GCG	2	6	205987	205992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672108
3524	NC_009456	GGT	2	6	206022	206027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672108
3525	NC_009456	CAC	3	9	206112	206120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672108
3526	NC_009456	TGG	2	6	206153	206158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672108
3527	NC_009456	CAG	2	6	206221	206226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672108
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3529	NC_009456	CGG	2	6	206282	206287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672108
3530	NC_009456	GAA	2	6	206338	206343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672108
3531	NC_009456	GCA	2	6	206358	206363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672108
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3534	NC_009456	CT	3	6	207289	207294	0 %	50 %	0 %	50 %	147671701
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3539	NC_009456	GGAT	2	8	207604	207611	25 %	25 %	50 %	0 %	147671701
3540	NC_009456	GCT	2	6	207612	207617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671701
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3542	NC_009456	CAC	2	6	207704	207709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671701
3543	NC_009456	TGC	2	6	207723	207728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671701
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3545	NC_009456	CCA	2	6	207770	207775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671701
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3550	NC_009456	CG	3	6	208005	208010	0 %	0 %	50 %	50 %	147671701
3551	NC_009456	CAT	2	6	208023	208028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671701
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3553	NC_009456	TGC	2	6	208082	208087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671701
3554	NC_009456	GC	3	6	208135	208140	0 %	0 %	50 %	50 %	147671701
3555	NC_009456	GTA	2	6	208157	208162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671701
3556	NC_009456	ACA	2	6	208206	208211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671701
3557	NC_009456	GAT	2	6	208219	208224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671701
3558	NC_009456	TGC	2	6	208292	208297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671701
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3561	NC_009456	GAA	2	6	208390	208395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671701
3562	NC_009456	TCAA	2	8	208409	208416	50 %	25 %	0 %	25 %	147671701
3563	NC_009456	TGA	2	6	208442	208447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671701
3564	NC_009456	AG	3	6	208452	208457	50 %	0 %	50 %	0 %	147671701
3565	NC_009456	GTG	3	9	208493	208501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671701
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3568	NC_009456	GAT	2	6	208537	208542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671701
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3570	NC_009456	CAGGG	2	10	208568	208577	20 %	0 %	60 %	20 %	147671701
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3591	NC_009456	CGT	2	6	210005	210010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671454
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3594	NC_009456	A	6	6	210050	210055	100 %	0 %	0 %	0 %	147671454
3595	NC_009456	TTGC	2	8	210081	210088	0 %	50 %	25 %	25 %	147671454
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3613	NC_009456	TGGG	2	8	210662	210669	0 %	25 %	75 %	0 %	147671454
3614	NC_009456	ATG	2	6	210689	210694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671454
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3619	NC_009456	CAC	2	6	210815	210820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671454
3620	NC_009456	TGC	2	6	210873	210878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671454
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3749	NC_009456	GGAAT	2	10	218617	218626	40 %	20 %	40 %	0 %	147672207
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3863	NC_009456	TGGT	2	8	225879	225886	0 %	50 %	50 %	0 %	147672234
3864	NC_009456	GC	3	6	225926	225931	0 %	0 %	50 %	50 %	147672234
3865	NC_009456	A	6	6	225978	225983	100 %	0 %	0 %	0 %	147672234
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3989	NC_009456	CG	3	6	232831	232836	0 %	0 %	50 %	50 %	147671586
3990	NC_009456	CAAG	2	8	232873	232880	50 %	0 %	25 %	25 %	147671586
3991	NC_009456	T	6	6	232893	232898	0 %	100 %	0 %	0 %	147671586
3992	NC_009456	ATCC	2	8	232917	232924	25 %	25 %	0 %	50 %	147671586
3993	NC_009456	CTT	2	6	232931	232936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671586
3994	NC_009456	GCT	2	6	232995	233000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671586
3995	NC_009456	TGC	2	6	233104	233109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671586
3996	NC_009456	TCA	2	6	233155	233160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671586
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3998	NC_009456	TTG	2	6	233181	233186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671586
3999	NC_009456	TGC	2	6	233221	233226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671586
4000	NC_009456	CAT	2	6	233258	233263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671586

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