MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009456	GAA	2	6	177003	177008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672062
3002	NC_009456	GCC	2	6	177012	177017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672062
3003	NC_009456	GCG	2	6	177093	177098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672062
3004	NC_009456	A	6	6	177099	177104	100 %	0 %	0 %	0 %	147672062
3005	NC_009456	TGGT	2	8	177124	177131	0 %	50 %	50 %	0 %	147672062
3006	NC_009456	CAAT	2	8	177154	177161	50 %	25 %	0 %	25 %	147672062
3007	NC_009456	CAT	2	6	177185	177190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672062
3008	NC_009456	TGAT	2	8	177196	177203	25 %	50 %	25 %	0 %	147672062
3009	NC_009456	TTG	2	6	177225	177230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672062
3010	NC_009456	TGC	2	6	177239	177244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672062
3011	NC_009456	GCG	2	6	177252	177257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672062
3012	NC_009456	GCG	2	6	177333	177338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672062
3013	NC_009456	TGAA	2	8	177379	177386	50 %	25 %	25 %	0 %	147672062
3014	NC_009456	TTG	2	6	177430	177435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672062
3015	NC_009456	CGC	2	6	177473	177478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672062
3016	NC_009456	TGA	2	6	177506	177511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672062
3017	NC_009456	TGC	2	6	177527	177532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672062
3018	NC_009456	CAG	2	6	177549	177554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672062
3019	NC_009456	TGG	2	6	177565	177570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672062
3020	NC_009456	GCG	2	6	177582	177587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672062
3021	NC_009456	AGTC	2	8	177588	177595	25 %	25 %	25 %	25 %	147672062
3022	NC_009456	GCT	2	6	177617	177622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672062
3023	NC_009456	TGA	2	6	177628	177633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672062
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3025	NC_009456	GCAT	2	8	177718	177725	25 %	25 %	25 %	25 %	147672062
3026	NC_009456	AGA	2	6	177773	177778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672062
3027	NC_009456	GAA	2	6	177792	177797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672062
3028	NC_009456	TGA	2	6	178009	178014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671444
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3030	NC_009456	CAT	2	6	178079	178084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671444
3031	NC_009456	CGT	2	6	178340	178345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671444
3032	NC_009456	ATCTT	2	10	178467	178476	20 %	60 %	0 %	20 %	147671444
3033	NC_009456	TGA	2	6	178488	178493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671444
3034	NC_009456	TTGA	2	8	178523	178530	25 %	50 %	25 %	0 %	147671444
3035	NC_009456	AG	3	6	178582	178587	50 %	0 %	50 %	0 %	147671444
3036	NC_009456	CAT	2	6	178613	178618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671444
3037	NC_009456	GAA	2	6	178677	178682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671711
3038	NC_009456	ACC	2	6	178708	178713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671711
3039	NC_009456	ATC	2	6	178720	178725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671711
3040	NC_009456	ATT	2	6	178779	178784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671711
3041	NC_009456	TG	3	6	178803	178808	0 %	50 %	50 %	0 %	147671711
3042	NC_009456	TGCTTG	2	12	178811	178822	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	147671711
3043	NC_009456	TGC	2	6	178861	178866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671711
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3045	NC_009456	GA	4	8	178990	178997	50 %	0 %	50 %	0 %	147671711
3046	NC_009456	TGG	2	6	179015	179020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671711
3047	NC_009456	A	7	7	179056	179062	100 %	0 %	0 %	0 %	147671711
3048	NC_009456	CGT	2	6	179105	179110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671711
3049	NC_009456	TTG	2	6	179145	179150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671711
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3051	NC_009456	GAA	2	6	179223	179228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671711
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3053	NC_009456	A	7	7	179288	179294	100 %	0 %	0 %	0 %	147671711
3054	NC_009456	GAT	2	6	179312	179317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672462
3055	NC_009456	TTA	2	6	179336	179341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672462
3056	NC_009456	TTGA	2	8	179348	179355	25 %	50 %	25 %	0 %	147672462
3057	NC_009456	GTG	2	6	179375	179380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672462
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3059	NC_009456	AATG	2	8	179467	179474	50 %	25 %	25 %	0 %	147672462
3060	NC_009456	TGA	2	6	179523	179528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672462
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3062	NC_009456	ATT	2	6	179592	179597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672462
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3064	NC_009456	CAAAAT	2	12	179659	179670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	147672462
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3066	NC_009456	TGG	2	6	179776	179781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672462
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3069	NC_009456	GC	3	6	179856	179861	0 %	0 %	50 %	50 %	147672462
3070	NC_009456	CCT	2	6	179871	179876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147672462
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3073	NC_009456	TTG	2	6	180119	180124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672462
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3089	NC_009456	CCAA	2	8	180759	180766	50 %	0 %	0 %	50 %	147672233
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3102	NC_009456	CAA	2	6	181325	181330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672233
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3104	NC_009456	GCT	2	6	181475	181480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672233
3105	NC_009456	CAGCA	2	10	181484	181493	40 %	0 %	20 %	40 %	147672233
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3108	NC_009456	CA	3	6	181928	181933	50 %	0 %	0 %	50 %	147671409
3109	NC_009456	GCA	2	6	181953	181958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671409
3110	NC_009456	CCTG	2	8	181989	181996	0 %	25 %	25 %	50 %	147671409
3111	NC_009456	TGATG	2	10	182010	182019	20 %	40 %	40 %	0 %	147671409
3112	NC_009456	AGCGT	2	10	182174	182183	20 %	20 %	40 %	20 %	147671409
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3117	NC_009456	TGA	2	6	182444	182449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671409
3118	NC_009456	GCG	2	6	182479	182484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671409
3119	NC_009456	CGA	2	6	182489	182494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671409
3120	NC_009456	TCT	2	6	182513	182518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671409
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3122	NC_009456	CT	3	6	182571	182576	0 %	50 %	0 %	50 %	147671409
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3488	NC_009456	TTG	2	6	203669	203674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672079
3489	NC_009456	TTGA	2	8	203743	203750	25 %	50 %	25 %	0 %	147672079
3490	NC_009456	AC	3	6	203976	203981	50 %	0 %	0 %	50 %	147671630
3491	NC_009456	CA	3	6	203984	203989	50 %	0 %	0 %	50 %	147671630
3492	NC_009456	TGA	2	6	203996	204001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671630
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3495	NC_009456	CAG	2	6	204118	204123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671630
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