MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_009456	CA	3	6	87868	87873	50 %	0 %	0 %	50 %	147672153
1503	NC_009456	GC	3	6	87998	88003	0 %	0 %	50 %	50 %	147672153
1504	NC_009456	T	6	6	88124	88129	0 %	100 %	0 %	0 %	147672153
1505	NC_009456	GGC	2	6	88139	88144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672153
1506	NC_009456	GC	3	6	88163	88168	0 %	0 %	50 %	50 %	147672153
1507	NC_009456	A	6	6	88189	88194	100 %	0 %	0 %	0 %	147672153
1508	NC_009456	ATC	2	6	88240	88245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672153
1509	NC_009456	CTG	2	6	88282	88287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672153
1510	NC_009456	TGC	2	6	88304	88309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672153
1511	NC_009456	GCC	2	6	88385	88390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672153
1512	NC_009456	A	6	6	88416	88421	100 %	0 %	0 %	0 %	147672153
1513	NC_009456	GCA	2	6	88436	88441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672153
1514	NC_009456	TTG	2	6	88447	88452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672153
1515	NC_009456	CAAAT	2	10	88472	88481	60 %	20 %	0 %	20 %	147672153
1516	NC_009456	CGC	2	6	88540	88545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672153
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1518	NC_009456	TAT	2	6	88584	88589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672153
1519	NC_009456	ACG	2	6	88606	88611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672153
1520	NC_009456	AAACC	2	10	88612	88621	60 %	0 %	0 %	40 %	147672153
1521	NC_009456	TGT	2	6	88652	88657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671661
1522	NC_009456	AC	3	6	88673	88678	50 %	0 %	0 %	50 %	147671661
1523	NC_009456	CTG	2	6	88690	88695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671661
1524	NC_009456	ATC	2	6	88804	88809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671661
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1527	NC_009456	ACTC	2	8	89190	89197	25 %	25 %	0 %	50 %	147671661
1528	NC_009456	GTA	2	6	89214	89219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671661
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1530	NC_009456	CACG	2	8	89357	89364	25 %	0 %	25 %	50 %	147671661
1531	NC_009456	TCA	2	6	89423	89428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671661
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1533	NC_009456	CACC	2	8	89554	89561	25 %	0 %	0 %	75 %	147672017
1534	NC_009456	AGCG	2	8	89610	89617	25 %	0 %	50 %	25 %	147672017
1535	NC_009456	CG	3	6	89765	89770	0 %	0 %	50 %	50 %	147672017
1536	NC_009456	CGA	2	6	89824	89829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672017
1537	NC_009456	T	7	7	89830	89836	0 %	100 %	0 %	0 %	147672017
1538	NC_009456	TCT	2	6	89934	89939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672017
1539	NC_009456	CA	3	6	90076	90081	50 %	0 %	0 %	50 %	147672017
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1542	NC_009456	CT	3	6	90123	90128	0 %	50 %	0 %	50 %	147672017
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1554	NC_009456	GCA	2	6	90909	90914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672088
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1556	NC_009456	A	6	6	90949	90954	100 %	0 %	0 %	0 %	147672088
1557	NC_009456	CAT	2	6	90955	90960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672088
1558	NC_009456	TGA	2	6	90988	90993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672088
1559	NC_009456	GTG	2	6	91010	91015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672088
1560	NC_009456	CCTGAG	2	12	91187	91198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	147672088
1561	NC_009456	A	6	6	91214	91219	100 %	0 %	0 %	0 %	147672088
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1563	NC_009456	CTCAG	2	10	91337	91346	20 %	20 %	20 %	40 %	147672088
1564	NC_009456	ATG	2	6	91373	91378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672088
1565	NC_009456	ATCTA	2	10	91406	91415	40 %	40 %	0 %	20 %	147672088
1566	NC_009456	TTA	2	6	91421	91426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672075
1567	NC_009456	ACC	2	6	91493	91498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672075
1568	NC_009456	CAACT	2	10	91515	91524	40 %	20 %	0 %	40 %	147672075
1569	NC_009456	C	7	7	91637	91643	0 %	0 %	0 %	100 %	147672075
1570	NC_009456	TAA	2	6	91649	91654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672075
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1572	NC_009456	TCAA	2	8	91941	91948	50 %	25 %	0 %	25 %	147672075
1573	NC_009456	GTC	2	6	91993	91998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672075
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1607	NC_009456	CAA	2	6	93967	93972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671462
1608	NC_009456	AGA	2	6	93984	93989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671462
1609	NC_009456	GGC	2	6	94005	94010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671462
1610	NC_009456	A	6	6	94024	94029	100 %	0 %	0 %	0 %	147671462
1611	NC_009456	TGA	2	6	94046	94051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671462
1612	NC_009456	TGC	2	6	94052	94057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671462
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1614	NC_009456	GC	3	6	94123	94128	0 %	0 %	50 %	50 %	147671462
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1863	NC_009456	A	8	8	109245	109252	100 %	0 %	0 %	0 %	147672116
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1869	NC_009456	TGG	2	6	109847	109852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671877
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1993	NC_009456	ACC	2	6	117265	117270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671910
1994	NC_009456	CAC	2	6	117312	117317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671910
1995	NC_009456	T	6	6	117325	117330	0 %	100 %	0 %	0 %	147671910
1996	NC_009456	ACTG	2	8	117376	117383	25 %	25 %	25 %	25 %	147671910
1997	NC_009456	ACC	2	6	117533	117538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671910
1998	NC_009456	GTG	2	6	117605	117610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671910
1999	NC_009456	ACC	2	6	117629	117634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671910
2000	NC_009456	CAG	2	6	117759	117764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671910

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