MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_009456	TGATT	2	10	1018155	1018164	20 %	60 %	20 %	0 %	147671434
16502	NC_009456	TTG	2	6	1018239	1018244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672259
16503	NC_009456	CTT	2	6	1018286	1018291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672259
16504	NC_009456	GCG	2	6	1018380	1018385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672259
16505	NC_009456	CTGC	2	8	1018558	1018565	0 %	25 %	25 %	50 %	147672259
16506	NC_009456	T	6	6	1018670	1018675	0 %	100 %	0 %	0 %	147672259
16507	NC_009456	AC	3	6	1018748	1018753	50 %	0 %	0 %	50 %	147672259
16508	NC_009456	TCT	2	6	1018778	1018783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672259
16509	NC_009456	GGT	2	6	1018791	1018796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672259
16510	NC_009456	CCA	2	6	1018809	1018814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672259
16511	NC_009456	GGCGTT	2	12	1018816	1018827	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147672259
16512	NC_009456	TGAG	2	8	1018905	1018912	25 %	25 %	50 %	0 %	147671782
16513	NC_009456	TGA	2	6	1018918	1018923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671782
16514	NC_009456	GGTT	2	8	1018928	1018935	0 %	50 %	50 %	0 %	147671782
16515	NC_009456	TGA	2	6	1018948	1018953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671782
16516	NC_009456	CAG	2	6	1019096	1019101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671782
16517	NC_009456	ACC	2	6	1019142	1019147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671782
16518	NC_009456	TGCTG	2	10	1019158	1019167	0 %	40 %	40 %	20 %	147671782
16519	NC_009456	CCGTGG	2	12	1019202	1019213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	147671782
16520	NC_009456	AGA	2	6	1019332	1019337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671782
16521	NC_009456	TTC	2	6	1019444	1019449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671782
16522	NC_009456	CGG	2	6	1019548	1019553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671782
16523	NC_009456	CA	3	6	1019587	1019592	50 %	0 %	0 %	50 %	147671782
16524	NC_009456	ATG	2	6	1019682	1019687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671782
16525	NC_009456	GCG	2	6	1019715	1019720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671782
16526	NC_009456	CCG	2	6	1019815	1019820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671782
16527	NC_009456	CAG	2	6	1019893	1019898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671782
16528	NC_009456	AAT	2	6	1020160	1020165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671727
16529	NC_009456	GCA	2	6	1020198	1020203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671727
16530	NC_009456	GCC	2	6	1020346	1020351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671727
16531	NC_009456	GCC	2	6	1020428	1020433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
16532	NC_009456	GCT	2	6	1020491	1020496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
16533	NC_009456	GTT	2	6	1020503	1020508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672374
16534	NC_009456	GGGTT	2	10	1020638	1020647	0 %	40 %	60 %	0 %	147672374
16535	NC_009456	GGC	2	6	1020737	1020742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672374
16536	NC_009456	GAT	2	6	1020746	1020751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672374
16537	NC_009456	CCA	2	6	1020794	1020799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672374
16538	NC_009456	ACC	2	6	1020846	1020851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672374
16539	NC_009456	GCA	2	6	1020903	1020908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672374
16540	NC_009456	CCT	2	6	1020972	1020977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147672374
16541	NC_009456	CAT	2	6	1020980	1020985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672374
16542	NC_009456	CGAG	2	8	1021003	1021010	25 %	0 %	50 %	25 %	147672374
16543	NC_009456	AG	4	8	1021009	1021016	50 %	0 %	50 %	0 %	147672374
16544	NC_009456	GAT	2	6	1021043	1021048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672374
16545	NC_009456	CAGTG	2	10	1021061	1021070	20 %	20 %	40 %	20 %	147672374
16546	NC_009456	TGC	2	6	1021126	1021131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
16547	NC_009456	TGC	2	6	1021169	1021174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
16548	NC_009456	GAGC	2	8	1021288	1021295	25 %	0 %	50 %	25 %	147672374
16549	NC_009456	TCA	2	6	1021296	1021301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672374
16550	NC_009456	TTTGC	2	10	1021304	1021313	0 %	60 %	20 %	20 %	147672374
16551	NC_009456	CCGAA	2	10	1021342	1021351	40 %	0 %	20 %	40 %	147672374
16552	NC_009456	AG	3	6	1021358	1021363	50 %	0 %	50 %	0 %	147672374
16553	NC_009456	GAA	2	6	1021457	1021462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672374
16554	NC_009456	GCC	2	6	1021496	1021501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
16555	NC_009456	AAGG	2	8	1021502	1021509	50 %	0 %	50 %	0 %	147672374
16556	NC_009456	GGC	2	6	1021523	1021528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672374
16557	NC_009456	TGG	2	6	1021543	1021548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672374
16558	NC_009456	TGA	2	6	1021607	1021612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672374
16559	NC_009456	TTA	2	6	1021641	1021646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672374
16560	NC_009456	TGC	2	6	1021721	1021726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672374
16561	NC_009456	CGC	3	9	1021796	1021804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
16562	NC_009456	GCC	2	6	1021881	1021886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
16563	NC_009456	CCG	2	6	1021963	1021968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672374
16564	NC_009456	CAC	2	6	1022065	1022070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672374
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16566	NC_009456	CAT	2	6	1022177	1022182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672374
16567	NC_009456	TCA	2	6	1022309	1022314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671479
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16569	NC_009456	CGC	2	6	1022336	1022341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671479
16570	NC_009456	T	6	6	1022398	1022403	0 %	100 %	0 %	0 %	147672405
16571	NC_009456	TACCG	2	10	1022439	1022448	20 %	20 %	20 %	40 %	147672405
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16573	NC_009456	CTT	2	6	1022498	1022503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672405
16574	NC_009456	GTT	2	6	1022583	1022588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672405
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16583	NC_009456	TGG	2	6	1023062	1023067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671481
16584	NC_009456	CTGC	2	8	1023086	1023093	0 %	25 %	25 %	50 %	147671481
16585	NC_009456	TGGC	2	8	1023133	1023140	0 %	25 %	50 %	25 %	147671481
16586	NC_009456	GT	3	6	1023342	1023347	0 %	50 %	50 %	0 %	147671795
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16588	NC_009456	ATG	2	6	1023399	1023404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671795
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16602	NC_009456	GATA	2	8	1024252	1024259	50 %	25 %	25 %	0 %	147671900
16603	NC_009456	AACA	2	8	1024278	1024285	75 %	0 %	0 %	25 %	147671900
16604	NC_009456	GCT	2	6	1024329	1024334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671900
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16617	NC_009456	TTGAG	2	10	1024897	1024906	20 %	40 %	40 %	0 %	147672250
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