MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_009456	TCT	2	6	928093	928098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672473
15003	NC_009456	CTA	2	6	928486	928491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672223
15004	NC_009456	CTT	2	6	928538	928543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671645
15005	NC_009456	GGC	2	6	928556	928561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671645
15006	NC_009456	GCC	2	6	928581	928586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671645
15007	NC_009456	CGT	2	6	928716	928721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671645
15008	NC_009456	TAC	2	6	928722	928727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671645
15009	NC_009456	TGCT	2	8	928849	928856	0 %	50 %	25 %	25 %	147671645
15010	NC_009456	CTG	2	6	928857	928862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671645
15011	NC_009456	TAT	2	6	928877	928882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671645
15012	NC_009456	GC	3	6	928923	928928	0 %	0 %	50 %	50 %	147671645
15013	NC_009456	ATC	2	6	929043	929048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671645
15014	NC_009456	GGC	2	6	929052	929057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671645
15015	NC_009456	GC	3	6	929116	929121	0 %	0 %	50 %	50 %	147671645
15016	NC_009456	GTC	2	6	929199	929204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671645
15017	NC_009456	CA	4	8	929213	929220	50 %	0 %	0 %	50 %	147671645
15018	NC_009456	CG	3	6	929236	929241	0 %	0 %	50 %	50 %	147671645
15019	NC_009456	GCTG	2	8	929420	929427	0 %	25 %	50 %	25 %	147671645
15020	NC_009456	GAA	2	6	929658	929663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671645
15021	NC_009456	TGG	2	6	929707	929712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671645
15022	NC_009456	CAA	2	6	929742	929747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671645
15023	NC_009456	GTC	2	6	930054	930059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671753
15024	NC_009456	GTGAAA	2	12	930132	930143	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	147671753
15025	NC_009456	TGA	2	6	930155	930160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671753
15026	NC_009456	GAA	2	6	930204	930209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671753
15027	NC_009456	T	7	7	930253	930259	0 %	100 %	0 %	0 %	147671788
15028	NC_009456	TCAC	2	8	930265	930272	25 %	25 %	0 %	50 %	147671788
15029	NC_009456	AGTG	2	8	930299	930306	25 %	25 %	50 %	0 %	147671788
15030	NC_009456	CCA	2	6	930313	930318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671788
15031	NC_009456	GTT	2	6	930321	930326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671788
15032	NC_009456	AAG	2	6	930343	930348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671788
15033	NC_009456	CA	3	6	930385	930390	50 %	0 %	0 %	50 %	147671551
15034	NC_009456	CCA	2	6	930438	930443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671551
15035	NC_009456	TGCC	2	8	930495	930502	0 %	25 %	25 %	50 %	147671551
15036	NC_009456	TAC	2	6	930623	930628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671551
15037	NC_009456	GCT	2	6	930736	930741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15038	NC_009456	CAG	2	6	930749	930754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15039	NC_009456	CTG	2	6	930797	930802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15040	NC_009456	GCG	2	6	930815	930820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671551
15041	NC_009456	TTG	2	6	930876	930881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671551
15042	NC_009456	GTG	2	6	930911	930916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671551
15043	NC_009456	CGC	2	6	930925	930930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671551
15044	NC_009456	TCGAT	2	10	930954	930963	20 %	40 %	20 %	20 %	147671551
15045	NC_009456	ACA	2	6	930966	930971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671551
15046	NC_009456	CAA	2	6	930977	930982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671551
15047	NC_009456	CTG	2	6	930998	931003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15048	NC_009456	CTGA	2	8	931037	931044	25 %	25 %	25 %	25 %	147671551
15049	NC_009456	CAT	2	6	931045	931050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671551
15050	NC_009456	CAA	2	6	931066	931071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671551
15051	NC_009456	TGC	2	6	931110	931115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15052	NC_009456	GGC	2	6	931190	931195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671551
15053	NC_009456	AGC	2	6	931317	931322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15054	NC_009456	GCT	2	6	931369	931374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15055	NC_009456	GC	3	6	931433	931438	0 %	0 %	50 %	50 %	147671551
15056	NC_009456	CAC	2	6	931445	931450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671551
15057	NC_009456	TGC	2	6	931465	931470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
15058	NC_009456	CAA	2	6	931571	931576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671551
15059	NC_009456	TGA	2	6	931624	931629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671551
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15061	NC_009456	CGC	2	6	931726	931731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671551
15062	NC_009456	CGT	2	6	931748	931753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
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15064	NC_009456	TGC	2	6	931809	931814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671551
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15066	NC_009456	GAT	2	6	931909	931914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671551
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15068	NC_009456	ATG	2	6	932031	932036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671551
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15072	NC_009456	TGCA	2	8	932358	932365	25 %	25 %	25 %	25 %	147671551
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15088	NC_009456	AGC	2	6	933812	933817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672183
15089	NC_009456	GA	3	6	933831	933836	50 %	0 %	50 %	0 %	147672183
15090	NC_009456	CAAGA	2	10	934139	934148	60 %	0 %	20 %	20 %	147672042
15091	NC_009456	ATT	2	6	934175	934180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672042
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15099	NC_009456	TCG	2	6	934461	934466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672042
15100	NC_009456	ATGAAA	2	12	934529	934540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	147672042
15101	NC_009456	TTA	2	6	934581	934586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672042
15102	NC_009456	AGC	2	6	934623	934628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672042
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15104	NC_009456	GAA	2	6	935207	935212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671514
15105	NC_009456	CA	3	6	935217	935222	50 %	0 %	0 %	50 %	147671514
15106	NC_009456	GAT	2	6	935616	935621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672417
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15109	NC_009456	CGT	2	6	935900	935905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672417
15110	NC_009456	TCT	2	6	935920	935925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672417
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15112	NC_009456	AGC	2	6	936136	936141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671927
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15469	NC_009456	A	6	6	956195	956200	100 %	0 %	0 %	0 %	147672048
15470	NC_009456	TCGCGC	2	12	956249	956260	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	147672048
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