MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_009456	ACGC	2	8	599612	599619	25 %	0 %	25 %	50 %	147671497
10003	NC_009456	TG	3	6	599683	599688	0 %	50 %	50 %	0 %	147672112
10004	NC_009456	AC	3	6	599735	599740	50 %	0 %	0 %	50 %	147672112
10005	NC_009456	GAC	2	6	599784	599789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672112
10006	NC_009456	CAAAT	2	10	599844	599853	60 %	20 %	0 %	20 %	147672112
10007	NC_009456	CAA	2	6	599966	599971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672112
10008	NC_009456	GCG	2	6	600014	600019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672112
10009	NC_009456	TCA	2	6	600047	600052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672112
10010	NC_009456	CTT	3	9	600080	600088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672112
10011	NC_009456	ATG	2	6	600103	600108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672112
10012	NC_009456	TTC	2	6	600144	600149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672112
10013	NC_009456	TCA	2	6	600193	600198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672112
10014	NC_009456	TAA	2	6	600204	600209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672112
10015	NC_009456	GCT	3	9	600248	600256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672112
10016	NC_009456	AG	3	6	600264	600269	50 %	0 %	50 %	0 %	147672112
10017	NC_009456	ATC	2	6	600307	600312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672112
10018	NC_009456	TTC	2	6	600387	600392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672112
10019	NC_009456	GCT	2	6	600446	600451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672112
10020	NC_009456	A	6	6	600460	600465	100 %	0 %	0 %	0 %	147672112
10021	NC_009456	TGG	2	6	600484	600489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672112
10022	NC_009456	GC	3	6	600526	600531	0 %	0 %	50 %	50 %	147672112
10023	NC_009456	GGT	2	6	600537	600542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672112
10024	NC_009456	CTG	2	6	600667	600672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672112
10025	NC_009456	TGC	2	6	600691	600696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672112
10026	NC_009456	GAT	2	6	600707	600712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672112
10027	NC_009456	GCA	2	6	600906	600911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671616
10028	NC_009456	CTTG	2	8	600987	600994	0 %	50 %	25 %	25 %	147671616
10029	NC_009456	GATAG	2	10	601015	601024	40 %	20 %	40 %	0 %	147671616
10030	NC_009456	CTTT	2	8	601091	601098	0 %	75 %	0 %	25 %	147671616
10031	NC_009456	TG	3	6	601256	601261	0 %	50 %	50 %	0 %	147671616
10032	NC_009456	A	7	7	601483	601489	100 %	0 %	0 %	0 %	147671616
10033	NC_009456	GT	3	6	601563	601568	0 %	50 %	50 %	0 %	147671616
10034	NC_009456	GAG	2	6	601594	601599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671616
10035	NC_009456	CAC	2	6	601627	601632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671616
10036	NC_009456	CAGC	2	8	601656	601663	25 %	0 %	25 %	50 %	147671616
10037	NC_009456	CAG	2	6	601753	601758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671616
10038	NC_009456	CTT	2	6	601788	601793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671616
10039	NC_009456	TGC	2	6	601822	601827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671616
10040	NC_009456	TCA	2	6	601863	601868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671616
10041	NC_009456	ATTG	2	8	601878	601885	25 %	50 %	25 %	0 %	147671616
10042	NC_009456	GAA	2	6	602113	602118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671759
10043	NC_009456	CTG	2	6	602129	602134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671759
10044	NC_009456	CGTG	2	8	602164	602171	0 %	25 %	50 %	25 %	147671759
10045	NC_009456	GAT	3	9	602201	602209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671759
10046	NC_009456	TTG	2	6	602223	602228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671759
10047	NC_009456	CCG	2	6	602236	602241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671759
10048	NC_009456	CCA	2	6	602259	602264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671759
10049	NC_009456	CA	3	6	602263	602268	50 %	0 %	0 %	50 %	147671759
10050	NC_009456	CCA	2	6	602322	602327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671759
10051	NC_009456	GCT	2	6	602356	602361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671759
10052	NC_009456	TGAT	2	8	602364	602371	25 %	50 %	25 %	0 %	147671759
10053	NC_009456	TGA	2	6	602467	602472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671759
10054	NC_009456	ACC	3	9	602534	602542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671759
10055	NC_009456	CGATG	2	10	602608	602617	20 %	20 %	40 %	20 %	147671759
10056	NC_009456	TCAGC	2	10	602673	602682	20 %	20 %	20 %	40 %	147671759
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10058	NC_009456	CTCA	2	8	602767	602774	25 %	25 %	0 %	50 %	147671759
10059	NC_009456	GC	3	6	602906	602911	0 %	0 %	50 %	50 %	147671759
10060	NC_009456	CAT	2	6	603004	603009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671759
10061	NC_009456	AGTC	2	8	603103	603110	25 %	25 %	25 %	25 %	147671759
10062	NC_009456	GCA	2	6	603184	603189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671759
10063	NC_009456	AT	3	6	603194	603199	50 %	50 %	0 %	0 %	147671759
10064	NC_009456	CAA	2	6	603203	603208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671759
10065	NC_009456	ACC	2	6	603298	603303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672485
10066	NC_009456	ATG	2	6	603335	603340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672485
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10068	NC_009456	TTA	2	6	603355	603360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672485
10069	NC_009456	GCT	2	6	603434	603439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672485
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10071	NC_009456	AAT	2	6	603484	603489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672485
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10074	NC_009456	ACCTT	2	10	603550	603559	20 %	40 %	0 %	40 %	147672485
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10084	NC_009456	GCTGC	2	10	604247	604256	0 %	20 %	40 %	40 %	147672485
10085	NC_009456	AGC	2	6	604283	604288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672485
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10091	NC_009456	GCA	2	6	604800	604805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671852
10092	NC_009456	CGC	2	6	604899	604904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671852
10093	NC_009456	CTCA	2	8	604955	604962	25 %	25 %	0 %	50 %	147671852
10094	NC_009456	CG	3	6	604988	604993	0 %	0 %	50 %	50 %	147671852
10095	NC_009456	GATG	2	8	605034	605041	25 %	25 %	50 %	0 %	147671852
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10099	NC_009456	GAT	2	6	605194	605199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671852
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10101	NC_009456	CTG	2	6	605254	605259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671852
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10103	NC_009456	GCG	2	6	605323	605328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671852
10104	NC_009456	CG	3	6	605327	605332	0 %	0 %	50 %	50 %	147671852
10105	NC_009456	ATT	2	6	605369	605374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671852
10106	NC_009456	TGCC	2	8	605396	605403	0 %	25 %	25 %	50 %	147671852
10107	NC_009456	ATT	2	6	605427	605432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671852
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10112	NC_009456	AGC	2	6	605862	605867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672055
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10117	NC_009456	TGA	2	6	606163	606168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671410
10118	NC_009456	GGTTG	2	10	606258	606267	0 %	40 %	60 %	0 %	147671410
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