MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009456	TGAAA	2	10	322928	322937	60 %	20 %	20 %	0 %	147672305
5502	NC_009456	AAAC	2	8	322943	322950	75 %	0 %	0 %	25 %	147672305
5503	NC_009456	TGCA	2	8	322977	322984	25 %	25 %	25 %	25 %	147672305
5504	NC_009456	TTG	2	6	322992	322997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672305
5505	NC_009456	TGAT	2	8	323104	323111	25 %	50 %	25 %	0 %	147672305
5506	NC_009456	TGA	2	6	323126	323131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672305
5507	NC_009456	TCA	2	6	323188	323193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672305
5508	NC_009456	GCT	2	6	323222	323227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672305
5509	NC_009456	AAT	2	6	323238	323243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672305
5510	NC_009456	TGA	3	9	323264	323272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672305
5511	NC_009456	AAC	2	6	323419	323424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672305
5512	NC_009456	GTG	2	6	323446	323451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672305
5513	NC_009456	ATA	2	6	323575	323580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672305
5514	NC_009456	CGA	2	6	323778	323783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671797
5515	NC_009456	GTT	2	6	323892	323897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671797
5516	NC_009456	TTC	2	6	323902	323907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671797
5517	NC_009456	GC	4	8	323918	323925	0 %	0 %	50 %	50 %	147671797
5518	NC_009456	CCAC	2	8	323960	323967	25 %	0 %	0 %	75 %	147671797
5519	NC_009456	TG	3	6	324356	324361	0 %	50 %	50 %	0 %	147672430
5520	NC_009456	GAT	2	6	324363	324368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672430
5521	NC_009456	T	6	6	324368	324373	0 %	100 %	0 %	0 %	147672430
5522	NC_009456	AAG	2	6	324382	324387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672430
5523	NC_009456	TGC	2	6	324461	324466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672430
5524	NC_009456	GTGAA	2	10	324556	324565	40 %	20 %	40 %	0 %	147672430
5525	NC_009456	T	6	6	324573	324578	0 %	100 %	0 %	0 %	147672430
5526	NC_009456	GGC	2	6	324723	324728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672430
5527	NC_009456	TGG	2	6	324793	324798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672430
5528	NC_009456	TTTC	2	8	324801	324808	0 %	75 %	0 %	25 %	147672430
5529	NC_009456	TAA	2	6	324893	324898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672430
5530	NC_009456	GTT	2	6	325084	325089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671553
5531	NC_009456	GAG	2	6	325127	325132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147671553
5532	NC_009456	TCT	2	6	325140	325145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671553
5533	NC_009456	CGG	2	6	325195	325200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671553
5534	NC_009456	CAC	2	6	325219	325224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671553
5535	NC_009456	AAAC	2	8	325253	325260	75 %	0 %	0 %	25 %	147671553
5536	NC_009456	TACT	2	8	325324	325331	25 %	50 %	0 %	25 %	147672067
5537	NC_009456	TA	3	6	325338	325343	50 %	50 %	0 %	0 %	147672067
5538	NC_009456	TGA	2	6	325373	325378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672067
5539	NC_009456	TAAA	2	8	325464	325471	75 %	25 %	0 %	0 %	147672067
5540	NC_009456	GAT	3	9	325560	325568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672067
5541	NC_009456	GATG	2	8	325586	325593	25 %	25 %	50 %	0 %	147672067
5542	NC_009456	CGA	2	6	325613	325618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672067
5543	NC_009456	T	7	7	325630	325636	0 %	100 %	0 %	0 %	147672067
5544	NC_009456	CGT	2	6	325657	325662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672067
5545	NC_009456	TGTT	2	8	325681	325688	0 %	75 %	25 %	0 %	147672067
5546	NC_009456	TCA	2	6	325705	325710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672067
5547	NC_009456	GTT	2	6	325755	325760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672067
5548	NC_009456	CGC	2	6	325787	325792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672067
5549	NC_009456	ACTG	2	8	325814	325821	25 %	25 %	25 %	25 %	147672067
5550	NC_009456	GGCA	2	8	326089	326096	25 %	0 %	50 %	25 %	147671425
5551	NC_009456	GT	3	6	326149	326154	0 %	50 %	50 %	0 %	147671425
5552	NC_009456	GT	3	6	326173	326178	0 %	50 %	50 %	0 %	147671425
5553	NC_009456	CAA	2	6	326254	326259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671425
5554	NC_009456	TCA	2	6	326260	326265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671425
5555	NC_009456	TGC	2	6	326294	326299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671425
5556	NC_009456	ACC	2	6	326759	326764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671425
5557	NC_009456	AG	3	6	326765	326770	50 %	0 %	50 %	0 %	147671425
5558	NC_009456	AGA	2	6	326790	326795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671425
5559	NC_009456	TTG	2	6	326850	326855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671425
5560	NC_009456	TGT	2	6	326884	326889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671425
5561	NC_009456	CAT	2	6	326962	326967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671425
5562	NC_009456	GCA	2	6	327031	327036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671425
5563	NC_009456	CGA	2	6	327064	327069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671425
5564	NC_009456	CTT	2	6	327085	327090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671425
5565	NC_009456	TACA	2	8	327139	327146	50 %	25 %	0 %	25 %	147671425
5566	NC_009456	T	6	6	327147	327152	0 %	100 %	0 %	0 %	147671425
5567	NC_009456	GCTC	2	8	327680	327687	0 %	25 %	25 %	50 %	147672298
5568	NC_009456	ATA	2	6	327720	327725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672298
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5570	NC_009456	T	7	7	327763	327769	0 %	100 %	0 %	0 %	147672298
5571	NC_009456	ACA	2	6	327815	327820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672298
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5573	NC_009456	TGG	2	6	327879	327884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671546
5574	NC_009456	TGC	2	6	327907	327912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671546
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5580	NC_009456	GAA	2	6	328327	328332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671546
5581	NC_009456	CAT	2	6	328348	328353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671546
5582	NC_009456	GGC	2	6	328393	328398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671546
5583	NC_009456	ATG	2	6	328437	328442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671546
5584	NC_009456	CAA	2	6	328459	328464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671546
5585	NC_009456	TC	3	6	328521	328526	0 %	50 %	0 %	50 %	147671546
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5587	NC_009456	AAC	2	6	328790	328795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671546
5588	NC_009456	GGATGC	2	12	328843	328854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147671546
5589	NC_009456	GC	3	6	328853	328858	0 %	0 %	50 %	50 %	147671546
5590	NC_009456	GCG	2	6	328862	328867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671546
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5592	NC_009456	GTC	2	6	328968	328973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671546
5593	NC_009456	AAT	2	6	329019	329024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671546
5594	NC_009456	CAGT	2	8	329101	329108	25 %	25 %	25 %	25 %	147672454
5595	NC_009456	GGTA	2	8	329193	329200	25 %	25 %	50 %	0 %	147672454
5596	NC_009456	GAT	2	6	329349	329354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672454
5597	NC_009456	ACTC	2	8	329424	329431	25 %	25 %	0 %	50 %	147672454
5598	NC_009456	CAGT	2	8	329443	329450	25 %	25 %	25 %	25 %	147672454
5599	NC_009456	GTG	2	6	329474	329479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672454
5600	NC_009456	ATTG	2	8	329526	329533	25 %	50 %	25 %	0 %	147672454
5601	NC_009456	ACCG	2	8	329586	329593	25 %	0 %	25 %	50 %	147672454
5602	NC_009456	CAT	2	6	329649	329654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672454
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5605	NC_009456	CAA	2	6	329787	329792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672454
5606	NC_009456	GCG	2	6	329855	329860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672454
5607	NC_009456	TGA	2	6	330014	330019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672454
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5609	NC_009456	GATTTT	2	12	330123	330134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	147672454
5610	NC_009456	GTTT	2	8	330185	330192	0 %	75 %	25 %	0 %	147672454
5611	NC_009456	ATG	2	6	330277	330282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672454
5612	NC_009456	TATG	2	8	330287	330294	25 %	50 %	25 %	0 %	147672454
5613	NC_009456	GAT	2	6	330316	330321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672454
5614	NC_009456	CGAT	2	8	330338	330345	25 %	25 %	25 %	25 %	147672454
5615	NC_009456	TCAT	2	8	330356	330363	25 %	50 %	0 %	25 %	147672454
5616	NC_009456	GAT	3	9	330387	330395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672454
5617	NC_009456	GCTTT	2	10	330425	330434	0 %	60 %	20 %	20 %	147672454
5618	NC_009456	CAA	2	6	330441	330446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672454
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5620	NC_009456	TTTGG	2	10	330577	330586	0 %	60 %	40 %	0 %	147672454
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5622	NC_009456	TGG	2	6	330617	330622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672454
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5737	NC_009456	CAGC	2	8	337967	337974	25 %	0 %	25 %	50 %	147671526
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5742	NC_009456	TAA	2	6	338614	338619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671477
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