MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009456	TAG	2	6	292331	292336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671722
5003	NC_009456	GCC	2	6	292403	292408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671722
5004	NC_009456	CGG	2	6	292437	292442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671722
5005	NC_009456	GAT	2	6	292465	292470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671722
5006	NC_009456	CAT	2	6	292525	292530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671722
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5008	NC_009456	GCA	2	6	292619	292624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671722
5009	NC_009456	AGT	2	6	292633	292638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671722
5010	NC_009456	TGAG	2	8	292790	292797	25 %	25 %	50 %	0 %	147671722
5011	NC_009456	CCA	2	6	292829	292834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671722
5012	NC_009456	CGA	2	6	292947	292952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671722
5013	NC_009456	AGC	2	6	292964	292969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671722
5014	NC_009456	GGCTT	2	10	293003	293012	0 %	40 %	40 %	20 %	147671722
5015	NC_009456	AAG	2	6	293102	293107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671722
5016	NC_009456	T	6	6	293110	293115	0 %	100 %	0 %	0 %	147671722
5017	NC_009456	CGC	2	6	293116	293121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671722
5018	NC_009456	TGAG	2	8	293157	293164	25 %	25 %	50 %	0 %	147671722
5019	NC_009456	A	6	6	293226	293231	100 %	0 %	0 %	0 %	147671722
5020	NC_009456	GAA	2	6	293281	293286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671722
5021	NC_009456	CAT	2	6	293296	293301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671722
5022	NC_009456	TGG	2	6	293355	293360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671722
5023	NC_009456	TGC	2	6	293366	293371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671722
5024	NC_009456	CAG	2	6	293401	293406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671722
5025	NC_009456	TTG	2	6	293438	293443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671722
5026	NC_009456	CAA	2	6	293448	293453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671722
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5028	NC_009456	CAG	2	6	293548	293553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671722
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5030	NC_009456	CGC	2	6	293566	293571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671722
5031	NC_009456	GAT	3	9	293623	293631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671722
5032	NC_009456	TGGC	2	8	293865	293872	0 %	25 %	50 %	25 %	147671722
5033	NC_009456	CCA	2	6	293901	293906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671722
5034	NC_009456	CCA	2	6	293922	293927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671722
5035	NC_009456	GCAA	2	8	293930	293937	50 %	0 %	25 %	25 %	147671722
5036	NC_009456	TCAT	2	8	293942	293949	25 %	50 %	0 %	25 %	147671722
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5039	NC_009456	GGT	2	6	294244	294249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671871
5040	NC_009456	AAC	2	6	294304	294309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671871
5041	NC_009456	AGGC	2	8	294330	294337	25 %	0 %	50 %	25 %	147671871
5042	NC_009456	AAGC	2	8	294368	294375	50 %	0 %	25 %	25 %	147671871
5043	NC_009456	AAG	2	6	294381	294386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671871
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5045	NC_009456	TTG	2	6	294552	294557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671871
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5049	NC_009456	TGG	2	6	294912	294917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671871
5050	NC_009456	A	6	6	294941	294946	100 %	0 %	0 %	0 %	147671871
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5057	NC_009456	TGG	2	6	295395	295400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672066
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5059	NC_009456	ACA	2	6	295488	295493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672066
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5061	NC_009456	CT	3	6	295664	295669	0 %	50 %	0 %	50 %	147672066
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5067	NC_009456	A	6	6	296169	296174	100 %	0 %	0 %	0 %	147672187
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5081	NC_009456	CTG	2	6	297093	297098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672187
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5104	NC_009456	CAAA	2	8	298110	298117	75 %	0 %	0 %	25 %	147672009
5105	NC_009456	TGG	2	6	298169	298174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672009
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5123	NC_009456	CTTG	2	8	299230	299237	0 %	50 %	25 %	25 %	147671832
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5242	NC_009456	ATTT	2	8	305296	305303	25 %	75 %	0 %	0 %	147672110
5243	NC_009456	T	6	6	305344	305349	0 %	100 %	0 %	0 %	147672110
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5353	NC_009456	GT	3	6	312161	312166	0 %	50 %	50 %	0 %	147671904
5354	NC_009456	TTGC	2	8	312232	312239	0 %	50 %	25 %	25 %	147671904
5355	NC_009456	TTTA	2	8	312255	312262	25 %	75 %	0 %	0 %	147671904
5356	NC_009456	TTA	2	6	312352	312357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671904
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5363	NC_009456	AGC	2	6	312851	312856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672460
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5488	NC_009456	TTGGA	2	10	321668	321677	20 %	40 %	40 %	0 %	147671657
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5490	NC_009456	ATG	3	9	321749	321757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671657
5491	NC_009456	TGC	2	6	321831	321836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671657
5492	NC_009456	GAC	2	6	321887	321892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671657
5493	NC_009456	ATA	2	6	321900	321905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671657
5494	NC_009456	GCA	2	6	322088	322093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672166
5495	NC_009456	GAT	2	6	322130	322135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672166
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5499	NC_009456	GGC	2	6	322214	322219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672166
5500	NC_009456	TTGG	2	8	322317	322324	0 %	50 %	50 %	0 %	147672166

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