MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009456	TGA	2	6	262869	262874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671702
4502	NC_009456	TGA	2	6	262914	262919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671702
4503	NC_009456	TTA	2	6	263184	263189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672380
4504	NC_009456	T	6	6	263287	263292	0 %	100 %	0 %	0 %	147672380
4505	NC_009456	GAT	2	6	263297	263302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672380
4506	NC_009456	GCA	2	6	263334	263339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672380
4507	NC_009456	CT	3	6	263340	263345	0 %	50 %	0 %	50 %	147672380
4508	NC_009456	TGA	2	6	263476	263481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672380
4509	NC_009456	CATGC	2	10	263557	263566	20 %	20 %	20 %	40 %	147672380
4510	NC_009456	CCA	2	6	263585	263590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672380
4511	NC_009456	GCCA	2	8	263630	263637	25 %	0 %	25 %	50 %	147672380
4512	NC_009456	AG	3	6	263737	263742	50 %	0 %	50 %	0 %	147672380
4513	NC_009456	TCA	2	6	263761	263766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672380
4514	NC_009456	TTTC	2	8	263822	263829	0 %	75 %	0 %	25 %	147671885
4515	NC_009456	T	7	7	263839	263845	0 %	100 %	0 %	0 %	147671885
4516	NC_009456	TGC	2	6	263887	263892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671885
4517	NC_009456	GGT	2	6	263912	263917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671885
4518	NC_009456	CCAA	2	8	263920	263927	50 %	0 %	0 %	50 %	147671885
4519	NC_009456	CCAG	3	12	263935	263946	25 %	0 %	25 %	50 %	147671885
4520	NC_009456	AGC	2	6	264065	264070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671885
4521	NC_009456	CAG	3	9	264136	264144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671885
4522	NC_009456	ACC	2	6	264152	264157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671885
4523	NC_009456	TGG	2	6	264159	264164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671885
4524	NC_009456	GAGAG	2	10	264177	264186	40 %	0 %	60 %	0 %	147671885
4525	NC_009456	T	6	6	264187	264192	0 %	100 %	0 %	0 %	147671885
4526	NC_009456	ATC	2	6	264259	264264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671885
4527	NC_009456	GAT	2	6	264280	264285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671885
4528	NC_009456	GC	3	6	264322	264327	0 %	0 %	50 %	50 %	147671885
4529	NC_009456	TGG	2	6	264366	264371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671885
4530	NC_009456	TCA	2	6	264387	264392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671885
4531	NC_009456	GCCA	2	8	264486	264493	25 %	0 %	25 %	50 %	147671885
4532	NC_009456	CTG	2	6	264496	264501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671885
4533	NC_009456	CAATCG	2	12	264555	264566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147671885
4534	NC_009456	GGT	2	6	264586	264591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671885
4535	NC_009456	GGAA	2	8	264592	264599	50 %	0 %	50 %	0 %	147671885
4536	NC_009456	TCT	3	9	265041	265049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672511
4537	NC_009456	GTG	2	6	265155	265160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672511
4538	NC_009456	CCAAA	2	10	265273	265282	60 %	0 %	0 %	40 %	147672511
4539	NC_009456	ATC	2	6	265331	265336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672511
4540	NC_009456	GCTT	2	8	265346	265353	0 %	50 %	25 %	25 %	147672511
4541	NC_009456	GTT	2	6	265394	265399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672511
4542	NC_009456	GGC	2	6	265495	265500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672511
4543	NC_009456	GTT	2	6	265549	265554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672511
4544	NC_009456	CGT	2	6	265559	265564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672511
4545	NC_009456	TTG	2	6	265686	265691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672511
4546	NC_009456	TTC	2	6	265709	265714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672511
4547	NC_009456	CAC	2	6	265738	265743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672511
4548	NC_009456	GAC	2	6	265753	265758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672511
4549	NC_009456	C	6	6	265758	265763	0 %	0 %	0 %	100 %	147672511
4550	NC_009456	CAT	2	6	265786	265791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672511
4551	NC_009456	TGC	2	6	265850	265855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672511
4552	NC_009456	T	6	6	265856	265861	0 %	100 %	0 %	0 %	147672511
4553	NC_009456	TCT	2	6	266229	266234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671974
4554	NC_009456	TG	3	6	266242	266247	0 %	50 %	50 %	0 %	147671974
4555	NC_009456	GCC	2	6	266273	266278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671974
4556	NC_009456	CTT	2	6	266320	266325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671974
4557	NC_009456	AGCA	2	8	266374	266381	50 %	0 %	25 %	25 %	147671974
4558	NC_009456	GTTG	2	8	266411	266418	0 %	50 %	50 %	0 %	147671974
4559	NC_009456	ACT	2	6	266487	266492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671974
4560	NC_009456	CAT	2	6	266650	266655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672522
4561	NC_009456	GCT	2	6	266770	266775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672522
4562	NC_009456	AAC	2	6	266778	266783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672522
4563	NC_009456	TGC	2	6	266811	266816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672522
4564	NC_009456	GCA	2	6	266827	266832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672522
4565	NC_009456	ACT	2	6	266896	266901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672522
4566	NC_009456	GCA	3	9	266940	266948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672522
4567	NC_009456	TGA	2	6	266950	266955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672522
4568	NC_009456	TG	3	6	267277	267282	0 %	50 %	50 %	0 %	147672215
4569	NC_009456	TCA	2	6	267360	267365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672215
4570	NC_009456	GC	3	6	267383	267388	0 %	0 %	50 %	50 %	147672215
4571	NC_009456	GC	3	6	267530	267535	0 %	0 %	50 %	50 %	147672215
4572	NC_009456	TTG	2	6	267571	267576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672215
4573	NC_009456	CGA	2	6	267596	267601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672215
4574	NC_009456	CTG	2	6	267615	267620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672215
4575	NC_009456	TGA	2	6	267730	267735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672215
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4577	NC_009456	TTGA	2	8	267813	267820	25 %	50 %	25 %	0 %	147672215
4578	NC_009456	ACC	2	6	267904	267909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671488
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4580	NC_009456	GTC	2	6	267946	267951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671488
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4584	NC_009456	TAAG	2	8	268100	268107	50 %	25 %	25 %	0 %	147671488
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4588	NC_009456	GC	3	6	268540	268545	0 %	0 %	50 %	50 %	147672218
4589	NC_009456	GCC	2	6	268591	268596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672218
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4592	NC_009456	A	7	7	268664	268670	100 %	0 %	0 %	0 %	147672218
4593	NC_009456	CAA	2	6	268679	268684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672218
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4595	NC_009456	GGCTT	2	10	268763	268772	0 %	40 %	40 %	20 %	147672218
4596	NC_009456	TAA	2	6	268814	268819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672218
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4603	NC_009456	TCA	2	6	269435	269440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671559
4604	NC_009456	ACC	2	6	269548	269553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671559
4605	NC_009456	ACC	2	6	269649	269654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671559
4606	NC_009456	CGG	2	6	269660	269665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671559
4607	NC_009456	AAT	2	6	269700	269705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671559
4608	NC_009456	GCG	2	6	269714	269719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671559
4609	NC_009456	GCC	2	6	269730	269735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671559
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4620	NC_009456	G	6	6	270349	270354	0 %	0 %	100 %	0 %	147672360
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4987	NC_009456	GCT	2	6	290860	290865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672346
4988	NC_009456	TAT	2	6	290992	290997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672249
4989	NC_009456	TGA	2	6	291380	291385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672249
4990	NC_009456	CAGC	2	8	291459	291466	25 %	0 %	25 %	50 %	147672249
4991	NC_009456	CTT	2	6	291785	291790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672249
4992	NC_009456	CGC	2	6	291866	291871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672249
4993	NC_009456	GGCG	2	8	291872	291879	0 %	0 %	75 %	25 %	147672249
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4995	NC_009456	CTCAG	2	10	291955	291964	20 %	20 %	20 %	40 %	147672249
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5000	NC_009456	TAGT	2	8	292263	292270	25 %	50 %	25 %	0 %	147671722

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