MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Verminephrobacter eiseniae EF01-2 plasmid pVEIS01

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008771	ACTG	2	8	147	154	25 %	25 %	25 %	25 %	121583591
2	NC_008771	GC	3	6	179	184	0 %	0 %	50 %	50 %	121583591
3	NC_008771	AAC	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583591
4	NC_008771	TGG	2	6	239	244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583591
5	NC_008771	GCG	2	6	271	276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583591
6	NC_008771	TGG	2	6	410	415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583591
7	NC_008771	GTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583591
8	NC_008771	ACG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583591
9	NC_008771	GCG	2	6	731	736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583591
10	NC_008771	CAA	2	6	765	770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583591
11	NC_008771	ACA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583591
12	NC_008771	GCG	2	6	878	883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583591
13	NC_008771	ACG	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583591
14	NC_008771	GGGC	2	8	1180	1187	0 %	0 %	75 %	25 %	121583591
15	NC_008771	CCTTGC	2	12	1242	1253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	121583592
16	NC_008771	TGG	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583592
17	NC_008771	GCC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
18	NC_008771	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583592
19	NC_008771	GGCGC	2	10	1591	1600	0 %	0 %	60 %	40 %	121583592
20	NC_008771	CAC	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583592
21	NC_008771	GCC	2	6	1683	1688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
22	NC_008771	GCC	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
23	NC_008771	TCG	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
24	NC_008771	GTC	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
25	NC_008771	CCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
26	NC_008771	TTG	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583592
27	NC_008771	TCG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
28	NC_008771	CTG	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
29	NC_008771	TGG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583592
30	NC_008771	GT	3	6	2704	2709	0 %	50 %	50 %	0 %	121583593
31	NC_008771	TTGT	2	8	2800	2807	0 %	75 %	25 %	0 %	121583593
32	NC_008771	GCT	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583593
33	NC_008771	TGG	2	6	2952	2957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583593
34	NC_008771	TTC	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583593
35	NC_008771	TGG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583593
36	NC_008771	GCTT	2	8	3134	3141	0 %	50 %	25 %	25 %	121583593
37	NC_008771	CCA	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583593
38	NC_008771	CTT	2	6	3276	3281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583593
39	NC_008771	TGG	3	9	3285	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583593
40	NC_008771	GCG	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
41	NC_008771	GCG	3	9	3490	3498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
42	NC_008771	CGG	3	9	3537	3545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
43	NC_008771	GGCTT	2	10	3569	3578	0 %	40 %	40 %	20 %	121583593
44	NC_008771	GGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
45	NC_008771	CCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583593
46	NC_008771	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583593
47	NC_008771	CGC	2	6	3837	3842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583593
48	NC_008771	CCG	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583594
49	NC_008771	CCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
50	NC_008771	CGC	2	6	4225	4230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583594
51	NC_008771	CGA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
52	NC_008771	GCC	2	6	4291	4296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583594
53	NC_008771	TCG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
54	NC_008771	ACC	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
55	NC_008771	CAAC	2	8	4362	4369	50 %	0 %	0 %	50 %	121583594
56	NC_008771	CCA	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
57	NC_008771	ACC	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
58	NC_008771	AGC	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
59	NC_008771	CCA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
60	NC_008771	TGA	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583594
61	NC_008771	GCA	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
62	NC_008771	ATC	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583594
63	NC_008771	CGT	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
64	NC_008771	TCG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
65	NC_008771	G	6	6	4872	4877	0 %	0 %	100 %	0 %	121583594
66	NC_008771	TCG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
67	NC_008771	CAG	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
68	NC_008771	TGT	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583594
69	NC_008771	ATG	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583594
70	NC_008771	AGC	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
71	NC_008771	ACC	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
72	NC_008771	CGAA	2	8	5295	5302	50 %	0 %	25 %	25 %	121583594
73	NC_008771	CTT	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583594
74	NC_008771	ATG	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583594
75	NC_008771	TCA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583594
76	NC_008771	CAG	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
77	NC_008771	TCA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583594
78	NC_008771	CAC	3	9	5758	5766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
79	NC_008771	A	6	6	5867	5872	100 %	0 %	0 %	0 %	121583594
80	NC_008771	CTTG	2	8	5880	5887	0 %	50 %	25 %	25 %	121583594
81	NC_008771	CAC	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
82	NC_008771	GTC	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
83	NC_008771	ACCC	2	8	5937	5944	25 %	0 %	0 %	75 %	121583594
84	NC_008771	T	6	6	5996	6001	0 %	100 %	0 %	0 %	121583594
85	NC_008771	CAG	2	6	6034	6039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
86	NC_008771	CCA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
87	NC_008771	CTT	2	6	6091	6096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583594
88	NC_008771	CAG	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
89	NC_008771	CAG	3	9	6220	6228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
90	NC_008771	T	7	7	6249	6255	0 %	100 %	0 %	0 %	121583594
91	NC_008771	CG	3	6	6267	6272	0 %	0 %	50 %	50 %	121583595
92	NC_008771	GCA	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583595
93	NC_008771	TTC	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583595
94	NC_008771	GAA	2	6	6336	6341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583595
95	NC_008771	ACC	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583595
96	NC_008771	ACC	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583595
97	NC_008771	ATG	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583595
98	NC_008771	TGA	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583595
99	NC_008771	ACA	2	6	6584	6589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583595
100	NC_008771	GGC	2	6	6683	6688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583595
101	NC_008771	CGT	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583595
102	NC_008771	GCC	2	6	6747	6752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583595
103	NC_008771	AAG	2	6	6793	6798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583595
104	NC_008771	TTG	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583595
105	NC_008771	TTC	2	6	6855	6860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583595
106	NC_008771	AGCC	2	8	6866	6873	25 %	0 %	25 %	50 %	121583595
107	NC_008771	GCC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583595
108	NC_008771	CTT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583595
109	NC_008771	CCG	2	6	7133	7138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583595
110	NC_008771	GCCTG	2	10	7158	7167	0 %	20 %	40 %	40 %	121583595
111	NC_008771	CTCA	2	8	7281	7288	25 %	25 %	0 %	50 %	121583595
112	NC_008771	TCACG	2	10	7314	7323	20 %	20 %	20 %	40 %	121583596
113	NC_008771	CCA	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
114	NC_008771	TCG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
115	NC_008771	CAC	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
116	NC_008771	GTGG	2	8	7367	7374	0 %	25 %	75 %	0 %	121583596
117	NC_008771	TGC	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
118	NC_008771	GCC	2	6	7534	7539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
119	NC_008771	GTTC	2	8	7667	7674	0 %	50 %	25 %	25 %	121583596
120	NC_008771	CTTG	2	8	7680	7687	0 %	50 %	25 %	25 %	121583596
121	NC_008771	TGC	2	6	7697	7702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
122	NC_008771	CAA	2	6	7732	7737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583596
123	NC_008771	GTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583596
124	NC_008771	CGT	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
125	NC_008771	GC	3	6	7821	7826	0 %	0 %	50 %	50 %	121583596
126	NC_008771	GTG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583596
127	NC_008771	GCCC	2	8	7876	7883	0 %	0 %	25 %	75 %	121583596
128	NC_008771	CCA	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
129	NC_008771	CCA	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
130	NC_008771	GCC	3	9	8012	8020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
131	NC_008771	TGC	2	6	8042	8047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
132	NC_008771	CGC	2	6	8109	8114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
133	NC_008771	GTGG	2	8	8138	8145	0 %	25 %	75 %	0 %	121583596
134	NC_008771	CTG	2	6	8164	8169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
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259	NC_008771	G	6	6	15576	15581	0 %	0 %	100 %	0 %	121583604
260	NC_008771	GCT	2	6	15596	15601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583604
261	NC_008771	GCCCTT	4	24	15710	15733	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	121583605
262	NC_008771	CCTC	2	8	15785	15792	0 %	25 %	0 %	75 %	121583605
263	NC_008771	CTG	2	6	15796	15801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583605
264	NC_008771	GCAAG	2	10	15899	15908	40 %	0 %	40 %	20 %	121583605
265	NC_008771	ATC	2	6	15936	15941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583605
266	NC_008771	CCAT	2	8	16039	16046	25 %	25 %	0 %	50 %	121583605
267	NC_008771	CTTG	2	8	16426	16433	0 %	50 %	25 %	25 %	121583606
268	NC_008771	TCA	2	6	16437	16442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583606
269	NC_008771	GCA	2	6	16446	16451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583606
270	NC_008771	GCAG	2	8	16592	16599	25 %	0 %	50 %	25 %	121583606
271	NC_008771	CCCTAG	2	12	16602	16613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121583606
272	NC_008771	AGC	3	9	16710	16718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583606
273	NC_008771	GCA	2	6	16762	16767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583606
274	NC_008771	GGC	2	6	16791	16796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583606
275	NC_008771	CGA	2	6	16803	16808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583606
276	NC_008771	GCC	2	6	16813	16818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583606
277	NC_008771	CGGG	2	8	16825	16832	0 %	0 %	75 %	25 %	121583606
278	NC_008771	AGCG	2	8	16968	16975	25 %	0 %	50 %	25 %	121583607
279	NC_008771	AGCCA	2	10	17037	17046	40 %	0 %	20 %	40 %	121583607
280	NC_008771	GTG	2	6	17070	17075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583607
281	NC_008771	CTGC	2	8	17197	17204	0 %	25 %	25 %	50 %	121583607
282	NC_008771	GCG	2	6	17218	17223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583607
283	NC_008771	GCG	2	6	17271	17276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583608
284	NC_008771	TC	3	6	17277	17282	0 %	50 %	0 %	50 %	121583608
285	NC_008771	GAT	2	6	17307	17312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583608
286	NC_008771	GGT	2	6	17328	17333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583608
287	NC_008771	TCC	2	6	17353	17358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583608
288	NC_008771	CCA	2	6	17372	17377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583608
289	NC_008771	CCA	2	6	17396	17401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583608
290	NC_008771	TGCT	2	8	17506	17513	0 %	50 %	25 %	25 %	121583608
291	NC_008771	ACG	2	6	17883	17888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583609
292	NC_008771	CGG	2	6	17914	17919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583609
293	NC_008771	GACGA	2	10	17951	17960	40 %	0 %	40 %	20 %	121583609
294	NC_008771	CGC	2	6	17961	17966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583609
295	NC_008771	GTG	2	6	17981	17986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583609
296	NC_008771	GGC	2	6	18006	18011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583609
297	NC_008771	CAA	2	6	18109	18114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583609
298	NC_008771	TTCT	2	8	18453	18460	0 %	75 %	0 %	25 %	121583610
299	NC_008771	CTGC	2	8	18587	18594	0 %	25 %	25 %	50 %	121583610
300	NC_008771	CCA	2	6	18629	18634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583610
301	NC_008771	GTA	2	6	18648	18653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583610
302	NC_008771	TGG	2	6	18821	18826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583610
303	NC_008771	ATC	2	6	18933	18938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583610
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308	NC_008771	G	6	6	19198	19203	0 %	0 %	100 %	0 %	121583610
309	NC_008771	CGA	2	6	19263	19268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583610
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312	NC_008771	ACG	2	6	19754	19759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583611
313	NC_008771	ACG	2	6	19801	19806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583611
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375	NC_008771	GC	3	6	24223	24228	0 %	0 %	50 %	50 %	121583618
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380	NC_008771	GAT	2	6	24409	24414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583619
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382	NC_008771	AGCGGC	2	12	24542	24553	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121583619
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384	NC_008771	GCAG	2	8	24643	24650	25 %	0 %	50 %	25 %	121583619
385	NC_008771	GC	3	6	24762	24767	0 %	0 %	50 %	50 %	121583619
386	NC_008771	GCA	2	6	24771	24776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583619
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388	NC_008771	CAG	2	6	24828	24833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583619
389	NC_008771	CGC	2	6	25116	25121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583620
390	NC_008771	CAG	3	9	25167	25175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583620
391	NC_008771	AGC	2	6	25205	25210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583620
392	NC_008771	GA	3	6	25223	25228	50 %	0 %	50 %	0 %	121583620
393	NC_008771	CGC	2	6	25351	25356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583621
394	NC_008771	ACG	2	6	25392	25397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583621
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396	NC_008771	ATCC	2	8	25489	25496	25 %	25 %	0 %	50 %	121583621
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422	NC_008771	GCA	2	6	27122	27127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583624
423	NC_008771	GCG	2	6	27157	27162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583624
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