MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome I

Total Repeats: 54284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006840	TTA	2	6	310	315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710608
2	NC_006840	TGT	2	6	323	328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710608
3	NC_006840	CTG	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710608
4	NC_006840	TTC	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710608
5	NC_006840	ATCT	2	8	376	383	25 %	50 %	0 %	25 %	59710608
6	NC_006840	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710608
7	NC_006840	CAA	2	6	483	488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710608
8	NC_006840	TGT	2	6	552	557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710608
9	NC_006840	TATCAA	2	12	606	617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59710608
10	NC_006840	ATC	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710608
11	NC_006840	TCT	2	6	665	670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710608
12	NC_006840	CAC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710608
13	NC_006840	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710608
14	NC_006840	T	6	6	739	744	0 %	100 %	0 %	0 %	59710608
15	NC_006840	TTTA	2	8	816	823	25 %	75 %	0 %	0 %	59710609
16	NC_006840	ATC	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710609
17	NC_006840	TGT	3	9	896	904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710609
18	NC_006840	TTC	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
19	NC_006840	TTG	2	6	955	960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710609
20	NC_006840	GCT	2	6	983	988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710609
21	NC_006840	CGA	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710609
22	NC_006840	CTT	2	6	1032	1037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
23	NC_006840	T	6	6	1202	1207	0 %	100 %	0 %	0 %	59710609
24	NC_006840	AATT	2	8	1234	1241	50 %	50 %	0 %	0 %	59710609
25	NC_006840	TGT	3	9	1258	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710609
26	NC_006840	ATAA	2	8	1277	1284	75 %	25 %	0 %	0 %	59710609
27	NC_006840	CAATAC	2	12	1323	1334	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59710609
28	NC_006840	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710609
29	NC_006840	AAT	2	6	1375	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710609
30	NC_006840	CT	3	6	1411	1416	0 %	50 %	0 %	50 %	59710609
31	NC_006840	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710609
32	NC_006840	GAC	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710609
33	NC_006840	AAC	2	6	1522	1527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710609
34	NC_006840	ATG	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710609
35	NC_006840	CTT	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
36	NC_006840	ATG	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710609
37	NC_006840	CAC	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710609
38	NC_006840	TGC	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710609
39	NC_006840	TAGA	2	8	1684	1691	50 %	25 %	25 %	0 %	59710609
40	NC_006840	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
41	NC_006840	GAC	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710609
42	NC_006840	ACC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710609
43	NC_006840	AATG	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	59710609
44	NC_006840	CTTTTG	2	12	2091	2102	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	59710609
45	NC_006840	ATG	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710609
46	NC_006840	CGC	2	6	2127	2132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59710609
47	NC_006840	CAA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710609
48	NC_006840	TGTA	2	8	2170	2177	25 %	50 %	25 %	0 %	59710609
49	NC_006840	T	6	6	2299	2304	0 %	100 %	0 %	0 %	59710610
50	NC_006840	AAG	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
51	NC_006840	TCT	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
52	NC_006840	TGT	2	6	2458	2463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
53	NC_006840	TCT	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
54	NC_006840	TAA	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710610
55	NC_006840	GTA	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710610
56	NC_006840	CCAA	2	8	2551	2558	50 %	0 %	0 %	50 %	59710610
57	NC_006840	GAA	3	9	2628	2636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
58	NC_006840	ACC	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
59	NC_006840	TCTT	2	8	2669	2676	0 %	75 %	0 %	25 %	59710610
60	NC_006840	CAT	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710610
61	NC_006840	CAC	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
62	NC_006840	GTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710610
63	NC_006840	AACC	2	8	2915	2922	50 %	0 %	0 %	50 %	59710610
64	NC_006840	AGC	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710610
65	NC_006840	TTTC	2	8	2964	2971	0 %	75 %	0 %	25 %	59710610
66	NC_006840	CTT	2	6	3012	3017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
67	NC_006840	CTG	2	6	3021	3026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
68	NC_006840	CAT	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710610
69	NC_006840	AGT	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710610
70	NC_006840	GATA	2	8	3178	3185	50 %	25 %	25 %	0 %	59710610
71	NC_006840	GTC	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
72	NC_006840	T	6	6	3217	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	59710610
73	NC_006840	TCT	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
74	NC_006840	CAC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
75	NC_006840	CAT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710610
76	NC_006840	T	6	6	3486	3491	0 %	100 %	0 %	0 %	59710610
77	NC_006840	TG	3	6	3567	3572	0 %	50 %	50 %	0 %	59710610
78	NC_006840	CGT	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
79	NC_006840	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
80	NC_006840	CGT	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
81	NC_006840	TTA	2	6	3629	3634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710610
82	NC_006840	ATG	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710610
83	NC_006840	CAC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
84	NC_006840	TTGTGA	2	12	3693	3704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710610
85	NC_006840	GAA	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
86	NC_006840	GTTTGT	2	12	3779	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
87	NC_006840	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
88	NC_006840	TTG	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
89	NC_006840	A	6	6	3854	3859	100 %	0 %	0 %	0 %	59710610
90	NC_006840	TTG	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710611
91	NC_006840	ACGA	2	8	4280	4287	50 %	0 %	25 %	25 %	59710611
92	NC_006840	TTG	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710611
93	NC_006840	CAG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710611
94	NC_006840	CTT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710611
95	NC_006840	AG	3	6	4365	4370	50 %	0 %	50 %	0 %	59710611
96	NC_006840	GCTT	2	8	4416	4423	0 %	50 %	25 %	25 %	59710611
97	NC_006840	GA	3	6	4468	4473	50 %	0 %	50 %	0 %	59710611
98	NC_006840	TCA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710611
99	NC_006840	TAGA	2	8	4507	4514	50 %	25 %	25 %	0 %	59710612
100	NC_006840	ACG	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710612
101	NC_006840	TTACG	2	10	4546	4555	20 %	40 %	20 %	20 %	59710612
102	NC_006840	TAG	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710612
103	NC_006840	CGA	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710613
104	NC_006840	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	59710613
105	NC_006840	TCA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710613
106	NC_006840	AAT	2	6	5072	5077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710613
107	NC_006840	AGT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710613
108	NC_006840	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710613
109	NC_006840	AGC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710613
110	NC_006840	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710613
111	NC_006840	T	7	7	5203	5209	0 %	100 %	0 %	0 %	59710613
112	NC_006840	CGT	2	6	5214	5219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710613
113	NC_006840	TTA	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710613
114	NC_006840	TTC	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710613
115	NC_006840	TG	3	6	5347	5352	0 %	50 %	50 %	0 %	59710613
116	NC_006840	TC	3	6	5475	5480	0 %	50 %	0 %	50 %	59710613
117	NC_006840	ATC	2	6	5555	5560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710613
118	NC_006840	TTC	2	6	5583	5588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710614
119	NC_006840	ACG	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710614
120	NC_006840	AATA	2	8	5630	5637	75 %	25 %	0 %	0 %	59710614
121	NC_006840	AG	3	6	5734	5739	50 %	0 %	50 %	0 %	59710614
122	NC_006840	AAG	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710614
123	NC_006840	TGT	2	6	5832	5837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710614
124	NC_006840	AAT	2	6	5883	5888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710614
125	NC_006840	TAA	2	6	6001	6006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710614
126	NC_006840	AGG	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59710614
127	NC_006840	TAA	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710614
128	NC_006840	AAG	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710614
129	NC_006840	ATA	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710614
130	NC_006840	AAC	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710614
131	NC_006840	AAATC	2	10	6214	6223	60 %	20 %	0 %	20 %	59710614
132	NC_006840	GA	3	6	6384	6389	50 %	0 %	50 %	0 %	59710615
133	NC_006840	CT	3	6	6409	6414	0 %	50 %	0 %	50 %	59710615
134	NC_006840	CTT	2	6	6438	6443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710615
135	NC_006840	CAT	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710615
136	NC_006840	ATC	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710615
137	NC_006840	TTTGGT	2	12	6820	6831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710615
138	NC_006840	ATTTG	2	10	6833	6842	20 %	60 %	20 %	0 %	59710615
139	NC_006840	TAA	2	6	6868	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710615
140	NC_006840	GCG	2	6	6925	6930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59710615
141	NC_006840	TGC	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710615
142	NC_006840	TTC	2	6	7088	7093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710615
143	NC_006840	TGAT	2	8	7104	7111	25 %	50 %	25 %	0 %	59710615
144	NC_006840	AAG	2	6	7441	7446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710616
145	NC_006840	ATT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710616
146	NC_006840	CTG	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710616
147	NC_006840	CTG	3	9	7675	7683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710616
148	NC_006840	TGC	2	6	7688	7693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710616
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150	NC_006840	TTG	2	6	7828	7833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710616
151	NC_006840	GGC	2	6	7859	7864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59710616
152	NC_006840	CT	3	6	7906	7911	0 %	50 %	0 %	50 %	59710616
153	NC_006840	TGG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710616
154	NC_006840	TTG	2	6	7972	7977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710616
155	NC_006840	AAT	2	6	8052	8057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710616
156	NC_006840	GAA	2	6	8064	8069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710616
157	NC_006840	TTA	2	6	8078	8083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710616
158	NC_006840	TGCTT	2	10	8096	8105	0 %	60 %	20 %	20 %	59710616
159	NC_006840	GAT	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710616
160	NC_006840	TTC	2	6	8121	8126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710616
161	NC_006840	AAG	2	6	8146	8151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710616
162	NC_006840	T	6	6	8154	8159	0 %	100 %	0 %	0 %	59710616
163	NC_006840	CAA	2	6	8190	8195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710616
164	NC_006840	AGAT	2	8	8210	8217	50 %	25 %	25 %	0 %	59710616
165	NC_006840	TTGG	2	8	8263	8270	0 %	50 %	50 %	0 %	59710616
166	NC_006840	TGA	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710616
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168	NC_006840	CTT	2	6	8372	8377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710616
169	NC_006840	GATT	2	8	8471	8478	25 %	50 %	25 %	0 %	59710616
170	NC_006840	TTA	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710616
171	NC_006840	ATA	2	6	8536	8541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710616
172	NC_006840	A	6	6	8545	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	59710616
173	NC_006840	TAT	2	6	8587	8592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710616
174	NC_006840	CGT	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710616
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176	NC_006840	TGG	2	6	8693	8698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710616
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180	NC_006840	TAATT	2	10	8783	8792	40 %	60 %	0 %	0 %	59710616
181	NC_006840	TAT	2	6	8839	8844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710617
182	NC_006840	CAA	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710617
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252	NC_006840	CCGATG	2	12	12546	12557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59710619
253	NC_006840	CTT	2	6	12581	12586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710619
254	NC_006840	TTC	2	6	12593	12598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710619
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257	NC_006840	AAGATG	2	12	12696	12707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59710619
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259	NC_006840	ACA	2	6	12816	12821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710619
260	NC_006840	ATCG	2	8	12836	12843	25 %	25 %	25 %	25 %	59710619
261	NC_006840	TCG	2	6	12850	12855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710619
262	NC_006840	TG	3	6	12912	12917	0 %	50 %	50 %	0 %	59710619
263	NC_006840	TGA	2	6	12919	12924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710619
264	NC_006840	TTG	2	6	12954	12959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710619
265	NC_006840	TGC	2	6	13000	13005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710619
266	NC_006840	TGA	2	6	13015	13020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710619
267	NC_006840	GTT	2	6	13049	13054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710619
268	NC_006840	TCT	2	6	13153	13158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710619
269	NC_006840	AGA	2	6	13159	13164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710619
270	NC_006840	GTG	2	6	13182	13187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710619
271	NC_006840	TCG	2	6	13246	13251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710619
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274	NC_006840	TCG	2	6	13333	13338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710619
275	NC_006840	ATG	2	6	13340	13345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710619
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278	NC_006840	TAC	2	6	13387	13392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710619
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280	NC_006840	TAT	2	6	13891	13896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710620
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282	NC_006840	AAAT	2	8	14026	14033	75 %	25 %	0 %	0 %	59710620
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296	NC_006840	TCT	2	6	14991	14996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710621
297	NC_006840	CATA	2	8	15052	15059	50 %	25 %	0 %	25 %	59710621
298	NC_006840	CTT	2	6	15186	15191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710621
299	NC_006840	ATTAC	2	10	15200	15209	40 %	40 %	0 %	20 %	59710621
300	NC_006840	TCA	2	6	15254	15259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710621
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381	NC_006840	GAA	2	6	19506	19511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710624
382	NC_006840	A	6	6	19586	19591	100 %	0 %	0 %	0 %	59710624
383	NC_006840	ATT	2	6	19643	19648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710624
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386	NC_006840	ACA	2	6	19902	19907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710624
387	NC_006840	GAAT	2	8	19953	19960	50 %	25 %	25 %	0 %	59710624
388	NC_006840	GTG	2	6	20034	20039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710624
389	NC_006840	TTC	2	6	20092	20097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710624
390	NC_006840	GGT	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710624
391	NC_006840	GCGAGT	2	12	20245	20256	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59710624
392	NC_006840	CTT	2	6	20309	20314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710624
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394	NC_006840	GAA	2	6	20461	20466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710624
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397	NC_006840	A	6	6	20745	20750	100 %	0 %	0 %	0 %	59710624
398	NC_006840	GTT	2	6	20770	20775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710624
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