MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004605	CAC	2	6	213737	213742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900067
3502	NC_004605	CGA	2	6	213745	213750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3503	NC_004605	AATA	2	8	213771	213778	75 %	25 %	0 %	0 %	28900067
3504	NC_004605	GAAGA	2	10	213858	213867	60 %	0 %	40 %	0 %	28900067
3505	NC_004605	GTT	2	6	213872	213877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900067
3506	NC_004605	ATCG	2	8	213896	213903	25 %	25 %	25 %	25 %	28900067
3507	NC_004605	ATC	2	6	214098	214103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3508	NC_004605	CAG	2	6	214226	214231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3509	NC_004605	GGC	2	6	214283	214288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900067
3510	NC_004605	AGA	2	6	214340	214345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900067
3511	NC_004605	AGC	2	6	214361	214366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3512	NC_004605	ATG	2	6	214402	214407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067
3513	NC_004605	GGT	2	6	214424	214429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900067
3514	NC_004605	AAC	2	6	214467	214472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3515	NC_004605	CGT	2	6	214489	214494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3516	NC_004605	TTC	2	6	214499	214504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900067
3517	NC_004605	TGA	2	6	214568	214573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067
3518	NC_004605	ACT	2	6	214747	214752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3519	NC_004605	AAC	2	6	214785	214790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3520	NC_004605	CGA	2	6	214807	214812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3521	NC_004605	GCG	2	6	214869	214874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900067
3522	NC_004605	TTC	2	6	214916	214921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900067
3523	NC_004605	GCGA	2	8	214962	214969	25 %	0 %	50 %	25 %	28900067
3524	NC_004605	CAA	2	6	215019	215024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3525	NC_004605	CAA	2	6	215045	215050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3526	NC_004605	ACA	2	6	215056	215061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3527	NC_004605	GT	3	6	215073	215078	0 %	50 %	50 %	0 %	28900067
3528	NC_004605	TGAAG	2	10	215081	215090	40 %	20 %	40 %	0 %	28900067
3529	NC_004605	CCG	2	6	215152	215157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900067
3530	NC_004605	TGA	2	6	215165	215170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067
3531	NC_004605	TAC	2	6	215208	215213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3532	NC_004605	TGAA	2	8	215224	215231	50 %	25 %	25 %	0 %	28900067
3533	NC_004605	AGA	2	6	215318	215323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900067
3534	NC_004605	GAC	2	6	215390	215395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3535	NC_004605	ATT	2	6	215399	215404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900067
3536	NC_004605	A	6	6	215631	215636	100 %	0 %	0 %	0 %	28900067
3537	NC_004605	TTC	2	6	215646	215651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900067
3538	NC_004605	TG	3	6	215682	215687	0 %	50 %	50 %	0 %	28900067
3539	NC_004605	GGCA	2	8	215699	215706	25 %	0 %	50 %	25 %	28900067
3540	NC_004605	ACA	2	6	215740	215745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3541	NC_004605	CAGC	2	8	215782	215789	25 %	0 %	25 %	50 %	28900067
3542	NC_004605	TGA	2	6	215795	215800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067
3543	NC_004605	GCA	2	6	215805	215810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3544	NC_004605	TA	3	6	215838	215843	50 %	50 %	0 %	0 %	28900067
3545	NC_004605	CTT	2	6	215966	215971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900067
3546	NC_004605	GCT	2	6	216020	216025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3547	NC_004605	CAT	2	6	216059	216064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3548	NC_004605	TGG	2	6	216109	216114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900067
3549	NC_004605	ACC	2	6	216191	216196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900067
3550	NC_004605	AGC	2	6	216349	216354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3551	NC_004605	ATC	2	6	216369	216374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3552	NC_004605	CAA	2	6	216421	216426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900067
3553	NC_004605	AG	3	6	216536	216541	50 %	0 %	50 %	0 %	28900067
3554	NC_004605	TGC	2	6	216604	216609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900067
3555	NC_004605	TCA	2	6	216691	216696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3556	NC_004605	GGT	2	6	216768	216773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900067
3557	NC_004605	GATGC	2	10	216813	216822	20 %	20 %	40 %	20 %	28900067
3558	NC_004605	ATG	2	6	216852	216857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067
3559	NC_004605	GTG	2	6	216955	216960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900067
3560	NC_004605	TAC	2	6	216984	216989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3561	NC_004605	GAT	2	6	217114	217119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900068
3562	NC_004605	TCT	2	6	217127	217132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900068
3563	NC_004605	TCA	2	6	217134	217139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900068
3564	NC_004605	TTCG	2	8	217155	217162	0 %	50 %	25 %	25 %	28900068
3565	NC_004605	AGC	2	6	217171	217176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900068
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3568	NC_004605	GA	3	6	217485	217490	50 %	0 %	50 %	0 %	28900069
3569	NC_004605	TC	3	6	217641	217646	0 %	50 %	0 %	50 %	28900069
3570	NC_004605	TGA	2	6	217693	217698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900069
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3572	NC_004605	TGG	2	6	217823	217828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900069
3573	NC_004605	CAT	2	6	217902	217907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900069
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3582	NC_004605	TGAG	2	8	218368	218375	25 %	25 %	50 %	0 %	28900070
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3590	NC_004605	TGAC	2	8	218977	218984	25 %	25 %	25 %	25 %	28900071
3591	NC_004605	CGAG	2	8	219187	219194	25 %	0 %	50 %	25 %	28900071
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3594	NC_004605	ACA	2	6	219496	219501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900071
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3602	NC_004605	GCA	2	6	220154	220159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900072
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3621	NC_004605	T	6	6	221059	221064	0 %	100 %	0 %	0 %	28900074
3622	NC_004605	TGC	2	6	221091	221096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900074
3623	NC_004605	TTG	2	6	221145	221150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900074
3624	NC_004605	CTT	2	6	221162	221167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900074
3625	NC_004605	TTTGAT	2	12	221272	221283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	28900074
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3627	NC_004605	CTT	2	6	221534	221539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900075
3628	NC_004605	TGC	2	6	221593	221598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900075
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3732	NC_004605	TTGGC	2	10	227981	227990	0 %	40 %	40 %	20 %	28900079
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3742	NC_004605	CCAAG	2	10	228608	228617	40 %	0 %	20 %	40 %	28900080
3743	NC_004605	CGG	2	6	228622	228627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900080
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3993	NC_004605	CATG	2	8	244124	244131	25 %	25 %	25 %	25 %	28900094
3994	NC_004605	TGG	2	6	244248	244253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900094
3995	NC_004605	TGA	2	6	244319	244324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900094
3996	NC_004605	T	6	6	244405	244410	0 %	100 %	0 %	0 %	28900094
3997	NC_004605	GCG	2	6	244426	244431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900094
3998	NC_004605	CGAC	2	8	244529	244536	25 %	0 %	25 %	50 %	28900094
3999	NC_004605	GTG	2	6	244549	244554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900094
4000	NC_004605	CAT	2	6	244590	244595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900094

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