MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004605	AAAC	2	8	183887	183894	75 %	0 %	0 %	25 %	28900040
3002	NC_004605	TGC	2	6	183968	183973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900040
3003	NC_004605	CCAA	2	8	183993	184000	50 %	0 %	0 %	50 %	28900040
3004	NC_004605	CATC	2	8	184019	184026	25 %	25 %	0 %	50 %	28900040
3005	NC_004605	CAC	2	6	184061	184066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900040
3006	NC_004605	CTG	2	6	184100	184105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900040
3007	NC_004605	GACA	2	8	184122	184129	50 %	0 %	25 %	25 %	28900040
3008	NC_004605	TGA	2	6	184130	184135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900040
3009	NC_004605	CAAC	2	8	184181	184188	50 %	0 %	0 %	50 %	28900040
3010	NC_004605	GCC	2	6	184252	184257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900040
3011	NC_004605	CGATGA	2	12	184328	184339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28900040
3012	NC_004605	CCA	2	6	184415	184420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900040
3013	NC_004605	GGC	2	6	184569	184574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900040
3014	NC_004605	TGCG	2	8	184580	184587	0 %	25 %	50 %	25 %	28900040
3015	NC_004605	AG	4	8	184727	184734	50 %	0 %	50 %	0 %	28900041
3016	NC_004605	AGG	2	6	184736	184741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28900041
3017	NC_004605	GCA	2	6	184748	184753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900041
3018	NC_004605	GA	3	6	184804	184809	50 %	0 %	50 %	0 %	28900041
3019	NC_004605	A	6	6	184822	184827	100 %	0 %	0 %	0 %	28900041
3020	NC_004605	TATT	2	8	185355	185362	25 %	75 %	0 %	0 %	28900042
3021	NC_004605	TAA	2	6	185473	185478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900043
3022	NC_004605	GCG	2	6	185547	185552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900043
3023	NC_004605	TGG	2	6	185588	185593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900043
3024	NC_004605	TAC	2	6	185598	185603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900043
3025	NC_004605	CAC	2	6	185655	185660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900043
3026	NC_004605	CTG	2	6	185683	185688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900043
3027	NC_004605	TGAA	2	8	185713	185720	50 %	25 %	25 %	0 %	28900043
3028	NC_004605	CGG	2	6	186026	186031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900043
3029	NC_004605	CAG	2	6	186079	186084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900043
3030	NC_004605	GCG	2	6	186117	186122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900043
3031	NC_004605	CAAG	2	8	186167	186174	50 %	0 %	25 %	25 %	28900043
3032	NC_004605	ACG	2	6	186249	186254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900043
3033	NC_004605	TAC	2	6	186438	186443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900043
3034	NC_004605	ACC	3	9	186639	186647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900044
3035	NC_004605	TGCAT	2	10	186674	186683	20 %	40 %	20 %	20 %	28900044
3036	NC_004605	GCA	2	6	186831	186836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900044
3037	NC_004605	GTG	2	6	186892	186897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900044
3038	NC_004605	CGC	2	6	186963	186968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900044
3039	NC_004605	GGT	2	6	186976	186981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900044
3040	NC_004605	GTT	2	6	187017	187022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900044
3041	NC_004605	TTC	2	6	187100	187105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900044
3042	NC_004605	CAT	2	6	187205	187210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900044
3043	NC_004605	ATC	2	6	187239	187244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900044
3044	NC_004605	TGC	2	6	187379	187384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900044
3045	NC_004605	GGT	2	6	187410	187415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900044
3046	NC_004605	GGGC	2	8	187438	187445	0 %	0 %	75 %	25 %	28900044
3047	NC_004605	ATTT	2	8	187518	187525	25 %	75 %	0 %	0 %	28900044
3048	NC_004605	GTCG	2	8	187529	187536	0 %	25 %	50 %	25 %	28900044
3049	NC_004605	T	6	6	187539	187544	0 %	100 %	0 %	0 %	28900044
3050	NC_004605	CGAAG	3	15	187553	187567	40 %	0 %	40 %	20 %	28900044
3051	NC_004605	TGG	2	6	187645	187650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900044
3052	NC_004605	CAT	2	6	187706	187711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900044
3053	NC_004605	TGT	3	9	187715	187723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900044
3054	NC_004605	ATC	2	6	187767	187772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900044
3055	NC_004605	GAA	2	6	187793	187798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900044
3056	NC_004605	ACC	2	6	187806	187811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900044
3057	NC_004605	TGG	2	6	187822	187827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900044
3058	NC_004605	TGA	2	6	187885	187890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900044
3059	NC_004605	TCA	2	6	187918	187923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900044
3060	NC_004605	GCG	2	6	187980	187985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900044
3061	NC_004605	AAGCGA	2	12	188083	188094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28900044
3062	NC_004605	TCT	2	6	188126	188131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900044
3063	NC_004605	GAAA	2	8	188159	188166	75 %	0 %	25 %	0 %	28900044
3064	NC_004605	CTG	2	6	188182	188187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900044
3065	NC_004605	TTG	2	6	188191	188196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900044
3066	NC_004605	CTA	2	6	188202	188207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900044
3067	NC_004605	TTGGC	2	10	188233	188242	0 %	40 %	40 %	20 %	28900044
3068	NC_004605	TTG	2	6	188244	188249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900044
3069	NC_004605	CCA	2	6	188298	188303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900044
3070	NC_004605	GT	3	6	188304	188309	0 %	50 %	50 %	0 %	28900044
3071	NC_004605	GCG	2	6	188325	188330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900044
3072	NC_004605	CCA	2	6	188346	188351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900044
3073	NC_004605	CTT	2	6	188465	188470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900044
3074	NC_004605	AT	3	6	188533	188538	50 %	50 %	0 %	0 %	28900044
3075	NC_004605	TGA	2	6	188539	188544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900044
3076	NC_004605	TTTGG	2	10	188573	188582	0 %	60 %	40 %	0 %	28900044
3077	NC_004605	GTGTG	2	10	188605	188614	0 %	40 %	60 %	0 %	28900044
3078	NC_004605	GTTT	2	8	188636	188643	0 %	75 %	25 %	0 %	28900044
3079	NC_004605	TTG	2	6	188724	188729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900045
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3081	NC_004605	GT	3	6	188748	188753	0 %	50 %	50 %	0 %	28900045
3082	NC_004605	CAA	2	6	188771	188776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900045
3083	NC_004605	GCG	2	6	188850	188855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900045
3084	NC_004605	GT	3	6	188868	188873	0 %	50 %	50 %	0 %	28900045
3085	NC_004605	A	6	6	188922	188927	100 %	0 %	0 %	0 %	28900045
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3089	NC_004605	CGAA	2	8	189007	189014	50 %	0 %	25 %	25 %	28900045
3090	NC_004605	TGA	2	6	189067	189072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900045
3091	NC_004605	ACC	2	6	189131	189136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900045
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3093	NC_004605	GGT	2	6	189194	189199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900045
3094	NC_004605	GGT	2	6	189220	189225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900045
3095	NC_004605	GCC	2	6	189227	189232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900045
3096	NC_004605	GAA	2	6	189245	189250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900045
3097	NC_004605	ATG	2	6	189347	189352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900045
3098	NC_004605	CCGA	2	8	189359	189366	25 %	0 %	25 %	50 %	28900045
3099	NC_004605	TAC	2	6	189395	189400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900045
3100	NC_004605	GTG	2	6	189425	189430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900045
3101	NC_004605	TCCAGA	2	12	189451	189462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28900045
3102	NC_004605	TGAT	2	8	189495	189502	25 %	50 %	25 %	0 %	28900045
3103	NC_004605	CA	3	6	189622	189627	50 %	0 %	0 %	50 %	28900045
3104	NC_004605	GTG	2	6	189667	189672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900045
3105	NC_004605	AATA	2	8	189698	189705	75 %	25 %	0 %	0 %	28900045
3106	NC_004605	CG	3	6	189755	189760	0 %	0 %	50 %	50 %	28900045
3107	NC_004605	AG	3	6	189808	189813	50 %	0 %	50 %	0 %	28900045
3108	NC_004605	AAG	2	6	189817	189822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900045
3109	NC_004605	GT	3	6	189830	189835	0 %	50 %	50 %	0 %	28900045
3110	NC_004605	GTC	2	6	189920	189925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900045
3111	NC_004605	T	6	6	190013	190018	0 %	100 %	0 %	0 %	28900046
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3113	NC_004605	GCGCT	2	10	190202	190211	0 %	20 %	40 %	40 %	28900046
3114	NC_004605	CTTG	2	8	190303	190310	0 %	50 %	25 %	25 %	28900046
3115	NC_004605	TTG	2	6	190326	190331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900046
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3120	NC_004605	GAG	2	6	191114	191119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28900047
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3124	NC_004605	ACG	2	6	191284	191289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900047
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3126	NC_004605	GAA	2	6	191355	191360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900047
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3139	NC_004605	G	6	6	191835	191840	0 %	0 %	100 %	0 %	28900047
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3141	NC_004605	TGG	2	6	191862	191867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900047
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3235	NC_004605	AGC	2	6	197936	197941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900053
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3241	NC_004605	CGG	2	6	198196	198201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900053
3242	NC_004605	A	6	6	198204	198209	100 %	0 %	0 %	0 %	28900053
3243	NC_004605	TCA	2	6	198375	198380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900054
3244	NC_004605	TGC	2	6	198508	198513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900054
3245	NC_004605	AC	3	6	198526	198531	50 %	0 %	0 %	50 %	28900054
3246	NC_004605	TTG	2	6	198542	198547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900054
3247	NC_004605	GTC	2	6	198563	198568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900054
3248	NC_004605	CTT	2	6	198658	198663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900054
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3369	NC_004605	TTACG	2	10	205917	205926	20 %	40 %	20 %	20 %	28900059
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3495	NC_004605	TGA	2	6	213464	213469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067
3496	NC_004605	CAC	2	6	213478	213483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900067
3497	NC_004605	ATA	2	6	213562	213567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900067
3498	NC_004605	CTA	2	6	213644	213649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900067
3499	NC_004605	AAGTG	2	10	213665	213674	40 %	20 %	40 %	0 %	28900067
3500	NC_004605	TGA	2	6	213713	213718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900067

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