MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_004605	GCT	2	6	1811184	1811189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901548
30002	NC_004605	TGA	2	6	1811190	1811195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901548
30003	NC_004605	CTA	2	6	1811330	1811335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901548
30004	NC_004605	GTG	2	6	1811425	1811430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901548
30005	NC_004605	GGCA	2	8	1811451	1811458	25 %	0 %	50 %	25 %	28901548
30006	NC_004605	AGCG	2	8	1811469	1811476	25 %	0 %	50 %	25 %	28901548
30007	NC_004605	TCAA	2	8	1811521	1811528	50 %	25 %	0 %	25 %	28901548
30008	NC_004605	TGA	2	6	1811538	1811543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901548
30009	NC_004605	AGA	2	6	1811559	1811564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901548
30010	NC_004605	GGT	2	6	1811607	1811612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901548
30011	NC_004605	ACA	2	6	1811705	1811710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901548
30012	NC_004605	TAC	2	6	1811785	1811790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901548
30013	NC_004605	AAG	2	6	1811820	1811825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901548
30014	NC_004605	CA	3	6	1811846	1811851	50 %	0 %	0 %	50 %	28901548
30015	NC_004605	GTG	2	6	1811956	1811961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901548
30016	NC_004605	GATG	2	8	1811979	1811986	25 %	25 %	50 %	0 %	28901548
30017	NC_004605	ATC	2	6	1811989	1811994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901548
30018	NC_004605	CGC	2	6	1812073	1812078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901549
30019	NC_004605	TGC	2	6	1812092	1812097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901549
30020	NC_004605	CAAAT	2	10	1812110	1812119	60 %	20 %	0 %	20 %	28901549
30021	NC_004605	TC	3	6	1812164	1812169	0 %	50 %	0 %	50 %	28901549
30022	NC_004605	GGC	2	6	1812229	1812234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901549
30023	NC_004605	ATC	2	6	1812236	1812241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901549
30024	NC_004605	AGGT	2	8	1812263	1812270	25 %	25 %	50 %	0 %	28901549
30025	NC_004605	TTCAG	2	10	1812293	1812302	20 %	40 %	20 %	20 %	28901549
30026	NC_004605	TGGC	2	8	1812398	1812405	0 %	25 %	50 %	25 %	28901549
30027	NC_004605	ACT	2	6	1812406	1812411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901549
30028	NC_004605	GTA	2	6	1812436	1812441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901549
30029	NC_004605	TTC	2	6	1812466	1812471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901549
30030	NC_004605	TGA	2	6	1812485	1812490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901549
30031	NC_004605	GTA	2	6	1812517	1812522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901549
30032	NC_004605	GA	3	6	1812589	1812594	50 %	0 %	50 %	0 %	28901549
30033	NC_004605	CCA	2	6	1812615	1812620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901549
30034	NC_004605	CCTT	2	8	1812761	1812768	0 %	50 %	0 %	50 %	28901549
30035	NC_004605	CCG	2	6	1812781	1812786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901549
30036	NC_004605	GTT	2	6	1812816	1812821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901549
30037	NC_004605	AAC	2	6	1812866	1812871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901549
30038	NC_004605	AG	3	6	1812931	1812936	50 %	0 %	50 %	0 %	28901549
30039	NC_004605	CTG	2	6	1812940	1812945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901549
30040	NC_004605	ATT	2	6	1813097	1813102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28901550
30041	NC_004605	TCA	2	6	1813143	1813148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901550
30042	NC_004605	TGGT	2	8	1813181	1813188	0 %	50 %	50 %	0 %	28901550
30043	NC_004605	CAT	2	6	1813219	1813224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901550
30044	NC_004605	AAC	2	6	1813256	1813261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901550
30045	NC_004605	TCACG	2	10	1813279	1813288	20 %	20 %	20 %	40 %	28901550
30046	NC_004605	CG	3	6	1813340	1813345	0 %	0 %	50 %	50 %	28901550
30047	NC_004605	GTT	2	6	1813347	1813352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901550
30048	NC_004605	AC	3	6	1813558	1813563	50 %	0 %	0 %	50 %	28901550
30049	NC_004605	CGGT	2	8	1813575	1813582	0 %	25 %	50 %	25 %	28901550
30050	NC_004605	GC	3	6	1813688	1813693	0 %	0 %	50 %	50 %	28901550
30051	NC_004605	TCC	2	6	1813780	1813785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28901550
30052	NC_004605	CTG	2	6	1813805	1813810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901550
30053	NC_004605	GAT	2	6	1813822	1813827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901550
30054	NC_004605	CTA	2	6	1813846	1813851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901550
30055	NC_004605	CAT	2	6	1813867	1813872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901550
30056	NC_004605	GAA	2	6	1813886	1813891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901550
30057	NC_004605	TAC	2	6	1814012	1814017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901550
30058	NC_004605	AGC	2	6	1814023	1814028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901550
30059	NC_004605	TGA	2	6	1814037	1814042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901550
30060	NC_004605	CAT	2	6	1814068	1814073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901550
30061	NC_004605	CAA	2	6	1814089	1814094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901550
30062	NC_004605	GAC	2	6	1814117	1814122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901550
30063	NC_004605	TGA	2	6	1814217	1814222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901550
30064	NC_004605	AGCA	2	8	1814328	1814335	50 %	0 %	25 %	25 %	28901550
30065	NC_004605	GAA	2	6	1814339	1814344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901550
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30070	NC_004605	AAG	2	6	1814631	1814636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28901551
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30072	NC_004605	A	6	6	1814672	1814677	100 %	0 %	0 %	0 %	28901551
30073	NC_004605	TTTC	2	8	1814731	1814738	0 %	75 %	0 %	25 %	28901551
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30075	NC_004605	ATCGT	2	10	1814859	1814868	20 %	40 %	20 %	20 %	28901551
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30101	NC_004605	CAT	2	6	1816275	1816280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901552
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30105	NC_004605	CGT	2	6	1816457	1816462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901553
30106	NC_004605	CAAT	2	8	1816516	1816523	50 %	25 %	0 %	25 %	28901553
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30117	NC_004605	GCC	2	6	1817071	1817076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28901553
30118	NC_004605	TTGG	2	8	1817112	1817119	0 %	50 %	50 %	0 %	28901553
30119	NC_004605	CTT	2	6	1817255	1817260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901554
30120	NC_004605	CGG	2	6	1817271	1817276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901554
30121	NC_004605	T	6	6	1817282	1817287	0 %	100 %	0 %	0 %	28901554
30122	NC_004605	GC	3	6	1817296	1817301	0 %	0 %	50 %	50 %	28901554
30123	NC_004605	TGCA	2	8	1817489	1817496	25 %	25 %	25 %	25 %	28901554
30124	NC_004605	CG	3	6	1817545	1817550	0 %	0 %	50 %	50 %	28901554
30125	NC_004605	TAG	2	6	1817552	1817557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901554
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30129	NC_004605	TGC	2	6	1817773	1817778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901554
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30132	NC_004605	GTC	2	6	1818066	1818071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901554
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30217	NC_004605	TCTT	2	8	1822778	1822785	0 %	75 %	0 %	25 %	28901559
30218	NC_004605	GCA	2	6	1822851	1822856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901559
30219	NC_004605	CAT	2	6	1822910	1822915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901559
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30221	NC_004605	ACGTGA	2	12	1822993	1823004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28901559
30222	NC_004605	ATG	2	6	1823013	1823018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901559
30223	NC_004605	CAC	2	6	1823077	1823082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901559
30224	NC_004605	AAAG	2	8	1823087	1823094	75 %	0 %	25 %	0 %	28901559
30225	NC_004605	CTT	2	6	1823134	1823139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901559
30226	NC_004605	TTG	2	6	1823151	1823156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901559
30227	NC_004605	CAT	2	6	1823264	1823269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901559
30228	NC_004605	GGT	2	6	1823270	1823275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28901559
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30230	NC_004605	CGT	2	6	1823295	1823300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901559
30231	NC_004605	TGC	2	6	1823312	1823317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901559
30232	NC_004605	GCG	2	6	1823358	1823363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901559
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30234	NC_004605	CAT	2	6	1823399	1823404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901559
30235	NC_004605	CGG	2	6	1823405	1823410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28901559
30236	NC_004605	CAC	2	6	1823531	1823536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28901559
30237	NC_004605	GTTG	2	8	1823552	1823559	0 %	50 %	50 %	0 %	28901559
30238	NC_004605	GCT	2	6	1823624	1823629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28901559
30239	NC_004605	ATG	2	6	1823649	1823654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28901559
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30241	NC_004605	CAT	2	6	1823672	1823677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901559
30242	NC_004605	CAT	2	6	1823786	1823791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901559
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30340	NC_004605	CCCAAA	2	12	1829143	1829154	50 %	0 %	0 %	50 %	28901564
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30348	NC_004605	CAAA	2	8	1829401	1829408	75 %	0 %	0 %	25 %	28901565
30349	NC_004605	GTT	2	6	1829481	1829486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28901565
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30351	NC_004605	CAA	2	6	1829584	1829589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28901565
30352	NC_004605	AGC	2	6	1829600	1829605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28901565
30353	NC_004605	TGCGTA	2	12	1829633	1829644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28901565
30354	NC_004605	CTT	2	6	1829659	1829664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901565
30355	NC_004605	CAT	2	6	1829698	1829703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901565
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30358	NC_004605	ATC	2	6	1829877	1829882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28901565
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30372	NC_004605	TGAT	2	8	1830916	1830923	25 %	50 %	25 %	0 %	28901568
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30375	NC_004605	TCT	2	6	1831110	1831115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28901568
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