MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004605	TTGG	2	8	667098	667105	0 %	50 %	50 %	0 %	28900519
11002	NC_004605	GAA	2	6	667124	667129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900519
11003	NC_004605	ATA	2	6	667239	667244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900519
11004	NC_004605	GAT	2	6	667307	667312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900519
11005	NC_004605	CTG	2	6	667544	667549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900520
11006	NC_004605	ATT	2	6	667585	667590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900520
11007	NC_004605	AG	3	6	667669	667674	50 %	0 %	50 %	0 %	28900520
11008	NC_004605	A	6	6	667720	667725	100 %	0 %	0 %	0 %	28900520
11009	NC_004605	T	9	9	667794	667802	0 %	100 %	0 %	0 %	28900521
11010	NC_004605	CTG	2	6	667804	667809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900521
11011	NC_004605	ACT	2	6	667862	667867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900521
11012	NC_004605	AATC	2	8	667875	667882	50 %	25 %	0 %	25 %	28900521
11013	NC_004605	ATT	2	6	668018	668023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900521
11014	NC_004605	ATT	2	6	668318	668323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28900522
11015	NC_004605	ATG	2	6	668342	668347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900522
11016	NC_004605	TAGTT	2	10	668359	668368	20 %	60 %	20 %	0 %	28900522
11017	NC_004605	GT	3	6	668410	668415	0 %	50 %	50 %	0 %	28900522
11018	NC_004605	ATG	2	6	668438	668443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900522
11019	NC_004605	TTCTT	2	10	668495	668504	0 %	80 %	0 %	20 %	28900522
11020	NC_004605	TAA	2	6	668514	668519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28900522
11021	NC_004605	TTTG	2	8	668551	668558	0 %	75 %	25 %	0 %	28900522
11022	NC_004605	TCA	2	6	669106	669111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
11023	NC_004605	AAC	2	6	669113	669118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900523
11024	NC_004605	ATG	2	6	669200	669205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
11025	NC_004605	TGC	2	6	669207	669212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900523
11026	NC_004605	CAA	2	6	669217	669222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900523
11027	NC_004605	CCGAC	2	10	669239	669248	20 %	0 %	20 %	60 %	28900523
11028	NC_004605	TGG	2	6	669273	669278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11029	NC_004605	ACA	2	6	669323	669328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900523
11030	NC_004605	GAA	2	6	669394	669399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900523
11031	NC_004605	TGG	2	6	669432	669437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11032	NC_004605	GGCG	2	8	669522	669529	0 %	0 %	75 %	25 %	28900523
11033	NC_004605	CTG	2	6	669563	669568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900523
11034	NC_004605	TGG	2	6	669615	669620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11035	NC_004605	ACG	2	6	669641	669646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
11036	NC_004605	CAT	2	6	669660	669665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
11037	NC_004605	ATTGAA	2	12	669697	669708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28900523
11038	NC_004605	GAC	2	6	669744	669749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
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11040	NC_004605	TGG	2	6	669855	669860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11041	NC_004605	ACG	2	6	669892	669897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
11042	NC_004605	GAA	2	6	669946	669951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900523
11043	NC_004605	GGT	2	6	670134	670139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11044	NC_004605	CGATA	2	10	670215	670224	40 %	20 %	20 %	20 %	28900523
11045	NC_004605	ACG	2	6	670240	670245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
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11050	NC_004605	CTT	2	6	670727	670732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900523
11051	NC_004605	GAT	2	6	670786	670791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
11052	NC_004605	GAC	2	6	670834	670839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
11053	NC_004605	CAC	2	6	670893	670898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900523
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11055	NC_004605	CCAAT	2	10	670946	670955	40 %	20 %	0 %	40 %	28900523
11056	NC_004605	TGG	2	6	671063	671068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11057	NC_004605	GTG	2	6	671279	671284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
11058	NC_004605	GTTG	2	8	671301	671308	0 %	50 %	50 %	0 %	28900523
11059	NC_004605	TTACA	2	10	671483	671492	40 %	40 %	0 %	20 %	28900523
11060	NC_004605	CAT	2	6	671580	671585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900523
11061	NC_004605	TGA	2	6	671682	671687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
11062	NC_004605	CTGG	2	8	671695	671702	0 %	25 %	50 %	25 %	28900523
11063	NC_004605	CAGA	2	8	671765	671772	50 %	0 %	25 %	25 %	28900523
11064	NC_004605	GCC	2	6	671836	671841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28900523
11065	NC_004605	CAG	2	6	671891	671896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
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11068	NC_004605	TGA	2	6	672111	672116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900523
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11232	NC_004605	ACGGTA	2	12	681793	681804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28900523
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11235	NC_004605	GCAA	2	8	681921	681928	50 %	0 %	25 %	25 %	28900523
11236	NC_004605	TCACA	2	10	681981	681990	40 %	20 %	0 %	40 %	28900523
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11241	NC_004605	AGTTG	2	10	682335	682344	20 %	40 %	40 %	0 %	28900523
11242	NC_004605	TTTGA	2	10	682366	682375	20 %	60 %	20 %	0 %	28900523
11243	NC_004605	GGTTC	2	10	682462	682471	0 %	40 %	40 %	20 %	28900523
11244	NC_004605	GTT	2	6	682489	682494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900523
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11259	NC_004605	GTG	2	6	682972	682977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900523
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11272	NC_004605	CGA	2	6	684066	684071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900523
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11343	NC_004605	CGATA	2	10	688554	688563	40 %	20 %	20 %	20 %	28900526
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11358	NC_004605	AAG	2	6	689404	689409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900526
11359	NC_004605	AGC	2	6	689611	689616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900526
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11362	NC_004605	TCA	2	6	690065	690070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900526
11363	NC_004605	GCT	2	6	690230	690235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900526
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11374	NC_004605	CAA	2	6	691307	691312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900527
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11390	NC_004605	A	6	6	691911	691916	100 %	0 %	0 %	0 %	28900527
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11483	NC_004605	ACC	2	6	697063	697068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900530
11484	NC_004605	AAC	2	6	697069	697074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900530
11485	NC_004605	TCA	2	6	697093	697098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900530
11486	NC_004605	A	6	6	697144	697149	100 %	0 %	0 %	0 %	28900530
11487	NC_004605	TGC	2	6	697150	697155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900530
11488	NC_004605	ATC	2	6	697158	697163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900530
11489	NC_004605	GTTG	2	8	697202	697209	0 %	50 %	50 %	0 %	28900530
11490	NC_004605	CAG	2	6	697213	697218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900530
11491	NC_004605	A	7	7	697219	697225	100 %	0 %	0 %	0 %	28900530
11492	NC_004605	TGC	2	6	697325	697330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900530
11493	NC_004605	ATAC	2	8	697342	697349	50 %	25 %	0 %	25 %	28900530
11494	NC_004605	TGA	2	6	697403	697408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900530
11495	NC_004605	GTCAT	2	10	697500	697509	20 %	40 %	20 %	20 %	28900531
11496	NC_004605	TCA	2	6	697545	697550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900531
11497	NC_004605	TTG	2	6	697646	697651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900531
11498	NC_004605	TGT	2	6	697666	697671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900531
11499	NC_004605	ATC	3	9	697699	697707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900532
11500	NC_004605	CAA	2	6	697832	697837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900532

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