MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004605	CAT	2	6	28601	28606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899888
502	NC_004605	TTG	2	6	28620	28625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899888
503	NC_004605	T	6	6	28645	28650	0 %	100 %	0 %	0 %	28899888
504	NC_004605	TCA	2	6	28710	28715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899889
505	NC_004605	TTG	2	6	28799	28804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899889
506	NC_004605	T	6	6	28841	28846	0 %	100 %	0 %	0 %	28899889
507	NC_004605	CCA	2	6	28849	28854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899889
508	NC_004605	TCA	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899889
509	NC_004605	GGT	2	6	28897	28902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899889
510	NC_004605	TGC	2	6	28924	28929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899889
511	NC_004605	CTT	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899889
512	NC_004605	TTG	2	6	28976	28981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899889
513	NC_004605	TCG	2	6	29513	29518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899890
514	NC_004605	TG	3	6	29524	29529	0 %	50 %	50 %	0 %	28899890
515	NC_004605	A	7	7	29571	29577	100 %	0 %	0 %	0 %	28899890
516	NC_004605	TTG	2	6	29597	29602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899890
517	NC_004605	GTTA	2	8	29607	29614	25 %	50 %	25 %	0 %	28899890
518	NC_004605	T	6	6	29698	29703	0 %	100 %	0 %	0 %	28899890
519	NC_004605	GGT	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899890
520	NC_004605	GT	3	6	29813	29818	0 %	50 %	50 %	0 %	28899890
521	NC_004605	TGG	2	6	29883	29888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899890
522	NC_004605	GGC	2	6	29992	29997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899890
523	NC_004605	ATC	2	6	29998	30003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899890
524	NC_004605	AAC	2	6	30037	30042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899890
525	NC_004605	GAA	2	6	30115	30120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899890
526	NC_004605	AAAG	2	8	30135	30142	75 %	0 %	25 %	0 %	28899890
527	NC_004605	ATT	2	6	30160	30165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899890
528	NC_004605	TTG	2	6	30166	30171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899890
529	NC_004605	TG	4	8	30170	30177	0 %	50 %	50 %	0 %	28899890
530	NC_004605	AGC	2	6	30208	30213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899890
531	NC_004605	TGA	2	6	30230	30235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899890
532	NC_004605	GTT	2	6	30255	30260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899890
533	NC_004605	TGGTG	2	10	30264	30273	0 %	40 %	60 %	0 %	28899890
534	NC_004605	CAT	2	6	30282	30287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899890
535	NC_004605	ATC	2	6	30424	30429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899890
536	NC_004605	TAC	2	6	30466	30471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899890
537	NC_004605	ACG	2	6	30500	30505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899890
538	NC_004605	CGG	2	6	30506	30511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899890
539	NC_004605	TGGTTT	2	12	30531	30542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899890
540	NC_004605	TGA	2	6	30563	30568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899890
541	NC_004605	CAC	2	6	30602	30607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899890
542	NC_004605	AAT	2	6	30695	30700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899890
543	NC_004605	CA	3	6	30872	30877	50 %	0 %	0 %	50 %	28899891
544	NC_004605	A	6	6	30884	30889	100 %	0 %	0 %	0 %	28899891
545	NC_004605	GCT	2	6	30933	30938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899891
546	NC_004605	CGG	2	6	31017	31022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899891
547	NC_004605	ACC	2	6	31034	31039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899891
548	NC_004605	CA	3	6	31119	31124	50 %	0 %	0 %	50 %	28899891
549	NC_004605	TTG	2	6	31168	31173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899891
550	NC_004605	GGT	2	6	31240	31245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899891
551	NC_004605	CAA	2	6	31308	31313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899891
552	NC_004605	GTTC	2	8	31438	31445	0 %	50 %	25 %	25 %	28899891
553	NC_004605	TTA	2	6	31456	31461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899891
554	NC_004605	TGGC	2	8	31481	31488	0 %	25 %	50 %	25 %	28899891
555	NC_004605	AAG	2	6	31526	31531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899891
556	NC_004605	TGA	2	6	31532	31537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899891
557	NC_004605	CTG	2	6	31553	31558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899891
558	NC_004605	GA	3	6	31595	31600	50 %	0 %	50 %	0 %	28899891
559	NC_004605	CG	3	6	31627	31632	0 %	0 %	50 %	50 %	28899891
560	NC_004605	A	6	6	31805	31810	100 %	0 %	0 %	0 %	28899892
561	NC_004605	TGA	2	6	31815	31820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899892
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563	NC_004605	GGT	2	6	32005	32010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28899893
564	NC_004605	TGT	2	6	32050	32055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899893
565	NC_004605	ATC	2	6	32070	32075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899893
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567	NC_004605	TAG	2	6	32090	32095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899893
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569	NC_004605	TGCGAG	2	12	32197	32208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28899893
570	NC_004605	AGA	2	6	32216	32221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899893
571	NC_004605	CGT	2	6	32248	32253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899893
572	NC_004605	CGC	2	6	32260	32265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899893
573	NC_004605	TCT	2	6	32367	32372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899893
574	NC_004605	GAA	2	6	32390	32395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899893
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577	NC_004605	ACTT	2	8	32486	32493	25 %	50 %	0 %	25 %	28899893
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591	NC_004605	TTA	2	6	34364	34369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899896
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595	NC_004605	CGCTT	2	10	34529	34538	0 %	40 %	20 %	40 %	28899896
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597	NC_004605	GCG	2	6	34634	34639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899896
598	NC_004605	TC	3	6	34652	34657	0 %	50 %	0 %	50 %	28899896
599	NC_004605	GAAA	2	8	34789	34796	75 %	0 %	25 %	0 %	28899896
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609	NC_004605	AGCC	2	8	35624	35631	25 %	0 %	25 %	50 %	28899897
610	NC_004605	TCT	2	6	35651	35656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899897
611	NC_004605	ATC	2	6	35672	35677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899897
612	NC_004605	T	6	6	35707	35712	0 %	100 %	0 %	0 %	28899898
613	NC_004605	CGC	2	6	35731	35736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899898
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615	NC_004605	GTT	2	6	35803	35808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899898
616	NC_004605	ATAA	2	8	35813	35820	75 %	25 %	0 %	0 %	28899898
617	NC_004605	GCC	2	6	35917	35922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899898
618	NC_004605	CCAT	2	8	35985	35992	25 %	25 %	0 %	50 %	28899898
619	NC_004605	GCC	2	6	36016	36021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899898
620	NC_004605	GAT	2	6	36061	36066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899898
621	NC_004605	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	28899899
622	NC_004605	TTG	2	6	36399	36404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899899
623	NC_004605	A	9	9	36415	36423	100 %	0 %	0 %	0 %	28899899
624	NC_004605	GT	3	6	36472	36477	0 %	50 %	50 %	0 %	28899899
625	NC_004605	AGA	2	6	36485	36490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899899
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627	NC_004605	CCGA	2	8	36994	37001	25 %	0 %	25 %	50 %	28899900
628	NC_004605	AGA	2	6	37024	37029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899900
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