MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome II

Total Repeats: 30797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_004460	CGT	2	6	1824948	1824953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368013
30502	NC_004460	GAA	2	6	1824987	1824992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27368013
30503	NC_004460	GGT	2	6	1825011	1825016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368013
30504	NC_004460	T	6	6	1825043	1825048	0 %	100 %	0 %	0 %	27368013
30505	NC_004460	TCT	2	6	1825075	1825080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27368013
30506	NC_004460	TC	3	6	1825136	1825141	0 %	50 %	0 %	50 %	27368013
30507	NC_004460	GTTG	2	8	1825228	1825235	0 %	50 %	50 %	0 %	27368013
30508	NC_004460	ATG	2	6	1825242	1825247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27368013
30509	NC_004460	GAA	2	6	1825264	1825269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27368013
30510	NC_004460	AAG	2	6	1825270	1825275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27368013
30511	NC_004460	AACA	2	8	1825291	1825298	75 %	0 %	0 %	25 %	27368013
30512	NC_004460	TGGC	2	8	1825317	1825324	0 %	25 %	50 %	25 %	27368013
30513	NC_004460	CTG	2	6	1825339	1825344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368013
30514	NC_004460	AAT	2	6	1825363	1825368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27368013
30515	NC_004460	ACC	2	6	1825494	1825499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27368014
30516	NC_004460	GGC	2	6	1825554	1825559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27368014
30517	NC_004460	GGA	2	6	1825560	1825565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27368014
30518	NC_004460	TGC	2	6	1825581	1825586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368014
30519	NC_004460	TTTG	2	8	1825632	1825639	0 %	75 %	25 %	0 %	27368014
30520	NC_004460	GC	3	6	1825649	1825654	0 %	0 %	50 %	50 %	27368014
30521	NC_004460	GGC	2	6	1825671	1825676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27368014
30522	NC_004460	GA	3	6	1825677	1825682	50 %	0 %	50 %	0 %	27368014
30523	NC_004460	ATC	2	6	1825912	1825917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27368014
30524	NC_004460	GAT	2	6	1826026	1826031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27368014
30525	NC_004460	TGG	2	6	1826207	1826212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368014
30526	NC_004460	CAT	2	6	1826278	1826283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27368014
30527	NC_004460	TTG	2	6	1826343	1826348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27368014
30528	NC_004460	TGG	2	6	1826490	1826495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368015
30529	NC_004460	CTG	2	6	1826572	1826577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368015
30530	NC_004460	ATCA	2	8	1826700	1826707	50 %	25 %	0 %	25 %	27368015
30531	NC_004460	TGC	2	6	1826801	1826806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368015
30532	NC_004460	TGA	2	6	1826868	1826873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27368015
30533	NC_004460	GGT	3	9	1826877	1826885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368015
30534	NC_004460	TTTGAT	2	12	1826893	1826904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27368015
30535	NC_004460	AGA	2	6	1827000	1827005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27368015
30536	NC_004460	GAA	2	6	1827064	1827069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27368015
30537	NC_004460	TGG	2	6	1827104	1827109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368015
30538	NC_004460	AATA	2	8	1827208	1827215	75 %	25 %	0 %	0 %	27368015
30539	NC_004460	TGC	2	6	1827239	1827244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368015
30540	NC_004460	CT	3	6	1827394	1827399	0 %	50 %	0 %	50 %	326424425
30541	NC_004460	TGC	2	6	1827402	1827407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326424425
30542	NC_004460	AAT	2	6	1827423	1827428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326424425
30543	NC_004460	AAG	2	6	1827431	1827436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326424425
30544	NC_004460	CAGC	2	8	1827437	1827444	25 %	0 %	25 %	50 %	326424425
30545	NC_004460	GAC	2	6	1827459	1827464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326424425
30546	NC_004460	CCA	3	9	1827659	1827667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326424425
30547	NC_004460	GAA	2	6	1827699	1827704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326424425
30548	NC_004460	GAT	2	6	1827732	1827737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326424425
30549	NC_004460	TGA	2	6	1827755	1827760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326424425
30550	NC_004460	AAAC	2	8	1827797	1827804	75 %	0 %	0 %	25 %	326424425
30551	NC_004460	TTG	2	6	1827818	1827823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326424425
30552	NC_004460	CCAC	2	8	1827883	1827890	25 %	0 %	0 %	75 %	326424425
30553	NC_004460	CCA	2	6	1827977	1827982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326424425
30554	NC_004460	TCA	2	6	1827995	1828000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326424425
30555	NC_004460	GTA	2	6	1828008	1828013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326424425
30556	NC_004460	GAA	2	6	1828017	1828022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326424425
30557	NC_004460	GCC	2	6	1828122	1828127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326424425
30558	NC_004460	GAA	2	6	1828173	1828178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326424425
30559	NC_004460	AGA	2	6	1828214	1828219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326424425
30560	NC_004460	T	6	6	1828225	1828230	0 %	100 %	0 %	0 %	326424425
30561	NC_004460	CCA	2	6	1828268	1828273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326424425
30562	NC_004460	AAT	2	6	1828287	1828292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326424425
30563	NC_004460	GCC	2	6	1828306	1828311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326424425
30564	NC_004460	GCC	2	6	1828338	1828343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326424425
30565	NC_004460	GTT	2	6	1828404	1828409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326424425
30566	NC_004460	TCT	2	6	1828444	1828449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326424425
30567	NC_004460	AGA	2	6	1828587	1828592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326424425
30568	NC_004460	CGA	2	6	1828697	1828702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326424425
30569	NC_004460	TCA	2	6	1828703	1828708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326424425
30570	NC_004460	CAT	2	6	1828791	1828796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326424425
30571	NC_004460	CAT	2	6	1828806	1828811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326424425
30572	NC_004460	GTTTA	2	10	1828818	1828827	20 %	60 %	20 %	0 %	326424425
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30575	NC_004460	ATGAG	2	10	1829317	1829326	40 %	20 %	40 %	0 %	27368017
30576	NC_004460	ACTT	2	8	1829329	1829336	25 %	50 %	0 %	25 %	27368017
30577	NC_004460	CCA	2	6	1829421	1829426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27368017
30578	NC_004460	CTG	2	6	1829470	1829475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368017
30579	NC_004460	TGC	2	6	1829494	1829499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368017
30580	NC_004460	CGC	2	6	1829522	1829527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27368017
30581	NC_004460	GAG	2	6	1829535	1829540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27368017
30582	NC_004460	TGA	2	6	1829665	1829670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27368017
30583	NC_004460	GTA	2	6	1829678	1829683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27368017
30584	NC_004460	CTG	2	6	1829707	1829712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368017
30585	NC_004460	TTC	2	6	1829756	1829761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27368017
30586	NC_004460	GGCAAA	2	12	1829768	1829779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27368017
30587	NC_004460	AATCC	2	10	1829786	1829795	40 %	20 %	0 %	40 %	27368017
30588	NC_004460	TCA	2	6	1829929	1829934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27368017
30589	NC_004460	GCA	2	6	1829998	1830003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27368017
30590	NC_004460	TCC	2	6	1830008	1830013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27368017
30591	NC_004460	CTTG	2	8	1830094	1830101	0 %	50 %	25 %	25 %	27368017
30592	NC_004460	GCC	3	9	1830134	1830142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27368017
30593	NC_004460	AGT	2	6	1830148	1830153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27368017
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30596	NC_004460	GTG	2	6	1830398	1830403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368017
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30599	NC_004460	TGG	2	6	1830902	1830907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27368018
30600	NC_004460	CA	3	6	1830911	1830916	50 %	0 %	0 %	50 %	27368018
30601	NC_004460	CAA	2	6	1831155	1831160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27368018
30602	NC_004460	GCGCT	2	10	1831199	1831208	0 %	20 %	40 %	40 %	27368018
30603	NC_004460	CGG	2	6	1831277	1831282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27368018
30604	NC_004460	TTGA	2	8	1831302	1831309	25 %	50 %	25 %	0 %	27368018
30605	NC_004460	GC	3	6	1831347	1831352	0 %	0 %	50 %	50 %	27368018
30606	NC_004460	GT	3	6	1831354	1831359	0 %	50 %	50 %	0 %	27368018
30607	NC_004460	AAG	2	6	1831408	1831413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27368018
30608	NC_004460	TTA	2	6	1831463	1831468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27368018
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30611	NC_004460	GTT	2	6	1831549	1831554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27368018
30612	NC_004460	TCG	2	6	1831580	1831585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27368018
30613	NC_004460	AAATGT	2	12	1831774	1831785	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27368019
30614	NC_004460	CAA	2	6	1831788	1831793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27368019
30615	NC_004460	ACA	2	6	1831853	1831858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27368019
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30617	NC_004460	TGAT	2	8	1831912	1831919	25 %	50 %	25 %	0 %	27368019
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.