MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002506	CAAT	2	8	189119	189126	50 %	25 %	0 %	25 %	15600941
3002	NC_002506	GCG	2	6	189157	189162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600941
3003	NC_002506	CAA	2	6	189165	189170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600941
3004	NC_002506	CAA	2	6	189180	189185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600941
3005	NC_002506	AGC	2	6	189257	189262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600942
3006	NC_002506	GATTG	2	10	189315	189324	20 %	40 %	40 %	0 %	15600942
3007	NC_002506	TTG	2	6	189373	189378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600942
3008	NC_002506	TGG	2	6	189408	189413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600942
3009	NC_002506	ACC	2	6	189488	189493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600942
3010	NC_002506	CCGACG	2	12	189506	189517	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15600942
3011	NC_002506	GTG	2	6	189527	189532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600942
3012	NC_002506	GGC	2	6	189553	189558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600942
3013	NC_002506	TGC	2	6	189588	189593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600942
3014	NC_002506	ATC	2	6	189608	189613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600942
3015	NC_002506	GCG	2	6	189621	189626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600942
3016	NC_002506	CCA	2	6	189858	189863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600942
3017	NC_002506	CTG	2	6	189865	189870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600942
3018	NC_002506	ACC	2	6	189914	189919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600942
3019	NC_002506	AGC	2	6	189992	189997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600942
3020	NC_002506	CGC	2	6	190084	190089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600942
3021	NC_002506	A	7	7	190111	190117	100 %	0 %	0 %	0 %	15600942
3022	NC_002506	A	6	6	190141	190146	100 %	0 %	0 %	0 %	15600942
3023	NC_002506	CCA	3	9	190153	190161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600942
3024	NC_002506	CGG	2	6	190205	190210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600943
3025	NC_002506	GTG	2	6	190238	190243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600943
3026	NC_002506	TCA	2	6	190251	190256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600943
3027	NC_002506	TGC	2	6	190290	190295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600943
3028	NC_002506	GTA	2	6	190394	190399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600943
3029	NC_002506	GCC	2	6	190407	190412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600943
3030	NC_002506	AGA	2	6	190433	190438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600943
3031	NC_002506	T	7	7	190483	190489	0 %	100 %	0 %	0 %	15600943
3032	NC_002506	ATA	2	6	190530	190535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600943
3033	NC_002506	CCA	2	6	190568	190573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600943
3034	NC_002506	TTG	2	6	190675	190680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600944
3035	NC_002506	AAT	2	6	190724	190729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600944
3036	NC_002506	T	6	6	190771	190776	0 %	100 %	0 %	0 %	15600944
3037	NC_002506	CAC	2	6	190981	190986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600944
3038	NC_002506	CGT	2	6	191050	191055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600944
3039	NC_002506	TG	3	6	191060	191065	0 %	50 %	50 %	0 %	15600944
3040	NC_002506	TGC	3	9	191075	191083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600944
3041	NC_002506	CGC	2	6	191115	191120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600944
3042	NC_002506	GGC	2	6	191124	191129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600944
3043	NC_002506	ATCA	2	8	191164	191171	50 %	25 %	0 %	25 %	15600944
3044	NC_002506	TTG	2	6	191188	191193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600944
3045	NC_002506	CAG	2	6	191248	191253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600944
3046	NC_002506	CAC	2	6	191299	191304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600944
3047	NC_002506	CAAT	2	8	191369	191376	50 %	25 %	0 %	25 %	15600944
3048	NC_002506	TCA	2	6	191387	191392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600944
3049	NC_002506	ATCC	2	8	191422	191429	25 %	25 %	0 %	50 %	15600944
3050	NC_002506	A	6	6	191495	191500	100 %	0 %	0 %	0 %	15600944
3051	NC_002506	CTG	2	6	191509	191514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600944
3052	NC_002506	CTC	2	6	191530	191535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600944
3053	NC_002506	ACCA	2	8	191602	191609	50 %	0 %	0 %	50 %	15600945
3054	NC_002506	ACA	2	6	191613	191618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600945
3055	NC_002506	GAT	2	6	191626	191631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600945
3056	NC_002506	TTCC	2	8	191646	191653	0 %	50 %	0 %	50 %	15600945
3057	NC_002506	GCA	2	6	191688	191693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600945
3058	NC_002506	CAT	2	6	191715	191720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600945
3059	NC_002506	TCG	2	6	191784	191789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600945
3060	NC_002506	CG	3	6	191788	191793	0 %	0 %	50 %	50 %	15600945
3061	NC_002506	CTG	3	9	191938	191946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600945
3062	NC_002506	TTG	2	6	191971	191976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600945
3063	NC_002506	TCT	2	6	192020	192025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600945
3064	NC_002506	GAGCT	2	10	192067	192076	20 %	20 %	40 %	20 %	15600945
3065	NC_002506	A	7	7	192131	192137	100 %	0 %	0 %	0 %	15600945
3066	NC_002506	GCC	2	6	192203	192208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600945
3067	NC_002506	CGG	2	6	192421	192426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600945
3068	NC_002506	CCA	2	6	192432	192437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600945
3069	NC_002506	CAGC	2	8	192450	192457	25 %	0 %	25 %	50 %	15600945
3070	NC_002506	CAG	2	6	192466	192471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600945
3071	NC_002506	TGA	2	6	192477	192482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600945
3072	NC_002506	TTG	2	6	192502	192507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600945
3073	NC_002506	TGC	2	6	192518	192523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600945
3074	NC_002506	TGCT	2	8	193051	193058	0 %	50 %	25 %	25 %	15600946
3075	NC_002506	GCA	2	6	193091	193096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3076	NC_002506	TTA	2	6	193137	193142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600946
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3078	NC_002506	ATG	2	6	193183	193188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600946
3079	NC_002506	CAG	2	6	193254	193259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3080	NC_002506	T	6	6	193272	193277	0 %	100 %	0 %	0 %	15600946
3081	NC_002506	GATG	2	8	193400	193407	25 %	25 %	50 %	0 %	15600946
3082	NC_002506	GCT	2	6	193553	193558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3083	NC_002506	GAA	2	6	193602	193607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600946
3084	NC_002506	ATG	2	6	193710	193715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600946
3085	NC_002506	ACG	2	6	193719	193724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3086	NC_002506	ATCA	2	8	193788	193795	50 %	25 %	0 %	25 %	15600946
3087	NC_002506	TC	3	6	193838	193843	0 %	50 %	0 %	50 %	15600946
3088	NC_002506	ATG	2	6	193867	193872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600946
3089	NC_002506	GCC	2	6	193968	193973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600946
3090	NC_002506	ATA	2	6	194008	194013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600946
3091	NC_002506	CAG	3	9	194016	194024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3092	NC_002506	CGA	2	6	194071	194076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3093	NC_002506	GCG	2	6	194097	194102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600946
3094	NC_002506	GTC	2	6	194157	194162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600946
3095	NC_002506	GTG	2	6	194220	194225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600946
3096	NC_002506	GCC	2	6	194328	194333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600946
3097	NC_002506	GGT	2	6	194363	194368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600946
3098	NC_002506	GAA	2	6	194415	194420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600946
3099	NC_002506	AGA	2	6	194425	194430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600946
3100	NC_002506	ATG	2	6	194449	194454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600946
3101	NC_002506	TCA	2	6	194498	194503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600946
3102	NC_002506	TGA	2	6	194519	194524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600946
3103	NC_002506	TGA	2	6	194539	194544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600946
3104	NC_002506	AC	3	6	194581	194586	50 %	0 %	0 %	50 %	15600946
3105	NC_002506	AC	3	6	194624	194629	50 %	0 %	0 %	50 %	15600946
3106	NC_002506	ACC	2	6	194673	194678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600946
3107	NC_002506	AGA	2	6	194687	194692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600946
3108	NC_002506	GCTG	2	8	194693	194700	0 %	25 %	50 %	25 %	15600946
3109	NC_002506	CT	3	6	194724	194729	0 %	50 %	0 %	50 %	15600946
3110	NC_002506	TGG	2	6	194746	194751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600946
3111	NC_002506	TGA	2	6	194826	194831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600947
3112	NC_002506	AGA	2	6	194875	194880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600947
3113	NC_002506	CGGCA	2	10	195409	195418	20 %	0 %	40 %	40 %	15600948
3114	NC_002506	CTG	2	6	195490	195495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600948
3115	NC_002506	CAG	2	6	195535	195540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600948
3116	NC_002506	CCTCAT	2	12	195543	195554	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15600948
3117	NC_002506	TGA	2	6	195623	195628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600948
3118	NC_002506	CAG	2	6	195634	195639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600948
3119	NC_002506	TGG	2	6	195644	195649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600948
3120	NC_002506	GT	3	6	195657	195662	0 %	50 %	50 %	0 %	15600948
3121	NC_002506	TCA	2	6	195677	195682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600948
3122	NC_002506	A	6	6	195682	195687	100 %	0 %	0 %	0 %	15600948
3123	NC_002506	CGT	2	6	195705	195710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600948
3124	NC_002506	TCAG	2	8	195719	195726	25 %	25 %	25 %	25 %	15600948
3125	NC_002506	TGCT	2	8	195736	195743	0 %	50 %	25 %	25 %	15600948
3126	NC_002506	T	6	6	195769	195774	0 %	100 %	0 %	0 %	15600948
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3232	NC_002506	TGA	2	6	203107	203112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600953
3233	NC_002506	GAT	2	6	203120	203125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600953
3234	NC_002506	TG	3	6	203190	203195	0 %	50 %	50 %	0 %	15600953
3235	NC_002506	GCG	2	6	203297	203302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600953
3236	NC_002506	CTTG	2	8	203589	203596	0 %	50 %	25 %	25 %	15600954
3237	NC_002506	ATA	2	6	203657	203662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600954
3238	NC_002506	AAAC	2	8	204022	204029	75 %	0 %	0 %	25 %	15600955
3239	NC_002506	GTG	2	6	204081	204086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600955
3240	NC_002506	CGT	2	6	204112	204117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600955
3241	NC_002506	A	6	6	204155	204160	100 %	0 %	0 %	0 %	15600955
3242	NC_002506	CAT	2	6	204628	204633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600956
3243	NC_002506	GCATC	2	10	204672	204681	20 %	20 %	20 %	40 %	15600956
3244	NC_002506	GTA	2	6	204762	204767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600956
3245	NC_002506	CGT	2	6	204832	204837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600956
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3369	NC_002506	CAAG	2	8	211272	211279	50 %	0 %	25 %	25 %	15600964
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3499	NC_002506	GA	3	6	219182	219187	50 %	0 %	50 %	0 %	15600971
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