MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_002506	GAT	2	6	1009263	1009268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601809
15502	NC_002506	AAG	2	6	1009273	1009278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601809
15503	NC_002506	CG	3	6	1009279	1009284	0 %	0 %	50 %	50 %	15601809
15504	NC_002506	GGGC	2	8	1009307	1009314	0 %	0 %	75 %	25 %	15601809
15505	NC_002506	AGT	2	6	1009395	1009400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601809
15506	NC_002506	TTGAT	2	10	1009408	1009417	20 %	60 %	20 %	0 %	15601809
15507	NC_002506	GAA	2	6	1009419	1009424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601809
15508	NC_002506	AGA	2	6	1009457	1009462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601809
15509	NC_002506	TG	3	6	1009534	1009539	0 %	50 %	50 %	0 %	15601809
15510	NC_002506	ATC	2	6	1009570	1009575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601809
15511	NC_002506	GCT	2	6	1009576	1009581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601809
15512	NC_002506	CAT	2	6	1009712	1009717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601809
15513	NC_002506	CCA	2	6	1009739	1009744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601809
15514	NC_002506	TCC	2	6	1010023	1010028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601810
15515	NC_002506	GCTC	2	8	1010031	1010038	0 %	25 %	25 %	50 %	15601810
15516	NC_002506	ACCG	2	8	1010042	1010049	25 %	0 %	25 %	50 %	15601810
15517	NC_002506	TGG	2	6	1010075	1010080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601810
15518	NC_002506	ATG	2	6	1010112	1010117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601810
15519	NC_002506	CG	3	6	1010182	1010187	0 %	0 %	50 %	50 %	15601810
15520	NC_002506	ATT	2	6	1010188	1010193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601810
15521	NC_002506	ATG	2	6	1010400	1010405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601810
15522	NC_002506	A	6	6	1010409	1010414	100 %	0 %	0 %	0 %	15601810
15523	NC_002506	A	6	6	1010524	1010529	100 %	0 %	0 %	0 %	15601810
15524	NC_002506	AAG	2	6	1010599	1010604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601810
15525	NC_002506	TCCC	2	8	1010616	1010623	0 %	25 %	0 %	75 %	15601810
15526	NC_002506	GAT	2	6	1010767	1010772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601811
15527	NC_002506	TGC	2	6	1010790	1010795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601811
15528	NC_002506	CA	3	6	1010814	1010819	50 %	0 %	0 %	50 %	15601811
15529	NC_002506	GGCT	2	8	1010827	1010834	0 %	25 %	50 %	25 %	15601811
15530	NC_002506	ATCAA	2	10	1010852	1010861	60 %	20 %	0 %	20 %	15601811
15531	NC_002506	ACG	2	6	1010881	1010886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601811
15532	NC_002506	TCT	2	6	1010945	1010950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601811
15533	NC_002506	GGC	2	6	1010968	1010973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601811
15534	NC_002506	TGG	2	6	1010982	1010987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601811
15535	NC_002506	TGT	3	9	1011069	1011077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601811
15536	NC_002506	ACC	2	6	1011080	1011085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601811
15537	NC_002506	TCAG	2	8	1011119	1011126	25 %	25 %	25 %	25 %	15601811
15538	NC_002506	ATC	2	6	1011158	1011163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601811
15539	NC_002506	GTA	2	6	1011179	1011184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601811
15540	NC_002506	ATA	2	6	1011203	1011208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601811
15541	NC_002506	TCA	2	6	1011230	1011235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601811
15542	NC_002506	AGC	3	9	1011239	1011247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601811
15543	NC_002506	GAA	2	6	1011858	1011863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601813
15544	NC_002506	GCT	2	6	1011986	1011991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601813
15545	NC_002506	AG	3	6	1012017	1012022	50 %	0 %	50 %	0 %	15601813
15546	NC_002506	ATG	2	6	1012033	1012038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
15547	NC_002506	TGAG	2	8	1012082	1012089	25 %	25 %	50 %	0 %	15601813
15548	NC_002506	TCA	2	6	1012100	1012105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601813
15549	NC_002506	GAA	2	6	1012191	1012196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601813
15550	NC_002506	GCCA	2	8	1012241	1012248	25 %	0 %	25 %	50 %	15601813
15551	NC_002506	GAT	2	6	1012398	1012403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
15552	NC_002506	GCC	2	6	1012428	1012433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601813
15553	NC_002506	GCC	2	6	1012536	1012541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601813
15554	NC_002506	GAA	2	6	1012551	1012556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601813
15555	NC_002506	CG	3	6	1012581	1012586	0 %	0 %	50 %	50 %	15601813
15556	NC_002506	GAT	2	6	1012617	1012622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
15557	NC_002506	ATG	3	9	1012642	1012650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
15558	NC_002506	GC	3	6	1012686	1012691	0 %	0 %	50 %	50 %	15601813
15559	NC_002506	ACC	2	6	1012692	1012697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601813
15560	NC_002506	ACC	2	6	1012896	1012901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601813
15561	NC_002506	CCG	2	6	1012906	1012911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601813
15562	NC_002506	T	6	6	1012914	1012919	0 %	100 %	0 %	0 %	15601813
15563	NC_002506	AAGAT	2	10	1012985	1012994	60 %	20 %	20 %	0 %	15601813
15564	NC_002506	ATG	2	6	1013035	1013040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601813
15565	NC_002506	CAT	2	6	1013049	1013054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601813
15566	NC_002506	GCA	2	6	1013271	1013276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601814
15567	NC_002506	CTT	2	6	1013286	1013291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601814
15568	NC_002506	CA	4	8	1013344	1013351	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
15569	NC_002506	AC	3	6	1013352	1013357	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
15570	NC_002506	GCG	2	6	1013384	1013389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601814
15571	NC_002506	CTT	2	6	1013454	1013459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601814
15572	NC_002506	CG	4	8	1013489	1013496	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
15573	NC_002506	CAT	2	6	1013523	1013528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
15574	NC_002506	CG	3	6	1013599	1013604	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
15575	NC_002506	GTG	2	6	1013631	1013636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601814
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15578	NC_002506	TGC	2	6	1013684	1013689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601814
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15584	NC_002506	TGG	2	6	1014001	1014006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601814
15585	NC_002506	T	6	6	1014031	1014036	0 %	100 %	0 %	0 %	15601814
15586	NC_002506	GCA	2	6	1014171	1014176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601814
15587	NC_002506	TCTT	2	8	1014236	1014243	0 %	75 %	0 %	25 %	15601814
15588	NC_002506	CCTG	2	8	1014269	1014276	0 %	25 %	25 %	50 %	15601814
15589	NC_002506	GAT	2	6	1014301	1014306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601814
15590	NC_002506	GAA	2	6	1014333	1014338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601814
15591	NC_002506	TCA	2	6	1014354	1014359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
15592	NC_002506	CCCA	2	8	1014380	1014387	25 %	0 %	0 %	75 %	15601814
15593	NC_002506	CA	3	6	1014411	1014416	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
15594	NC_002506	CCA	2	6	1014432	1014437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601814
15595	NC_002506	CG	3	6	1014443	1014448	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
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15598	NC_002506	CG	3	6	1014514	1014519	0 %	0 %	50 %	50 %	15601814
15599	NC_002506	GTG	2	6	1014658	1014663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601814
15600	NC_002506	GTT	2	6	1014676	1014681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601814
15601	NC_002506	CAG	2	6	1014712	1014717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601814
15602	NC_002506	AC	3	6	1014724	1014729	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
15603	NC_002506	TTG	2	6	1014734	1014739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601814
15604	NC_002506	CAT	2	6	1014810	1014815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
15605	NC_002506	ACGT	2	8	1014850	1014857	25 %	25 %	25 %	25 %	15601814
15606	NC_002506	A	6	6	1014904	1014909	100 %	0 %	0 %	0 %	15601814
15607	NC_002506	GAA	2	6	1014934	1014939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601814
15608	NC_002506	ACC	2	6	1014943	1014948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601814
15609	NC_002506	GCAA	2	8	1014961	1014968	50 %	0 %	25 %	25 %	15601814
15610	NC_002506	T	6	6	1014994	1014999	0 %	100 %	0 %	0 %	15601814
15611	NC_002506	AAAG	2	8	1015009	1015016	75 %	0 %	25 %	0 %	15601814
15612	NC_002506	CAA	2	6	1015021	1015026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601814
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15614	NC_002506	CA	3	6	1015089	1015094	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
15615	NC_002506	ATC	2	6	1015126	1015131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601814
15616	NC_002506	GCA	2	6	1015147	1015152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601814
15617	NC_002506	CA	3	6	1015151	1015156	50 %	0 %	0 %	50 %	15601814
15618	NC_002506	CAA	2	6	1015158	1015163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601814
15619	NC_002506	CATT	2	8	1015188	1015195	25 %	50 %	0 %	25 %	15601814
15620	NC_002506	ATG	2	6	1015202	1015207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601814
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