MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002506	ATC	2	6	974444	974449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601779
15002	NC_002506	ATA	2	6	974501	974506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601779
15003	NC_002506	ATT	2	6	974663	974668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601780
15004	NC_002506	CTT	2	6	974696	974701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601780
15005	NC_002506	GCTC	2	8	974776	974783	0 %	25 %	25 %	50 %	15601780
15006	NC_002506	GGA	2	6	974787	974792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601780
15007	NC_002506	GCA	2	6	974839	974844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601780
15008	NC_002506	TGT	2	6	974853	974858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601780
15009	NC_002506	AAGA	2	8	974890	974897	75 %	0 %	25 %	0 %	15601780
15010	NC_002506	ACAA	2	8	975058	975065	75 %	0 %	0 %	25 %	15601780
15011	NC_002506	ATC	2	6	975196	975201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601780
15012	NC_002506	CTG	2	6	975393	975398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601780
15013	NC_002506	CCT	2	6	975401	975406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601780
15014	NC_002506	CAA	2	6	975431	975436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601780
15015	NC_002506	TAA	2	6	975480	975485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601780
15016	NC_002506	ACC	2	6	975707	975712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601781
15017	NC_002506	ATC	3	9	975747	975755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601781
15018	NC_002506	AGA	2	6	975784	975789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601781
15019	NC_002506	ACC	2	6	975894	975899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601781
15020	NC_002506	TAC	3	9	975978	975986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601781
15021	NC_002506	TTA	2	6	976030	976035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601781
15022	NC_002506	ACC	2	6	976056	976061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601781
15023	NC_002506	TAAG	2	8	976077	976084	50 %	25 %	25 %	0 %	15601781
15024	NC_002506	TAA	2	6	976137	976142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601781
15025	NC_002506	CAT	2	6	976157	976162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601781
15026	NC_002506	AGC	2	6	976212	976217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601781
15027	NC_002506	CAT	2	6	976310	976315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601781
15028	NC_002506	GAA	2	6	976432	976437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601781
15029	NC_002506	TAT	2	6	976442	976447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601781
15030	NC_002506	AG	3	6	976470	976475	50 %	0 %	50 %	0 %	15601781
15031	NC_002506	ACC	3	9	976506	976514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601781
15032	NC_002506	GTA	2	6	976569	976574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601781
15033	NC_002506	CTT	2	6	976598	976603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601781
15034	NC_002506	TTC	2	6	976740	976745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601781
15035	NC_002506	TAG	2	6	976762	976767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601781
15036	NC_002506	GAC	2	6	976787	976792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601781
15037	NC_002506	GCA	2	6	976918	976923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601781
15038	NC_002506	ACTT	2	8	976929	976936	25 %	50 %	0 %	25 %	15601781
15039	NC_002506	T	6	6	976935	976940	0 %	100 %	0 %	0 %	15601781
15040	NC_002506	AAAATG	2	12	977372	977383	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15601782
15041	NC_002506	CT	3	6	977478	977483	0 %	50 %	0 %	50 %	15601782
15042	NC_002506	ATG	2	6	977601	977606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601782
15043	NC_002506	GAGAT	2	10	977763	977772	40 %	20 %	40 %	0 %	15601782
15044	NC_002506	ATT	2	6	977970	977975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601782
15045	NC_002506	ACC	2	6	978050	978055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601782
15046	NC_002506	ACT	2	6	978168	978173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601782
15047	NC_002506	TC	3	6	978229	978234	0 %	50 %	0 %	50 %	15601782
15048	NC_002506	TTTCG	2	10	978305	978314	0 %	60 %	20 %	20 %	15601782
15049	NC_002506	GCC	2	6	978320	978325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601782
15050	NC_002506	GTG	2	6	978339	978344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601782
15051	NC_002506	AAG	2	6	978357	978362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601782
15052	NC_002506	TGC	2	6	978396	978401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601782
15053	NC_002506	TTGG	2	8	978471	978478	0 %	50 %	50 %	0 %	15601782
15054	NC_002506	TGGCG	2	10	978521	978530	0 %	20 %	60 %	20 %	15601782
15055	NC_002506	AAACAC	2	12	978671	978682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601782
15056	NC_002506	CG	3	6	978776	978781	0 %	0 %	50 %	50 %	15601782
15057	NC_002506	CTG	2	6	978818	978823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601782
15058	NC_002506	CA	3	6	978840	978845	50 %	0 %	0 %	50 %	15601782
15059	NC_002506	CCG	2	6	978852	978857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601782
15060	NC_002506	CA	3	6	978867	978872	50 %	0 %	0 %	50 %	15601782
15061	NC_002506	CAA	2	6	978883	978888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601782
15062	NC_002506	AAC	2	6	978935	978940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601782
15063	NC_002506	AGC	2	6	978982	978987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601782
15064	NC_002506	CTC	2	6	979108	979113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601782
15065	NC_002506	TGT	2	6	979155	979160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601782
15066	NC_002506	GC	3	6	979187	979192	0 %	0 %	50 %	50 %	15601782
15067	NC_002506	GCA	2	6	979213	979218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601782
15068	NC_002506	A	6	6	979331	979336	100 %	0 %	0 %	0 %	15601782
15069	NC_002506	TGAA	2	8	979477	979484	50 %	25 %	25 %	0 %	15601783
15070	NC_002506	GAAA	2	8	979503	979510	75 %	0 %	25 %	0 %	15601783
15071	NC_002506	GTT	2	6	979539	979544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601783
15072	NC_002506	GCC	2	6	979570	979575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601783
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15077	NC_002506	GCGCA	2	10	982173	982182	20 %	0 %	40 %	40 %	15601784
15078	NC_002506	TGG	2	6	982184	982189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601784
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15080	NC_002506	CCATT	2	10	982342	982351	20 %	40 %	0 %	40 %	15601784
15081	NC_002506	CAA	2	6	982678	982683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601785
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15083	NC_002506	CCAA	2	8	982830	982837	50 %	0 %	0 %	50 %	15601785
15084	NC_002506	TCA	2	6	982863	982868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601785
15085	NC_002506	TTGCG	2	10	982898	982907	0 %	40 %	40 %	20 %	15601785
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15089	NC_002506	GCT	2	6	983070	983075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601785
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15093	NC_002506	TTA	2	6	983571	983576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601785
15094	NC_002506	A	6	6	983580	983585	100 %	0 %	0 %	0 %	15601785
15095	NC_002506	ATC	2	6	983732	983737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601785
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15099	NC_002506	ATC	2	6	983897	983902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601785
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15101	NC_002506	TAG	2	6	983951	983956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601785
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15106	NC_002506	CGAT	2	8	984216	984223	25 %	25 %	25 %	25 %	15601786
15107	NC_002506	CCA	2	6	984396	984401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601786
15108	NC_002506	CG	3	6	984431	984436	0 %	0 %	50 %	50 %	15601786
15109	NC_002506	CGC	2	6	984445	984450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601786
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15114	NC_002506	GCTT	2	8	984790	984797	0 %	50 %	25 %	25 %	15601786
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15122	NC_002506	CTG	2	6	985204	985209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601786
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15468	NC_002506	TAC	2	6	1006944	1006949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
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15474	NC_002506	CAT	2	6	1007172	1007177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
15475	NC_002506	CAT	2	6	1007235	1007240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601807
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15480	NC_002506	GCTC	2	8	1007618	1007625	0 %	25 %	25 %	50 %	15601807
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15483	NC_002506	A	6	6	1007691	1007696	100 %	0 %	0 %	0 %	15601807
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15485	NC_002506	TGT	2	6	1008139	1008144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601808
15486	NC_002506	GCT	2	6	1008188	1008193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601808
15487	NC_002506	CAT	2	6	1008221	1008226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601808
15488	NC_002506	AC	3	6	1008236	1008241	50 %	0 %	0 %	50 %	15601808
15489	NC_002506	GT	3	6	1008295	1008300	0 %	50 %	50 %	0 %	15601808
15490	NC_002506	AGC	2	6	1008304	1008309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601808
15491	NC_002506	CACG	2	8	1008371	1008378	25 %	0 %	25 %	50 %	15601808
15492	NC_002506	AGC	2	6	1008420	1008425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601808
15493	NC_002506	CATT	2	8	1008562	1008569	25 %	50 %	0 %	25 %	15601808
15494	NC_002506	CTT	2	6	1008572	1008577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601808
15495	NC_002506	AGC	2	6	1008595	1008600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601808
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15498	NC_002506	GT	3	6	1008710	1008715	0 %	50 %	50 %	0 %	15601808
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