MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_002506	GCG	2	6	945763	945768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601744
14502	NC_002506	ACA	2	6	945811	945816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601744
14503	NC_002506	TCG	2	6	945826	945831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14504	NC_002506	CTG	2	6	945852	945857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14505	NC_002506	CAC	2	6	945881	945886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601744
14506	NC_002506	TGT	2	6	945916	945921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601744
14507	NC_002506	CAC	2	6	945941	945946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601744
14508	NC_002506	CTT	2	6	946039	946044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601744
14509	NC_002506	TGC	2	6	946045	946050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14510	NC_002506	GCA	2	6	946057	946062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14511	NC_002506	CACG	2	8	946075	946082	25 %	0 %	25 %	50 %	15601744
14512	NC_002506	TGA	2	6	946107	946112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601744
14513	NC_002506	GA	3	6	946137	946142	50 %	0 %	50 %	0 %	15601744
14514	NC_002506	TGC	2	6	946150	946155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14515	NC_002506	AACTC	2	10	946225	946234	40 %	20 %	0 %	40 %	15601744
14516	NC_002506	GCC	2	6	946245	946250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601744
14517	NC_002506	ACG	3	9	946524	946532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601745
14518	NC_002506	ACC	2	6	946538	946543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601745
14519	NC_002506	AAAG	2	8	946583	946590	75 %	0 %	25 %	0 %	15601745
14520	NC_002506	CAT	2	6	946618	946623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601745
14521	NC_002506	GCAGC	2	10	946690	946699	20 %	0 %	40 %	40 %	15601745
14522	NC_002506	A	6	6	946716	946721	100 %	0 %	0 %	0 %	15601745
14523	NC_002506	CAA	2	6	946778	946783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601745
14524	NC_002506	A	7	7	946795	946801	100 %	0 %	0 %	0 %	15601745
14525	NC_002506	TGCAAG	2	12	946857	946868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15601745
14526	NC_002506	GCT	2	6	946891	946896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601745
14527	NC_002506	TGA	2	6	946930	946935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601745
14528	NC_002506	GC	3	6	946971	946976	0 %	0 %	50 %	50 %	15601745
14529	NC_002506	TTG	2	6	947045	947050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601745
14530	NC_002506	AGG	2	6	947083	947088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601745
14531	NC_002506	ATT	2	6	947101	947106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601746
14532	NC_002506	AACC	2	8	947109	947116	50 %	0 %	0 %	50 %	15601746
14533	NC_002506	AAC	2	6	947124	947129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601746
14534	NC_002506	GTG	2	6	947147	947152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601746
14535	NC_002506	CGCA	2	8	947170	947177	25 %	0 %	25 %	50 %	15601746
14536	NC_002506	CCCAA	2	10	947198	947207	40 %	0 %	0 %	60 %	15601746
14537	NC_002506	GC	3	6	947230	947235	0 %	0 %	50 %	50 %	15601746
14538	NC_002506	GAT	2	6	947276	947281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601746
14539	NC_002506	ATTC	2	8	947292	947299	25 %	50 %	0 %	25 %	15601746
14540	NC_002506	ACA	2	6	947362	947367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601746
14541	NC_002506	TGG	2	6	947514	947519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601746
14542	NC_002506	GTG	2	6	947564	947569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601746
14543	NC_002506	GGC	2	6	947584	947589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601746
14544	NC_002506	ATC	2	6	947679	947684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601746
14545	NC_002506	TGG	2	6	947698	947703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601746
14546	NC_002506	GTG	2	6	947738	947743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601746
14547	NC_002506	GTCA	2	8	947750	947757	25 %	25 %	25 %	25 %	15601746
14548	NC_002506	TTA	2	6	947799	947804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601746
14549	NC_002506	CAA	2	6	947838	947843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601746
14550	NC_002506	GAT	2	6	947912	947917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601746
14551	NC_002506	TCG	2	6	947979	947984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601746
14552	NC_002506	GC	3	6	948004	948009	0 %	0 %	50 %	50 %	15601746
14553	NC_002506	TGG	2	6	948139	948144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601746
14554	NC_002506	AAC	2	6	948336	948341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601747
14555	NC_002506	CCG	2	6	948369	948374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601747
14556	NC_002506	GCA	2	6	948403	948408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601747
14557	NC_002506	TTGA	2	8	948428	948435	25 %	50 %	25 %	0 %	15601747
14558	NC_002506	GCGTAA	2	12	948439	948450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15601747
14559	NC_002506	AATCGA	2	12	948545	948556	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15601747
14560	NC_002506	CAT	2	6	948656	948661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601747
14561	NC_002506	CG	3	6	948718	948723	0 %	0 %	50 %	50 %	15601747
14562	NC_002506	TGC	2	6	948846	948851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601747
14563	NC_002506	T	6	6	948878	948883	0 %	100 %	0 %	0 %	15601747
14564	NC_002506	ATCA	2	8	948911	948918	50 %	25 %	0 %	25 %	15601747
14565	NC_002506	CGCC	2	8	948979	948986	0 %	0 %	25 %	75 %	15601747
14566	NC_002506	GTG	2	6	948990	948995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601747
14567	NC_002506	GC	3	6	949119	949124	0 %	0 %	50 %	50 %	15601747
14568	NC_002506	GGC	2	6	949209	949214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601747
14569	NC_002506	GCA	2	6	949242	949247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601747
14570	NC_002506	ATA	2	6	949287	949292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601747
14571	NC_002506	TCA	2	6	949298	949303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601747
14572	NC_002506	CCCA	2	8	949710	949717	25 %	0 %	0 %	75 %	15601749
14573	NC_002506	TC	3	6	949814	949819	0 %	50 %	0 %	50 %	15601749
14574	NC_002506	TGG	2	6	949841	949846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601749
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14579	NC_002506	TGA	2	6	950120	950125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601749
14580	NC_002506	TGGC	2	8	950224	950231	0 %	25 %	50 %	25 %	15601749
14581	NC_002506	TTACG	2	10	950235	950244	20 %	40 %	20 %	20 %	15601749
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14583	NC_002506	TGA	2	6	950309	950314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601749
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14586	NC_002506	ACT	2	6	950480	950485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601749
14587	NC_002506	TGC	2	6	950502	950507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601749
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14589	NC_002506	TCACCG	2	12	950681	950692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15601749
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14591	NC_002506	TGG	2	6	950727	950732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601749
14592	NC_002506	TGA	2	6	950742	950747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601749
14593	NC_002506	ATCTCA	2	12	950789	950800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601749
14594	NC_002506	ATG	2	6	950885	950890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601749
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14596	NC_002506	GCA	2	6	950954	950959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601749
14597	NC_002506	CTG	2	6	950989	950994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601749
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14601	NC_002506	CT	3	6	951160	951165	0 %	50 %	0 %	50 %	15601749
14602	NC_002506	TC	3	6	951191	951196	0 %	50 %	0 %	50 %	15601749
14603	NC_002506	GCG	2	6	951268	951273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601749
14604	NC_002506	AG	3	6	951279	951284	50 %	0 %	50 %	0 %	15601749
14605	NC_002506	GATTGC	2	12	951315	951326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15601749
14606	NC_002506	TTG	2	6	951386	951391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601749
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14609	NC_002506	TTA	2	6	951678	951683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601750
14610	NC_002506	CCAT	2	8	951792	951799	25 %	25 %	0 %	50 %	15601750
14611	NC_002506	GCC	2	6	951869	951874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601750
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14619	NC_002506	GGCT	2	8	952301	952308	0 %	25 %	50 %	25 %	15601750
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14986	NC_002506	ATC	2	6	973553	973558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601779
14987	NC_002506	TGG	2	6	973578	973583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601779
14988	NC_002506	C	6	6	973649	973654	0 %	0 %	0 %	100 %	15601779
14989	NC_002506	AAC	2	6	973706	973711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601779
14990	NC_002506	CAC	2	6	973740	973745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601779
14991	NC_002506	CCA	2	6	973844	973849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601779
14992	NC_002506	TCA	2	6	973878	973883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601779
14993	NC_002506	CTT	2	6	974019	974024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601779
14994	NC_002506	GCCAT	2	10	974076	974085	20 %	20 %	20 %	40 %	15601779
14995	NC_002506	CA	3	6	974128	974133	50 %	0 %	0 %	50 %	15601779
14996	NC_002506	TCT	2	6	974171	974176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601779
14997	NC_002506	GGC	2	6	974233	974238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601779
14998	NC_002506	CTT	2	6	974259	974264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601779
14999	NC_002506	TCTT	2	8	974338	974345	0 %	75 %	0 %	25 %	15601779
15000	NC_002506	TTC	2	6	974407	974412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601779

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