MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_002506	TGGA	2	8	914414	914421	25 %	25 %	50 %	0 %	15601718
14002	NC_002506	AGC	2	6	914475	914480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601718
14003	NC_002506	TAC	2	6	914537	914542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601718
14004	NC_002506	TTA	2	6	914579	914584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601718
14005	NC_002506	AC	3	6	914638	914643	50 %	0 %	0 %	50 %	15601718
14006	NC_002506	TCA	2	6	914745	914750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601718
14007	NC_002506	T	6	6	914878	914883	0 %	100 %	0 %	0 %	15601718
14008	NC_002506	CTT	2	6	914922	914927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601718
14009	NC_002506	AAG	2	6	914970	914975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601718
14010	NC_002506	AAC	2	6	915063	915068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601718
14011	NC_002506	ATG	2	6	915144	915149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601718
14012	NC_002506	AAT	2	6	915191	915196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601718
14013	NC_002506	TAA	2	6	915202	915207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601718
14014	NC_002506	CCA	2	6	915216	915221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601718
14015	NC_002506	ATT	2	6	915231	915236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601718
14016	NC_002506	TGA	2	6	915256	915261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601718
14017	NC_002506	ATA	2	6	915306	915311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601718
14018	NC_002506	TCG	2	6	915336	915341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601718
14019	NC_002506	CAA	2	6	915367	915372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601718
14020	NC_002506	A	6	6	915478	915483	100 %	0 %	0 %	0 %	15601718
14021	NC_002506	ATG	2	6	915501	915506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601718
14022	NC_002506	A	6	6	915578	915583	100 %	0 %	0 %	0 %	15601718
14023	NC_002506	AGCG	2	8	915657	915664	25 %	0 %	50 %	25 %	15601719
14024	NC_002506	ACC	2	6	915692	915697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601719
14025	NC_002506	CCGT	2	8	915708	915715	0 %	25 %	25 %	50 %	15601719
14026	NC_002506	TTC	2	6	915754	915759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601719
14027	NC_002506	CGC	2	6	915781	915786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601719
14028	NC_002506	ATCG	2	8	915846	915853	25 %	25 %	25 %	25 %	15601719
14029	NC_002506	TCCC	2	8	915882	915889	0 %	25 %	0 %	75 %	15601719
14030	NC_002506	GATGGT	2	12	916117	916128	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15601722
14031	NC_002506	GGT	2	6	916225	916230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601722
14032	NC_002506	TGC	2	6	916274	916279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601722
14033	NC_002506	CGG	2	6	916332	916337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601722
14034	NC_002506	ATGG	2	8	916344	916351	25 %	25 %	50 %	0 %	15601722
14035	NC_002506	CAG	2	6	916352	916357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601722
14036	NC_002506	AAG	2	6	916394	916399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601722
14037	NC_002506	CAA	2	6	916443	916448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601722
14038	NC_002506	TTG	2	6	916490	916495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601722
14039	NC_002506	CAT	2	6	916501	916506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601722
14040	NC_002506	CAA	2	6	916510	916515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601722
14041	NC_002506	TGCC	2	8	916592	916599	0 %	25 %	25 %	50 %	15601722
14042	NC_002506	AC	3	6	916646	916651	50 %	0 %	0 %	50 %	15601722
14043	NC_002506	TGT	2	6	916670	916675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601722
14044	NC_002506	GCTT	2	8	916787	916794	0 %	50 %	25 %	25 %	15601722
14045	NC_002506	TGA	2	6	916844	916849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601722
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14047	NC_002506	CT	3	6	917269	917274	0 %	50 %	0 %	50 %	15601723
14048	NC_002506	GCTG	2	8	917282	917289	0 %	25 %	50 %	25 %	15601723
14049	NC_002506	T	6	6	917339	917344	0 %	100 %	0 %	0 %	15601723
14050	NC_002506	CTGT	2	8	917349	917356	0 %	50 %	25 %	25 %	15601723
14051	NC_002506	ATCA	2	8	917358	917365	50 %	25 %	0 %	25 %	15601723
14052	NC_002506	TCA	2	6	917914	917919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601724
14053	NC_002506	CT	3	6	917920	917925	0 %	50 %	0 %	50 %	15601724
14054	NC_002506	TGC	2	6	917948	917953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601724
14055	NC_002506	TGC	2	6	918041	918046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601724
14056	NC_002506	CGC	2	6	918267	918272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601724
14057	NC_002506	TC	3	6	918351	918356	0 %	50 %	0 %	50 %	15601725
14058	NC_002506	AGT	2	6	918389	918394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601725
14059	NC_002506	CAT	2	6	918402	918407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601725
14060	NC_002506	CAAAA	2	10	918417	918426	80 %	0 %	0 %	20 %	15601725
14061	NC_002506	ATC	2	6	918463	918468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601725
14062	NC_002506	CCAG	2	8	918475	918482	25 %	0 %	25 %	50 %	15601725
14063	NC_002506	AAC	2	6	918715	918720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601725
14064	NC_002506	AATAA	2	10	918757	918766	80 %	20 %	0 %	0 %	15601725
14065	NC_002506	CCA	2	6	918797	918802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601725
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14067	NC_002506	ATC	2	6	918877	918882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601725
14068	NC_002506	CAT	2	6	918897	918902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601725
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14070	NC_002506	ATG	2	6	919243	919248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601725
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14072	NC_002506	CTGTCG	2	12	919418	919429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601725
14073	NC_002506	A	6	6	919476	919481	100 %	0 %	0 %	0 %	15601725
14074	NC_002506	GC	3	6	919488	919493	0 %	0 %	50 %	50 %	15601725
14075	NC_002506	ACCC	2	8	919539	919546	25 %	0 %	0 %	75 %	15601725
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14080	NC_002506	TTAA	2	8	919748	919755	50 %	50 %	0 %	0 %	15601726
14081	NC_002506	ACAG	2	8	919767	919774	50 %	0 %	25 %	25 %	15601726
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14087	NC_002506	CTGA	2	8	919969	919976	25 %	25 %	25 %	25 %	15601727
14088	NC_002506	TGC	2	6	920051	920056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601727
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14093	NC_002506	CGC	2	6	920341	920346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601727
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14103	NC_002506	TG	3	6	920747	920752	0 %	50 %	50 %	0 %	15601727
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14123	NC_002506	CCACC	2	10	922210	922219	20 %	0 %	0 %	80 %	15601728
14124	NC_002506	GTGCG	2	10	922261	922270	0 %	20 %	60 %	20 %	15601728
14125	NC_002506	ATC	2	6	922302	922307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601728
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14149	NC_002506	T	6	6	923399	923404	0 %	100 %	0 %	0 %	15601728
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14245	NC_002506	GCTT	2	8	930673	930680	0 %	50 %	25 %	25 %	15601735
14246	NC_002506	CAA	2	6	930699	930704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601735
14247	NC_002506	TGCCT	2	10	930705	930714	0 %	40 %	20 %	40 %	15601735
14248	NC_002506	GTT	2	6	930739	930744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601735
14249	NC_002506	TTC	3	9	930768	930776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601735
14250	NC_002506	ACC	2	6	930799	930804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601735
14251	NC_002506	ATGA	2	8	931099	931106	50 %	25 %	25 %	0 %	15601736
14252	NC_002506	TGG	2	6	931121	931126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601736
14253	NC_002506	GTG	2	6	931141	931146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601736
14254	NC_002506	GCCA	2	8	931176	931183	25 %	0 %	25 %	50 %	15601736
14255	NC_002506	CGC	2	6	931402	931407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601736
14256	NC_002506	CAT	3	9	931416	931424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601736
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14258	NC_002506	GCC	2	6	931486	931491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601736
14259	NC_002506	CTG	2	6	931495	931500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601736
14260	NC_002506	GCG	2	6	931525	931530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601736
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14264	NC_002506	GCT	2	6	931641	931646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601736
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14270	NC_002506	GCCTT	2	10	931826	931835	0 %	40 %	20 %	40 %	15601736
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14272	NC_002506	CGG	2	6	931925	931930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601736
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14274	NC_002506	CTT	2	6	931941	931946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601736
14275	NC_002506	AAGCC	2	10	932036	932045	40 %	0 %	20 %	40 %	15601736
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14277	NC_002506	TCG	2	6	932096	932101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601736
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14353	NC_002506	TTAC	2	8	936633	936640	25 %	50 %	0 %	25 %	15601738
14354	NC_002506	CAT	2	6	936675	936680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601738
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14360	NC_002506	AG	3	6	936996	937001	50 %	0 %	50 %	0 %	15601738
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14363	NC_002506	ACG	2	6	937122	937127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601739
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14486	NC_002506	CAGC	2	8	944877	944884	25 %	0 %	25 %	50 %	15601743
14487	NC_002506	TGC	2	6	944891	944896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601743
14488	NC_002506	GT	3	6	944928	944933	0 %	50 %	50 %	0 %	15601743
14489	NC_002506	GTGA	2	8	944956	944963	25 %	25 %	50 %	0 %	15601743
14490	NC_002506	TGC	2	6	945017	945022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601743
14491	NC_002506	GA	3	6	945205	945210	50 %	0 %	50 %	0 %	15601743
14492	NC_002506	A	6	6	945244	945249	100 %	0 %	0 %	0 %	15601743
14493	NC_002506	TCAA	2	8	945411	945418	50 %	25 %	0 %	25 %	15601744
14494	NC_002506	GGC	2	6	945457	945462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601744
14495	NC_002506	TTC	2	6	945516	945521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601744
14496	NC_002506	GCT	2	6	945550	945555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14497	NC_002506	CAT	2	6	945637	945642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601744
14498	NC_002506	TAC	2	6	945659	945664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601744
14499	NC_002506	TGC	2	6	945678	945683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744
14500	NC_002506	TGC	2	6	945721	945726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601744

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