MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_002506	GCC	2	6	880141	880146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601680
13502	NC_002506	AGT	2	6	880211	880216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601680
13503	NC_002506	T	6	6	880220	880225	0 %	100 %	0 %	0 %	15601680
13504	NC_002506	GTC	2	6	880318	880323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601680
13505	NC_002506	TCA	2	6	880342	880347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601680
13506	NC_002506	CTG	2	6	880348	880353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601680
13507	NC_002506	GA	3	6	880464	880469	50 %	0 %	50 %	0 %	15601680
13508	NC_002506	CAG	2	6	880497	880502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601680
13509	NC_002506	AGAT	2	8	880615	880622	50 %	25 %	25 %	0 %	15601680
13510	NC_002506	CAA	2	6	880668	880673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601680
13511	NC_002506	AAC	2	6	880712	880717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601680
13512	NC_002506	GCA	2	6	880759	880764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601680
13513	NC_002506	GCGCA	2	10	880800	880809	20 %	0 %	40 %	40 %	15601680
13514	NC_002506	CA	3	6	880856	880861	50 %	0 %	0 %	50 %	15601680
13515	NC_002506	A	7	7	880867	880873	100 %	0 %	0 %	0 %	15601680
13516	NC_002506	CAG	2	6	880929	880934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601680
13517	NC_002506	ATC	2	6	880963	880968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601680
13518	NC_002506	AAC	2	6	881200	881205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601681
13519	NC_002506	TGG	2	6	881219	881224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601681
13520	NC_002506	GCTC	2	8	881230	881237	0 %	25 %	25 %	50 %	15601681
13521	NC_002506	TGG	3	9	881253	881261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601681
13522	NC_002506	AAC	2	6	881282	881287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601681
13523	NC_002506	TCA	2	6	881316	881321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601681
13524	NC_002506	TGG	2	6	881381	881386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601681
13525	NC_002506	TACT	2	8	881432	881439	25 %	50 %	0 %	25 %	15601681
13526	NC_002506	TCC	2	6	881453	881458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601681
13527	NC_002506	CTG	2	6	881506	881511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601682
13528	NC_002506	CGG	2	6	881534	881539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601682
13529	NC_002506	CTA	2	6	881584	881589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601682
13530	NC_002506	CTT	2	6	881617	881622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601682
13531	NC_002506	TGA	2	6	881756	881761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601682
13532	NC_002506	GAT	2	6	881821	881826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601682
13533	NC_002506	AGA	2	6	881844	881849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601682
13534	NC_002506	TGC	2	6	881886	881891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601682
13535	NC_002506	TCG	2	6	881916	881921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601682
13536	NC_002506	GCT	2	6	881937	881942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601682
13537	NC_002506	CAA	2	6	882056	882061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601683
13538	NC_002506	ACG	2	6	882239	882244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601683
13539	NC_002506	CAT	2	6	882338	882343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601683
13540	NC_002506	GC	3	6	882358	882363	0 %	0 %	50 %	50 %	15601683
13541	NC_002506	TTCAAT	2	12	882380	882391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15601683
13542	NC_002506	CAG	2	6	882400	882405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601683
13543	NC_002506	GGCGC	2	10	882411	882420	0 %	0 %	60 %	40 %	15601683
13544	NC_002506	GCT	2	6	882511	882516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601683
13545	NC_002506	GGTT	2	8	882529	882536	0 %	50 %	50 %	0 %	15601683
13546	NC_002506	ATC	2	6	882678	882683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601683
13547	NC_002506	GC	3	6	882743	882748	0 %	0 %	50 %	50 %	15601683
13548	NC_002506	GCA	2	6	882757	882762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601683
13549	NC_002506	T	6	6	882815	882820	0 %	100 %	0 %	0 %	15601683
13550	NC_002506	AGC	2	6	882879	882884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601683
13551	NC_002506	CAC	2	6	882983	882988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601683
13552	NC_002506	TGGC	2	8	883054	883061	0 %	25 %	50 %	25 %	15601683
13553	NC_002506	CTG	2	6	883079	883084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601683
13554	NC_002506	ATA	2	6	883170	883175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601683
13555	NC_002506	CTA	2	6	883320	883325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193309
13556	NC_002506	GCCA	2	8	883333	883340	25 %	0 %	25 %	50 %	471193309
13557	NC_002506	TCA	2	6	883359	883364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193309
13558	NC_002506	CATG	2	8	883394	883401	25 %	25 %	25 %	25 %	471193309
13559	NC_002506	GAC	2	6	883402	883407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193309
13560	NC_002506	ATG	2	6	883429	883434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193309
13561	NC_002506	CCG	2	6	883466	883471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193309
13562	NC_002506	CGC	2	6	883483	883488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193309
13563	NC_002506	TCA	2	6	883512	883517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193309
13564	NC_002506	CGC	2	6	883542	883547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193309
13565	NC_002506	TGCC	2	8	883620	883627	0 %	25 %	25 %	50 %	471193309
13566	NC_002506	ATG	2	6	883652	883657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193309
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13568	NC_002506	TG	3	6	883685	883690	0 %	50 %	50 %	0 %	471193309
13569	NC_002506	AAT	2	6	883729	883734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471193309
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13572	NC_002506	TCT	2	6	883905	883910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471193309
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13574	NC_002506	TAA	3	9	883983	883991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471193309
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13579	NC_002506	CAT	2	6	884163	884168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193309
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13585	NC_002506	GC	3	6	884621	884626	0 %	0 %	50 %	50 %	15601685
13586	NC_002506	GCA	2	6	884767	884772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601685
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13588	NC_002506	CAT	2	6	884932	884937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601685
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13594	NC_002506	CA	3	6	885069	885074	50 %	0 %	0 %	50 %	15601685
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13602	NC_002506	A	6	6	885542	885547	100 %	0 %	0 %	0 %	15601685
13603	NC_002506	CTCA	2	8	885566	885573	25 %	25 %	0 %	50 %	15601685
13604	NC_002506	CAA	2	6	885609	885614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601685
13605	NC_002506	GGC	2	6	885630	885635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601685
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13609	NC_002506	TCAG	2	8	886174	886181	25 %	25 %	25 %	25 %	15601687
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13990	NC_002506	TCA	2	6	913847	913852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601717
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