MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002506	AAG	2	6	849658	849663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601649
13002	NC_002506	CCA	2	6	849707	849712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601649
13003	NC_002506	CTG	2	6	849739	849744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601649
13004	NC_002506	GCA	2	6	849750	849755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601649
13005	NC_002506	TCA	2	6	849762	849767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601649
13006	NC_002506	TTTC	2	8	849784	849791	0 %	75 %	0 %	25 %	15601649
13007	NC_002506	GAT	2	6	850216	850221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601650
13008	NC_002506	CAG	2	6	850237	850242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13009	NC_002506	A	6	6	850419	850424	100 %	0 %	0 %	0 %	15601650
13010	NC_002506	GCA	2	6	850453	850458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13011	NC_002506	AGC	2	6	850551	850556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13012	NC_002506	CCA	2	6	850583	850588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601650
13013	NC_002506	CTTGC	2	10	850611	850620	0 %	40 %	20 %	40 %	15601650
13014	NC_002506	ATC	2	6	850664	850669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601650
13015	NC_002506	CCA	3	9	850723	850731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601650
13016	NC_002506	CTG	2	6	850793	850798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13017	NC_002506	GCG	2	6	850899	850904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601650
13018	NC_002506	TTA	2	6	850906	850911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601650
13019	NC_002506	ACC	2	6	850947	850952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601650
13020	NC_002506	TGC	2	6	850953	850958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13021	NC_002506	TGG	2	6	850971	850976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601650
13022	NC_002506	GCC	2	6	850984	850989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601650
13023	NC_002506	GCG	2	6	850991	850996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601650
13024	NC_002506	ATCTG	2	10	851062	851071	20 %	40 %	20 %	20 %	15601650
13025	NC_002506	CAA	2	6	851074	851079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601650
13026	NC_002506	GGC	2	6	851155	851160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601650
13027	NC_002506	TCA	2	6	851199	851204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601650
13028	NC_002506	ATC	2	6	851342	851347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601650
13029	NC_002506	TGA	2	6	851359	851364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601650
13030	NC_002506	TGA	2	6	851373	851378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601650
13031	NC_002506	AAG	2	6	851418	851423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601650
13032	NC_002506	TGC	2	6	851487	851492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13033	NC_002506	TTG	2	6	851548	851553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601650
13034	NC_002506	TGC	2	6	851649	851654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601650
13035	NC_002506	CGA	2	6	851772	851777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601651
13036	NC_002506	CAGC	2	8	851790	851797	25 %	0 %	25 %	50 %	15601651
13037	NC_002506	GGC	2	6	851827	851832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601651
13038	NC_002506	AGCC	2	8	851866	851873	25 %	0 %	25 %	50 %	15601651
13039	NC_002506	TGG	2	6	851911	851916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601651
13040	NC_002506	G	6	6	851915	851920	0 %	0 %	100 %	0 %	15601651
13041	NC_002506	TG	3	6	851929	851934	0 %	50 %	50 %	0 %	15601651
13042	NC_002506	GCT	2	6	851976	851981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601651
13043	NC_002506	GGT	2	6	852201	852206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601651
13044	NC_002506	TGC	2	6	852257	852262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601651
13045	NC_002506	CAC	2	6	852330	852335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601651
13046	NC_002506	AAC	2	6	852344	852349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601651
13047	NC_002506	CGC	2	6	852414	852419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601651
13048	NC_002506	GA	3	6	852438	852443	50 %	0 %	50 %	0 %	15601651
13049	NC_002506	GTG	2	6	852530	852535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601652
13050	NC_002506	CA	3	6	852537	852542	50 %	0 %	0 %	50 %	15601652
13051	NC_002506	TTG	2	6	852600	852605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601652
13052	NC_002506	TGA	2	6	852688	852693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601652
13053	NC_002506	CAT	3	9	852733	852741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601652
13054	NC_002506	TGG	2	6	852745	852750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601652
13055	NC_002506	CCG	2	6	852775	852780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601652
13056	NC_002506	TGG	2	6	852832	852837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601652
13057	NC_002506	GAA	2	6	852839	852844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601652
13058	NC_002506	TGGG	2	8	852962	852969	0 %	25 %	75 %	0 %	15601652
13059	NC_002506	AAGATG	2	12	853173	853184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15601652
13060	NC_002506	GTTG	2	8	853192	853199	0 %	50 %	50 %	0 %	15601652
13061	NC_002506	AGA	2	6	853200	853205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601652
13062	NC_002506	CTG	2	6	853215	853220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601652
13063	NC_002506	TC	3	6	853302	853307	0 %	50 %	0 %	50 %	15601652
13064	NC_002506	ACAA	2	8	853386	853393	75 %	0 %	0 %	25 %	15601652
13065	NC_002506	GCT	2	6	853420	853425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601652
13066	NC_002506	ATC	2	6	853436	853441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601652
13067	NC_002506	GTG	2	6	853530	853535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601652
13068	NC_002506	ATC	2	6	853541	853546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601652
13069	NC_002506	CCTT	2	8	853725	853732	0 %	50 %	0 %	50 %	15601652
13070	NC_002506	CTG	2	6	853766	853771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601652
13071	NC_002506	ATCG	2	8	853814	853821	25 %	25 %	25 %	25 %	15601652
13072	NC_002506	GTG	2	6	853827	853832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601652
13073	NC_002506	TTC	2	6	853835	853840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601652
13074	NC_002506	CTA	2	6	853878	853883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601652
13075	NC_002506	ACG	2	6	853887	853892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601652
13076	NC_002506	CAA	2	6	854061	854066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601653
13077	NC_002506	CAA	2	6	854149	854154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601653
13078	NC_002506	AAG	2	6	854162	854167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601653
13079	NC_002506	TGCTT	2	10	854454	854463	0 %	60 %	20 %	20 %	15601654
13080	NC_002506	CAA	2	6	854474	854479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601654
13081	NC_002506	CAA	2	6	854491	854496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601654
13082	NC_002506	ACT	2	6	854526	854531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601654
13083	NC_002506	TGC	2	6	854532	854537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601654
13084	NC_002506	GTG	2	6	854632	854637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601654
13085	NC_002506	TGCGC	2	10	854688	854697	0 %	20 %	40 %	40 %	15601654
13086	NC_002506	TC	3	6	854747	854752	0 %	50 %	0 %	50 %	15601654
13087	NC_002506	ACT	3	9	854765	854773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601654
13088	NC_002506	ATGG	2	8	855075	855082	25 %	25 %	50 %	0 %	15601654
13089	NC_002506	ACAG	2	8	855094	855101	50 %	0 %	25 %	25 %	15601654
13090	NC_002506	AAC	2	6	855122	855127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601654
13091	NC_002506	CAG	2	6	855198	855203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601654
13092	NC_002506	A	6	6	855284	855289	100 %	0 %	0 %	0 %	15601654
13093	NC_002506	GCCT	2	8	855314	855321	0 %	25 %	25 %	50 %	15601654
13094	NC_002506	TGAAA	2	10	855357	855366	60 %	20 %	20 %	0 %	15601654
13095	NC_002506	TG	3	6	855397	855402	0 %	50 %	50 %	0 %	15601655
13096	NC_002506	GGT	2	6	855403	855408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601655
13097	NC_002506	AAC	2	6	855433	855438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601655
13098	NC_002506	CAA	2	6	855444	855449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601655
13099	NC_002506	TAC	2	6	855466	855471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601655
13100	NC_002506	ATG	2	6	855483	855488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601655
13101	NC_002506	CAT	2	6	855644	855649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601655
13102	NC_002506	GCA	2	6	855813	855818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601655
13103	NC_002506	GGT	2	6	855873	855878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601655
13104	NC_002506	ACT	2	6	855934	855939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601655
13105	NC_002506	CGC	2	6	855942	855947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601655
13106	NC_002506	A	6	6	855994	855999	100 %	0 %	0 %	0 %	15601655
13107	NC_002506	TAA	2	6	856037	856042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601656
13108	NC_002506	TGT	2	6	856086	856091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601656
13109	NC_002506	AGCTT	2	10	856161	856170	20 %	40 %	20 %	20 %	15601656
13110	NC_002506	ATC	2	6	856176	856181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601656
13111	NC_002506	TGC	2	6	856188	856193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601656
13112	NC_002506	TAG	2	6	856202	856207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601656
13113	NC_002506	AAT	2	6	856257	856262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601656
13114	NC_002506	TCG	2	6	856282	856287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601656
13115	NC_002506	TCT	2	6	856383	856388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601656
13116	NC_002506	ACTC	2	8	856426	856433	25 %	25 %	0 %	50 %	15601656
13117	NC_002506	CATC	2	8	856435	856442	25 %	25 %	0 %	50 %	15601656
13118	NC_002506	CTC	2	6	856508	856513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601656
13119	NC_002506	GGC	2	6	856523	856528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601656
13120	NC_002506	AGC	2	6	856548	856553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601656
13121	NC_002506	AAAG	2	8	856629	856636	75 %	0 %	25 %	0 %	15601656
13122	NC_002506	CATC	2	8	856648	856655	25 %	25 %	0 %	50 %	15601656
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13125	NC_002506	CTG	2	6	856733	856738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601656
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13129	NC_002506	AG	3	6	856866	856871	50 %	0 %	50 %	0 %	15601656
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13137	NC_002506	TCCA	2	8	857462	857469	25 %	25 %	0 %	50 %	15601657
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13230	NC_002506	A	6	6	862646	862651	100 %	0 %	0 %	0 %	15601660
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13239	NC_002506	TAAC	2	8	863384	863391	50 %	25 %	0 %	25 %	15601661
13240	NC_002506	GAC	2	6	863397	863402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601661
13241	NC_002506	TGT	2	6	863546	863551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193306
13242	NC_002506	TGC	2	6	863552	863557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193306
13243	NC_002506	TCA	2	6	863603	863608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193306
13244	NC_002506	AGAT	2	8	863615	863622	50 %	25 %	25 %	0 %	471193306
13245	NC_002506	AAG	2	6	863651	863656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471193306
13246	NC_002506	AGT	2	6	863661	863666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193306
13247	NC_002506	GTA	2	6	863767	863772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193306
13248	NC_002506	GTG	2	6	863843	863848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193306
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13251	NC_002506	TGC	2	6	863996	864001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193306
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13263	NC_002506	GAT	2	6	864545	864550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601663
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13267	NC_002506	GTAGA	2	10	864759	864768	40 %	20 %	40 %	0 %	15601663
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13274	NC_002506	TTTG	2	8	865115	865122	0 %	75 %	25 %	0 %	15601663
13275	NC_002506	CCA	2	6	865154	865159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601663
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13351	NC_002506	ACTC	2	8	869870	869877	25 %	25 %	0 %	50 %	229220823
13352	NC_002506	TCA	2	6	869945	869950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220823
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13355	NC_002506	GAA	2	6	869988	869993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229220823
13356	NC_002506	CGT	3	9	870002	870010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220823
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13358	NC_002506	AGAA	2	8	870116	870123	75 %	0 %	25 %	0 %	229220823
13359	NC_002506	GCC	2	6	870156	870161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220823
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13362	NC_002506	CT	3	6	870389	870394	0 %	50 %	0 %	50 %	15601671
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13486	NC_002506	ACA	2	6	878842	878847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601679
13487	NC_002506	GAC	2	6	878866	878871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601679
13488	NC_002506	CG	3	6	878941	878946	0 %	0 %	50 %	50 %	15601679
13489	NC_002506	ACC	2	6	878977	878982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601679
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13491	NC_002506	ACC	2	6	879151	879156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601679
13492	NC_002506	CAC	2	6	879252	879257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601679
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13494	NC_002506	CAA	2	6	879388	879393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601679
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