MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002506	GGT	2	6	817662	817667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601620
12502	NC_002506	GTG	2	6	817671	817676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601620
12503	NC_002506	AAG	2	6	817681	817686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601620
12504	NC_002506	TACG	2	8	817840	817847	25 %	25 %	25 %	25 %	15601620
12505	NC_002506	CG	3	6	817880	817885	0 %	0 %	50 %	50 %	15601620
12506	NC_002506	ACC	2	6	817988	817993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601620
12507	NC_002506	GGA	2	6	817994	817999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601620
12508	NC_002506	ACC	2	6	818093	818098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601620
12509	NC_002506	CCA	2	6	818176	818181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601620
12510	NC_002506	GCG	2	6	818290	818295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601620
12511	NC_002506	CTG	2	6	818309	818314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601620
12512	NC_002506	AAG	2	6	818340	818345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601620
12513	NC_002506	CGT	2	6	818350	818355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601620
12514	NC_002506	TGT	2	6	818392	818397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601620
12515	NC_002506	TGT	2	6	818407	818412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601620
12516	NC_002506	GCC	2	6	818447	818452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601620
12517	NC_002506	GGT	2	6	818495	818500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601620
12518	NC_002506	T	6	6	818560	818565	0 %	100 %	0 %	0 %	15601620
12519	NC_002506	CCG	2	6	818571	818576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601620
12520	NC_002506	A	6	6	818687	818692	100 %	0 %	0 %	0 %	15601620
12521	NC_002506	ATC	2	6	818726	818731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601620
12522	NC_002506	GTT	2	6	818788	818793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601620
12523	NC_002506	CTG	2	6	818825	818830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601620
12524	NC_002506	CTG	2	6	818873	818878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601620
12525	NC_002506	CCA	2	6	818926	818931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601620
12526	NC_002506	CTG	2	6	818966	818971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601620
12527	NC_002506	GGC	2	6	819032	819037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601620
12528	NC_002506	CAT	2	6	819041	819046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601620
12529	NC_002506	ACTGT	2	10	819047	819056	20 %	40 %	20 %	20 %	15601620
12530	NC_002506	TGC	2	6	819057	819062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601620
12531	NC_002506	CAT	2	6	819088	819093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601620
12532	NC_002506	AG	3	6	819118	819123	50 %	0 %	50 %	0 %	15601620
12533	NC_002506	TCATTT	2	12	819175	819186	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15601620
12534	NC_002506	TCAA	2	8	819263	819270	50 %	25 %	0 %	25 %	15601621
12535	NC_002506	A	7	7	819308	819314	100 %	0 %	0 %	0 %	15601621
12536	NC_002506	ACT	2	6	819349	819354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601621
12537	NC_002506	AAAAT	2	10	819395	819404	80 %	20 %	0 %	0 %	15601621
12538	NC_002506	ACC	2	6	819617	819622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601622
12539	NC_002506	GATT	2	8	819643	819650	25 %	50 %	25 %	0 %	15601622
12540	NC_002506	GTT	2	6	819696	819701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601622
12541	NC_002506	CA	3	6	819717	819722	50 %	0 %	0 %	50 %	15601622
12542	NC_002506	AGC	2	6	819773	819778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601622
12543	NC_002506	GTC	2	6	819791	819796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601622
12544	NC_002506	TCA	2	6	819846	819851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601622
12545	NC_002506	GTG	2	6	819858	819863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601622
12546	NC_002506	AGT	2	6	819916	819921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601622
12547	NC_002506	AGGT	2	8	819934	819941	25 %	25 %	50 %	0 %	15601622
12548	NC_002506	TGTTT	2	10	819948	819957	0 %	80 %	20 %	0 %	15601622
12549	NC_002506	CAC	2	6	819985	819990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601622
12550	NC_002506	AGC	2	6	820022	820027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601622
12551	NC_002506	TGT	2	6	820045	820050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601622
12552	NC_002506	TAC	2	6	820148	820153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601622
12553	NC_002506	CG	3	6	820166	820171	0 %	0 %	50 %	50 %	15601622
12554	NC_002506	CTT	2	6	820186	820191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601622
12555	NC_002506	GGAGC	2	10	820206	820215	20 %	0 %	60 %	20 %	15601622
12556	NC_002506	GTTT	2	8	820248	820255	0 %	75 %	25 %	0 %	15601622
12557	NC_002506	TCT	2	6	821219	821224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601625
12558	NC_002506	TTC	2	6	821240	821245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601625
12559	NC_002506	GCA	2	6	821252	821257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601625
12560	NC_002506	CCG	2	6	821285	821290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601625
12561	NC_002506	A	8	8	821319	821326	100 %	0 %	0 %	0 %	15601625
12562	NC_002506	AAG	2	6	821332	821337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601625
12563	NC_002506	CT	3	6	821344	821349	0 %	50 %	0 %	50 %	15601625
12564	NC_002506	GATC	2	8	821367	821374	25 %	25 %	25 %	25 %	15601625
12565	NC_002506	ATT	2	6	821389	821394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601625
12566	NC_002506	AAT	2	6	821401	821406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601625
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12568	NC_002506	CCGCG	2	10	821610	821619	0 %	0 %	40 %	60 %	15601625
12569	NC_002506	CAC	2	6	821632	821637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601625
12570	NC_002506	GGC	2	6	821644	821649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601625
12571	NC_002506	TGG	2	6	821765	821770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601625
12572	NC_002506	A	6	6	821788	821793	100 %	0 %	0 %	0 %	15601625
12573	NC_002506	TTG	2	6	821800	821805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601625
12574	NC_002506	TTGTC	2	10	821952	821961	0 %	60 %	20 %	20 %	15601625
12575	NC_002506	CA	3	6	821967	821972	50 %	0 %	0 %	50 %	15601625
12576	NC_002506	TCG	2	6	821996	822001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601625
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12578	NC_002506	A	6	6	822470	822475	100 %	0 %	0 %	0 %	15601626
12579	NC_002506	TCGAT	2	10	822481	822490	20 %	40 %	20 %	20 %	15601626
12580	NC_002506	GAA	2	6	822605	822610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601626
12581	NC_002506	ACG	2	6	822683	822688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601626
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12583	NC_002506	A	6	6	822878	822883	100 %	0 %	0 %	0 %	15601626
12584	NC_002506	CGG	2	6	823043	823048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601626
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12587	NC_002506	AGC	2	6	823187	823192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601626
12588	NC_002506	GAT	2	6	823237	823242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601626
12589	NC_002506	AGC	2	6	823429	823434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601626
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12591	NC_002506	A	7	7	823494	823500	100 %	0 %	0 %	0 %	15601626
12592	NC_002506	A	6	6	823525	823530	100 %	0 %	0 %	0 %	15601626
12593	NC_002506	CAG	2	6	823695	823700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601626
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12595	NC_002506	TGA	2	6	823749	823754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601626
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12597	NC_002506	GTT	2	6	823968	823973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601627
12598	NC_002506	GAC	2	6	824159	824164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601627
12599	NC_002506	TCG	2	6	824260	824265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601627
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12601	NC_002506	TTC	2	6	824298	824303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601627
12602	NC_002506	TGGT	2	8	824306	824313	0 %	50 %	50 %	0 %	15601627
12603	NC_002506	TCA	2	6	824341	824346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601627
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12605	NC_002506	TTA	2	6	824570	824575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601627
12606	NC_002506	GC	3	6	824604	824609	0 %	0 %	50 %	50 %	15601627
12607	NC_002506	CGC	2	6	824624	824629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601627
12608	NC_002506	AAAGT	2	10	824706	824715	60 %	20 %	20 %	0 %	15601627
12609	NC_002506	CAG	2	6	824755	824760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601627
12610	NC_002506	AGAA	2	8	824788	824795	75 %	0 %	25 %	0 %	15601627
12611	NC_002506	CGTT	2	8	824850	824857	0 %	50 %	25 %	25 %	15601627
12612	NC_002506	TGA	2	6	824858	824863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601627
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12615	NC_002506	ACT	2	6	824936	824941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601627
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12617	NC_002506	GAT	2	6	825087	825092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601627
12618	NC_002506	TG	3	6	825104	825109	0 %	50 %	50 %	0 %	15601627
12619	NC_002506	CAT	2	6	825131	825136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601627
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12622	NC_002506	GTC	2	6	825298	825303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601627
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12990	NC_002506	GAT	2	6	849196	849201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601649
12991	NC_002506	GCCGC	2	10	849230	849239	0 %	0 %	40 %	60 %	15601649
12992	NC_002506	CCA	2	6	849291	849296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601649
12993	NC_002506	AAG	2	6	849338	849343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601649
12994	NC_002506	AGA	2	6	849426	849431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601649
12995	NC_002506	CAT	2	6	849453	849458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601649
12996	NC_002506	TGC	2	6	849473	849478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601649
12997	NC_002506	TACCC	2	10	849485	849494	20 %	20 %	0 %	60 %	15601649
12998	NC_002506	AGG	2	6	849525	849530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601649
12999	NC_002506	ATGG	2	8	849544	849551	25 %	25 %	50 %	0 %	15601649
13000	NC_002506	CAT	2	6	849603	849608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601649

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