MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_002506	AGCA	2	8	723319	723326	50 %	0 %	25 %	25 %	15601535
11002	NC_002506	CAA	2	6	723809	723814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601536
11003	NC_002506	GCA	2	6	723828	723833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11004	NC_002506	CGA	2	6	723922	723927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11005	NC_002506	CGG	2	6	724008	724013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601536
11006	NC_002506	CTG	2	6	724049	724054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11007	NC_002506	CTGA	2	8	724058	724065	25 %	25 %	25 %	25 %	15601536
11008	NC_002506	GCA	2	6	724075	724080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11009	NC_002506	GCC	2	6	724119	724124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601536
11010	NC_002506	CAA	2	6	724154	724159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601536
11011	NC_002506	CAT	2	6	724240	724245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601536
11012	NC_002506	ACTG	2	8	724277	724284	25 %	25 %	25 %	25 %	15601536
11013	NC_002506	CAC	2	6	724295	724300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601536
11014	NC_002506	GC	3	6	724372	724377	0 %	0 %	50 %	50 %	15601536
11015	NC_002506	TCGC	2	8	724434	724441	0 %	25 %	25 %	50 %	15601536
11016	NC_002506	CT	3	6	724560	724565	0 %	50 %	0 %	50 %	15601536
11017	NC_002506	ATG	2	6	724626	724631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601536
11018	NC_002506	AGC	2	6	724637	724642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11019	NC_002506	TGCT	2	8	724654	724661	0 %	50 %	25 %	25 %	15601536
11020	NC_002506	GAT	2	6	724784	724789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601536
11021	NC_002506	AG	4	8	724805	724812	50 %	0 %	50 %	0 %	15601536
11022	NC_002506	TGC	2	6	724838	724843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11023	NC_002506	CAG	2	6	724904	724909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11024	NC_002506	ACC	2	6	724929	724934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601536
11025	NC_002506	CAC	2	6	724952	724957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601536
11026	NC_002506	CAG	2	6	725003	725008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11027	NC_002506	CAG	2	6	725033	725038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11028	NC_002506	ACCGCA	2	12	725082	725093	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15601536
11029	NC_002506	AAG	2	6	725145	725150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601536
11030	NC_002506	CTG	2	6	725151	725156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11031	NC_002506	CAA	2	6	725207	725212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601536
11032	NC_002506	GCA	2	6	725230	725235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11033	NC_002506	ACC	2	6	725271	725276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601536
11034	NC_002506	GCG	2	6	725327	725332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601536
11035	NC_002506	TGCG	2	8	725367	725374	0 %	25 %	50 %	25 %	15601536
11036	NC_002506	GGT	2	6	725408	725413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601536
11037	NC_002506	TCGC	2	8	725517	725524	0 %	25 %	25 %	50 %	15601536
11038	NC_002506	TTG	2	6	725537	725542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601536
11039	NC_002506	TCGAT	2	10	725548	725557	20 %	40 %	20 %	20 %	15601536
11040	NC_002506	TCA	2	6	725565	725570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601536
11041	NC_002506	GTTG	2	8	725797	725804	0 %	50 %	50 %	0 %	15601536
11042	NC_002506	TGC	2	6	725961	725966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601536
11043	NC_002506	GCG	2	6	726179	726184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601536
11044	NC_002506	CTC	2	6	726220	726225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601537
11045	NC_002506	A	6	6	726244	726249	100 %	0 %	0 %	0 %	15601537
11046	NC_002506	TCG	2	6	726250	726255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601537
11047	NC_002506	TAGTG	2	10	726298	726307	20 %	40 %	40 %	0 %	15601537
11048	NC_002506	GTTCA	2	10	726319	726328	20 %	40 %	20 %	20 %	15601537
11049	NC_002506	ATCA	2	8	726337	726344	50 %	25 %	0 %	25 %	15601537
11050	NC_002506	TCA	2	6	726383	726388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601537
11051	NC_002506	TGC	2	6	726440	726445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601537
11052	NC_002506	CAC	2	6	726447	726452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601537
11053	NC_002506	ACCG	2	8	726493	726500	25 %	0 %	25 %	50 %	15601537
11054	NC_002506	AGC	2	6	726506	726511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601537
11055	NC_002506	TCC	2	6	726530	726535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601537
11056	NC_002506	AACA	2	8	726548	726555	75 %	0 %	0 %	25 %	15601537
11057	NC_002506	GCG	2	6	726641	726646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601537
11058	NC_002506	TCA	2	6	726653	726658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601537
11059	NC_002506	TCA	2	6	726732	726737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601537
11060	NC_002506	GA	3	6	726797	726802	50 %	0 %	50 %	0 %	15601537
11061	NC_002506	ATG	2	6	726872	726877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601537
11062	NC_002506	ACT	2	6	726895	726900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601538
11063	NC_002506	TGTT	2	8	726909	726916	0 %	75 %	25 %	0 %	15601538
11064	NC_002506	CTG	2	6	726927	726932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601538
11065	NC_002506	CAGC	2	8	726933	726940	25 %	0 %	25 %	50 %	15601538
11066	NC_002506	CGCC	2	8	727102	727109	0 %	0 %	25 %	75 %	15601538
11067	NC_002506	CT	3	6	727114	727119	0 %	50 %	0 %	50 %	15601538
11068	NC_002506	ACG	2	6	727167	727172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601538
11069	NC_002506	CAC	2	6	727213	727218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601538
11070	NC_002506	CCTAG	2	10	727325	727334	20 %	20 %	20 %	40 %	15601538
11071	NC_002506	TTCT	2	8	727364	727371	0 %	75 %	0 %	25 %	15601538
11072	NC_002506	GAT	2	6	727399	727404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601538
11073	NC_002506	GC	3	6	727609	727614	0 %	0 %	50 %	50 %	15601539
11074	NC_002506	ACA	2	6	727650	727655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601539
11075	NC_002506	TCG	2	6	727723	727728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601539
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11079	NC_002506	AGCA	2	8	727874	727881	50 %	0 %	25 %	25 %	15601539
11080	NC_002506	T	6	6	727913	727918	0 %	100 %	0 %	0 %	15601539
11081	NC_002506	TCA	2	6	727982	727987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601539
11082	NC_002506	CTTG	2	8	728100	728107	0 %	50 %	25 %	25 %	15601539
11083	NC_002506	ACC	2	6	728128	728133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601539
11084	NC_002506	GCG	2	6	728183	728188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601539
11085	NC_002506	CTAT	2	8	728291	728298	25 %	50 %	0 %	25 %	15601539
11086	NC_002506	GTT	2	6	728395	728400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601539
11087	NC_002506	TATT	2	8	728429	728436	25 %	75 %	0 %	0 %	15601539
11088	NC_002506	CTTA	2	8	728450	728457	25 %	50 %	0 %	25 %	15601539
11089	NC_002506	GAT	2	6	728590	728595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601539
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11091	NC_002506	AATG	2	8	728646	728653	50 %	25 %	25 %	0 %	15601539
11092	NC_002506	CAG	2	6	728665	728670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601539
11093	NC_002506	TAA	2	6	728772	728777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601539
11094	NC_002506	CGATCC	2	12	728975	728986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15601540
11095	NC_002506	GCA	2	6	729009	729014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11096	NC_002506	CTG	2	6	729025	729030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11097	NC_002506	GC	3	6	729261	729266	0 %	0 %	50 %	50 %	15601540
11098	NC_002506	TG	3	6	729317	729322	0 %	50 %	50 %	0 %	15601540
11099	NC_002506	GTT	2	6	729429	729434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601540
11100	NC_002506	TC	3	6	729502	729507	0 %	50 %	0 %	50 %	15601540
11101	NC_002506	CAG	2	6	729541	729546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11102	NC_002506	AGC	3	9	729605	729613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601540
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11104	NC_002506	GAT	2	6	729721	729726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601540
11105	NC_002506	GCA	2	6	729963	729968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11106	NC_002506	CAG	2	6	729987	729992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11107	NC_002506	T	6	6	730027	730032	0 %	100 %	0 %	0 %	15601540
11108	NC_002506	CAA	2	6	730104	730109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601540
11109	NC_002506	CTG	2	6	730114	730119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11110	NC_002506	TTG	2	6	730177	730182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601540
11111	NC_002506	TTTTG	2	10	730272	730281	0 %	80 %	20 %	0 %	15601540
11112	NC_002506	GCC	2	6	730297	730302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601540
11113	NC_002506	CTG	2	6	730399	730404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11114	NC_002506	TCG	2	6	730463	730468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11115	NC_002506	AC	3	6	730503	730508	50 %	0 %	0 %	50 %	15601540
11116	NC_002506	GAT	2	6	730531	730536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601540
11117	NC_002506	A	7	7	730569	730575	100 %	0 %	0 %	0 %	15601540
11118	NC_002506	TGC	2	6	730661	730666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601540
11119	NC_002506	A	6	6	730675	730680	100 %	0 %	0 %	0 %	15601540
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11121	NC_002506	GCA	2	6	730719	730724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601540
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11487	NC_002506	CAG	2	6	754299	754304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601564
11488	NC_002506	GAA	2	6	754403	754408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601564
11489	NC_002506	TTA	2	6	754426	754431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601564
11490	NC_002506	TCA	2	6	754484	754489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601564
11491	NC_002506	TCG	2	6	754512	754517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601564
11492	NC_002506	TTGC	2	8	754543	754550	0 %	50 %	25 %	25 %	15601564
11493	NC_002506	AAG	2	6	754585	754590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601564
11494	NC_002506	GC	3	6	754745	754750	0 %	0 %	50 %	50 %	15601564
11495	NC_002506	ATCCAG	2	12	754755	754766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15601564
11496	NC_002506	AAT	2	6	754796	754801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601564
11497	NC_002506	A	6	6	754824	754829	100 %	0 %	0 %	0 %	15601564
11498	NC_002506	CTCCTG	2	12	754863	754874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15601564
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11500	NC_002506	A	6	6	755479	755484	100 %	0 %	0 %	0 %	15601566

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