MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_002506	CCGTA	2	10	688803	688812	20 %	20 %	20 %	40 %	15601500
10502	NC_002506	CA	4	8	688837	688844	50 %	0 %	0 %	50 %	15601500
10503	NC_002506	TTG	2	6	688864	688869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601500
10504	NC_002506	ACC	2	6	688912	688917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601500
10505	NC_002506	T	6	6	688948	688953	0 %	100 %	0 %	0 %	15601500
10506	NC_002506	CAT	2	6	688963	688968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
10507	NC_002506	CAG	2	6	689122	689127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601500
10508	NC_002506	GCA	2	6	689276	689281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601500
10509	NC_002506	CAC	2	6	689341	689346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601500
10510	NC_002506	GTTG	2	8	689358	689365	0 %	50 %	50 %	0 %	15601500
10511	NC_002506	TCA	2	6	689387	689392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
10512	NC_002506	GCGTA	2	10	689439	689448	20 %	20 %	40 %	20 %	15601500
10513	NC_002506	CCAC	2	8	689469	689476	25 %	0 %	0 %	75 %	15601500
10514	NC_002506	CAT	2	6	689532	689537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
10515	NC_002506	GTA	2	6	689564	689569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601500
10516	NC_002506	CGA	2	6	689583	689588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601500
10517	NC_002506	TCA	2	6	691281	691286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601502
10518	NC_002506	GGC	3	9	691289	691297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601502
10519	NC_002506	CAC	2	6	691381	691386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601502
10520	NC_002506	TGC	2	6	691404	691409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601502
10521	NC_002506	CG	3	6	691489	691494	0 %	0 %	50 %	50 %	15601502
10522	NC_002506	GTTT	2	8	691518	691525	0 %	75 %	25 %	0 %	15601502
10523	NC_002506	AGA	2	6	691537	691542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601502
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10525	NC_002506	GC	3	6	691740	691745	0 %	0 %	50 %	50 %	15601502
10526	NC_002506	GCGT	2	8	691803	691810	0 %	25 %	50 %	25 %	15601502
10527	NC_002506	GCT	2	6	691942	691947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601502
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10529	NC_002506	GC	3	6	692170	692175	0 %	0 %	50 %	50 %	15601502
10530	NC_002506	GAT	2	6	692210	692215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601502
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10532	NC_002506	CAC	2	6	692287	692292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601502
10533	NC_002506	TGA	2	6	692310	692315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601502
10534	NC_002506	AGCA	2	8	692415	692422	50 %	0 %	25 %	25 %	15601502
10535	NC_002506	CGA	2	6	692515	692520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601502
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10537	NC_002506	AAT	2	6	692603	692608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601502
10538	NC_002506	ACG	2	6	692620	692625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601502
10539	NC_002506	TTG	2	6	692732	692737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601502
10540	NC_002506	CCTT	2	8	692855	692862	0 %	50 %	0 %	50 %	15601502
10541	NC_002506	ACA	2	6	692881	692886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601502
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10543	NC_002506	ATG	2	6	692897	692902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601503
10544	NC_002506	GCC	2	6	692938	692943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601503
10545	NC_002506	GC	3	6	692946	692951	0 %	0 %	50 %	50 %	15601503
10546	NC_002506	A	7	7	692964	692970	100 %	0 %	0 %	0 %	15601503
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10550	NC_002506	A	6	6	693249	693254	100 %	0 %	0 %	0 %	15601503
10551	NC_002506	CAT	2	6	693312	693317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601503
10552	NC_002506	TTG	2	6	693320	693325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601503
10553	NC_002506	TGC	2	6	693359	693364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601503
10554	NC_002506	TGC	2	6	693491	693496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601503
10555	NC_002506	TGA	2	6	693552	693557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601503
10556	NC_002506	TGCC	2	8	693569	693576	0 %	25 %	25 %	50 %	15601503
10557	NC_002506	TGA	2	6	693605	693610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601503
10558	NC_002506	GAA	2	6	693688	693693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601503
10559	NC_002506	GGC	2	6	693721	693726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601503
10560	NC_002506	TGG	2	6	693753	693758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601503
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10564	NC_002506	TGC	2	6	694187	694192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601503
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10569	NC_002506	GCACG	2	10	694652	694661	20 %	0 %	40 %	40 %	15601504
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10588	NC_002506	GCG	2	6	695737	695742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582040
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10604	NC_002506	GC	3	6	696946	696951	0 %	0 %	50 %	50 %	15601507
10605	NC_002506	GCT	2	6	696983	696988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601507
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10987	NC_002506	TTG	2	6	722648	722653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601535
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10989	NC_002506	CGTA	2	8	722727	722734	25 %	25 %	25 %	25 %	15601535
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10991	NC_002506	GAGT	2	8	722810	722817	25 %	25 %	50 %	0 %	15601535
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