MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002506	TCAC	2	8	659326	659333	25 %	25 %	0 %	50 %	15601472
10002	NC_002506	CCAT	2	8	659361	659368	25 %	25 %	0 %	50 %	15601472
10003	NC_002506	GTG	2	6	659397	659402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601472
10004	NC_002506	CTG	2	6	659437	659442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601472
10005	NC_002506	TGAG	2	8	659503	659510	25 %	25 %	50 %	0 %	15601472
10006	NC_002506	TGCCGT	2	12	659579	659590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601472
10007	NC_002506	ATT	2	6	659607	659612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601472
10008	NC_002506	AAC	2	6	659764	659769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161582042
10009	NC_002506	TCA	2	6	659777	659782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
10010	NC_002506	GCCGTT	2	12	659809	659820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10011	NC_002506	ATC	2	6	659896	659901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
10012	NC_002506	CAT	2	6	659919	659924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
10013	NC_002506	AAT	2	6	659977	659982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161582042
10014	NC_002506	CTTTGC	2	12	659997	660008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161582042
10015	NC_002506	TGGCA	2	10	660009	660018	20 %	20 %	40 %	20 %	161582042
10016	NC_002506	GA	5	10	660037	660046	50 %	0 %	50 %	0 %	161582042
10017	NC_002506	TGG	2	6	660126	660131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582042
10018	NC_002506	GATT	2	8	660135	660142	25 %	50 %	25 %	0 %	161582042
10019	NC_002506	T	6	6	660153	660158	0 %	100 %	0 %	0 %	161582042
10020	NC_002506	AGT	2	6	660295	660300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582042
10021	NC_002506	GGT	2	6	660346	660351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582042
10022	NC_002506	ATC	2	6	660394	660399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
10023	NC_002506	ACCG	2	8	660400	660407	25 %	0 %	25 %	50 %	161582042
10024	NC_002506	CA	3	6	660438	660443	50 %	0 %	0 %	50 %	161582042
10025	NC_002506	GCG	2	6	660468	660473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582042
10026	NC_002506	TCA	2	6	660488	660493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
10027	NC_002506	ATG	2	6	660560	660565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582042
10028	NC_002506	CTG	2	6	660598	660603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10029	NC_002506	CCA	2	6	660669	660674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161582042
10030	NC_002506	T	6	6	660691	660696	0 %	100 %	0 %	0 %	161582042
10031	NC_002506	GCT	2	6	660726	660731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10032	NC_002506	TCA	2	6	660779	660784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582042
10033	NC_002506	CAAT	2	8	660872	660879	50 %	25 %	0 %	25 %	161582042
10034	NC_002506	T	6	6	661019	661024	0 %	100 %	0 %	0 %	161582042
10035	NC_002506	CAA	2	6	661069	661074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161582042
10036	NC_002506	AATA	2	8	661106	661113	75 %	25 %	0 %	0 %	161582042
10037	NC_002506	CG	3	6	661119	661124	0 %	0 %	50 %	50 %	161582042
10038	NC_002506	CAGT	2	8	661125	661132	25 %	25 %	25 %	25 %	161582042
10039	NC_002506	CAG	2	6	661186	661191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10040	NC_002506	TGC	2	6	661202	661207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10041	NC_002506	GCG	2	6	661218	661223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582042
10042	NC_002506	CG	3	6	661258	661263	0 %	0 %	50 %	50 %	161582042
10043	NC_002506	TTA	2	6	661283	661288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161582042
10044	NC_002506	AGC	2	6	661316	661321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10045	NC_002506	GGA	2	6	661429	661434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161582042
10046	NC_002506	TGC	2	6	661478	661483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582042
10047	NC_002506	A	6	6	661633	661638	100 %	0 %	0 %	0 %	161582042
10048	NC_002506	TTC	2	6	661708	661713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161582042
10049	NC_002506	ACCA	2	8	661733	661740	50 %	0 %	0 %	50 %	161582042
10050	NC_002506	A	6	6	661780	661785	100 %	0 %	0 %	0 %	161582042
10051	NC_002506	TGC	2	6	662005	662010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
10052	NC_002506	GTG	2	6	662098	662103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601474
10053	NC_002506	TAT	2	6	662116	662121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601474
10054	NC_002506	CAT	2	6	662214	662219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601474
10055	NC_002506	TAC	2	6	662464	662469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601474
10056	NC_002506	ACA	2	6	662514	662519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601474
10057	NC_002506	ATT	2	6	662552	662557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601474
10058	NC_002506	CGC	2	6	662637	662642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601474
10059	NC_002506	ACGA	2	8	662759	662766	50 %	0 %	25 %	25 %	15601474
10060	NC_002506	CAA	2	6	662974	662979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601474
10061	NC_002506	GA	3	6	662980	662985	50 %	0 %	50 %	0 %	15601474
10062	NC_002506	TATT	2	8	663019	663026	25 %	75 %	0 %	0 %	15601474
10063	NC_002506	GAA	2	6	663091	663096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601474
10064	NC_002506	GCA	2	6	663131	663136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601474
10065	NC_002506	TGCGC	2	10	663189	663198	0 %	20 %	40 %	40 %	15601474
10066	NC_002506	ATC	2	6	663229	663234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601474
10067	NC_002506	CAC	2	6	663273	663278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601474
10068	NC_002506	TGTT	2	8	663281	663288	0 %	75 %	25 %	0 %	15601474
10069	NC_002506	GCCA	2	8	663290	663297	25 %	0 %	25 %	50 %	15601474
10070	NC_002506	CGC	2	6	663303	663308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601474
10071	NC_002506	CG	3	6	663327	663332	0 %	0 %	50 %	50 %	15601474
10072	NC_002506	CTT	2	6	663381	663386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601474
10073	NC_002506	AG	3	6	663396	663401	50 %	0 %	50 %	0 %	15601474
10074	NC_002506	TCT	2	6	663419	663424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601474
10075	NC_002506	T	6	6	663436	663441	0 %	100 %	0 %	0 %	15601474
10076	NC_002506	CAA	2	6	663453	663458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601474
10077	NC_002506	TGTTT	2	10	663497	663506	0 %	80 %	20 %	0 %	15601474
10078	NC_002506	GGT	2	6	663531	663536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601474
10079	NC_002506	GTG	2	6	663589	663594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601474
10080	NC_002506	A	6	6	663703	663708	100 %	0 %	0 %	0 %	15601474
10081	NC_002506	GCG	2	6	663732	663737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601474
10082	NC_002506	GCG	2	6	663811	663816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601474
10083	NC_002506	GCT	2	6	663855	663860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
10084	NC_002506	GAT	2	6	663901	663906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601474
10085	NC_002506	TGC	2	6	663965	663970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
10086	NC_002506	GAT	2	6	664060	664065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601474
10087	NC_002506	GC	3	6	664075	664080	0 %	0 %	50 %	50 %	15601474
10088	NC_002506	TGC	2	6	664115	664120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601474
10089	NC_002506	TGG	2	6	664323	664328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601475
10090	NC_002506	GTA	2	6	664436	664441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601475
10091	NC_002506	TCA	2	6	664460	664465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601475
10092	NC_002506	TGA	2	6	664482	664487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601475
10093	NC_002506	TCA	2	6	664494	664499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601475
10094	NC_002506	CA	3	6	664592	664597	50 %	0 %	0 %	50 %	15601475
10095	NC_002506	CTG	2	6	664655	664660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601475
10096	NC_002506	TTC	2	6	664720	664725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601475
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10098	NC_002506	ATT	2	6	664912	664917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601475
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10100	NC_002506	ATG	2	6	665135	665140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601475
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10102	NC_002506	CCG	3	9	665252	665260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601476
10103	NC_002506	AGT	2	6	665279	665284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601476
10104	NC_002506	CTT	2	6	665360	665365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601476
10105	NC_002506	TAAA	2	8	665441	665448	75 %	25 %	0 %	0 %	15601476
10106	NC_002506	CCA	2	6	665522	665527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601476
10107	NC_002506	TCG	2	6	665542	665547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601476
10108	NC_002506	TCT	2	6	665596	665601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601476
10109	NC_002506	GA	3	6	665650	665655	50 %	0 %	50 %	0 %	15601476
10110	NC_002506	TTCA	2	8	665704	665711	25 %	50 %	0 %	25 %	15601476
10111	NC_002506	GCA	2	6	666039	666044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	533112012
10112	NC_002506	GC	3	6	666048	666053	0 %	0 %	50 %	50 %	533112012
10113	NC_002506	ATCG	2	8	666067	666074	25 %	25 %	25 %	25 %	533112012
10114	NC_002506	GAA	2	6	666109	666114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	533112012
10115	NC_002506	GCGAT	2	10	666119	666128	20 %	20 %	40 %	20 %	533112012
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10117	NC_002506	ATG	2	6	666258	666263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601478
10118	NC_002506	CG	4	8	666272	666279	0 %	0 %	50 %	50 %	15601478
10119	NC_002506	CCA	2	6	666310	666315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601478
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10121	NC_002506	GCTT	2	8	666589	666596	0 %	50 %	25 %	25 %	15601479
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10246	NC_002506	ATC	2	6	673065	673070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601484
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10249	NC_002506	CAAT	2	8	673240	673247	50 %	25 %	0 %	25 %	15601484
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10362	NC_002506	T	7	7	680484	680490	0 %	100 %	0 %	0 %	15601492
10363	NC_002506	ATG	3	9	680495	680503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601492
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10368	NC_002506	TCC	2	6	680832	680837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601492
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10370	NC_002506	TGC	2	6	680898	680903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601492
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10372	NC_002506	GTG	2	6	681057	681062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601492
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10381	NC_002506	TGG	2	6	681667	681672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601492
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10400	NC_002506	TCA	2	6	682728	682733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601492
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10402	NC_002506	CAAA	2	8	682849	682856	75 %	0 %	0 %	25 %	15601492
10403	NC_002506	CTT	2	6	682897	682902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601492
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10414	NC_002506	AAT	2	6	683594	683599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601493
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10480	NC_002506	GC	3	6	687381	687386	0 %	0 %	50 %	50 %	15601498
10481	NC_002506	TC	3	6	687396	687401	0 %	50 %	0 %	50 %	15601498
10482	NC_002506	TGG	2	6	687804	687809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601499
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10484	NC_002506	GTC	2	6	687911	687916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601499
10485	NC_002506	A	7	7	687975	687981	100 %	0 %	0 %	0 %	15601499
10486	NC_002506	CTT	2	6	688095	688100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601500
10487	NC_002506	TCA	2	6	688178	688183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
10488	NC_002506	CGAT	2	8	688202	688209	25 %	25 %	25 %	25 %	15601500
10489	NC_002506	GCG	2	6	688274	688279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601500
10490	NC_002506	GTT	2	6	688357	688362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601500
10491	NC_002506	CAC	2	6	688371	688376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601500
10492	NC_002506	CGCAG	2	10	688385	688394	20 %	0 %	40 %	40 %	15601500
10493	NC_002506	GCATC	2	10	688419	688428	20 %	20 %	20 %	40 %	15601500
10494	NC_002506	AAT	2	6	688474	688479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601500
10495	NC_002506	CAC	2	6	688494	688499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601500
10496	NC_002506	CAC	2	6	688570	688575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601500
10497	NC_002506	TGG	2	6	688602	688607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601500
10498	NC_002506	TCA	2	6	688649	688654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
10499	NC_002506	TCA	2	6	688785	688790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601500
10500	NC_002506	AAG	2	6	688793	688798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601500

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