MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_002506	GACC	2	8	504555	504562	25 %	0 %	25 %	50 %	15601324
7502	NC_002506	TGG	2	6	504656	504661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601324
7503	NC_002506	GAT	2	6	504752	504757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601324
7504	NC_002506	A	7	7	504923	504929	100 %	0 %	0 %	0 %	15601325
7505	NC_002506	AGCTG	2	10	505036	505045	20 %	20 %	40 %	20 %	15601325
7506	NC_002506	GTG	2	6	505103	505108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601325
7507	NC_002506	TTC	2	6	505148	505153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601325
7508	NC_002506	CGA	2	6	505278	505283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601325
7509	NC_002506	TTGAAA	2	12	505335	505346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15601325
7510	NC_002506	GGT	2	6	505457	505462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601326
7511	NC_002506	TCA	2	6	505491	505496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601326
7512	NC_002506	TGG	2	6	505538	505543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601326
7513	NC_002506	A	7	7	505559	505565	100 %	0 %	0 %	0 %	15601326
7514	NC_002506	CGA	2	6	505678	505683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601326
7515	NC_002506	ACCAAA	2	12	505732	505743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601326
7516	NC_002506	GTC	2	6	505786	505791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601326
7517	NC_002506	CAA	2	6	505832	505837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601326
7518	NC_002506	CCG	2	6	505910	505915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601326
7519	NC_002506	CAAG	2	8	505965	505972	50 %	0 %	25 %	25 %	15601326
7520	NC_002506	AGA	2	6	506009	506014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601326
7521	NC_002506	GCTA	2	8	506208	506215	25 %	25 %	25 %	25 %	15601326
7522	NC_002506	TTA	2	6	506231	506236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601326
7523	NC_002506	ATG	2	6	506246	506251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601326
7524	NC_002506	ATG	2	6	506507	506512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601327
7525	NC_002506	CAT	2	6	506595	506600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601327
7526	NC_002506	CGG	2	6	506691	506696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601327
7527	NC_002506	GTA	2	6	506698	506703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601327
7528	NC_002506	ATTT	2	8	506724	506731	25 %	75 %	0 %	0 %	15601327
7529	NC_002506	ATT	2	6	506779	506784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601327
7530	NC_002506	GAT	2	6	506803	506808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601327
7531	NC_002506	GC	3	6	506823	506828	0 %	0 %	50 %	50 %	15601327
7532	NC_002506	GCA	2	6	506910	506915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601327
7533	NC_002506	AAGC	2	8	506969	506976	50 %	0 %	25 %	25 %	15601327
7534	NC_002506	TGC	2	6	507084	507089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601327
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7536	NC_002506	CAAAAC	2	12	507114	507125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601327
7537	NC_002506	TCATAC	2	12	507157	507168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601327
7538	NC_002506	TTG	2	6	507203	507208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601327
7539	NC_002506	GAA	2	6	507247	507252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601327
7540	NC_002506	ACA	2	6	507275	507280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601327
7541	NC_002506	CA	3	6	507279	507284	50 %	0 %	0 %	50 %	15601327
7542	NC_002506	ACA	2	6	507344	507349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601327
7543	NC_002506	ATA	2	6	507365	507370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601327
7544	NC_002506	TTA	2	6	507489	507494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601327
7545	NC_002506	TGA	2	6	507541	507546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601328
7546	NC_002506	TTG	2	6	507642	507647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601328
7547	NC_002506	A	6	6	507668	507673	100 %	0 %	0 %	0 %	15601328
7548	NC_002506	ACC	2	6	508285	508290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601329
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7552	NC_002506	T	6	6	508539	508544	0 %	100 %	0 %	0 %	15601329
7553	NC_002506	T	6	6	508606	508611	0 %	100 %	0 %	0 %	15601330
7554	NC_002506	TTG	3	9	508619	508627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601330
7555	NC_002506	A	6	6	508709	508714	100 %	0 %	0 %	0 %	15601330
7556	NC_002506	AAT	2	6	508832	508837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601330
7557	NC_002506	CTT	2	6	508868	508873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601330
7558	NC_002506	T	6	6	508905	508910	0 %	100 %	0 %	0 %	15601330
7559	NC_002506	AATT	2	8	509378	509385	50 %	50 %	0 %	0 %	15601331
7560	NC_002506	TTC	2	6	509453	509458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601331
7561	NC_002506	CT	3	6	509549	509554	0 %	50 %	0 %	50 %	15601331
7562	NC_002506	AGC	2	6	509600	509605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601331
7563	NC_002506	TCT	2	6	509628	509633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601331
7564	NC_002506	GAA	2	6	509658	509663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601331
7565	NC_002506	AGC	2	6	509672	509677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601331
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7568	NC_002506	TGCC	2	8	509860	509867	0 %	25 %	25 %	50 %	15601331
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7575	NC_002506	TTA	2	6	510321	510326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601332
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7583	NC_002506	AAG	2	6	510848	510853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601332
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7593	NC_002506	GGT	2	6	511825	511830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601333
7594	NC_002506	GAA	2	6	511844	511849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601333
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7596	NC_002506	CAT	2	6	511890	511895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601333
7597	NC_002506	GCG	2	6	511957	511962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601333
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7602	NC_002506	CA	3	6	512138	512143	50 %	0 %	0 %	50 %	15601333
7603	NC_002506	ATC	2	6	512174	512179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601333
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7605	NC_002506	CTGGT	2	10	512346	512355	0 %	40 %	40 %	20 %	15601333
7606	NC_002506	TCA	2	6	512589	512594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601333
7607	NC_002506	AACTC	2	10	512814	512823	40 %	20 %	0 %	40 %	15601333
7608	NC_002506	TTA	2	6	512851	512856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601333
7609	NC_002506	CTGG	2	8	512875	512882	0 %	25 %	50 %	25 %	15601333
7610	NC_002506	GAA	2	6	512887	512892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601333
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7612	NC_002506	TGCCGC	2	12	512979	512990	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15601333
7613	NC_002506	C	6	6	512994	512999	0 %	0 %	0 %	100 %	15601333
7614	NC_002506	GC	3	6	513016	513021	0 %	0 %	50 %	50 %	15601333
7615	NC_002506	TATTGA	2	12	513081	513092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15601333
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7621	NC_002506	GA	3	6	513470	513475	50 %	0 %	50 %	0 %	15601333
7622	NC_002506	GTG	2	6	513494	513499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601333
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7624	NC_002506	TTAA	2	8	513538	513545	50 %	50 %	0 %	0 %	15601333
7625	NC_002506	ATT	2	6	513631	513636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601333
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7746	NC_002506	TATC	2	8	521628	521635	25 %	50 %	0 %	25 %	15601342
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7996	NC_002506	CA	3	6	538189	538194	50 %	0 %	0 %	50 %	15601359
7997	NC_002506	CCA	2	6	538195	538200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601359
7998	NC_002506	A	6	6	538262	538267	100 %	0 %	0 %	0 %	15601359
7999	NC_002506	CGC	2	6	538298	538303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601359
8000	NC_002506	GGT	2	6	538337	538342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601359

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