MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_002506	CTGA	2	8	471124	471131	25 %	25 %	25 %	25 %	15601292
7002	NC_002506	TTG	2	6	471408	471413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601293
7003	NC_002506	GAC	2	6	471508	471513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601293
7004	NC_002506	TCA	2	6	471518	471523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601293
7005	NC_002506	GTC	2	6	471565	471570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601293
7006	NC_002506	TTC	2	6	471574	471579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601293
7007	NC_002506	GTC	2	6	472719	472724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601294
7008	NC_002506	GAA	2	6	472730	472735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601294
7009	NC_002506	GCA	2	6	472791	472796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601294
7010	NC_002506	TCT	2	6	472821	472826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601294
7011	NC_002506	TTC	2	6	472829	472834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601294
7012	NC_002506	TAA	2	6	472847	472852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601294
7013	NC_002506	AGC	2	6	472881	472886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601294
7014	NC_002506	TG	3	6	472904	472909	0 %	50 %	50 %	0 %	15601294
7015	NC_002506	AAT	2	6	472949	472954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601294
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7017	NC_002506	GCA	2	6	472975	472980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601294
7018	NC_002506	TGC	2	6	472985	472990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601294
7019	NC_002506	TTAG	2	8	473169	473176	25 %	50 %	25 %	0 %	15601295
7020	NC_002506	GTA	2	6	473223	473228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601295
7021	NC_002506	CCG	2	6	473276	473281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601295
7022	NC_002506	T	6	6	473315	473320	0 %	100 %	0 %	0 %	15601295
7023	NC_002506	TGA	2	6	473396	473401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601295
7024	NC_002506	GCA	2	6	473411	473416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601295
7025	NC_002506	TCA	2	6	473455	473460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601295
7026	NC_002506	CGA	2	6	473483	473488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601295
7027	NC_002506	GCA	2	6	473507	473512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601295
7028	NC_002506	CAAC	2	8	473537	473544	50 %	0 %	0 %	50 %	15601295
7029	NC_002506	GCAA	2	8	473593	473600	50 %	0 %	25 %	25 %	15601295
7030	NC_002506	TCA	2	6	473740	473745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601295
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7033	NC_002506	TTG	2	6	473943	473948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601295
7034	NC_002506	TCAG	2	8	473953	473960	25 %	25 %	25 %	25 %	15601295
7035	NC_002506	ACGC	2	8	474025	474032	25 %	0 %	25 %	50 %	15601295
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7038	NC_002506	TAC	2	6	475497	475502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601297
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7041	NC_002506	GC	4	8	475618	475625	0 %	0 %	50 %	50 %	15601297
7042	NC_002506	TCA	2	6	475652	475657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601297
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7044	NC_002506	ATCTC	2	10	475699	475708	20 %	40 %	0 %	40 %	15601297
7045	NC_002506	CGC	2	6	475856	475861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601297
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7050	NC_002506	GC	3	6	476016	476021	0 %	0 %	50 %	50 %	15601298
7051	NC_002506	TCAA	2	8	476027	476034	50 %	25 %	0 %	25 %	15601298
7052	NC_002506	CGCAG	2	10	476198	476207	20 %	0 %	40 %	40 %	15601298
7053	NC_002506	GTT	2	6	476258	476263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601298
7054	NC_002506	TGACT	2	10	476296	476305	20 %	40 %	20 %	20 %	15601298
7055	NC_002506	GGT	2	6	476372	476377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601298
7056	NC_002506	AAT	2	6	476490	476495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601298
7057	NC_002506	CAT	2	6	476676	476681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601299
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7059	NC_002506	GTTT	2	8	476736	476743	0 %	75 %	25 %	0 %	15601299
7060	NC_002506	CG	3	6	476758	476763	0 %	0 %	50 %	50 %	15601299
7061	NC_002506	TTC	2	6	476764	476769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601299
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7122	NC_002506	T	6	6	480231	480236	0 %	100 %	0 %	0 %	15601303
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7124	NC_002506	GAA	2	6	480279	480284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601303
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7232	NC_002506	ATCT	2	8	487162	487169	25 %	50 %	0 %	25 %	15601309
7233	NC_002506	TGG	2	6	487182	487187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601309
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7240	NC_002506	GTT	2	6	487695	487700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601309
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7244	NC_002506	CT	3	6	487975	487980	0 %	50 %	0 %	50 %	15601310
7245	NC_002506	CAAAC	2	10	488198	488207	60 %	0 %	0 %	40 %	15601311
7246	NC_002506	GCG	2	6	488276	488281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601311
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7248	NC_002506	TTTC	2	8	488365	488372	0 %	75 %	0 %	25 %	15601311
7249	NC_002506	GTT	2	6	488447	488452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601311
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7369	NC_002506	CAA	2	6	496850	496855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601318
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7371	NC_002506	TTTC	2	8	497000	497007	0 %	75 %	0 %	25 %	15601318
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7483	NC_002506	CGA	2	6	503417	503422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601324
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7494	NC_002506	TCG	2	6	504246	504251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601324
7495	NC_002506	TG	3	6	504254	504259	0 %	50 %	50 %	0 %	15601324
7496	NC_002506	CGA	2	6	504268	504273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601324
7497	NC_002506	GGA	2	6	504354	504359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601324
7498	NC_002506	GAA	3	9	504379	504387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601324
7499	NC_002506	TG	3	6	504460	504465	0 %	50 %	50 %	0 %	15601324
7500	NC_002506	AACT	2	8	504531	504538	50 %	25 %	0 %	25 %	15601324

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