MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002506	GC	3	6	441068	441073	0 %	0 %	50 %	50 %	15601271
6502	NC_002506	TTTGGT	2	12	441164	441175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601271
6503	NC_002506	ATCGC	2	10	441225	441234	20 %	20 %	20 %	40 %	15601271
6504	NC_002506	CGG	2	6	441258	441263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601271
6505	NC_002506	AGA	2	6	441313	441318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601271
6506	NC_002506	AGC	2	6	441336	441341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601271
6507	NC_002506	TTCA	2	8	441415	441422	25 %	50 %	0 %	25 %	15601271
6508	NC_002506	TAA	2	6	441493	441498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601271
6509	NC_002506	CGC	2	6	441599	441604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601271
6510	NC_002506	TA	3	6	441663	441668	50 %	50 %	0 %	0 %	15601271
6511	NC_002506	GTGTG	2	10	441679	441688	0 %	40 %	60 %	0 %	15601271
6512	NC_002506	CAT	2	6	441775	441780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601271
6513	NC_002506	ATG	3	9	441810	441818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601271
6514	NC_002506	GAA	2	6	441830	441835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601271
6515	NC_002506	A	6	6	441881	441886	100 %	0 %	0 %	0 %	15601271
6516	NC_002506	GTG	2	6	441974	441979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601271
6517	NC_002506	TAC	2	6	442001	442006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601271
6518	NC_002506	AGA	2	6	442032	442037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601271
6519	NC_002506	AACGT	2	10	442131	442140	40 %	20 %	20 %	20 %	15601271
6520	NC_002506	GTTT	2	8	442264	442271	0 %	75 %	25 %	0 %	15601271
6521	NC_002506	AAG	3	9	442374	442382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601271
6522	NC_002506	TCA	2	6	442493	442498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601272
6523	NC_002506	GTC	2	6	442535	442540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601272
6524	NC_002506	AC	3	6	442594	442599	50 %	0 %	0 %	50 %	15601272
6525	NC_002506	GAT	2	6	442749	442754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601272
6526	NC_002506	CAA	2	6	442758	442763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601272
6527	NC_002506	TGG	2	6	442789	442794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601272
6528	NC_002506	TC	4	8	443044	443051	0 %	50 %	0 %	50 %	161582043
6529	NC_002506	GTG	2	6	443167	443172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582043
6530	NC_002506	A	6	6	443180	443185	100 %	0 %	0 %	0 %	161582043
6531	NC_002506	ATG	2	6	443233	443238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582043
6532	NC_002506	GCG	2	6	443303	443308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582043
6533	NC_002506	TAC	2	6	443352	443357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582043
6534	NC_002506	TAC	2	6	443428	443433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582043
6535	NC_002506	TGG	2	6	443459	443464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582043
6536	NC_002506	GTT	2	6	443528	443533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161582043
6537	NC_002506	GCG	2	6	443761	443766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582043
6538	NC_002506	GCC	2	6	443847	443852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161582043
6539	NC_002506	TGC	2	6	443862	443867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582043
6540	NC_002506	GCA	2	6	443934	443939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582043
6541	NC_002506	TACTG	2	10	444036	444045	20 %	40 %	20 %	20 %	161582043
6542	NC_002506	GCAGA	2	10	444055	444064	40 %	0 %	40 %	20 %	161582043
6543	NC_002506	TAT	2	6	444165	444170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161582043
6544	NC_002506	GTT	2	6	444258	444263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601274
6545	NC_002506	AGT	2	6	444280	444285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601274
6546	NC_002506	TGG	2	6	444290	444295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601274
6547	NC_002506	GGT	2	6	444342	444347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601274
6548	NC_002506	TCG	2	6	444389	444394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601274
6549	NC_002506	CTC	2	6	444404	444409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601274
6550	NC_002506	CTTG	2	8	444426	444433	0 %	50 %	25 %	25 %	15601274
6551	NC_002506	GAT	2	6	444460	444465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601274
6552	NC_002506	AG	3	6	444543	444548	50 %	0 %	50 %	0 %	15601274
6553	NC_002506	ACC	2	6	444577	444582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601274
6554	NC_002506	ACA	2	6	444659	444664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601274
6555	NC_002506	GAG	2	6	444673	444678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601274
6556	NC_002506	TGG	2	6	444752	444757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601274
6557	NC_002506	CGCA	2	8	444811	444818	25 %	0 %	25 %	50 %	15601274
6558	NC_002506	CTT	2	6	444849	444854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601274
6559	NC_002506	TC	3	6	444878	444883	0 %	50 %	0 %	50 %	15601274
6560	NC_002506	A	6	6	444916	444921	100 %	0 %	0 %	0 %	15601274
6561	NC_002506	CAG	2	6	445251	445256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601276
6562	NC_002506	CCG	2	6	445297	445302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601276
6563	NC_002506	AG	3	6	445335	445340	50 %	0 %	50 %	0 %	15601276
6564	NC_002506	CCAC	2	8	445357	445364	25 %	0 %	0 %	75 %	15601276
6565	NC_002506	GGC	2	6	445398	445403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601276
6566	NC_002506	GCC	2	6	445540	445545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601276
6567	NC_002506	CAT	2	6	445641	445646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601276
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6571	NC_002506	GCC	2	6	445737	445742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601276
6572	NC_002506	ACG	2	6	445744	445749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601276
6573	NC_002506	ATC	2	6	445753	445758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601276
6574	NC_002506	GAT	2	6	445791	445796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601276
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6576	NC_002506	AGCA	2	8	445989	445996	50 %	0 %	25 %	25 %	15601276
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6581	NC_002506	AG	3	6	446094	446099	50 %	0 %	50 %	0 %	15601276
6582	NC_002506	GAT	2	6	446103	446108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601276
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6588	NC_002506	T	6	6	446304	446309	0 %	100 %	0 %	0 %	15601276
6589	NC_002506	GAT	2	6	446349	446354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601276
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6596	NC_002506	T	6	6	446667	446672	0 %	100 %	0 %	0 %	15601276
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6603	NC_002506	CGG	3	9	447236	447244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601277
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6619	NC_002506	AC	3	6	448363	448368	50 %	0 %	0 %	50 %	15601278
6620	NC_002506	TTG	2	6	448396	448401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601278
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6996	NC_002506	ACA	2	6	470954	470959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601292
6997	NC_002506	A	6	6	470976	470981	100 %	0 %	0 %	0 %	15601292
6998	NC_002506	AAG	2	6	471017	471022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601292
6999	NC_002506	GGC	2	6	471028	471033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601292
7000	NC_002506	CAT	2	6	471046	471051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601292

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