MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002506	CAA	2	6	402047	402052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	533112010
6002	NC_002506	GAC	2	6	402101	402106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	533112010
6003	NC_002506	ATG	2	6	402108	402113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	533112010
6004	NC_002506	A	6	6	402254	402259	100 %	0 %	0 %	0 %	533112010
6005	NC_002506	TTC	2	6	402267	402272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	533112010
6006	NC_002506	TGGT	2	8	402310	402317	0 %	50 %	50 %	0 %	533112010
6007	NC_002506	AGA	3	9	402506	402514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601212
6008	NC_002506	GTT	2	6	402542	402547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601212
6009	NC_002506	TGC	2	6	402571	402576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601212
6010	NC_002506	ATTT	2	8	402644	402651	25 %	75 %	0 %	0 %	15601212
6011	NC_002506	ATT	2	6	402736	402741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601212
6012	NC_002506	AAT	2	6	402875	402880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601212
6013	NC_002506	TAA	2	6	402903	402908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601212
6014	NC_002506	TATT	2	8	403187	403194	25 %	75 %	0 %	0 %	15601213
6015	NC_002506	TGT	2	6	403197	403202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601213
6016	NC_002506	TGC	2	6	403395	403400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601213
6017	NC_002506	TTCAT	2	10	403408	403417	20 %	60 %	0 %	20 %	15601213
6018	NC_002506	AATT	2	8	403442	403449	50 %	50 %	0 %	0 %	15601213
6019	NC_002506	GCA	2	6	403503	403508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601213
6020	NC_002506	CAG	2	6	403571	403576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601213
6021	NC_002506	AAT	2	6	403626	403631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601213
6022	NC_002506	GAA	2	6	403642	403647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601213
6023	NC_002506	TTA	2	6	404334	404339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601215
6024	NC_002506	GTTA	2	8	404351	404358	25 %	50 %	25 %	0 %	15601215
6025	NC_002506	GGC	2	6	404396	404401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601215
6026	NC_002506	CTTTG	2	10	404415	404424	0 %	60 %	20 %	20 %	15601215
6027	NC_002506	CTGTAT	2	12	404428	404439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15601215
6028	NC_002506	GTG	2	6	404538	404543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601215
6029	NC_002506	GCA	2	6	404625	404630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601215
6030	NC_002506	T	6	6	404639	404644	0 %	100 %	0 %	0 %	15601215
6031	NC_002506	TCT	2	6	404647	404652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601215
6032	NC_002506	TCA	2	6	404679	404684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601215
6033	NC_002506	GTT	2	6	404687	404692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601215
6034	NC_002506	TTAT	2	8	404736	404743	25 %	75 %	0 %	0 %	15601215
6035	NC_002506	TAT	2	6	404761	404766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601215
6036	NC_002506	CATCC	2	10	405224	405233	20 %	20 %	0 %	60 %	533112011
6037	NC_002506	T	6	6	405396	405401	0 %	100 %	0 %	0 %	533112011
6038	NC_002506	CTA	2	6	405416	405421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	533112011
6039	NC_002506	ATT	3	9	405460	405468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	533112011
6040	NC_002506	TTA	2	6	405490	405495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	533112011
6041	NC_002506	TGA	2	6	405564	405569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	533112011
6042	NC_002506	GATT	2	8	405609	405616	25 %	50 %	25 %	0 %	533112011
6043	NC_002506	TTG	2	6	405624	405629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	533112011
6044	NC_002506	TCG	2	6	405640	405645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	533112011
6045	NC_002506	TTA	2	6	405646	405651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	533112011
6046	NC_002506	GCT	2	6	405676	405681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	533112011
6047	NC_002506	CTC	2	6	405698	405703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	533112011
6048	NC_002506	TGA	2	6	405725	405730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	533112011
6049	NC_002506	TC	3	6	405740	405745	0 %	50 %	0 %	50 %	533112011
6050	NC_002506	ATC	2	6	405753	405758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	533112011
6051	NC_002506	T	6	6	405772	405777	0 %	100 %	0 %	0 %	533112011
6052	NC_002506	TAA	2	6	405935	405940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	533112011
6053	NC_002506	GATT	2	8	405973	405980	25 %	50 %	25 %	0 %	533112011
6054	NC_002506	TGT	2	6	405991	405996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	533112011
6055	NC_002506	T	7	7	405996	406002	0 %	100 %	0 %	0 %	533112011
6056	NC_002506	GGT	2	6	406548	406553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601216
6057	NC_002506	GTT	2	6	406611	406616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601216
6058	NC_002506	GGA	2	6	406772	406777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601216
6059	NC_002506	AAC	2	6	406792	406797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601216
6060	NC_002506	AGCA	2	8	406841	406848	50 %	0 %	25 %	25 %	15601216
6061	NC_002506	GGT	2	6	406863	406868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601216
6062	NC_002506	TCA	2	6	406943	406948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601216
6063	NC_002506	AT	3	6	407797	407802	50 %	50 %	0 %	0 %	15601218
6064	NC_002506	GA	3	6	407873	407878	50 %	0 %	50 %	0 %	15601218
6065	NC_002506	AAG	2	6	407888	407893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601218
6066	NC_002506	CTT	2	6	407895	407900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601218
6067	NC_002506	TAA	2	6	407903	407908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601218
6068	NC_002506	TAC	2	6	407986	407991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601218
6069	NC_002506	CAT	2	6	408015	408020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601218
6070	NC_002506	AGC	2	6	408027	408032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601218
6071	NC_002506	A	6	6	408060	408065	100 %	0 %	0 %	0 %	15601218
6072	NC_002506	CATG	2	8	408108	408115	25 %	25 %	25 %	25 %	15601218
6073	NC_002506	TGAT	2	8	408161	408168	25 %	50 %	25 %	0 %	15601218
6074	NC_002506	ATGG	2	8	408202	408209	25 %	25 %	50 %	0 %	15601218
6075	NC_002506	T	6	6	408210	408215	0 %	100 %	0 %	0 %	15601218
6076	NC_002506	TGA	2	6	408243	408248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601218
6077	NC_002506	CAG	2	6	408382	408387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601218
6078	NC_002506	TTA	2	6	408556	408561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601219
6079	NC_002506	AAG	2	6	408638	408643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601219
6080	NC_002506	A	6	6	408651	408656	100 %	0 %	0 %	0 %	15601219
6081	NC_002506	TGCT	2	8	408691	408698	0 %	50 %	25 %	25 %	15601219
6082	NC_002506	CAA	2	6	408720	408725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601219
6083	NC_002506	GA	3	6	408735	408740	50 %	0 %	50 %	0 %	15601219
6084	NC_002506	AAG	2	6	408751	408756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601219
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6087	NC_002506	GGATT	2	10	408842	408851	20 %	40 %	40 %	0 %	15601219
6088	NC_002506	TTG	2	6	408970	408975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601219
6089	NC_002506	AAGA	2	8	408987	408994	75 %	0 %	25 %	0 %	15601219
6090	NC_002506	ATGG	2	8	409028	409035	25 %	25 %	50 %	0 %	15601219
6091	NC_002506	AT	3	6	409077	409082	50 %	50 %	0 %	0 %	15601219
6092	NC_002506	A	6	6	409182	409187	100 %	0 %	0 %	0 %	15601219
6093	NC_002506	TCT	2	6	409195	409200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601219
6094	NC_002506	AAT	2	6	409239	409244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601219
6095	NC_002506	ATC	2	6	409627	409632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601220
6096	NC_002506	ACTGT	2	10	409636	409645	20 %	40 %	20 %	20 %	15601220
6097	NC_002506	GTG	2	6	409665	409670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601220
6098	NC_002506	ACT	2	6	409708	409713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601220
6099	NC_002506	CA	3	6	409774	409779	50 %	0 %	0 %	50 %	15601220
6100	NC_002506	TATC	2	8	409789	409796	25 %	50 %	0 %	25 %	15601220
6101	NC_002506	TGG	2	6	409838	409843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601220
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6103	NC_002506	GAA	2	6	409882	409887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601220
6104	NC_002506	GTC	2	6	409961	409966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601220
6105	NC_002506	AGC	2	6	410022	410027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601220
6106	NC_002506	GTA	2	6	410054	410059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601220
6107	NC_002506	GTGA	2	8	410265	410272	25 %	25 %	50 %	0 %	15601221
6108	NC_002506	AAT	2	6	410285	410290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601221
6109	NC_002506	ATT	2	6	410393	410398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601221
6110	NC_002506	GTTT	2	8	410407	410414	0 %	75 %	25 %	0 %	15601221
6111	NC_002506	T	6	6	410430	410435	0 %	100 %	0 %	0 %	15601221
6112	NC_002506	CTGG	2	8	410514	410521	0 %	25 %	50 %	25 %	15601221
6113	NC_002506	T	6	6	410525	410530	0 %	100 %	0 %	0 %	15601221
6114	NC_002506	AGT	2	6	410540	410545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601221
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6116	NC_002506	TGA	2	6	412370	412375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601224
6117	NC_002506	CAA	3	9	412421	412429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601224
6118	NC_002506	AGA	2	6	412508	412513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601224
6119	NC_002506	TCA	2	6	412521	412526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601224
6120	NC_002506	TTA	2	6	412589	412594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601224
6121	NC_002506	TCTG	2	8	412605	412612	0 %	50 %	25 %	25 %	15601224
6122	NC_002506	CAT	2	6	412694	412699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601224
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6124	NC_002506	GGCG	2	8	412868	412875	0 %	0 %	75 %	25 %	15601225
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6249	NC_002506	TGA	2	6	421816	421821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601242
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6369	NC_002506	T	6	6	430584	430589	0 %	100 %	0 %	0 %	15601256
6370	NC_002506	TAAGT	2	10	430655	430664	40 %	40 %	20 %	0 %	15601256
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6500	NC_002506	TGA	2	6	440971	440976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601271

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