MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002506	ACC	2	6	321029	321034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601073
5002	NC_002506	ATG	2	6	321093	321098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601073
5003	NC_002506	A	7	7	321340	321346	100 %	0 %	0 %	0 %	15601074
5004	NC_002506	GCA	2	6	321372	321377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601074
5005	NC_002506	TCGT	2	8	321395	321402	0 %	50 %	25 %	25 %	15601074
5006	NC_002506	GAA	2	6	321410	321415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601074
5007	NC_002506	TGA	2	6	321466	321471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601074
5008	NC_002506	GAA	2	6	321489	321494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601074
5009	NC_002506	AT	3	6	321510	321515	50 %	50 %	0 %	0 %	15601074
5010	NC_002506	AAT	2	6	321527	321532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601074
5011	NC_002506	GAG	2	6	321617	321622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601074
5012	NC_002506	AGA	2	6	321694	321699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601074
5013	NC_002506	CAA	2	6	321732	321737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601074
5014	NC_002506	CAT	2	6	321878	321883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601074
5015	NC_002506	A	6	6	321905	321910	100 %	0 %	0 %	0 %	15601074
5016	NC_002506	TCC	2	6	321985	321990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601074
5017	NC_002506	TAA	2	6	322008	322013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601074
5018	NC_002506	GAA	2	6	322196	322201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601075
5019	NC_002506	TTC	2	6	322324	322329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601075
5020	NC_002506	T	7	7	322344	322350	0 %	100 %	0 %	0 %	15601075
5021	NC_002506	T	6	6	322513	322518	0 %	100 %	0 %	0 %	15601075
5022	NC_002506	CAA	2	6	322748	322753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601076
5023	NC_002506	CTT	2	6	322769	322774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601076
5024	NC_002506	TAA	2	6	322780	322785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601076
5025	NC_002506	TCAA	2	8	323018	323025	50 %	25 %	0 %	25 %	15601076
5026	NC_002506	TTC	2	6	323130	323135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601077
5027	NC_002506	TGA	3	9	323183	323191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601077
5028	NC_002506	AGA	2	6	323212	323217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601077
5029	NC_002506	CAT	2	6	323240	323245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601077
5030	NC_002506	GT	3	6	323255	323260	0 %	50 %	50 %	0 %	15601077
5031	NC_002506	ATC	2	6	323512	323517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601078
5032	NC_002506	TAA	2	6	323533	323538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601078
5033	NC_002506	A	6	6	323573	323578	100 %	0 %	0 %	0 %	15601078
5034	NC_002506	GAT	2	6	323585	323590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601078
5035	NC_002506	GGT	2	6	323604	323609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601078
5036	NC_002506	AGCA	2	8	323635	323642	50 %	0 %	25 %	25 %	15601078
5037	NC_002506	GGA	2	6	323660	323665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601078
5038	NC_002506	GGC	2	6	323721	323726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601078
5039	NC_002506	TGT	2	6	323738	323743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601078
5040	NC_002506	ACA	2	6	323792	323797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601078
5041	NC_002506	TCA	2	6	323863	323868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601078
5042	NC_002506	TTG	2	6	324147	324152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601079
5043	NC_002506	TGA	2	6	324195	324200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601079
5044	NC_002506	AGT	2	6	324214	324219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601079
5045	NC_002506	CAA	2	6	324221	324226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601079
5046	NC_002506	TAGCT	2	10	324255	324264	20 %	40 %	20 %	20 %	15601079
5047	NC_002506	AT	3	6	324281	324286	50 %	50 %	0 %	0 %	15601079
5048	NC_002506	ATG	2	6	324315	324320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601080
5049	NC_002506	AC	4	8	324392	324399	50 %	0 %	0 %	50 %	15601080
5050	NC_002506	GGA	2	6	324596	324601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601081
5051	NC_002506	AAAG	2	8	324753	324760	75 %	0 %	25 %	0 %	15601081
5052	NC_002506	GTG	2	6	324814	324819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601081
5053	NC_002506	GGCC	2	8	325075	325082	0 %	0 %	50 %	50 %	15601081
5054	NC_002506	CAT	2	6	325221	325226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601082
5055	NC_002506	GCT	2	6	325268	325273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601082
5056	NC_002506	TGAAC	2	10	325311	325320	40 %	20 %	20 %	20 %	15601082
5057	NC_002506	CTCGA	2	10	325349	325358	20 %	20 %	20 %	40 %	15601082
5058	NC_002506	ATG	2	6	325412	325417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601082
5059	NC_002506	GGAA	2	8	325466	325473	50 %	0 %	50 %	0 %	15601082
5060	NC_002506	T	6	6	325531	325536	0 %	100 %	0 %	0 %	15601082
5061	NC_002506	CAG	2	6	325729	325734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601082
5062	NC_002506	AATA	2	8	325736	325743	75 %	25 %	0 %	0 %	15601082
5063	NC_002506	TGA	2	6	325922	325927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601083
5064	NC_002506	GTTT	2	8	325931	325938	0 %	75 %	25 %	0 %	15601083
5065	NC_002506	CAA	2	6	326003	326008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601083
5066	NC_002506	ACA	2	6	326011	326016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601083
5067	NC_002506	TATC	2	8	326098	326105	25 %	50 %	0 %	25 %	15601083
5068	NC_002506	CTT	2	6	326154	326159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601083
5069	NC_002506	GAT	2	6	326220	326225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601083
5070	NC_002506	T	6	6	326274	326279	0 %	100 %	0 %	0 %	15601083
5071	NC_002506	TTG	2	6	326311	326316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601083
5072	NC_002506	TCA	2	6	326381	326386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601083
5073	NC_002506	TAC	2	6	326435	326440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601084
5074	NC_002506	TGC	2	6	326537	326542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601084
5075	NC_002506	AGC	3	9	326582	326590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601084
5076	NC_002506	AGA	2	6	327444	327449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601087
5077	NC_002506	GTT	2	6	327539	327544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601087
5078	NC_002506	TTG	2	6	327611	327616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601087
5079	NC_002506	CTG	2	6	327621	327626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601087
5080	NC_002506	GAT	2	6	327691	327696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601087
5081	NC_002506	A	6	6	327761	327766	100 %	0 %	0 %	0 %	15601087
5082	NC_002506	A	7	7	327820	327826	100 %	0 %	0 %	0 %	15601087
5083	NC_002506	CAA	2	6	327834	327839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601087
5084	NC_002506	CAAA	2	8	327848	327855	75 %	0 %	0 %	25 %	15601087
5085	NC_002506	GC	3	6	328045	328050	0 %	0 %	50 %	50 %	15601088
5086	NC_002506	TAGTTG	2	12	328051	328062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15601088
5087	NC_002506	CGC	2	6	328173	328178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601088
5088	NC_002506	ATG	2	6	328211	328216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601088
5089	NC_002506	TCTT	2	8	328250	328257	0 %	75 %	0 %	25 %	15601088
5090	NC_002506	TG	3	6	328262	328267	0 %	50 %	50 %	0 %	15601088
5091	NC_002506	CCA	2	6	328425	328430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601089
5092	NC_002506	TAA	2	6	328435	328440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601089
5093	NC_002506	TCGTG	2	10	328516	328525	0 %	40 %	40 %	20 %	15601089
5094	NC_002506	TGT	2	6	328884	328889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601090
5095	NC_002506	TTG	2	6	328911	328916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601090
5096	NC_002506	TTAC	2	8	328947	328954	25 %	50 %	0 %	25 %	15601090
5097	NC_002506	TCTG	2	8	329012	329019	0 %	50 %	25 %	25 %	15601090
5098	NC_002506	GTG	2	6	329069	329074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601090
5099	NC_002506	TGA	2	6	329869	329874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601093
5100	NC_002506	CAA	3	9	329920	329928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601093
5101	NC_002506	AGA	2	6	330007	330012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601093
5102	NC_002506	TCA	2	6	330020	330025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601093
5103	NC_002506	TTA	2	6	330088	330093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601093
5104	NC_002506	TCTG	2	8	330104	330111	0 %	50 %	25 %	25 %	15601093
5105	NC_002506	CAT	2	6	330193	330198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601093
5106	NC_002506	TAG	2	6	330589	330594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601094
5107	NC_002506	TAG	2	6	330664	330669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601094
5108	NC_002506	CT	3	6	330837	330842	0 %	50 %	0 %	50 %	533112004
5109	NC_002506	T	8	8	330888	330895	0 %	100 %	0 %	0 %	533112004
5110	NC_002506	GAA	2	6	330946	330951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	533112004
5111	NC_002506	TGA	2	6	330969	330974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	533112004
5112	NC_002506	AG	3	6	331007	331012	50 %	0 %	50 %	0 %	533112004
5113	NC_002506	T	6	6	331037	331042	0 %	100 %	0 %	0 %	533112004
5114	NC_002506	AGT	2	6	331043	331048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	533112004
5115	NC_002506	TGG	2	6	331066	331071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	533112004
5116	NC_002506	AGAT	2	8	331090	331097	50 %	25 %	25 %	0 %	533112004
5117	NC_002506	TGT	2	6	331099	331104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	533112004
5118	NC_002506	TGT	2	6	331451	331456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	533112005
5119	NC_002506	TTG	2	6	331478	331483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	533112005
5120	NC_002506	TTAC	2	8	331514	331521	25 %	50 %	0 %	25 %	533112005
5121	NC_002506	GCT	2	6	331559	331564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	533112005
5122	NC_002506	TCTG	2	8	331579	331586	0 %	50 %	25 %	25 %	533112005
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5124	NC_002506	TGG	2	6	332606	332611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601095
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5248	NC_002506	ATCA	2	8	341456	341463	50 %	25 %	0 %	25 %	15601110
5249	NC_002506	GTAGT	2	10	341477	341486	20 %	40 %	40 %	0 %	15601110
5250	NC_002506	GA	3	6	341645	341650	50 %	0 %	50 %	0 %	15601110
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5252	NC_002506	TTG	2	6	342043	342048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601111
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5256	NC_002506	TTAC	2	8	342208	342215	25 %	50 %	0 %	25 %	15601111
5257	NC_002506	GCTC	2	8	342246	342253	0 %	25 %	25 %	50 %	15601111
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5274	NC_002506	GTA	2	6	343272	343277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601113
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5282	NC_002506	TTG	2	6	343746	343751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471193283
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5324	NC_002506	AGCA	2	8	347164	347171	50 %	0 %	25 %	25 %	15601120
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5452	NC_002506	TC	3	6	356589	356594	0 %	50 %	0 %	50 %	15601133
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5459	NC_002506	CT	3	6	356788	356793	0 %	50 %	0 %	50 %	15601133
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5472	NC_002506	ATTA	2	8	357945	357952	50 %	50 %	0 %	0 %	15601135
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5484	NC_002506	AAG	2	6	358815	358820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601138
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5495	NC_002506	AT	3	6	359307	359312	50 %	50 %	0 %	0 %	15601138
5496	NC_002506	TTCT	2	8	359319	359326	0 %	75 %	0 %	25 %	15601138
5497	NC_002506	GAA	2	6	359330	359335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601138
5498	NC_002506	ATG	2	6	359369	359374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601138
5499	NC_002506	ATG	3	9	359445	359453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601138
5500	NC_002506	AAG	2	6	359485	359490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601138

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