MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_002505	CTG	2	6	2957203	2957208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642765
48502	NC_002505	CAC	2	6	2957313	2957318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642765
48503	NC_002505	CTTG	2	8	2957328	2957335	0 %	50 %	25 %	25 %	15642765
48504	NC_002505	GGC	2	6	2957371	2957376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642765
48505	NC_002505	ACG	2	6	2957383	2957388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642765
48506	NC_002505	TCC	2	6	2957410	2957415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642765
48507	NC_002505	ATA	2	6	2957447	2957452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642765
48508	NC_002505	GCC	2	6	2957471	2957476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642765
48509	NC_002505	CCG	2	6	2957568	2957573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642765
48510	NC_002505	GACT	2	8	2957579	2957586	25 %	25 %	25 %	25 %	15642765
48511	NC_002505	TGC	2	6	2957600	2957605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642765
48512	NC_002505	AGT	2	6	2957633	2957638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642765
48513	NC_002505	GTT	3	9	2957691	2957699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642765
48514	NC_002505	TAC	2	6	2957855	2957860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642766
48515	NC_002505	CGG	2	6	2957963	2957968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642766
48516	NC_002505	CGG	2	6	2958050	2958055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642766
48517	NC_002505	AAG	2	6	2958075	2958080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642766
48518	NC_002505	AAG	2	6	2958086	2958091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642766
48519	NC_002505	CAAT	2	8	2958097	2958104	50 %	25 %	0 %	25 %	15642766
48520	NC_002505	GGC	2	6	2958213	2958218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642766
48521	NC_002505	ACC	2	6	2958364	2958369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642766
48522	NC_002505	GGC	2	6	2958399	2958404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642766
48523	NC_002505	GTT	3	9	2958418	2958426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642766
48524	NC_002505	TCA	3	9	2958594	2958602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642767
48525	NC_002505	TTG	2	6	2958765	2958770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642767
48526	NC_002505	ACC	2	6	2958933	2958938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642767
48527	NC_002505	AGC	2	6	2959020	2959025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642767
48528	NC_002505	GCT	2	6	2959042	2959047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642767
48529	NC_002505	TGC	2	6	2959053	2959058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642767
48530	NC_002505	CGC	2	6	2959123	2959128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642767
48531	NC_002505	T	6	6	2959153	2959158	0 %	100 %	0 %	0 %	15642768
48532	NC_002505	CGC	2	6	2959183	2959188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642768
48533	NC_002505	ACC	2	6	2959256	2959261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642768
48534	NC_002505	CGG	2	6	2959398	2959403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642768
48535	NC_002505	CAG	2	6	2959447	2959452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642768
48536	NC_002505	CAC	2	6	2959488	2959493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642768
48537	NC_002505	CAG	2	6	2959519	2959524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642768
48538	NC_002505	TGT	2	6	2959599	2959604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642768
48539	NC_002505	T	6	6	2959608	2959613	0 %	100 %	0 %	0 %	15642768
48540	NC_002505	CAT	2	6	2959635	2959640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642768
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48542	NC_002505	TCG	2	6	2959769	2959774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642768
48543	NC_002505	CTT	2	6	2959818	2959823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642768
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48545	NC_002505	GTA	2	6	2959892	2959897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642768
48546	NC_002505	AT	3	6	2959931	2959936	50 %	50 %	0 %	0 %	15642768
48547	NC_002505	GAA	2	6	2959972	2959977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642768
48548	NC_002505	ACGA	2	8	2960002	2960009	50 %	0 %	25 %	25 %	15642768
48549	NC_002505	TGG	2	6	2960073	2960078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642768
48550	NC_002505	GTG	2	6	2960102	2960107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642768
48551	NC_002505	TCGA	2	8	2960174	2960181	25 %	25 %	25 %	25 %	15642768
48552	NC_002505	GAT	2	6	2960209	2960214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642768
48553	NC_002505	CATA	2	8	2960220	2960227	50 %	25 %	0 %	25 %	15642768
48554	NC_002505	CAT	2	6	2960256	2960261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642768
48555	NC_002505	A	6	6	2960334	2960339	100 %	0 %	0 %	0 %	15642768
48556	NC_002505	TGC	2	6	2960360	2960365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642768
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48559	NC_002505	CGA	2	6	2960625	2960630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642768
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48567	NC_002505	CCA	2	6	2960975	2960980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642768

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.