MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_002505	ACTTCA	2	12	2857472	2857483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642684
47003	NC_002505	A	6	6	2857511	2857516	100 %	0 %	0 %	0 %	15642684
47004	NC_002505	GCT	2	6	2857560	2857565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642684
47005	NC_002505	CGT	2	6	2857596	2857601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642684
47006	NC_002505	CAC	2	6	2857642	2857647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642684
47007	NC_002505	CCA	2	6	2857682	2857687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642684
47008	NC_002505	T	7	7	2857704	2857710	0 %	100 %	0 %	0 %	15642684
47009	NC_002505	CGAAT	2	10	2857735	2857744	40 %	20 %	20 %	20 %	15642684
47010	NC_002505	CAGA	2	8	2857778	2857785	50 %	0 %	25 %	25 %	15642684
47011	NC_002505	CAC	2	6	2858015	2858020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642685
47012	NC_002505	TGG	2	6	2858034	2858039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642685
47013	NC_002505	TCC	2	6	2858079	2858084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642685
47014	NC_002505	TGT	2	6	2858122	2858127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642685
47015	NC_002505	TGAA	2	8	2858148	2858155	50 %	25 %	25 %	0 %	15642685
47016	NC_002505	GCCA	2	8	2858204	2858211	25 %	0 %	25 %	50 %	15642685
47017	NC_002505	AGC	2	6	2858268	2858273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642685
47018	NC_002505	CAT	2	6	2858284	2858289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642685
47019	NC_002505	ACCGAT	2	12	2858324	2858335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642685
47020	NC_002505	CCA	2	6	2858366	2858371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642685
47021	NC_002505	ATG	2	6	2858391	2858396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642685
47022	NC_002505	TCA	2	6	2858404	2858409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642685
47023	NC_002505	ATGGCG	2	12	2858511	2858522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15642685
47024	NC_002505	ATTCA	2	10	2858549	2858558	40 %	40 %	0 %	20 %	15642685
47025	NC_002505	GAA	2	6	2858567	2858572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642685
47026	NC_002505	GGC	2	6	2858729	2858734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642685
47027	NC_002505	CAC	2	6	2858790	2858795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642685
47028	NC_002505	ACC	2	6	2858808	2858813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642685
47029	NC_002505	AGC	2	6	2858817	2858822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642685
47030	NC_002505	CCG	2	6	2858830	2858835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642685
47031	NC_002505	T	6	6	2858876	2858881	0 %	100 %	0 %	0 %	15642685
47032	NC_002505	CAGA	2	8	2858910	2858917	50 %	0 %	25 %	25 %	15642685
47033	NC_002505	TGCA	2	8	2859128	2859135	25 %	25 %	25 %	25 %	15642686
47034	NC_002505	TTG	2	6	2859151	2859156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642686
47035	NC_002505	TCA	2	6	2859198	2859203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642686
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47037	NC_002505	CAT	2	6	2859220	2859225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642686
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47039	NC_002505	GC	3	6	2859314	2859319	0 %	0 %	50 %	50 %	15642686
47040	NC_002505	CAT	2	6	2859345	2859350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642686
47041	NC_002505	GC	3	6	2859368	2859373	0 %	0 %	50 %	50 %	15642686
47042	NC_002505	TGC	2	6	2859416	2859421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642686
47043	NC_002505	ACC	2	6	2859505	2859510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642686
47044	NC_002505	GCC	2	6	2859521	2859526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642686
47045	NC_002505	T	7	7	2859570	2859576	0 %	100 %	0 %	0 %	15642686
47046	NC_002505	TCGT	2	8	2859588	2859595	0 %	50 %	25 %	25 %	15642686
47047	NC_002505	TTTCG	2	10	2859605	2859614	0 %	60 %	20 %	20 %	15642686
47048	NC_002505	TGA	2	6	2859930	2859935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642687
47049	NC_002505	GATC	2	8	2860024	2860031	25 %	25 %	25 %	25 %	15642687
47050	NC_002505	GAT	2	6	2860058	2860063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642687
47051	NC_002505	GC	3	6	2860100	2860105	0 %	0 %	50 %	50 %	15642687
47052	NC_002505	CTG	2	6	2860223	2860228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642687
47053	NC_002505	GAC	2	6	2860234	2860239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642687
47054	NC_002505	CTCA	2	8	2860256	2860263	25 %	25 %	0 %	50 %	15642687
47055	NC_002505	A	6	6	2860379	2860384	100 %	0 %	0 %	0 %	15642687
47056	NC_002505	AGG	2	6	2860452	2860457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642687
47057	NC_002505	T	7	7	2860734	2860740	0 %	100 %	0 %	0 %	15642688
47058	NC_002505	GCA	2	6	2860845	2860850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642688
47059	NC_002505	CTG	2	6	2860912	2860917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642688
47060	NC_002505	ACC	2	6	2860944	2860949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642688
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47063	NC_002505	GCT	2	6	2861019	2861024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642688
47064	NC_002505	TGGC	2	8	2861029	2861036	0 %	25 %	50 %	25 %	15642688
47065	NC_002505	CG	3	6	2861088	2861093	0 %	0 %	50 %	50 %	15642688
47066	NC_002505	TGG	2	6	2861171	2861176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642688
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47070	NC_002505	TGA	2	6	2861534	2861539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642688
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47073	NC_002505	GAT	3	9	2861638	2861646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642688
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47078	NC_002505	CTTACG	2	12	2862014	2862025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15642689
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47082	NC_002505	CG	4	8	2862159	2862166	0 %	0 %	50 %	50 %	15642689
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47088	NC_002505	CCA	2	6	2862407	2862412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642689
47089	NC_002505	GATG	2	8	2862432	2862439	25 %	25 %	50 %	0 %	15642689
47090	NC_002505	CGTG	2	8	2862447	2862454	0 %	25 %	50 %	25 %	15642689
47091	NC_002505	TG	3	6	2862477	2862482	0 %	50 %	50 %	0 %	15642689
47092	NC_002505	TAC	2	6	2862493	2862498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642689
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47099	NC_002505	GCGCC	2	10	2862790	2862799	0 %	0 %	40 %	60 %	15642690
47100	NC_002505	CGC	2	6	2862847	2862852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642690
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47102	NC_002505	CA	3	6	2862916	2862921	50 %	0 %	0 %	50 %	15642690
47103	NC_002505	CAT	2	6	2862923	2862928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642690
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47107	NC_002505	AGC	2	6	2863020	2863025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642690
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47110	NC_002505	ATT	2	6	2863085	2863090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642690
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47354	NC_002505	CG	3	6	2881102	2881107	0 %	0 %	50 %	50 %	15642704
47355	NC_002505	CTG	2	6	2881154	2881159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642704
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47471	NC_002505	CT	3	6	2887986	2887991	0 %	50 %	0 %	50 %	15642707
47472	NC_002505	ACT	2	6	2888033	2888038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642707
47473	NC_002505	TCA	2	6	2888050	2888055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642707
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47475	NC_002505	GCA	2	6	2888248	2888253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642707
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