MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46003	NC_002505	ATGG	2	8	2796728	2796735	25 %	25 %	50 %	0 %	15642620
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46015	NC_002505	TGG	2	6	2797896	2797901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642622
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46119	NC_002505	TGC	2	6	2803227	2803232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642626
46120	NC_002505	CTT	2	6	2803279	2803284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642626
46121	NC_002505	GC	3	6	2803286	2803291	0 %	0 %	50 %	50 %	15642626
46122	NC_002505	ATC	2	6	2803325	2803330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642626
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46131	NC_002505	TGAC	2	8	2803664	2803671	25 %	25 %	25 %	25 %	15642627
46132	NC_002505	A	6	6	2803717	2803722	100 %	0 %	0 %	0 %	15642627
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46232	NC_002505	ATTCC	2	10	2810405	2810414	20 %	40 %	0 %	40 %	15642633
46233	NC_002505	ACAAG	2	10	2810418	2810427	60 %	0 %	20 %	20 %	15642633
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46236	NC_002505	ATG	2	6	2810576	2810581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642633
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46238	NC_002505	CACT	2	8	2810717	2810724	25 %	25 %	0 %	50 %	15642633
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46352	NC_002505	CAA	2	6	2818926	2818931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161581981
46353	NC_002505	TGTC	2	8	2818951	2818958	0 %	50 %	25 %	25 %	161581981
46354	NC_002505	CT	3	6	2818978	2818983	0 %	50 %	0 %	50 %	161581981
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46468	NC_002505	GCA	2	6	2826882	2826887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642651
46469	NC_002505	GGT	2	6	2826939	2826944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642651
46470	NC_002505	TGT	2	6	2826965	2826970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642651
46471	NC_002505	TTG	2	6	2826979	2826984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642651
46472	NC_002505	ACGT	2	8	2827060	2827067	25 %	25 %	25 %	25 %	15642651
46473	NC_002505	CGG	2	6	2827073	2827078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642651
46474	NC_002505	TGC	2	6	2827103	2827108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642651
46475	NC_002505	TGC	2	6	2827129	2827134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642651
46476	NC_002505	TGG	2	6	2827195	2827200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642651
46477	NC_002505	TGA	2	6	2827211	2827216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642651
46478	NC_002505	GTT	2	6	2827287	2827292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642651
46479	NC_002505	CGG	2	6	2827337	2827342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642651
46480	NC_002505	ACC	2	6	2827417	2827422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642651
46481	NC_002505	TGA	2	6	2827450	2827455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642651
46482	NC_002505	GTG	2	6	2827468	2827473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642651
46483	NC_002505	TAT	2	6	2827481	2827486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642651
46484	NC_002505	CAA	2	6	2827490	2827495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642651
46485	NC_002505	AGC	2	6	2827615	2827620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642651
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46487	NC_002505	GGT	2	6	2827800	2827805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642651
46488	NC_002505	GC	3	6	2827961	2827966	0 %	0 %	50 %	50 %	15642651
46489	NC_002505	CGC	2	6	2828000	2828005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642651
46490	NC_002505	ATCGC	2	10	2828026	2828035	20 %	20 %	20 %	40 %	15642651
46491	NC_002505	GCA	2	6	2828045	2828050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642651
46492	NC_002505	TGA	2	6	2828057	2828062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642651
46493	NC_002505	GCATCA	2	12	2828188	2828199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642651
46494	NC_002505	CG	3	6	2828308	2828313	0 %	0 %	50 %	50 %	15642651
46495	NC_002505	TGA	2	6	2828330	2828335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642651
46496	NC_002505	TGA	2	6	2828351	2828356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642651
46497	NC_002505	AAG	2	6	2828392	2828397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642651
46498	NC_002505	AGC	2	6	2828471	2828476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642651
46499	NC_002505	AAT	2	6	2828527	2828532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642651
46500	NC_002505	CA	3	6	2828595	2828600	50 %	0 %	0 %	50 %	15642652

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