MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002505	GCT	2	6	245731	245736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640270
4002	NC_002505	AGT	2	6	245774	245779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640270
4003	NC_002505	GCA	2	6	245780	245785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640270
4004	NC_002505	GTT	2	6	245805	245810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640270
4005	NC_002505	ATC	2	6	245889	245894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640270
4006	NC_002505	CGA	2	6	245993	245998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640270
4007	NC_002505	TGC	2	6	246044	246049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640270
4008	NC_002505	GCC	2	6	246063	246068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640270
4009	NC_002505	ATC	2	6	246706	246711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237031
4010	NC_002505	TCG	2	6	246734	246739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237031
4011	NC_002505	CAG	2	6	246772	246777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237031
4012	NC_002505	AGC	2	6	246806	246811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237031
4013	NC_002505	AGG	2	6	246829	246834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471237031
4014	NC_002505	A	6	6	246875	246880	100 %	0 %	0 %	0 %	471237031
4015	NC_002505	GCT	2	6	246897	246902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237031
4016	NC_002505	AGC	2	6	246911	246916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237031
4017	NC_002505	CAC	2	6	246962	246967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237031
4018	NC_002505	GGTTAT	2	12	246978	246989	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	471237031
4019	NC_002505	TTG	2	6	247039	247044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237031
4020	NC_002505	GTG	2	6	247084	247089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237031
4021	NC_002505	GTT	2	6	247108	247113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237031
4022	NC_002505	TGCAA	2	10	247187	247196	40 %	20 %	20 %	20 %	471237031
4023	NC_002505	ACGATT	2	12	247207	247218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	471237031
4024	NC_002505	AGA	2	6	247235	247240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237031
4025	NC_002505	TGA	2	6	247256	247261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237031
4026	NC_002505	GTA	2	6	247305	247310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237031
4027	NC_002505	TGC	2	6	247457	247462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237031
4028	NC_002505	TTG	2	6	247480	247485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237031
4029	NC_002505	TGG	2	6	247486	247491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237031
4030	NC_002505	AAG	2	6	247534	247539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237031
4031	NC_002505	AAG	2	6	247542	247547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237031
4032	NC_002505	ACC	2	6	247708	247713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237031
4033	NC_002505	GAGCA	2	10	247714	247723	40 %	0 %	40 %	20 %	471237031
4034	NC_002505	GAT	2	6	247893	247898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237031
4035	NC_002505	GTA	2	6	247899	247904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237031
4036	NC_002505	ATAA	2	8	247915	247922	75 %	25 %	0 %	0 %	471237031
4037	NC_002505	GGT	2	6	248069	248074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640272
4038	NC_002505	TGG	2	6	248209	248214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640272
4039	NC_002505	GTG	2	6	248292	248297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640272
4040	NC_002505	GAAT	2	8	248335	248342	50 %	25 %	25 %	0 %	15640272
4041	NC_002505	TCA	2	6	248454	248459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640272
4042	NC_002505	TGAT	2	8	248487	248494	25 %	50 %	25 %	0 %	15640272
4043	NC_002505	ATTGA	2	10	248513	248522	40 %	40 %	20 %	0 %	15640272
4044	NC_002505	CAT	2	6	248549	248554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640272
4045	NC_002505	GAA	2	6	248555	248560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640272
4046	NC_002505	GCT	2	6	248682	248687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640272
4047	NC_002505	TGA	2	6	248695	248700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640272
4048	NC_002505	TAC	2	6	248723	248728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640272
4049	NC_002505	ATT	2	6	248780	248785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640272
4050	NC_002505	GCAT	2	8	248863	248870	25 %	25 %	25 %	25 %	15640272
4051	NC_002505	AGA	2	6	248893	248898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640272
4052	NC_002505	GGT	2	6	248909	248914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640272
4053	NC_002505	ACT	2	6	248931	248936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640272
4054	NC_002505	GAT	2	6	248965	248970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640272
4055	NC_002505	AATT	2	8	249070	249077	50 %	50 %	0 %	0 %	15640272
4056	NC_002505	TAA	2	6	249099	249104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640272
4057	NC_002505	TTTA	2	8	249114	249121	25 %	75 %	0 %	0 %	15640272
4058	NC_002505	ATT	2	6	249123	249128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640272
4059	NC_002505	TC	3	6	249165	249170	0 %	50 %	0 %	50 %	15640272
4060	NC_002505	TTA	2	6	249221	249226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640272
4061	NC_002505	TGA	2	6	249261	249266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640272
4062	NC_002505	ATTA	2	8	249292	249299	50 %	50 %	0 %	0 %	15640272
4063	NC_002505	A	6	6	249325	249330	100 %	0 %	0 %	0 %	15640273
4064	NC_002505	ATC	2	6	249455	249460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640273
4065	NC_002505	GC	3	6	249581	249586	0 %	0 %	50 %	50 %	15640273
4066	NC_002505	CTA	2	6	249658	249663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640273
4067	NC_002505	A	7	7	249691	249697	100 %	0 %	0 %	0 %	15640273
4068	NC_002505	AGAA	2	8	249755	249762	75 %	0 %	25 %	0 %	15640273
4069	NC_002505	AATT	2	8	249825	249832	50 %	50 %	0 %	0 %	15640273
4070	NC_002505	GAG	2	6	249896	249901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640273
4071	NC_002505	GAT	2	6	250035	250040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640273
4072	NC_002505	AG	3	6	250099	250104	50 %	0 %	50 %	0 %	15640273
4073	NC_002505	ATT	2	6	250228	250233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640273
4074	NC_002505	CCTAG	2	10	250291	250300	20 %	20 %	20 %	40 %	15640273
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4077	NC_002505	A	6	6	250402	250407	100 %	0 %	0 %	0 %	15640273
4078	NC_002505	TGGA	2	8	250476	250483	25 %	25 %	50 %	0 %	15640274
4079	NC_002505	AT	3	6	250543	250548	50 %	50 %	0 %	0 %	15640274
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4081	NC_002505	ATAA	2	8	250796	250803	75 %	25 %	0 %	0 %	15640274
4082	NC_002505	AT	3	6	250832	250837	50 %	50 %	0 %	0 %	15640274
4083	NC_002505	TG	3	6	250872	250877	0 %	50 %	50 %	0 %	15640274
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4088	NC_002505	TGC	2	6	251143	251148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640274
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4090	NC_002505	TGA	2	6	251337	251342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640274
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4092	NC_002505	AAT	2	6	251354	251359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640274
4093	NC_002505	GAT	2	6	251498	251503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640274
4094	NC_002505	ATT	2	6	251535	251540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640274
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4096	NC_002505	TAG	2	6	251579	251584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640275
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4100	NC_002505	AT	3	6	251744	251749	50 %	50 %	0 %	0 %	15640275
4101	NC_002505	CTA	2	6	251780	251785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640275
4102	NC_002505	A	7	7	251785	251791	100 %	0 %	0 %	0 %	15640275
4103	NC_002505	ATGT	2	8	251893	251900	25 %	50 %	25 %	0 %	15640275
4104	NC_002505	TAT	2	6	251918	251923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640275
4105	NC_002505	TA	3	6	251927	251932	50 %	50 %	0 %	0 %	15640275
4106	NC_002505	AAG	2	6	251949	251954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640275
4107	NC_002505	CTAC	2	8	251989	251996	25 %	25 %	0 %	50 %	15640275
4108	NC_002505	ATC	2	6	252001	252006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640275
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4110	NC_002505	GTTT	2	8	252057	252064	0 %	75 %	25 %	0 %	15640275
4111	NC_002505	CTG	2	6	252092	252097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640275
4112	NC_002505	ATT	2	6	252145	252150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640275
4113	NC_002505	TCAA	2	8	252153	252160	50 %	25 %	0 %	25 %	15640275
4114	NC_002505	ATT	2	6	252239	252244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640275
4115	NC_002505	CAA	2	6	252259	252264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640275
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4118	NC_002505	TAT	2	6	252368	252373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640275
4119	NC_002505	ATTTT	2	10	252506	252515	20 %	80 %	0 %	0 %	15640275
4120	NC_002505	GA	3	6	252565	252570	50 %	0 %	50 %	0 %	15640275
4121	NC_002505	ATT	2	6	252596	252601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640275
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4123	NC_002505	GGT	2	6	252658	252663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640275
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4241	NC_002505	AACC	2	8	258560	258567	50 %	0 %	0 %	50 %	15640281
4242	NC_002505	GC	3	6	258599	258604	0 %	0 %	50 %	50 %	15640281
4243	NC_002505	T	6	6	258730	258735	0 %	100 %	0 %	0 %	15640281
4244	NC_002505	T	6	6	258742	258747	0 %	100 %	0 %	0 %	15640281
4245	NC_002505	GTATC	2	10	258795	258804	20 %	40 %	20 %	20 %	15640281
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4372	NC_002505	GC	3	6	268318	268323	0 %	0 %	50 %	50 %	15640291
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4480	NC_002505	TCA	2	6	274078	274083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237033
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4485	NC_002505	A	6	6	274686	274691	100 %	0 %	0 %	0 %	15640298
4486	NC_002505	A	9	9	274716	274724	100 %	0 %	0 %	0 %	15640298
4487	NC_002505	TC	3	6	274732	274737	0 %	50 %	0 %	50 %	15640298
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4490	NC_002505	AGGA	2	8	274842	274849	50 %	0 %	50 %	0 %	15640298
4491	NC_002505	ATT	2	6	274985	274990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640298
4492	NC_002505	T	6	6	275078	275083	0 %	100 %	0 %	0 %	15640298
4493	NC_002505	A	9	9	275109	275117	100 %	0 %	0 %	0 %	15640298
4494	NC_002505	AAC	2	6	275163	275168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640298
4495	NC_002505	GAA	2	6	275186	275191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640298
4496	NC_002505	TGC	2	6	275238	275243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640298
4497	NC_002505	GC	3	6	275285	275290	0 %	0 %	50 %	50 %	15640298
4498	NC_002505	TGC	2	6	275349	275354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640298
4499	NC_002505	CAA	2	6	275453	275458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640298
4500	NC_002505	GCA	2	6	275521	275526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640298

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