MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_002505	CG	3	6	2608551	2608556	0 %	0 %	50 %	50 %	15642430
43002	NC_002505	CA	3	6	2608594	2608599	50 %	0 %	0 %	50 %	15642430
43003	NC_002505	CGA	2	6	2608627	2608632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
43004	NC_002505	CGCT	2	8	2608644	2608651	0 %	25 %	25 %	50 %	15642430
43005	NC_002505	CT	3	6	2608650	2608655	0 %	50 %	0 %	50 %	15642430
43006	NC_002505	GT	3	6	2608660	2608665	0 %	50 %	50 %	0 %	15642430
43007	NC_002505	CAAGC	2	10	2608672	2608681	40 %	0 %	20 %	40 %	15642430
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43009	NC_002505	GAT	2	6	2608699	2608704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642430
43010	NC_002505	GCA	3	9	2608708	2608716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
43011	NC_002505	CAG	2	6	2608757	2608762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
43012	NC_002505	CTG	2	6	2608769	2608774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642430
43013	NC_002505	CTCA	2	8	2608775	2608782	25 %	25 %	0 %	50 %	15642430
43014	NC_002505	CAG	2	6	2608844	2608849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
43015	NC_002505	T	7	7	2608940	2608946	0 %	100 %	0 %	0 %	15642430
43016	NC_002505	GT	3	6	2608987	2608992	0 %	50 %	50 %	0 %	15642430
43017	NC_002505	CCG	2	6	2609113	2609118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642430
43018	NC_002505	GAC	2	6	2609175	2609180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642430
43019	NC_002505	TTAT	2	8	2609209	2609216	25 %	75 %	0 %	0 %	15642430
43020	NC_002505	TTCG	2	8	2609324	2609331	0 %	50 %	25 %	25 %	15642431
43021	NC_002505	GC	3	6	2609342	2609347	0 %	0 %	50 %	50 %	15642431
43022	NC_002505	ACT	2	6	2609369	2609374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642431
43023	NC_002505	GACA	2	8	2609411	2609418	50 %	0 %	25 %	25 %	15642431
43024	NC_002505	TCA	2	6	2609445	2609450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642431
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43028	NC_002505	GCAG	2	8	2609559	2609566	25 %	0 %	50 %	25 %	15642431
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43032	NC_002505	TCA	2	6	2609782	2609787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642432
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43052	NC_002505	A	6	6	2610848	2610853	100 %	0 %	0 %	0 %	15642433
43053	NC_002505	CAA	2	6	2610887	2610892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642433
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43102	NC_002505	TCT	3	9	2614448	2614456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642434
43103	NC_002505	GC	3	6	2614462	2614467	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
43104	NC_002505	ATCA	2	8	2614531	2614538	50 %	25 %	0 %	25 %	15642434
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43107	NC_002505	GCT	2	6	2614569	2614574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642434
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43117	NC_002505	GCTC	2	8	2615004	2615011	0 %	25 %	25 %	50 %	15642434
43118	NC_002505	TCT	2	6	2615075	2615080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642434
43119	NC_002505	GCA	2	6	2615121	2615126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642434
43120	NC_002505	GCG	2	6	2615137	2615142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
43121	NC_002505	CG	3	6	2615181	2615186	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
43122	NC_002505	GCC	2	6	2615308	2615313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642434
43123	NC_002505	TGT	2	6	2615328	2615333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642434
43124	NC_002505	CGG	2	6	2615345	2615350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
43125	NC_002505	GCT	2	6	2615359	2615364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642434
43126	NC_002505	GCG	2	6	2615416	2615421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
43127	NC_002505	GCA	2	6	2615436	2615441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642434
43128	NC_002505	ATC	2	6	2615498	2615503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642434
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43130	NC_002505	GCG	2	6	2615701	2615706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
43131	NC_002505	CG	3	6	2615705	2615710	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
43132	NC_002505	GGA	2	6	2615758	2615763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642434
43133	NC_002505	GAT	2	6	2615800	2615805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642434
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43135	NC_002505	CT	3	6	2615930	2615935	0 %	50 %	0 %	50 %	15642434
43136	NC_002505	GCCA	2	8	2616041	2616048	25 %	0 %	25 %	50 %	15642434
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43138	NC_002505	GGCTT	2	10	2616081	2616090	0 %	40 %	40 %	20 %	15642434
43139	NC_002505	TAA	2	6	2616094	2616099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642434
43140	NC_002505	TG	3	6	2616213	2616218	0 %	50 %	50 %	0 %	15642434
43141	NC_002505	TGAT	2	8	2616235	2616242	25 %	50 %	25 %	0 %	15642434
43142	NC_002505	CGG	2	6	2616252	2616257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642434
43143	NC_002505	GC	3	6	2616267	2616272	0 %	0 %	50 %	50 %	15642434
43144	NC_002505	ATG	2	6	2616284	2616289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642434
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43147	NC_002505	CCA	2	6	2616510	2616515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642435
43148	NC_002505	TTG	2	6	2616527	2616532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642435
43149	NC_002505	CTG	2	6	2616573	2616578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642435
43150	NC_002505	TGA	2	6	2616657	2616662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642435
43151	NC_002505	GCT	2	6	2616677	2616682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642435
43152	NC_002505	CAC	2	6	2616685	2616690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642435
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43154	NC_002505	ATC	2	6	2616743	2616748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642435
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43185	NC_002505	CT	3	6	2618673	2618678	0 %	50 %	0 %	50 %	15642436
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43201	NC_002505	A	6	6	2619638	2619643	100 %	0 %	0 %	0 %	15642436
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43203	NC_002505	GAAT	2	8	2619947	2619954	50 %	25 %	25 %	0 %	15642437
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43210	NC_002505	AGCGC	2	10	2620505	2620514	20 %	0 %	40 %	40 %	15642437
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43212	NC_002505	ATT	2	6	2620729	2620734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642438
43213	NC_002505	ATTGGT	2	12	2620765	2620776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15642438
43214	NC_002505	CAATG	2	10	2620791	2620800	40 %	20 %	20 %	20 %	15642438
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43218	NC_002505	GGT	2	6	2620888	2620893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642438
43219	NC_002505	CT	4	8	2620932	2620939	0 %	50 %	0 %	50 %	15642438
43220	NC_002505	ATG	2	6	2620972	2620977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642438
43221	NC_002505	CTT	2	6	2620984	2620989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642438
43222	NC_002505	TGG	2	6	2621009	2621014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642438
43223	NC_002505	CACT	2	8	2621043	2621050	25 %	25 %	0 %	50 %	15642438
43224	NC_002505	ATC	2	6	2621053	2621058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642438
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43226	NC_002505	ATT	2	6	2621143	2621148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642438
43227	NC_002505	CTT	2	6	2621166	2621171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642438
43228	NC_002505	TCA	2	6	2621264	2621269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642438
43229	NC_002505	A	6	6	2621299	2621304	100 %	0 %	0 %	0 %	15642438
43230	NC_002505	GGT	2	6	2621361	2621366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642438
43231	NC_002505	CGG	2	6	2621385	2621390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642438
43232	NC_002505	AGA	2	6	2621405	2621410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642438
43233	NC_002505	ACG	2	6	2621516	2621521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642438
43234	NC_002505	GGT	2	6	2621550	2621555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642438
43235	NC_002505	TGG	2	6	2621605	2621610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642438
43236	NC_002505	TTC	2	6	2621612	2621617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642438
43237	NC_002505	GGT	2	6	2621623	2621628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642438
43238	NC_002505	TCG	3	9	2621636	2621644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642438
43239	NC_002505	CGT	2	6	2621748	2621753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642438
43240	NC_002505	TGGT	2	8	2621798	2621805	0 %	50 %	50 %	0 %	15642438
43241	NC_002505	TGC	2	6	2621838	2621843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642438
43242	NC_002505	GTC	2	6	2621884	2621889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642438
43243	NC_002505	TCT	2	6	2621924	2621929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642438
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43245	NC_002505	GCA	2	6	2622255	2622260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642439
43246	NC_002505	AG	3	6	2622301	2622306	50 %	0 %	50 %	0 %	15642439
43247	NC_002505	TGA	2	6	2622325	2622330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642439
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43250	NC_002505	AGCA	2	8	2622545	2622552	50 %	0 %	25 %	25 %	15642439
43251	NC_002505	GC	3	6	2622586	2622591	0 %	0 %	50 %	50 %	15642439
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43257	NC_002505	TACTC	2	10	2622946	2622955	20 %	40 %	0 %	40 %	15642440
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43262	NC_002505	CTG	2	6	2623398	2623403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642440
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43266	NC_002505	TCA	2	6	2623580	2623585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642440
43267	NC_002505	TCC	2	6	2623602	2623607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642440
43268	NC_002505	TGC	2	6	2623623	2623628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642441
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43272	NC_002505	CAT	2	6	2623985	2623990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642441
43273	NC_002505	GCT	2	6	2624150	2624155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642441
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43275	NC_002505	TCGG	2	8	2624205	2624212	0 %	25 %	50 %	25 %	15642441
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43280	NC_002505	GA	3	6	2624319	2624324	50 %	0 %	50 %	0 %	15642441
43281	NC_002505	AG	3	6	2624327	2624332	50 %	0 %	50 %	0 %	15642441
43282	NC_002505	AGG	2	6	2624342	2624347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642441
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43300	NC_002505	CG	4	8	2624966	2624973	0 %	0 %	50 %	50 %	15642441
43301	NC_002505	TCGC	2	8	2624998	2625005	0 %	25 %	25 %	50 %	15642441
43302	NC_002505	TCCCG	2	10	2625020	2625029	0 %	20 %	20 %	60 %	15642441
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43314	NC_002505	CGC	2	6	2625624	2625629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642442
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43325	NC_002505	CAAG	2	8	2625984	2625991	50 %	0 %	25 %	25 %	15642442
43326	NC_002505	CAT	2	6	2626113	2626118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642442
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43328	NC_002505	ACC	2	6	2626225	2626230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642442
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43330	NC_002505	TGT	2	6	2626297	2626302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642442
43331	NC_002505	ATC	2	6	2626310	2626315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642442
43332	NC_002505	GTTTAG	2	12	2626322	2626333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15642442
43333	NC_002505	AG	3	6	2626332	2626337	50 %	0 %	50 %	0 %	15642442
43334	NC_002505	GCC	2	6	2626381	2626386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642442
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43336	NC_002505	CTT	2	6	2626646	2626651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642443
43337	NC_002505	GTTG	2	8	2626664	2626671	0 %	50 %	50 %	0 %	15642443
43338	NC_002505	GCA	2	6	2626723	2626728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642443
43339	NC_002505	TACC	2	8	2626730	2626737	25 %	25 %	0 %	50 %	15642443
43340	NC_002505	GA	3	6	2626781	2626786	50 %	0 %	50 %	0 %	15642443
43341	NC_002505	TCAG	2	8	2626837	2626844	25 %	25 %	25 %	25 %	15642443
43342	NC_002505	TCAG	2	8	2627044	2627051	25 %	25 %	25 %	25 %	15642443
43343	NC_002505	TTCT	2	8	2627115	2627122	0 %	75 %	0 %	25 %	15642443
43344	NC_002505	CGT	2	6	2627129	2627134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642443
43345	NC_002505	AGC	2	6	2627145	2627150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642443
43346	NC_002505	ACC	2	6	2627259	2627264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642443
43347	NC_002505	CTT	2	6	2627348	2627353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642443
43348	NC_002505	GTT	2	6	2627403	2627408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642443
43349	NC_002505	CAC	2	6	2627420	2627425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642443
43350	NC_002505	TGA	2	6	2627429	2627434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642443
43351	NC_002505	TCA	2	6	2627438	2627443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642443
43352	NC_002505	TCAGC	2	10	2627480	2627489	20 %	20 %	20 %	40 %	15642443
43353	NC_002505	TGC	2	6	2627517	2627522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642443
43354	NC_002505	GCT	3	9	2627524	2627532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642443
43355	NC_002505	CAGC	2	8	2627684	2627691	25 %	0 %	25 %	50 %	15642443
43356	NC_002505	GCT	2	6	2627782	2627787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642443
43357	NC_002505	ACC	2	6	2627802	2627807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642443
43358	NC_002505	GAT	2	6	2627853	2627858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642443
43359	NC_002505	GCT	2	6	2628001	2628006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642444
43360	NC_002505	CTT	2	6	2628120	2628125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642444
43361	NC_002505	CTG	2	6	2628128	2628133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642444
43362	NC_002505	GCA	2	6	2628176	2628181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642444
43363	NC_002505	GTT	2	6	2628183	2628188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642444
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43371	NC_002505	CA	3	6	2628824	2628829	50 %	0 %	0 %	50 %	15642444
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43374	NC_002505	ACAGA	2	10	2628924	2628933	60 %	0 %	20 %	20 %	15642444
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43395	NC_002505	GTT	2	6	2630872	2630877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642447
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43460	NC_002505	CAA	2	6	2634273	2634278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642448
43461	NC_002505	GTGCT	2	10	2634365	2634374	0 %	40 %	40 %	20 %	15642448
43462	NC_002505	GAAA	2	8	2634384	2634391	75 %	0 %	25 %	0 %	15642448
43463	NC_002505	ATT	2	6	2634631	2634636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642449
43464	NC_002505	CTG	2	6	2634640	2634645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642449
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43466	NC_002505	GCA	2	6	2634824	2634829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642449
43467	NC_002505	AGT	2	6	2634931	2634936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642449
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43470	NC_002505	T	6	6	2635094	2635099	0 %	100 %	0 %	0 %	15642449
43471	NC_002505	TCAC	2	8	2635181	2635188	25 %	25 %	0 %	50 %	15642449
43472	NC_002505	TCG	2	6	2635212	2635217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642449
43473	NC_002505	A	6	6	2635273	2635278	100 %	0 %	0 %	0 %	15642449
43474	NC_002505	GCA	2	6	2635326	2635331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642449
43475	NC_002505	GC	3	6	2635416	2635421	0 %	0 %	50 %	50 %	15642449
43476	NC_002505	AAG	2	6	2635424	2635429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642449
43477	NC_002505	CAT	2	6	2635593	2635598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642449
43478	NC_002505	AAG	2	6	2635670	2635675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642449
43479	NC_002505	GGT	2	6	2635686	2635691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642449
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43482	NC_002505	CG	3	6	2635760	2635765	0 %	0 %	50 %	50 %	15642449
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43492	NC_002505	GAT	2	6	2636581	2636586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642449
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