MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_002505	GC	3	6	2580024	2580029	0 %	0 %	50 %	50 %	15642406
42502	NC_002505	TAAAAC	2	12	2580155	2580166	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15642406
42503	NC_002505	CAT	2	6	2580176	2580181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642406
42504	NC_002505	GAA	2	6	2580193	2580198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642406
42505	NC_002505	AAC	2	6	2580211	2580216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642406
42506	NC_002505	AC	3	6	2580215	2580220	50 %	0 %	0 %	50 %	15642406
42507	NC_002505	CCA	2	6	2580233	2580238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642406
42508	NC_002505	ATC	2	6	2580303	2580308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642406
42509	NC_002505	TCT	2	6	2580311	2580316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642406
42510	NC_002505	GAC	2	6	2580359	2580364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642406
42511	NC_002505	ACC	2	6	2580402	2580407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642406
42512	NC_002505	AAT	2	6	2580475	2580480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642406
42513	NC_002505	AAG	2	6	2580497	2580502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642406
42514	NC_002505	GCC	2	6	2581328	2581333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642409
42515	NC_002505	TCT	2	6	2581385	2581390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642409
42516	NC_002505	CAC	2	6	2581437	2581442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642409
42517	NC_002505	CAC	2	6	2581461	2581466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642409
42518	NC_002505	CTT	2	6	2581596	2581601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642409
42519	NC_002505	AGT	2	6	2581671	2581676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642409
42520	NC_002505	CTT	2	6	2581678	2581683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642409
42521	NC_002505	TG	3	6	2581728	2581733	0 %	50 %	50 %	0 %	15642409
42522	NC_002505	CAG	2	6	2581855	2581860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642409
42523	NC_002505	TCT	2	6	2581958	2581963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642409
42524	NC_002505	CGG	2	6	2581974	2581979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642409
42525	NC_002505	GCA	2	6	2582054	2582059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642409
42526	NC_002505	AGTG	2	8	2582105	2582112	25 %	25 %	50 %	0 %	15642409
42527	NC_002505	GAT	2	6	2582137	2582142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642409
42528	NC_002505	ACC	2	6	2582143	2582148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642409
42529	NC_002505	CTT	2	6	2582175	2582180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642409
42530	NC_002505	GAAT	2	8	2582229	2582236	50 %	25 %	25 %	0 %	15642409
42531	NC_002505	CCAG	2	8	2582387	2582394	25 %	0 %	25 %	50 %	15642409
42532	NC_002505	ACC	2	6	2582395	2582400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642409
42533	NC_002505	TGAT	2	8	2582408	2582415	25 %	50 %	25 %	0 %	15642409
42534	NC_002505	TTTC	2	8	2582421	2582428	0 %	75 %	0 %	25 %	15642409
42535	NC_002505	TCAG	2	8	2582483	2582490	25 %	25 %	25 %	25 %	15642409
42536	NC_002505	CTT	2	6	2582499	2582504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642409
42537	NC_002505	GCA	2	6	2582523	2582528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642409
42538	NC_002505	CAAC	2	8	2582546	2582553	50 %	0 %	0 %	50 %	15642409
42539	NC_002505	AC	4	8	2582560	2582567	50 %	0 %	0 %	50 %	15642409
42540	NC_002505	GAT	2	6	2582590	2582595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642409
42541	NC_002505	GCG	2	6	2582630	2582635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642409
42542	NC_002505	CAG	2	6	2582643	2582648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642409
42543	NC_002505	CAC	2	6	2582662	2582667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642409
42544	NC_002505	GTAA	2	8	2583004	2583011	50 %	25 %	25 %	0 %	15642410
42545	NC_002505	GACAGT	2	12	2583056	2583067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15642410
42546	NC_002505	AC	3	6	2583129	2583134	50 %	0 %	0 %	50 %	15642410
42547	NC_002505	TTC	2	6	2583260	2583265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642410
42548	NC_002505	CAGC	2	8	2583273	2583280	25 %	0 %	25 %	50 %	15642410
42549	NC_002505	ACC	2	6	2583332	2583337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642410
42550	NC_002505	TTC	2	6	2583380	2583385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642410
42551	NC_002505	CGT	2	6	2583402	2583407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42552	NC_002505	CAGA	2	8	2583408	2583415	50 %	0 %	25 %	25 %	15642410
42553	NC_002505	ATG	2	6	2583464	2583469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642410
42554	NC_002505	CGCTT	2	10	2583503	2583512	0 %	40 %	20 %	40 %	15642410
42555	NC_002505	ATC	2	6	2583587	2583592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642410
42556	NC_002505	GCC	2	6	2583731	2583736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642410
42557	NC_002505	GC	3	6	2583741	2583746	0 %	0 %	50 %	50 %	15642410
42558	NC_002505	CTT	2	6	2583768	2583773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642410
42559	NC_002505	TCT	2	6	2583791	2583796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642410
42560	NC_002505	GAC	2	6	2583864	2583869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642410
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42562	NC_002505	TTG	2	6	2583921	2583926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642410
42563	NC_002505	GCC	2	6	2583935	2583940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642410
42564	NC_002505	GCT	2	6	2583950	2583955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42565	NC_002505	TGC	4	12	2583976	2583987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42566	NC_002505	CCG	2	6	2584214	2584219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642410
42567	NC_002505	CTT	2	6	2584236	2584241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642410
42568	NC_002505	TGC	2	6	2584246	2584251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
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42570	NC_002505	TGC	2	6	2584297	2584302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42571	NC_002505	ACTTCA	2	12	2584499	2584510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642410
42572	NC_002505	CTT	2	6	2584536	2584541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642410
42573	NC_002505	GCA	2	6	2584565	2584570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42574	NC_002505	TGC	2	6	2584576	2584581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42575	NC_002505	TGC	2	6	2584603	2584608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42576	NC_002505	GCT	2	6	2584610	2584615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642410
42577	NC_002505	AG	3	6	2584643	2584648	50 %	0 %	50 %	0 %	15642410
42578	NC_002505	ACT	2	6	2584673	2584678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642410
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42585	NC_002505	AGTC	2	8	2585124	2585131	25 %	25 %	25 %	25 %	15642411
42586	NC_002505	GCA	2	6	2585199	2585204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642411
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42588	NC_002505	TCA	2	6	2585343	2585348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642411
42589	NC_002505	GCGT	2	8	2585372	2585379	0 %	25 %	50 %	25 %	15642411
42590	NC_002505	CTT	2	6	2585409	2585414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642411
42591	NC_002505	CAG	2	6	2585421	2585426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642411
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42599	NC_002505	CTT	2	6	2585826	2585831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642411
42600	NC_002505	ACCTG	2	10	2585837	2585846	20 %	20 %	20 %	40 %	15642411
42601	NC_002505	CTT	2	6	2585853	2585858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642411
42602	NC_002505	GTA	2	6	2585860	2585865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642411
42603	NC_002505	ACGT	2	8	2585952	2585959	25 %	25 %	25 %	25 %	15642411
42604	NC_002505	GAT	2	6	2585971	2585976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642411
42605	NC_002505	CAG	2	6	2586010	2586015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642411
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42607	NC_002505	CAG	2	6	2586073	2586078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642411
42608	NC_002505	GT	3	6	2586141	2586146	0 %	50 %	50 %	0 %	15642411
42609	NC_002505	ACG	2	6	2586163	2586168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642411
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42611	NC_002505	TTC	2	6	2586224	2586229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642411
42612	NC_002505	CTT	2	6	2586231	2586236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642411
42613	NC_002505	AGATC	2	10	2586243	2586252	40 %	20 %	20 %	20 %	15642411
42614	NC_002505	TCT	2	6	2586300	2586305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642411
42615	NC_002505	GAC	2	6	2586387	2586392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642411
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42617	NC_002505	GAT	2	6	2586434	2586439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642411
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42619	NC_002505	GTCA	2	8	2586475	2586482	25 %	25 %	25 %	25 %	15642411
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42736	NC_002505	CAAG	2	8	2593158	2593165	50 %	0 %	25 %	25 %	15642415
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42852	NC_002505	TCTT	2	8	2600506	2600513	0 %	75 %	0 %	25 %	15642422
42853	NC_002505	GGC	2	6	2600526	2600531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642422
42854	NC_002505	GTG	2	6	2600535	2600540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642422
42855	NC_002505	GC	3	6	2600765	2600770	0 %	0 %	50 %	50 %	15642423
42856	NC_002505	GCG	2	6	2600778	2600783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642423
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42858	NC_002505	ATA	2	6	2600884	2600889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642423
42859	NC_002505	TTGA	2	8	2600964	2600971	25 %	50 %	25 %	0 %	15642423
42860	NC_002505	CACT	2	8	2601005	2601012	25 %	25 %	0 %	50 %	15642423
42861	NC_002505	GCT	2	6	2601038	2601043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642423
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42865	NC_002505	CTG	2	6	2601243	2601248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642423
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42872	NC_002505	ATTG	2	8	2601477	2601484	25 %	50 %	25 %	0 %	15642423
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42883	NC_002505	TGC	2	6	2601985	2601990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642424
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42971	NC_002505	TTTGG	2	10	2606451	2606460	0 %	60 %	40 %	0 %	15642428
42972	NC_002505	GCA	2	6	2606549	2606554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642428
42973	NC_002505	CGCAT	2	10	2606578	2606587	20 %	20 %	20 %	40 %	15642428
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43000	NC_002505	CA	3	6	2608523	2608528	50 %	0 %	0 %	50 %	15642430

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