MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002505	ATC	2	6	215579	215584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640237
3502	NC_002505	GCG	2	6	215672	215677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640237
3503	NC_002505	CTT	2	6	215683	215688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640237
3504	NC_002505	GTG	2	6	215753	215758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640237
3505	NC_002505	TGA	2	6	215769	215774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640237
3506	NC_002505	GGT	2	6	215816	215821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640237
3507	NC_002505	TGC	2	6	215848	215853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640237
3508	NC_002505	CTT	2	6	215860	215865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640237
3509	NC_002505	CTT	2	6	216003	216008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640238
3510	NC_002505	GCA	3	9	216062	216070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640238
3511	NC_002505	TGA	2	6	216135	216140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640238
3512	NC_002505	CATCGA	2	12	216224	216235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15640238
3513	NC_002505	CATCAC	2	12	216267	216278	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15640238
3514	NC_002505	GCC	2	6	216285	216290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640238
3515	NC_002505	ATCA	2	8	216303	216310	50 %	25 %	0 %	25 %	15640238
3516	NC_002505	AG	3	6	216312	216317	50 %	0 %	50 %	0 %	15640238
3517	NC_002505	CTT	2	6	216338	216343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640238
3518	NC_002505	GAA	2	6	216384	216389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640238
3519	NC_002505	AGC	3	9	216406	216414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640238
3520	NC_002505	GAA	2	6	216454	216459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640238
3521	NC_002505	CT	3	6	216575	216580	0 %	50 %	0 %	50 %	15640239
3522	NC_002505	CAT	2	6	216680	216685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640239
3523	NC_002505	T	6	6	216716	216721	0 %	100 %	0 %	0 %	15640239
3524	NC_002505	CTT	2	6	216736	216741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640239
3525	NC_002505	CAG	2	6	216794	216799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640239
3526	NC_002505	TGCG	2	8	216898	216905	0 %	25 %	50 %	25 %	15640239
3527	NC_002505	GCT	2	6	216943	216948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640239
3528	NC_002505	CG	3	6	216984	216989	0 %	0 %	50 %	50 %	15640239
3529	NC_002505	TCA	2	6	217011	217016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640239
3530	NC_002505	AGT	2	6	217026	217031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640239
3531	NC_002505	GCA	2	6	217273	217278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640239
3532	NC_002505	CAGG	2	8	217303	217310	25 %	0 %	50 %	25 %	15640239
3533	NC_002505	CTT	2	6	217384	217389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640239
3534	NC_002505	TGCG	2	8	217390	217397	0 %	25 %	50 %	25 %	15640239
3535	NC_002505	ATC	2	6	217416	217421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640239
3536	NC_002505	TGG	2	6	217669	217674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582033
3537	NC_002505	GAA	2	6	217713	217718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161582033
3538	NC_002505	CGG	2	6	217762	217767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582033
3539	NC_002505	CACG	2	8	217798	217805	25 %	0 %	25 %	50 %	161582033
3540	NC_002505	CG	3	6	217865	217870	0 %	0 %	50 %	50 %	161582033
3541	NC_002505	TGG	2	6	217885	217890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582033
3542	NC_002505	TGTGA	2	10	217929	217938	20 %	40 %	40 %	0 %	161582033
3543	NC_002505	GAA	3	9	218033	218041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161582033
3544	NC_002505	TGTGC	2	10	218093	218102	0 %	40 %	40 %	20 %	161582033
3545	NC_002505	CTG	3	9	218125	218133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582033
3546	NC_002505	GAA	2	6	218160	218165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161582033
3547	NC_002505	CTG	2	6	218191	218196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582033
3548	NC_002505	GCTG	2	8	218234	218241	0 %	25 %	50 %	25 %	161582033
3549	NC_002505	A	6	6	218247	218252	100 %	0 %	0 %	0 %	161582033
3550	NC_002505	GTT	2	6	218288	218293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161582033
3551	NC_002505	GATT	2	8	218295	218302	25 %	50 %	25 %	0 %	161582033
3552	NC_002505	GC	3	6	218804	218809	0 %	0 %	50 %	50 %	161582032
3553	NC_002505	ACC	2	6	218900	218905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161582032
3554	NC_002505	CAG	2	6	218907	218912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582032
3555	NC_002505	CAC	2	6	218927	218932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161582032
3556	NC_002505	GCA	2	6	219003	219008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582032
3557	NC_002505	TGG	2	6	219030	219035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582032
3558	NC_002505	ATG	2	6	219036	219041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582032
3559	NC_002505	CAA	2	6	219091	219096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161582032
3560	NC_002505	CGAT	2	8	219123	219130	25 %	25 %	25 %	25 %	161582032
3561	NC_002505	AAG	2	6	219168	219173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161582032
3562	NC_002505	TCA	2	6	219225	219230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161582032
3563	NC_002505	AAC	2	6	219251	219256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161582032
3564	NC_002505	ATG	2	6	219408	219413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640242
3565	NC_002505	CTT	2	6	219536	219541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640242
3566	NC_002505	TGT	2	6	219605	219610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640242
3567	NC_002505	TAC	2	6	219627	219632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640242
3568	NC_002505	A	6	6	219693	219698	100 %	0 %	0 %	0 %	15640242
3569	NC_002505	CCA	2	6	219817	219822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640242
3570	NC_002505	ATG	2	6	219880	219885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640242
3571	NC_002505	GCC	2	6	219907	219912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640242
3572	NC_002505	CGG	2	6	219920	219925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640242
3573	NC_002505	CGC	2	6	219971	219976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640242
3574	NC_002505	AGC	2	6	219982	219987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640242
3575	NC_002505	GCA	2	6	219989	219994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640242
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3578	NC_002505	TGA	3	9	220193	220201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640242
3579	NC_002505	TGC	2	6	220260	220265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640242
3580	NC_002505	GC	3	6	220460	220465	0 %	0 %	50 %	50 %	15640243
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3586	NC_002505	TGAA	2	8	220817	220824	50 %	25 %	25 %	0 %	15640243
3587	NC_002505	GC	4	8	220889	220896	0 %	0 %	50 %	50 %	15640243
3588	NC_002505	ATCA	2	8	220984	220991	50 %	25 %	0 %	25 %	15640243
3589	NC_002505	AAAC	2	8	221076	221083	75 %	0 %	0 %	25 %	15640243
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3592	NC_002505	CAG	2	6	221230	221235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640243
3593	NC_002505	AGC	2	6	221353	221358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582031
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3598	NC_002505	AG	3	6	221601	221606	50 %	0 %	50 %	0 %	161582031
3599	NC_002505	AGC	2	6	221644	221649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161582031
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3603	NC_002505	GATT	2	8	221900	221907	25 %	50 %	25 %	0 %	161582031
3604	NC_002505	T	7	7	221906	221912	0 %	100 %	0 %	0 %	161582031
3605	NC_002505	AGCG	2	8	222119	222126	25 %	0 %	50 %	25 %	15640245
3606	NC_002505	CTT	2	6	222160	222165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640245
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3608	NC_002505	TCAG	2	8	222330	222337	25 %	25 %	25 %	25 %	15640245
3609	NC_002505	T	6	6	222408	222413	0 %	100 %	0 %	0 %	15640245
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3620	NC_002505	GC	3	6	222989	222994	0 %	0 %	50 %	50 %	15640245
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3622	NC_002505	CAAG	2	8	223084	223091	50 %	0 %	25 %	25 %	15640245
3623	NC_002505	GGC	2	6	223151	223156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640245
3624	NC_002505	TCA	2	6	223162	223167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640245
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3626	NC_002505	CGA	2	6	223200	223205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640245
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3628	NC_002505	TCT	2	6	223471	223476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640246
3629	NC_002505	TGAT	2	8	223610	223617	25 %	50 %	25 %	0 %	15640246
3630	NC_002505	A	6	6	223624	223629	100 %	0 %	0 %	0 %	15640246
3631	NC_002505	ATG	2	6	223648	223653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640246
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3634	NC_002505	CGA	2	6	223928	223933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640246
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3637	NC_002505	TAT	2	6	224121	224126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640246
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3640	NC_002505	CG	3	6	224220	224225	0 %	0 %	50 %	50 %	15640246
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3643	NC_002505	GC	3	6	224452	224457	0 %	0 %	50 %	50 %	15640246
3644	NC_002505	CTG	2	6	224591	224596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640246
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3656	NC_002505	CG	3	6	225290	225295	0 %	0 %	50 %	50 %	15640247
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3684	NC_002505	A	6	6	227282	227287	100 %	0 %	0 %	0 %	15640250
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3706	NC_002505	GCGCG	2	10	228671	228680	0 %	0 %	60 %	40 %	15640252
3707	NC_002505	TCAA	2	8	228682	228689	50 %	25 %	0 %	25 %	15640252
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3728	NC_002505	A	6	6	230077	230082	100 %	0 %	0 %	0 %	15640254
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3730	NC_002505	ATCGC	2	10	230245	230254	20 %	20 %	20 %	40 %	15640254
3731	NC_002505	AGTTG	2	10	230329	230338	20 %	40 %	40 %	0 %	15640254
3732	NC_002505	GCA	2	6	230443	230448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640254
3733	NC_002505	ACG	2	6	230601	230606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640254
3734	NC_002505	CG	3	6	230605	230610	0 %	0 %	50 %	50 %	15640254
3735	NC_002505	TCA	2	6	230656	230661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640254
3736	NC_002505	T	6	6	230710	230715	0 %	100 %	0 %	0 %	15640254
3737	NC_002505	TG	3	6	230806	230811	0 %	50 %	50 %	0 %	15640255
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3742	NC_002505	CTT	2	6	230948	230953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640255
3743	NC_002505	CCA	2	6	231137	231142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640255
3744	NC_002505	TGCT	2	8	231165	231172	0 %	50 %	25 %	25 %	15640255
3745	NC_002505	TTG	3	9	231237	231245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640255
3746	NC_002505	CTG	2	6	231260	231265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640255
3747	NC_002505	TGCT	2	8	231299	231306	0 %	50 %	25 %	25 %	15640255
3748	NC_002505	CAC	2	6	231312	231317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640255
3749	NC_002505	GCT	2	6	231329	231334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640255
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3751	NC_002505	GC	3	6	231513	231518	0 %	0 %	50 %	50 %	15640255
3752	NC_002505	GC	3	6	231540	231545	0 %	0 %	50 %	50 %	15640255
3753	NC_002505	GCA	2	6	231593	231598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640255
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3860	NC_002505	GCT	2	6	237687	237692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640263
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3864	NC_002505	TGC	2	6	237787	237792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640263
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3866	NC_002505	GGC	2	6	237849	237854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640263
3867	NC_002505	ACG	2	6	238203	238208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640263
3868	NC_002505	AATC	2	8	238235	238242	50 %	25 %	0 %	25 %	15640263
3869	NC_002505	CAG	2	6	238314	238319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640263
3870	NC_002505	CACC	2	8	238382	238389	25 %	0 %	0 %	75 %	15640263
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3998	NC_002505	GGC	2	6	245627	245632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640270
3999	NC_002505	TGC	2	6	245650	245655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640270
4000	NC_002505	TTC	2	6	245697	245702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640270

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