MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_002505	CGA	2	6	2311173	2311178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642161
38003	NC_002505	TTG	2	6	2311219	2311224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642161
38004	NC_002505	GCA	2	6	2311290	2311295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642161
38005	NC_002505	CAA	2	6	2311312	2311317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642161
38006	NC_002505	GAA	2	6	2311318	2311323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642161
38007	NC_002505	ACC	2	6	2311397	2311402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642161
38008	NC_002505	TGA	2	6	2311500	2311505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642161
38009	NC_002505	CGT	2	6	2311536	2311541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642161
38010	NC_002505	ACCAA	2	10	2311577	2311586	60 %	0 %	0 %	40 %	15642161
38011	NC_002505	ATC	2	6	2311598	2311603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642161
38012	NC_002505	CCA	2	6	2311710	2311715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642161
38013	NC_002505	AAG	2	6	2311739	2311744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642161
38014	NC_002505	ACA	2	6	2311764	2311769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642161
38015	NC_002505	CCA	2	6	2311776	2311781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642161
38016	NC_002505	AGT	2	6	2312016	2312021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642162
38017	NC_002505	GCT	2	6	2312038	2312043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642162
38018	NC_002505	AAT	2	6	2312057	2312062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642162
38019	NC_002505	TGC	2	6	2312421	2312426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642163
38020	NC_002505	AACC	2	8	2312432	2312439	50 %	0 %	0 %	50 %	15642163
38021	NC_002505	T	6	6	2312531	2312536	0 %	100 %	0 %	0 %	15642163
38022	NC_002505	T	6	6	2312570	2312575	0 %	100 %	0 %	0 %	15642163
38023	NC_002505	GGT	2	6	2312576	2312581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642163
38024	NC_002505	GTT	2	6	2312602	2312607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642163
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38027	NC_002505	GAA	2	6	2312696	2312701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642163
38028	NC_002505	CGC	2	6	2312708	2312713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642163
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38032	NC_002505	CCA	2	6	2312796	2312801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642163
38033	NC_002505	GCA	2	6	2312808	2312813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642163
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38035	NC_002505	ACGCCA	2	12	2312898	2312909	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15642163
38036	NC_002505	TGA	2	6	2312935	2312940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642163
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38038	NC_002505	TGC	2	6	2312970	2312975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642163
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38042	NC_002505	A	7	7	2313149	2313155	100 %	0 %	0 %	0 %	15642163
38043	NC_002505	AAC	2	6	2313261	2313266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642163
38044	NC_002505	CAAG	2	8	2313316	2313323	50 %	0 %	25 %	25 %	15642163
38045	NC_002505	TGC	2	6	2313405	2313410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642163
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38048	NC_002505	CAGT	2	8	2313610	2313617	25 %	25 %	25 %	25 %	15642163
38049	NC_002505	TGG	2	6	2313618	2313623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642163
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38051	NC_002505	GAA	2	6	2313852	2313857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642164
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38053	NC_002505	TGAA	2	8	2313886	2313893	50 %	25 %	25 %	0 %	15642164
38054	NC_002505	GTGC	2	8	2313894	2313901	0 %	25 %	50 %	25 %	15642164
38055	NC_002505	ATG	2	6	2313903	2313908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642164
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38067	NC_002505	GC	3	6	2314356	2314361	0 %	0 %	50 %	50 %	15642165
38068	NC_002505	TGAT	2	8	2314362	2314369	25 %	50 %	25 %	0 %	15642165
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38091	NC_002505	CAC	2	6	2315478	2315483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642167
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38098	NC_002505	TCGG	2	8	2315857	2315864	0 %	25 %	50 %	25 %	15642167
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38105	NC_002505	TTG	2	6	2316183	2316188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642167
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38112	NC_002505	CGC	2	6	2316796	2316801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642170
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38118	NC_002505	CTG	2	6	2316970	2316975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
38119	NC_002505	CCT	2	6	2316976	2316981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642170
38120	NC_002505	GCC	2	6	2317030	2317035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642170
38121	NC_002505	TCG	2	6	2317079	2317084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
38122	NC_002505	T	6	6	2317159	2317164	0 %	100 %	0 %	0 %	15642170
38123	NC_002505	TCCTA	2	10	2317173	2317182	20 %	40 %	0 %	40 %	15642170
38124	NC_002505	GTC	2	6	2317225	2317230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
38125	NC_002505	GCG	2	6	2317237	2317242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642170
38126	NC_002505	GCTTG	2	10	2317255	2317264	0 %	40 %	40 %	20 %	15642170
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38129	NC_002505	GC	3	6	2317466	2317471	0 %	0 %	50 %	50 %	15642170
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38131	NC_002505	GGC	2	6	2317548	2317553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642170
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38133	NC_002505	CTG	2	6	2317597	2317602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642170
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38141	NC_002505	TCG	2	6	2318086	2318091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642171
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38145	NC_002505	T	6	6	2318213	2318218	0 %	100 %	0 %	0 %	15642171
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38147	NC_002505	T	7	7	2318289	2318295	0 %	100 %	0 %	0 %	15642171
38148	NC_002505	GATG	2	8	2318407	2318414	25 %	25 %	50 %	0 %	15642171
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38150	NC_002505	GATT	2	8	2318443	2318450	25 %	50 %	25 %	0 %	15642171
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38238	NC_002505	AGTG	2	8	2324083	2324090	25 %	25 %	50 %	0 %	15642178
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38356	NC_002505	CTG	2	6	2330097	2330102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161581994
38357	NC_002505	CCA	2	6	2330113	2330118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161581994
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38472	NC_002505	TCC	2	6	2340030	2340035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642191
38473	NC_002505	GCTC	2	8	2340043	2340050	0 %	25 %	25 %	50 %	15642191
38474	NC_002505	GCCAA	2	10	2340090	2340099	40 %	0 %	20 %	40 %	15642191
38475	NC_002505	TGAAC	2	10	2340110	2340119	40 %	20 %	20 %	20 %	15642191
38476	NC_002505	TCA	2	6	2340175	2340180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642191
38477	NC_002505	CAT	2	6	2340224	2340229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642191
38478	NC_002505	TCA	2	6	2340291	2340296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642191
38479	NC_002505	ATT	2	6	2340365	2340370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642191
38480	NC_002505	TGGC	2	8	2340376	2340383	0 %	25 %	50 %	25 %	15642191
38481	NC_002505	AAT	2	6	2340390	2340395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642191
38482	NC_002505	GCA	2	6	2340463	2340468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642192
38483	NC_002505	CGCA	2	8	2340483	2340490	25 %	0 %	25 %	50 %	15642192
38484	NC_002505	ATC	2	6	2340495	2340500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642192
38485	NC_002505	ACC	2	6	2340574	2340579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642192
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38487	NC_002505	GTGA	2	8	2340651	2340658	25 %	25 %	50 %	0 %	15642192
38488	NC_002505	CGC	2	6	2340729	2340734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642192
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38490	NC_002505	GCTG	2	8	2340788	2340795	0 %	25 %	50 %	25 %	15642192
38491	NC_002505	CG	3	6	2340800	2340805	0 %	0 %	50 %	50 %	15642192
38492	NC_002505	TTGA	2	8	2340817	2340824	25 %	50 %	25 %	0 %	15642192
38493	NC_002505	CCG	2	6	2340836	2340841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642192
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38495	NC_002505	GTAAT	2	10	2340925	2340934	40 %	40 %	20 %	0 %	15642192
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