MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_002505	CTA	2	6	2281825	2281830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642127
37503	NC_002505	GCC	2	6	2281835	2281840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642127
37504	NC_002505	CCAT	2	8	2281855	2281862	25 %	25 %	0 %	50 %	15642127
37505	NC_002505	GCA	2	6	2281908	2281913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37506	NC_002505	GGC	2	6	2281986	2281991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642127
37507	NC_002505	TGT	2	6	2282016	2282021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642127
37508	NC_002505	TGC	2	6	2282040	2282045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37509	NC_002505	TGA	2	6	2282071	2282076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642127
37510	NC_002505	AAT	2	6	2282106	2282111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642127
37511	NC_002505	CTCA	2	8	2282120	2282127	25 %	25 %	0 %	50 %	15642127
37512	NC_002505	CAC	2	6	2282155	2282160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642127
37513	NC_002505	GCGA	2	8	2282205	2282212	25 %	0 %	50 %	25 %	15642127
37514	NC_002505	CTTG	2	8	2282245	2282252	0 %	50 %	25 %	25 %	15642127
37515	NC_002505	TGG	2	6	2282266	2282271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642127
37516	NC_002505	ATG	2	6	2282293	2282298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642127
37517	NC_002505	CTT	2	6	2282338	2282343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642127
37518	NC_002505	GCC	2	6	2282349	2282354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642127
37519	NC_002505	CATC	2	8	2282383	2282390	25 %	25 %	0 %	50 %	15642127
37520	NC_002505	TGC	2	6	2282506	2282511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37521	NC_002505	A	7	7	2282537	2282543	100 %	0 %	0 %	0 %	15642127
37522	NC_002505	CCA	2	6	2282544	2282549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642127
37523	NC_002505	ACTG	2	8	2282576	2282583	25 %	25 %	25 %	25 %	15642127
37524	NC_002505	CATC	2	8	2282870	2282877	25 %	25 %	0 %	50 %	15642128
37525	NC_002505	TAA	2	6	2282901	2282906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642128
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37527	NC_002505	T	6	6	2282922	2282927	0 %	100 %	0 %	0 %	15642128
37528	NC_002505	TGC	2	6	2283010	2283015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642128
37529	NC_002505	T	6	6	2283023	2283028	0 %	100 %	0 %	0 %	15642128
37530	NC_002505	TGAG	2	8	2283052	2283059	25 %	25 %	50 %	0 %	15642128
37531	NC_002505	TGGC	2	8	2283082	2283089	0 %	25 %	50 %	25 %	15642128
37532	NC_002505	AACT	2	8	2283114	2283121	50 %	25 %	0 %	25 %	15642128
37533	NC_002505	TGG	2	6	2283163	2283168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642128
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37536	NC_002505	TGC	2	6	2283351	2283356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642129
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37539	NC_002505	CG	4	8	2283617	2283624	0 %	0 %	50 %	50 %	15642129
37540	NC_002505	GCC	2	6	2283704	2283709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642129
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37542	NC_002505	TGG	2	6	2283755	2283760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642129
37543	NC_002505	GTGA	2	8	2283828	2283835	25 %	25 %	50 %	0 %	15642129
37544	NC_002505	CAG	2	6	2283845	2283850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642129
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37549	NC_002505	TCA	2	6	2284066	2284071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642129
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37551	NC_002505	ATCA	2	8	2284286	2284293	50 %	25 %	0 %	25 %	15642129
37552	NC_002505	CAG	2	6	2284301	2284306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642129
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37557	NC_002505	GCTAAC	2	12	2284590	2284601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642129
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37592	NC_002505	ACCC	2	8	2286382	2286389	25 %	0 %	0 %	75 %	15642131
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37605	NC_002505	GAT	3	9	2286824	2286832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642132
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37613	NC_002505	TGGC	2	8	2287330	2287337	0 %	25 %	50 %	25 %	15642132
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37620	NC_002505	GACGCT	2	12	2287674	2287685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15642132
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37623	NC_002505	TCG	2	6	2287860	2287865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642132
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37970	NC_002505	TAA	2	6	2309207	2309212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642160
37971	NC_002505	ATCG	2	8	2309302	2309309	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
37972	NC_002505	TCAC	2	8	2309317	2309324	25 %	25 %	0 %	50 %	15642160
37973	NC_002505	TCA	2	6	2309350	2309355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
37974	NC_002505	AGCCGC	2	12	2309364	2309375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15642160
37975	NC_002505	GCT	2	6	2309441	2309446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
37976	NC_002505	CTG	2	6	2309460	2309465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
37977	NC_002505	CATG	2	8	2309516	2309523	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
37978	NC_002505	TCA	2	6	2309702	2309707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
37979	NC_002505	ATC	2	6	2309787	2309792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
37980	NC_002505	CGAT	2	8	2309807	2309814	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
37981	NC_002505	CCA	2	6	2309819	2309824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642160
37982	NC_002505	CTT	2	6	2309909	2309914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642160
37983	NC_002505	ACTG	2	8	2309936	2309943	25 %	25 %	25 %	25 %	15642160
37984	NC_002505	TCG	2	6	2309996	2310001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642160
37985	NC_002505	TGA	2	6	2310002	2310007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642160
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37988	NC_002505	GAT	3	9	2310129	2310137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642160
37989	NC_002505	CTTT	2	8	2310180	2310187	0 %	75 %	0 %	25 %	15642160
37990	NC_002505	CAT	3	9	2310251	2310259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642160
37991	NC_002505	GTTG	2	8	2310357	2310364	0 %	50 %	50 %	0 %	15642160
37992	NC_002505	CAG	2	6	2310522	2310527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642160
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37996	NC_002505	A	6	6	2310853	2310858	100 %	0 %	0 %	0 %	15642161
37997	NC_002505	AAT	2	6	2310901	2310906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642161
37998	NC_002505	AAT	2	6	2310979	2310984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642161
37999	NC_002505	CAA	2	6	2310997	2311002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642161
38000	NC_002505	CGACTG	2	12	2311104	2311115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15642161

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