MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_002505	TCA	2	6	2249417	2249422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642087
37002	NC_002505	T	7	7	2249435	2249441	0 %	100 %	0 %	0 %	15642087
37003	NC_002505	AGT	2	6	2249451	2249456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642087
37004	NC_002505	ATG	2	6	2249612	2249617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642088
37005	NC_002505	CAT	2	6	2249643	2249648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642088
37006	NC_002505	ATCA	2	8	2249689	2249696	50 %	25 %	0 %	25 %	15642088
37007	NC_002505	AGC	2	6	2249707	2249712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642088
37008	NC_002505	CAA	2	6	2249713	2249718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642088
37009	NC_002505	CCA	2	6	2249749	2249754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642088
37010	NC_002505	ATA	2	6	2249789	2249794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642088
37011	NC_002505	TTC	2	6	2249824	2249829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642088
37012	NC_002505	TC	3	6	2249844	2249849	0 %	50 %	0 %	50 %	15642088
37013	NC_002505	CAT	2	6	2249865	2249870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642088
37014	NC_002505	GCG	2	6	2250076	2250081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642088
37015	NC_002505	CAT	2	6	2250133	2250138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642088
37016	NC_002505	TCA	3	9	2250364	2250372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642089
37017	NC_002505	CAC	2	6	2250401	2250406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642089
37018	NC_002505	GTT	2	6	2250606	2250611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642089
37019	NC_002505	TGCA	2	8	2250613	2250620	25 %	25 %	25 %	25 %	15642089
37020	NC_002505	ACC	2	6	2250787	2250792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642089
37021	NC_002505	GCC	2	6	2250810	2250815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642089
37022	NC_002505	CAC	2	6	2250854	2250859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642089
37023	NC_002505	CAT	2	6	2250945	2250950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642089
37024	NC_002505	CAGTTT	2	12	2251071	2251082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15642089
37025	NC_002505	TG	3	6	2251085	2251090	0 %	50 %	50 %	0 %	15642089
37026	NC_002505	ATC	2	6	2251132	2251137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642089
37027	NC_002505	CAG	2	6	2251221	2251226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642089
37028	NC_002505	TG	3	6	2251367	2251372	0 %	50 %	50 %	0 %	15642089
37029	NC_002505	TGG	2	6	2251376	2251381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642089
37030	NC_002505	GCTTTG	2	12	2251426	2251437	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15642089
37031	NC_002505	AGCAC	2	10	2251483	2251492	40 %	0 %	20 %	40 %	15642089
37032	NC_002505	TGG	2	6	2251538	2251543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642089
37033	NC_002505	TTG	2	6	2251560	2251565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642089
37034	NC_002505	CTG	4	12	2251601	2251612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642089
37035	NC_002505	AGC	2	6	2251620	2251625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642089
37036	NC_002505	CAC	2	6	2251631	2251636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642089
37037	NC_002505	TGAC	2	8	2251647	2251654	25 %	25 %	25 %	25 %	15642089
37038	NC_002505	CATA	2	8	2251805	2251812	50 %	25 %	0 %	25 %	15642089
37039	NC_002505	ATC	2	6	2251824	2251829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642089
37040	NC_002505	GCC	2	6	2251860	2251865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642089
37041	NC_002505	GCA	2	6	2251948	2251953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642089
37042	NC_002505	CAC	2	6	2251964	2251969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642089
37043	NC_002505	TAC	2	6	2251980	2251985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642089
37044	NC_002505	GAAC	2	8	2251996	2252003	50 %	0 %	25 %	25 %	15642089
37045	NC_002505	AGA	2	6	2252045	2252050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642090
37046	NC_002505	GAT	2	6	2252286	2252291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642090
37047	NC_002505	TACCA	2	10	2252355	2252364	40 %	20 %	0 %	40 %	15642090
37048	NC_002505	CCA	2	6	2252478	2252483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642091
37049	NC_002505	CAA	2	6	2252545	2252550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642091
37050	NC_002505	GAG	2	6	2252580	2252585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642091
37051	NC_002505	AAC	2	6	2252598	2252603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642091
37052	NC_002505	CAA	2	6	2252623	2252628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642091
37053	NC_002505	AC	3	6	2252644	2252649	50 %	0 %	0 %	50 %	15642091
37054	NC_002505	GGA	2	6	2252653	2252658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642091
37055	NC_002505	CTTT	3	12	2252720	2252731	0 %	75 %	0 %	25 %	15642091
37056	NC_002505	CTCA	2	8	2252742	2252749	25 %	25 %	0 %	50 %	15642091
37057	NC_002505	ATGG	2	8	2253202	2253209	25 %	25 %	50 %	0 %	15642092
37058	NC_002505	TTACT	2	10	2253258	2253267	20 %	60 %	0 %	20 %	15642092
37059	NC_002505	GT	3	6	2253397	2253402	0 %	50 %	50 %	0 %	15642092
37060	NC_002505	CTT	2	6	2253409	2253414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642092
37061	NC_002505	CCG	2	6	2253516	2253521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642092
37062	NC_002505	TG	3	6	2253545	2253550	0 %	50 %	50 %	0 %	15642092
37063	NC_002505	GTG	2	6	2253553	2253558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642092
37064	NC_002505	GCT	2	6	2253568	2253573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642092
37065	NC_002505	ATG	2	6	2253742	2253747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642092
37066	NC_002505	GAG	2	6	2253763	2253768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642092
37067	NC_002505	CATCGA	2	12	2253842	2253853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642092
37068	NC_002505	GCA	2	6	2253901	2253906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642092
37069	NC_002505	TGG	2	6	2253936	2253941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642092
37070	NC_002505	TGA	2	6	2254188	2254193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642092
37071	NC_002505	GAA	2	6	2254206	2254211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642092
37072	NC_002505	CAT	2	6	2254242	2254247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642092
37073	NC_002505	GTC	2	6	2254364	2254369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642092
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37075	NC_002505	CAC	2	6	2254704	2254709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642093
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37078	NC_002505	TTG	2	6	2254916	2254921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642093
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37083	NC_002505	TTAA	2	8	2255183	2255190	50 %	50 %	0 %	0 %	15642093
37084	NC_002505	ACA	2	6	2255423	2255428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642094
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37088	NC_002505	CCA	2	6	2255650	2255655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642094
37089	NC_002505	ACC	2	6	2255718	2255723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642094
37090	NC_002505	AAC	2	6	2255757	2255762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642094
37091	NC_002505	TTA	2	6	2255792	2255797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642094
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37094	NC_002505	CCGA	2	8	2255843	2255850	25 %	0 %	25 %	50 %	15642094
37095	NC_002505	AGC	2	6	2255910	2255915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642094
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37097	NC_002505	AATCTG	2	12	2256024	2256035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15642094
37098	NC_002505	A	6	6	2256087	2256092	100 %	0 %	0 %	0 %	15642094
37099	NC_002505	CTG	2	6	2256165	2256170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642095
37100	NC_002505	TCT	2	6	2256238	2256243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642095
37101	NC_002505	ACCA	2	8	2256266	2256273	50 %	0 %	0 %	50 %	15642095
37102	NC_002505	GCC	2	6	2256294	2256299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642095
37103	NC_002505	TTC	2	6	2256403	2256408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642095
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37105	NC_002505	TCA	2	6	2256472	2256477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642095
37106	NC_002505	AAG	2	6	2256587	2256592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642095
37107	NC_002505	CT	3	6	2256601	2256606	0 %	50 %	0 %	50 %	15642095
37108	NC_002505	AGAGT	2	10	2256630	2256639	40 %	20 %	40 %	0 %	15642095
37109	NC_002505	CAA	2	6	2256644	2256649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642095
37110	NC_002505	CA	3	6	2256674	2256679	50 %	0 %	0 %	50 %	15642095
37111	NC_002505	ATCA	2	8	2256708	2256715	50 %	25 %	0 %	25 %	15642095
37112	NC_002505	GCCC	2	8	2256753	2256760	0 %	0 %	25 %	75 %	15642095
37113	NC_002505	TCA	2	6	2256818	2256823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642095
37114	NC_002505	TGCCAC	2	12	2257055	2257066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15642095
37115	NC_002505	GCC	2	6	2257108	2257113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642095
37116	NC_002505	ATC	2	6	2257134	2257139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642095
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37118	NC_002505	GCT	2	6	2257223	2257228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642095
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37232	NC_002505	GTCGTA	2	12	2264483	2264494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15642107
37233	NC_002505	CAC	2	6	2264519	2264524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642107
37234	NC_002505	CAC	2	6	2264569	2264574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642107
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37236	NC_002505	CACG	2	8	2264632	2264639	25 %	0 %	25 %	50 %	15642107
37237	NC_002505	CAG	2	6	2264687	2264692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642107
37238	NC_002505	TTG	2	6	2264786	2264791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642107
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37471	NC_002505	CAC	3	9	2280504	2280512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642126
37472	NC_002505	GCCA	2	8	2280514	2280521	25 %	0 %	25 %	50 %	15642126
37473	NC_002505	CGG	2	6	2280531	2280536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642126
37474	NC_002505	ATG	2	6	2280542	2280547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642126
37475	NC_002505	TCT	2	6	2280590	2280595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642126
37476	NC_002505	TTG	2	6	2280667	2280672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642127
37477	NC_002505	TTC	2	6	2280710	2280715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642127
37478	NC_002505	TGCG	2	8	2280733	2280740	0 %	25 %	50 %	25 %	15642127
37479	NC_002505	GCT	2	6	2280778	2280783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37480	NC_002505	TGC	2	6	2280798	2280803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37481	NC_002505	TGC	2	6	2280834	2280839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37482	NC_002505	CGTG	2	8	2280885	2280892	0 %	25 %	50 %	25 %	15642127
37483	NC_002505	TTC	2	6	2281002	2281007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642127
37484	NC_002505	CAT	3	9	2281010	2281018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642127
37485	NC_002505	CTG	2	6	2281141	2281146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37486	NC_002505	TCT	2	6	2281170	2281175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642127
37487	NC_002505	ACG	2	6	2281196	2281201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37488	NC_002505	TGC	2	6	2281235	2281240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37489	NC_002505	GGC	2	6	2281256	2281261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642127
37490	NC_002505	CGC	2	6	2281349	2281354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642127
37491	NC_002505	GTG	2	6	2281377	2281382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642127
37492	NC_002505	TGC	2	6	2281389	2281394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642127
37493	NC_002505	GACT	2	8	2281427	2281434	25 %	25 %	25 %	25 %	15642127
37494	NC_002505	CTT	2	6	2281474	2281479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642127
37495	NC_002505	TG	3	6	2281536	2281541	0 %	50 %	50 %	0 %	15642127
37496	NC_002505	CAC	2	6	2281553	2281558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642127
37497	NC_002505	TCA	2	6	2281599	2281604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642127
37498	NC_002505	TGAT	2	8	2281609	2281616	25 %	50 %	25 %	0 %	15642127
37499	NC_002505	CTTGA	2	10	2281660	2281669	20 %	40 %	20 %	20 %	15642127
37500	NC_002505	CTCA	2	8	2281682	2281689	25 %	25 %	0 %	50 %	15642127

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